MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	TATAT	2	10	2227	2236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015632	TTTAT	2	10	2480	2489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015632	TTATA	2	10	3535	3544	40 %	60 %	0 %	0 %	336120992
4	NC_015632	TAAAC	2	10	5678	5687	60 %	20 %	0 %	20 %	336120993
5	NC_015632	TGTGG	2	10	6486	6495	0 %	40 %	60 %	0 %	336120993
6	NC_015632	AGAAA	2	10	7002	7011	80 %	0 %	20 %	0 %	336120993
7	NC_015632	TCCAT	2	10	7106	7115	20 %	40 %	0 %	40 %	336120993
8	NC_015632	AAAAT	2	10	8541	8550	80 %	20 %	0 %	0 %	336120993
9	NC_015632	TCAAA	2	10	9669	9678	60 %	20 %	0 %	20 %	336120995
10	NC_015632	GGGAA	2	10	9823	9832	40 %	0 %	60 %	0 %	336120995
11	NC_015632	AATGA	2	10	10433	10442	60 %	20 %	20 %	0 %	336120995
12	NC_015632	AGAAT	2	10	10910	10919	60 %	20 %	20 %	0 %	336120995
13	NC_015632	AGGGC	2	10	11759	11768	20 %	0 %	60 %	20 %	336120995
14	NC_015632	TTGGA	2	10	11895	11904	20 %	40 %	40 %	0 %	336120995
15	NC_015632	CAATA	2	10	12089	12098	60 %	20 %	0 %	20 %	336120995
16	NC_015632	AAAAC	2	10	12797	12806	80 %	0 %	0 %	20 %	336120996
17	NC_015632	ATATT	2	10	13261	13270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015632	GTATA	2	10	13358	13367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.