MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 126817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015576	GAC	2	6	37405	37410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988672
1002	NC_015576	GCA	2	6	37412	37417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988672
1003	NC_015576	TCG	2	6	37429	37434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988672
1004	NC_015576	GCC	2	6	37465	37470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988672
1005	NC_015576	TGCTGA	2	12	37493	37504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333988672
1006	NC_015576	GCC	2	6	37528	37533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988672
1007	NC_015576	CGA	2	6	37617	37622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988672
1008	NC_015576	GGGCC	2	10	37644	37653	0 %	0 %	60 %	40 %	333988672
1009	NC_015576	GC	3	6	37701	37706	0 %	0 %	50 %	50 %	333988672
1010	NC_015576	CGG	2	6	37740	37745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988672
1011	NC_015576	AAG	2	6	37796	37801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988672
1012	NC_015576	TCG	2	6	37962	37967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1013	NC_015576	CGT	2	6	38002	38007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1014	NC_015576	GGCC	2	8	38011	38018	0 %	0 %	50 %	50 %	333988673
1015	NC_015576	CCGAT	2	10	38108	38117	20 %	20 %	20 %	40 %	333988673
1016	NC_015576	GCT	2	6	38173	38178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1017	NC_015576	CTG	2	6	38243	38248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1018	NC_015576	GCG	3	9	38276	38284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988673
1019	NC_015576	GGTG	2	8	38302	38309	0 %	25 %	75 %	0 %	333988673
1020	NC_015576	TG	3	6	38346	38351	0 %	50 %	50 %	0 %	333988673
1021	NC_015576	GTT	2	6	38365	38370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988673
1022	NC_015576	GCG	3	9	38426	38434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988673
1023	NC_015576	CCG	2	6	38453	38458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988673
1024	NC_015576	AC	3	6	38482	38487	50 %	0 %	0 %	50 %	333988673
1025	NC_015576	CGG	2	6	38488	38493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988673
1026	NC_015576	GCG	2	6	38496	38501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988673
1027	NC_015576	GTGC	2	8	38561	38568	0 %	25 %	50 %	25 %	333988673
1028	NC_015576	CGG	2	6	38569	38574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988673
1029	NC_015576	GGT	2	6	38584	38589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988673
1030	NC_015576	CCCTTC	2	12	38609	38620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988673
1031	NC_015576	GCTG	2	8	38626	38633	0 %	25 %	50 %	25 %	333988673
1032	NC_015576	GCA	2	6	38643	38648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1033	NC_015576	GAC	2	6	38662	38667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1034	NC_015576	GCA	2	6	38677	38682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1035	NC_015576	GCT	2	6	38704	38709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1036	NC_015576	GGC	2	6	38718	38723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988673
1037	NC_015576	CAC	2	6	38743	38748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988673
1038	NC_015576	CGC	2	6	38764	38769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988673
1039	NC_015576	CGC	2	6	38791	38796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988673
1040	NC_015576	GTG	2	6	38810	38815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988673
1041	NC_015576	TGC	2	6	38820	38825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988673
1042	NC_015576	TCCG	2	8	38897	38904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_015576	TGA	2	6	38908	38913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015576	GC	3	6	38938	38943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_015576	CGA	2	6	38976	38981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015576	CGGC	2	8	39015	39022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_015576	CGG	2	6	39036	39041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015576	CGA	2	6	39072	39077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988674
1049	NC_015576	CGA	2	6	39090	39095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988674
1050	NC_015576	CGA	2	6	39177	39182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988674
1051	NC_015576	CCG	4	12	39218	39229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988674
1052	NC_015576	GCC	2	6	39267	39272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988675
1053	NC_015576	AGC	2	6	39290	39295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988675
1054	NC_015576	GGCC	2	8	39317	39324	0 %	0 %	50 %	50 %	333988675
1055	NC_015576	CGG	2	6	39374	39379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988675
1056	NC_015576	CGC	2	6	39422	39427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_015576	CAC	2	6	39450	39455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_015576	TC	3	6	39487	39492	0 %	50 %	0 %	50 %	333988676
1059	NC_015576	CGTC	2	8	39495	39502	0 %	25 %	25 %	50 %	333988676
1060	NC_015576	CGC	2	6	39511	39516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988676
1061	NC_015576	CGC	2	6	39518	39523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988676
1062	NC_015576	CGC	2	6	39530	39535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988676
1063	NC_015576	GACCG	2	10	39558	39567	20 %	0 %	40 %	40 %	333988676
1064	NC_015576	AGC	2	6	39577	39582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988676
1065	NC_015576	CCGC	2	8	39591	39598	0 %	0 %	25 %	75 %	333988677
1066	NC_015576	CGG	2	6	39600	39605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988677
1067	NC_015576	CGG	2	6	39620	39625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988677
1068	NC_015576	GCG	2	6	39628	39633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988677
1069	NC_015576	TCG	2	6	39687	39692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988677
1070	NC_015576	GCC	2	6	39706	39711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988677
1071	NC_015576	TCG	2	6	39726	39731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988677
1072	NC_015576	CCA	2	6	39752	39757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988677
1073	NC_015576	AGC	2	6	39795	39800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988677
1074	NC_015576	CGGG	2	8	39804	39811	0 %	0 %	75 %	25 %	333988677
1075	NC_015576	TTCGC	2	10	39962	39971	0 %	40 %	20 %	40 %	333988677
1076	NC_015576	CAG	2	6	39995	40000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988677
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1078	NC_015576	GTG	2	6	40097	40102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988677
1079	NC_015576	GGCG	2	8	40120	40127	0 %	0 %	75 %	25 %	333988677
1080	NC_015576	CCAC	2	8	40141	40148	25 %	0 %	0 %	75 %	333988677
1081	NC_015576	GCA	2	6	40162	40167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988677
1082	NC_015576	GCG	2	6	40173	40178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988677
1083	NC_015576	CGG	2	6	40219	40224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988677
1084	NC_015576	TCA	2	6	40225	40230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988677
1085	NC_015576	CCG	2	6	40266	40271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988677
1086	NC_015576	GT	3	6	40326	40331	0 %	50 %	50 %	0 %	333988677
1087	NC_015576	CGA	2	6	40390	40395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988677
1088	NC_015576	AGCG	2	8	40413	40420	25 %	0 %	50 %	25 %	333988677
1089	NC_015576	GCG	2	6	40439	40444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988677
1090	NC_015576	GC	3	6	40455	40460	0 %	0 %	50 %	50 %	333988677
1091	NC_015576	GCCC	2	8	40462	40469	0 %	0 %	25 %	75 %	333988677
1092	NC_015576	TGC	2	6	40514	40519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988677
1093	NC_015576	CCGTG	2	10	40572	40581	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_015576	GAACC	2	10	40626	40635	40 %	0 %	20 %	40 %	333988678
1095	NC_015576	GCT	2	6	40675	40680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988678
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1097	NC_015576	CGG	2	6	40741	40746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988678
1098	NC_015576	GCA	2	6	40756	40761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988678
1099	NC_015576	CCG	2	6	40803	40808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988678
1100	NC_015576	CTC	2	6	40838	40843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988678
1101	NC_015576	GCG	2	6	40863	40868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988678
1102	NC_015576	GCT	2	6	40876	40881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988678
1103	NC_015576	GCG	2	6	40895	40900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988678
1104	NC_015576	AGC	2	6	40908	40913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988678
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1106	NC_015576	TGG	2	6	41005	41010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988678
1107	NC_015576	CCT	2	6	41033	41038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_015576	AT	3	6	41116	41121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015576	CGG	2	6	41189	41194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015576	CAT	2	6	41268	41273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988679
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1112	NC_015576	GCT	2	6	41373	41378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988679
1113	NC_015576	CG	3	6	41439	41444	0 %	0 %	50 %	50 %	333988679
1114	NC_015576	GCCG	2	8	41445	41452	0 %	0 %	50 %	50 %	333988679
1115	NC_015576	CGT	3	9	41457	41465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988679
1116	NC_015576	CG	3	6	41538	41543	0 %	0 %	50 %	50 %	333988679
1117	NC_015576	CGG	2	6	41609	41614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988679
1118	NC_015576	GCTG	2	8	41619	41626	0 %	25 %	50 %	25 %	333988679
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1123	NC_015576	CGA	2	6	41757	41762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988679
1124	NC_015576	GC	3	6	41768	41773	0 %	0 %	50 %	50 %	333988679
1125	NC_015576	GTC	2	6	41775	41780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988679
1126	NC_015576	GGA	2	6	41823	41828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988679
1127	NC_015576	GC	3	6	41867	41872	0 %	0 %	50 %	50 %	333988679
1128	NC_015576	GC	3	6	41883	41888	0 %	0 %	50 %	50 %	333988679
1129	NC_015576	CGAG	2	8	41916	41923	25 %	0 %	50 %	25 %	333988679
1130	NC_015576	CGA	2	6	41925	41930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988679
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1158	NC_015576	GCCGG	2	10	42866	42875	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1159	NC_015576	CGA	2	6	42910	42915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988681
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1162	NC_015576	GGC	2	6	42982	42987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988681
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1226	NC_015576	ACG	2	6	45095	45100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1227	NC_015576	GTT	2	6	45108	45113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1230	NC_015576	CG	3	6	45150	45155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1231	NC_015576	GGGC	2	8	45177	45184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1232	NC_015576	TCGG	2	8	45212	45219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1233	NC_015576	G	6	6	45313	45318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1234	NC_015576	GGCC	2	8	45323	45330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1235	NC_015576	CGA	2	6	45338	45343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988685
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1237	NC_015576	TCA	2	6	45482	45487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988685
1238	NC_015576	CG	3	6	45492	45497	0 %	0 %	50 %	50 %	333988685
1239	NC_015576	GCC	2	6	45598	45603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988685
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1241	NC_015576	CCGCT	2	10	45660	45669	0 %	20 %	20 %	60 %	333988685
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1243	NC_015576	CCGCT	2	10	45678	45687	0 %	20 %	20 %	60 %	333988685
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1249	NC_015576	CCGA	2	8	45784	45791	25 %	0 %	25 %	50 %	333988685
1250	NC_015576	CCG	2	6	45799	45804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988685
1251	NC_015576	TGC	2	6	45815	45820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988685
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1253	NC_015576	CCA	2	6	45847	45852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988685
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1367	NC_015576	GC	4	8	50197	50204	0 %	0 %	50 %	50 %	333988688
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1370	NC_015576	CAG	2	6	50344	50349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988688
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1373	NC_015576	GTT	2	6	50404	50409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988688
1374	NC_015576	TCGGC	2	10	50421	50430	0 %	20 %	40 %	40 %	333988688
1375	NC_015576	GTCG	2	8	50434	50441	0 %	25 %	50 %	25 %	333988688
1376	NC_015576	CCG	3	9	50446	50454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988688
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1470	NC_015576	GCGCC	2	10	53206	53215	0 %	0 %	40 %	60 %	333988690
1471	NC_015576	GCCA	2	8	53232	53239	25 %	0 %	25 %	50 %	333988690
1472	NC_015576	CGGG	2	8	53265	53272	0 %	0 %	75 %	25 %	333988690
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1479	NC_015576	CGG	2	6	53556	53561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988690
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1481	NC_015576	ACC	2	6	53622	53627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988690
1482	NC_015576	GCACCA	2	12	53629	53640	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333988690
1483	NC_015576	GTG	2	6	53756	53761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988690
1484	NC_015576	TCG	2	6	53772	53777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988690
1485	NC_015576	AGT	2	6	53778	53783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988690
1486	NC_015576	CCGG	2	8	53820	53827	0 %	0 %	50 %	50 %	333988690
1487	NC_015576	GTC	2	6	53904	53909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1488	NC_015576	CGG	2	6	53964	53969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988691
1489	NC_015576	AGCCGC	2	12	53981	53992	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333988691
1490	NC_015576	TGG	2	6	54011	54016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988691
1491	NC_015576	GAT	2	6	54022	54027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988691
1492	NC_015576	GCC	2	6	54028	54033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988691
1493	NC_015576	CGT	2	6	54048	54053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988691
1494	NC_015576	GAG	2	6	54134	54139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988691
1495	NC_015576	TCGC	2	8	54156	54163	0 %	25 %	25 %	50 %	333988691
1496	NC_015576	GGC	2	6	54187	54192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988691
1497	NC_015576	GCA	2	6	54210	54215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988691
1498	NC_015576	CCGG	2	8	54216	54223	0 %	0 %	50 %	50 %	333988691
1499	NC_015576	CGG	2	6	54231	54236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988691
1500	NC_015576	TCA	2	6	54285	54290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988691

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