MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 26196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	TAA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015636	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015636	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	TAT	2	6	86	91	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
5	NC_015636	CAT	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
6	NC_015636	CTT	3	9	327	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121002
7	NC_015636	ATT	2	6	376	381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
8	NC_015636	TGT	2	6	420	425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121002
9	NC_015636	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
10	NC_015636	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
11	NC_015636	TAT	2	6	558	563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
12	NC_015636	ATT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015636	ACC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015636	ATA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015636	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015636	ACA	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121003
17	NC_015636	CTT	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121003
18	NC_015636	TAT	2	6	1170	1175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
19	NC_015636	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
20	NC_015636	TGT	3	9	1212	1220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121003
21	NC_015636	ATT	2	6	1298	1303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015636	ATT	3	9	1311	1319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015636	ATT	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015636	ATA	2	6	1343	1348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015636	TAA	2	6	1365	1370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015636	TAT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
27	NC_015636	GAA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
28	NC_015636	TAT	2	6	1431	1436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
29	NC_015636	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
30	NC_015636	AGA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
31	NC_015636	GAA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
32	NC_015636	TGA	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
33	NC_015636	ATA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
34	NC_015636	ATA	2	6	1666	1671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
35	NC_015636	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
36	NC_015636	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
37	NC_015636	ATT	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
38	NC_015636	CAT	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121004
39	NC_015636	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
40	NC_015636	ACA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121004
41	NC_015636	AGT	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
42	NC_015636	AGA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
43	NC_015636	ACC	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336121004
44	NC_015636	GAA	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
45	NC_015636	TTA	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
46	NC_015636	GTA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
47	NC_015636	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
48	NC_015636	ATT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
49	NC_015636	ATA	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
50	NC_015636	TAA	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
51	NC_015636	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
52	NC_015636	ATA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
53	NC_015636	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
54	NC_015636	GTT	2	6	2843	2848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
55	NC_015636	ATG	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
56	NC_015636	ATT	2	6	2927	2932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
57	NC_015636	TGA	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
58	NC_015636	ATG	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
59	NC_015636	TAA	2	6	2986	2991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
60	NC_015636	ATG	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
61	NC_015636	GTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121004
62	NC_015636	TGA	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
63	NC_015636	ATA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015636	ATA	2	6	3117	3122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015636	TAA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015636	TAA	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015636	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015636	CTT	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015636	TAT	2	6	3182	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015636	ATT	3	9	3188	3196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015636	TAT	3	9	3197	3205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015636	ATT	4	12	3215	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015636	TAA	2	6	3288	3293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
74	NC_015636	AAT	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
75	NC_015636	AGA	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121005
76	NC_015636	AAT	3	9	3433	3441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
77	NC_015636	ATA	2	6	3542	3547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
78	NC_015636	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
79	NC_015636	TAT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121005
80	NC_015636	TGA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121005
81	NC_015636	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
82	NC_015636	TAA	2	6	3707	3712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
83	NC_015636	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
84	NC_015636	AGA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
85	NC_015636	GAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
86	NC_015636	CAT	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121006
87	NC_015636	CAT	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121006
88	NC_015636	CTG	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336121006
89	NC_015636	ATA	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
90	NC_015636	GGT	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121006
91	NC_015636	AGT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
92	NC_015636	TAA	2	6	4268	4273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
93	NC_015636	TGA	2	6	4281	4286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
94	NC_015636	AGA	2	6	4299	4304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
95	NC_015636	AAG	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
96	NC_015636	TAT	2	6	4366	4371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
97	NC_015636	ATT	2	6	4496	4501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
98	NC_015636	TAT	2	6	4543	4548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121006
99	NC_015636	TAA	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
100	NC_015636	AAT	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
101	NC_015636	GCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336121006
102	NC_015636	AAT	2	6	4757	4762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121006
103	NC_015636	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015636	ATT	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015636	ATG	2	6	4842	4847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015636	GAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
107	NC_015636	TTA	2	6	5003	5008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
108	NC_015636	AAT	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121007
109	NC_015636	ATG	2	6	5126	5131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
110	NC_015636	GAT	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
111	NC_015636	TAT	2	6	5183	5188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
112	NC_015636	GTT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121007
113	NC_015636	GTG	2	6	5436	5441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121007
114	NC_015636	ATT	2	6	5471	5476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
115	NC_015636	TTC	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121007
116	NC_015636	TGT	3	9	5521	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121007
117	NC_015636	CCT	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336121007
118	NC_015636	TCA	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121007
119	NC_015636	AGG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121007
120	NC_015636	AGG	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121007
121	NC_015636	GGA	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336121007
122	NC_015636	GTA	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
123	NC_015636	TGA	3	9	5836	5844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121007
124	NC_015636	GTG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121007
125	NC_015636	ATT	2	6	6004	6009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121007
126	NC_015636	ATT	2	6	6060	6065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015636	ATA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015636	TTC	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015636	TAT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015636	TAT	2	6	6213	6218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015636	TTA	2	6	6219	6224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015636	ATA	2	6	6298	6303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121008
133	NC_015636	TCC	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336121008
134	NC_015636	CTT	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121008
135	NC_015636	CAT	2	6	6443	6448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121008
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257	NC_015636	ATA	2	6	14044	14049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015636	TAA	3	9	14057	14065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_015636	TAA	2	6	14082	14087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_015636	AAT	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015636	AAT	2	6	14108	14113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015636	TAA	2	6	14277	14282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121018
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500	NC_015636	TAA	2	6	28144	28149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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