MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	TTA	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
2	NC_015632	TCT	2	6	152	157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
3	NC_015632	TTC	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
4	NC_015632	TAA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120991
5	NC_015632	TTA	2	6	423	428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
6	NC_015632	CTC	2	6	433	438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336120991
7	NC_015632	ATT	2	6	458	463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
8	NC_015632	TAA	2	6	506	511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120991
9	NC_015632	TCT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
10	NC_015632	CAT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120991
11	NC_015632	TAT	2	6	764	769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
12	NC_015632	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
13	NC_015632	TTA	2	6	885	890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
14	NC_015632	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
15	NC_015632	CAC	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336120991
16	NC_015632	CGA	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336120991
17	NC_015632	ATA	3	9	1335	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015632	ATA	2	6	1351	1356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015632	TAG	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015632	CTC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015632	ATC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015632	TAT	2	6	1660	1665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015632	CAA	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015632	ACA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015632	TAA	3	9	1844	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015632	ATA	2	6	1874	1879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015632	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015632	ACT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015632	TAA	3	9	2034	2042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015632	TAA	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015632	AAT	2	6	2426	2431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015632	AAC	2	6	2602	2607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015632	CAA	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120992
34	NC_015632	TAA	2	6	2777	2782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
35	NC_015632	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
36	NC_015632	ATC	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120992
37	NC_015632	ATA	2	6	3051	3056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
38	NC_015632	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120992
39	NC_015632	AGA	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120992
40	NC_015632	CTA	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120992
41	NC_015632	AAT	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
42	NC_015632	TAA	3	9	3296	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
43	NC_015632	AAT	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
44	NC_015632	TGA	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
45	NC_015632	TAA	2	6	3410	3415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
46	NC_015632	TTA	2	6	3426	3431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120992
47	NC_015632	ATA	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
48	NC_015632	CAA	2	6	3619	3624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120992
49	NC_015632	ATG	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
50	NC_015632	GAT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
51	NC_015632	TAA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
52	NC_015632	TAA	2	6	4000	4005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
53	NC_015632	GAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120992
54	NC_015632	TGA	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
55	NC_015632	ATA	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
56	NC_015632	GAT	2	6	4202	4207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
57	NC_015632	ATA	2	6	4215	4220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
58	NC_015632	ATA	2	6	4252	4257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
59	NC_015632	GAT	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
60	NC_015632	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120992
61	NC_015632	ATC	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120992
62	NC_015632	AGA	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120992
63	NC_015632	TGG	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336120992
64	NC_015632	AAC	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120992
65	NC_015632	TGA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
66	NC_015632	GAA	3	9	4959	4967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120992
67	NC_015632	GAT	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
68	NC_015632	TAC	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015632	ATG	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
70	NC_015632	ATG	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
71	NC_015632	CAG	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336120993
72	NC_015632	ATA	2	6	5335	5340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
73	NC_015632	TAT	2	6	5382	5387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
74	NC_015632	TAT	2	6	5464	5469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
75	NC_015632	ATT	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
76	NC_015632	ATT	2	6	5634	5639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
77	NC_015632	AAG	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
78	NC_015632	TGT	2	6	5816	5821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336120993
79	NC_015632	TGG	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336120993
80	NC_015632	AGA	2	6	5996	6001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
81	NC_015632	GAT	2	6	6003	6008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
82	NC_015632	TGT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336120993
83	NC_015632	AGG	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336120993
84	NC_015632	TGA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
85	NC_015632	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120993
86	NC_015632	TAA	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
87	NC_015632	TTA	2	6	6430	6435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
88	NC_015632	ATG	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
89	NC_015632	AAT	2	6	6477	6482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
90	NC_015632	GAT	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
91	NC_015632	TCT	2	6	6570	6575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120993
92	NC_015632	TGA	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
93	NC_015632	GAA	2	6	6702	6707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
94	NC_015632	TAA	2	6	6730	6735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
95	NC_015632	GAA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
96	NC_015632	TAA	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
97	NC_015632	TAA	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
98	NC_015632	TGA	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120993
99	NC_015632	AGA	2	6	6992	6997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
100	NC_015632	GGA	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336120993
101	NC_015632	TGG	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336120993
102	NC_015632	TAT	2	6	7192	7197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
103	NC_015632	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
104	NC_015632	TAA	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
105	NC_015632	TCA	2	6	7398	7403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120993
106	NC_015632	TGG	2	6	7484	7489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336120993
107	NC_015632	AAT	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
108	NC_015632	ACA	2	6	7613	7618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120993
109	NC_015632	GGA	2	6	7635	7640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336120993
110	NC_015632	TTA	2	6	7641	7646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
111	NC_015632	CAA	2	6	7717	7722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120993
112	NC_015632	ATT	2	6	7744	7749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
113	NC_015632	AAG	2	6	7810	7815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
114	NC_015632	TAT	2	6	7829	7834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
115	NC_015632	GTT	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336120993
116	NC_015632	TTC	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120993
117	NC_015632	ATT	2	6	7853	7858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
118	NC_015632	TGG	2	6	7863	7868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336120993
119	NC_015632	ATT	2	6	7961	7966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
120	NC_015632	GAA	2	6	8020	8025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
121	NC_015632	ATT	2	6	8076	8081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
122	NC_015632	GAA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
123	NC_015632	TAT	2	6	8091	8096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
124	NC_015632	ATA	2	6	8115	8120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
125	NC_015632	ATT	2	6	8191	8196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
126	NC_015632	ATA	2	6	8256	8261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
127	NC_015632	CAA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120993
128	NC_015632	AGA	3	9	8435	8443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
129	NC_015632	AGA	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
130	NC_015632	ATA	2	6	8470	8475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120993
131	NC_015632	AAG	2	6	8488	8493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
132	NC_015632	AGA	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120993
133	NC_015632	ATT	2	6	8568	8573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120993
134	NC_015632	AAC	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120993
135	NC_015632	AAT	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015632	TTA	2	6	8829	8834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015632	TTC	2	6	8859	8864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120994
138	NC_015632	ATC	2	6	9006	9011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120994
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141	NC_015632	TTC	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015632	ATA	2	6	9529	9534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015632	TTC	2	6	9734	9739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120995
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238	NC_015632	ATA	3	9	14752	14760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_015632	ATT	2	6	14792	14797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_015632	AAT	2	6	14886	14891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.