MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 469

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	AATG	2	8	7	14	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015632	TTA	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
3	NC_015632	TCT	2	6	152	157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
4	NC_015632	T	7	7	245	251	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
5	NC_015632	AT	3	6	260	265	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
6	NC_015632	TTTTTC	2	12	266	277	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	336120991
7	NC_015632	TTC	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
8	NC_015632	TAA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120991
9	NC_015632	TA	3	6	377	382	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
10	NC_015632	A	6	6	416	421	100 %	0 %	0 %	0 %	336120991
11	NC_015632	TTA	2	6	423	428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
12	NC_015632	CTC	2	6	433	438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336120991
13	NC_015632	ATT	2	6	458	463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
14	NC_015632	TTTA	2	8	464	471	25 %	75 %	0 %	0 %	336120991
15	NC_015632	T	6	6	491	496	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
16	NC_015632	TAA	2	6	506	511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120991
17	NC_015632	AT	3	6	513	518	50 %	50 %	0 %	0 %	336120991
18	NC_015632	TCT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
19	NC_015632	CAT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120991
20	NC_015632	A	7	7	749	755	100 %	0 %	0 %	0 %	336120991
21	NC_015632	TAT	2	6	764	769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
22	NC_015632	T	6	6	769	774	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
23	NC_015632	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
24	NC_015632	TTA	2	6	885	890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120991
25	NC_015632	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120991
26	NC_015632	T	6	6	1039	1044	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
27	NC_015632	CTTT	2	8	1095	1102	0 %	75 %	0 %	25 %	336120991
28	NC_015632	A	6	6	1119	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	336120991
29	NC_015632	CAC	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336120991
30	NC_015632	CGA	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336120991
31	NC_015632	T	6	6	1157	1162	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
32	NC_015632	ATTG	2	8	1201	1208	25 %	50 %	25 %	0 %	336120991
33	NC_015632	CTCC	2	8	1214	1221	0 %	25 %	0 %	75 %	336120991
34	NC_015632	T	6	6	1227	1232	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
35	NC_015632	T	7	7	1238	1244	0 %	100 %	0 %	0 %	336120991
36	NC_015632	ATA	3	9	1335	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015632	ATA	2	6	1351	1356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015632	T	6	6	1367	1372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015632	TAG	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015632	A	6	6	1453	1458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015632	CTC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015632	AT	3	6	1562	1567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015632	ATC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015632	ATTTAA	2	12	1601	1612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015632	T	7	7	1620	1626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015632	TAT	2	6	1660	1665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015632	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015632	CAA	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015632	T	6	6	1695	1700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015632	TA	3	6	1740	1745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015632	TA	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015632	A	8	8	1803	1810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015632	ACA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015632	TAA	3	9	1844	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015632	ATA	2	6	1874	1879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015632	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015632	ACT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015632	AT	3	6	1968	1973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015632	A	8	8	1978	1985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015632	TA	3	6	2012	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015632	A	7	7	2025	2031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015632	TAA	3	9	2034	2042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015632	A	8	8	2047	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015632	A	6	6	2059	2064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015632	TTAA	2	8	2065	2072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015632	ATAA	2	8	2125	2132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015632	A	6	6	2134	2139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015632	AATA	2	8	2153	2160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015632	TAA	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015632	TA	3	6	2191	2196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015632	TATAT	2	10	2227	2236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015632	A	8	8	2259	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015632	TA	3	6	2314	2319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015632	A	7	7	2343	2349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015632	A	7	7	2376	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015632	TA	3	6	2417	2422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015632	AAT	2	6	2426	2431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015632	AT	3	6	2471	2476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015632	TTTAT	2	10	2480	2489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015632	AC	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015632	AT	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015632	AC	3	6	2551	2556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015632	TGTA	2	8	2559	2566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015632	ATTA	2	8	2567	2574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015632	ATTA	2	8	2594	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015632	AAC	2	6	2602	2607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015632	AT	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015632	CAA	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120992
89	NC_015632	AT	3	6	2710	2715	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
90	NC_015632	TA	3	6	2716	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
91	NC_015632	A	6	6	2721	2726	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
92	NC_015632	TAA	2	6	2777	2782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
93	NC_015632	T	6	6	2816	2821	0 %	100 %	0 %	0 %	336120992
94	NC_015632	A	6	6	2836	2841	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
95	NC_015632	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
96	NC_015632	ATC	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120992
97	NC_015632	AATT	2	8	2947	2954	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
98	NC_015632	ATA	2	6	3051	3056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
99	NC_015632	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120992
100	NC_015632	TACA	2	8	3101	3108	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
101	NC_015632	AGA	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120992
102	NC_015632	AT	4	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
103	NC_015632	AT	3	6	3164	3169	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
104	NC_015632	CTA	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120992
105	NC_015632	A	7	7	3195	3201	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
106	NC_015632	AAT	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
107	NC_015632	TAA	3	9	3296	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
108	NC_015632	AAT	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
109	NC_015632	TGA	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
110	NC_015632	TAA	2	6	3410	3415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
111	NC_015632	TTA	2	6	3426	3431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120992
112	NC_015632	CTAA	2	8	3438	3445	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
113	NC_015632	TAAA	2	8	3448	3455	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
114	NC_015632	ATA	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
115	NC_015632	ATTA	2	8	3510	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
116	NC_015632	TTATA	2	10	3535	3544	40 %	60 %	0 %	0 %	336120992
117	NC_015632	CAA	2	6	3619	3624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120992
118	NC_015632	ATG	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
119	NC_015632	AT	3	6	3721	3726	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
120	NC_015632	A	7	7	3732	3738	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
121	NC_015632	AT	4	8	3773	3780	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
122	NC_015632	AT	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
123	NC_015632	GAT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
124	NC_015632	ACTA	2	8	3899	3906	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
125	NC_015632	TAA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
126	NC_015632	TAA	2	6	4000	4005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
127	NC_015632	GAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120992
128	NC_015632	TGA	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
129	NC_015632	ATA	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
130	NC_015632	GAT	2	6	4202	4207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
131	NC_015632	ATA	2	6	4215	4220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
132	NC_015632	AATA	2	8	4232	4239	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
133	NC_015632	ATA	2	6	4252	4257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120992
134	NC_015632	TGAA	2	8	4291	4298	50 %	25 %	25 %	0 %	336120992
135	NC_015632	AT	3	6	4306	4311	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
136	NC_015632	TA	3	6	4312	4317	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
137	NC_015632	AT	3	6	4335	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	336120992
138	NC_015632	GAT	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336120992
139	NC_015632	A	7	7	4353	4359	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
140	NC_015632	AATA	2	8	4367	4374	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
141	NC_015632	TAAA	2	8	4405	4412	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
142	NC_015632	ACTA	2	8	4422	4429	50 %	25 %	0 %	25 %	336120992
143	NC_015632	CA	3	6	4442	4447	50 %	0 %	0 %	50 %	336120992
144	NC_015632	TTTA	2	8	4544	4551	25 %	75 %	0 %	0 %	336120992
145	NC_015632	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120992
146	NC_015632	ATC	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120992
147	NC_015632	TG	3	6	4615	4620	0 %	50 %	50 %	0 %	336120992
148	NC_015632	AAGT	2	8	4693	4700	50 %	25 %	25 %	0 %	336120992
149	NC_015632	AGA	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336120992
150	NC_015632	AAAT	2	8	4762	4769	75 %	25 %	0 %	0 %	336120992
151	NC_015632	A	6	6	4781	4786	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
152	NC_015632	TGG	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336120992
153	NC_015632	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	336120992
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159	NC_015632	TA	3	6	5094	5099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015632	TAC	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_015632	A	7	7	5435	5441	100 %	0 %	0 %	0 %	336120993
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271	NC_015632	CAA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120993
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277	NC_015632	TTAA	2	8	8532	8539	50 %	50 %	0 %	0 %	336120993
278	NC_015632	AAAAT	2	10	8541	8550	80 %	20 %	0 %	0 %	336120993
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280	NC_015632	AAC	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120993
281	NC_015632	AT	3	6	8605	8610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015632	AAT	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015632	T	7	7	8627	8633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_015632	TA	3	6	8724	8729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_015632	TAT	2	6	13163	13168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120997
418	NC_015632	ATT	2	6	13173	13178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120997
419	NC_015632	ACC	2	6	13224	13229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_015632	TAT	2	6	13240	13245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_015632	ATATT	2	10	13261	13270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_015632	AAAT	2	8	13312	13319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015632	ATA	2	6	13329	13334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_015632	TA	3	6	13351	13356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_015632	GTATA	2	10	13358	13367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
426	NC_015632	A	7	7	13438	13444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_015632	ATTT	2	8	13451	13458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_015632	ACT	2	6	13504	13509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120998
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430	NC_015632	CTT	2	6	13529	13534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120998
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432	NC_015632	TAA	2	6	13571	13576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336120998
433	NC_015632	AAC	2	6	13611	13616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336120998
434	NC_015632	TAT	2	6	13623	13628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120998
435	NC_015632	TTA	2	6	13660	13665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120998
436	NC_015632	TTA	2	6	13753	13758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336120998
437	NC_015632	ACT	2	6	13765	13770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336120998
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442	NC_015632	TCT	2	6	13884	13889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120999
443	NC_015632	TCT	2	6	13944	13949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336120999
444	NC_015632	T	7	7	13964	13970	0 %	100 %	0 %	0 %	336120999
445	NC_015632	TGG	2	6	13978	13983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336120999
446	NC_015632	ATT	2	6	14036	14041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_015632	TAT	2	6	14054	14059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015632	ATA	2	6	14062	14067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015632	A	6	6	14137	14142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_015632	T	6	6	14165	14170	0 %	100 %	0 %	0 %	336121000
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453	NC_015632	TCTT	2	8	14204	14211	0 %	75 %	0 %	25 %	336121000
454	NC_015632	GTT	2	6	14263	14268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121000
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460	NC_015632	TCA	2	6	14560	14565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121000
461	NC_015632	CTT	2	6	14598	14603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121000
462	NC_015632	ATA	2	6	14617	14622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121000
463	NC_015632	TAT	2	6	14638	14643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_015632	TA	3	6	14721	14726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_015632	TA	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015632	ATA	3	9	14752	14760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_015632	TA	3	6	14759	14764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_015632	ATT	2	6	14792	14797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_015632	AAT	2	6	14886	14891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding