MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 126817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015576	GCC	2	6	19297	19302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988656
502	NC_015576	CGC	2	6	19342	19347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988656
503	NC_015576	CCG	2	6	19353	19358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988656
504	NC_015576	CGGCG	2	10	19407	19416	0 %	0 %	60 %	40 %	333988657
505	NC_015576	CCG	2	6	19423	19428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988657
506	NC_015576	GCG	2	6	19529	19534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988657
507	NC_015576	CGG	2	6	19562	19567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988657
508	NC_015576	CTG	2	6	19611	19616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988657
509	NC_015576	ATC	2	6	19636	19641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988657
510	NC_015576	TTAGC	2	10	19649	19658	20 %	40 %	20 %	20 %	333988657
511	NC_015576	CG	3	6	19691	19696	0 %	0 %	50 %	50 %	333988657
512	NC_015576	CCG	2	6	19768	19773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988657
513	NC_015576	TTC	2	6	19801	19806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988657
514	NC_015576	GCG	2	6	19808	19813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988657
515	NC_015576	GCG	3	9	19855	19863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988657
516	NC_015576	TGG	2	6	19880	19885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988657
517	NC_015576	GCC	2	6	20061	20066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988657
518	NC_015576	GCG	2	6	20110	20115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988657
519	NC_015576	GGT	2	6	20163	20168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988657
520	NC_015576	CGGG	2	8	20189	20196	0 %	0 %	75 %	25 %	333988657
521	NC_015576	GCG	2	6	20225	20230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988657
522	NC_015576	CTG	2	6	20268	20273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988657
523	NC_015576	ACA	2	6	20291	20296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988657
524	NC_015576	CCA	2	6	20360	20365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988657
525	NC_015576	CTC	2	6	20369	20374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988657
526	NC_015576	GCC	2	6	20379	20384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988657
527	NC_015576	CTG	2	6	20418	20423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988657
528	NC_015576	TGG	2	6	20438	20443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988657
529	NC_015576	GCC	2	6	20454	20459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988657
530	NC_015576	GAA	2	6	20478	20483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988657
531	NC_015576	GCT	2	6	20556	20561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988657
532	NC_015576	CCG	2	6	20603	20608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988657
533	NC_015576	CAG	2	6	20664	20669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988657
534	NC_015576	TCG	2	6	20710	20715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988657
535	NC_015576	AGC	2	6	20716	20721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988657
536	NC_015576	GC	3	6	20743	20748	0 %	0 %	50 %	50 %	333988657
537	NC_015576	CGG	2	6	20756	20761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988657
538	NC_015576	CAG	2	6	20793	20798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988657
539	NC_015576	CCG	2	6	20863	20868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988658
540	NC_015576	GCA	2	6	20941	20946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
541	NC_015576	CAG	2	6	20954	20959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
542	NC_015576	ACG	2	6	20977	20982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
543	NC_015576	CCG	2	6	20985	20990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988658
544	NC_015576	CGG	2	6	21088	21093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988658
545	NC_015576	CAG	2	6	21095	21100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
546	NC_015576	CACGAT	2	12	21146	21157	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333988658
547	NC_015576	GAT	2	6	21218	21223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988658
548	NC_015576	CGC	2	6	21236	21241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988658
549	NC_015576	GCC	2	6	21287	21292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988658
550	NC_015576	AAC	2	6	21306	21311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988658
551	NC_015576	CGC	2	6	21404	21409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988658
552	NC_015576	CAG	2	6	21428	21433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
553	NC_015576	CCG	2	6	21458	21463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988658
554	NC_015576	ACC	3	9	21477	21485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988658
555	NC_015576	ACG	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
556	NC_015576	ACA	2	6	21499	21504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988658
557	NC_015576	GGC	2	6	21560	21565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988658
558	NC_015576	CAG	2	6	21566	21571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
559	NC_015576	CG	3	6	21583	21588	0 %	0 %	50 %	50 %	333988658
560	NC_015576	GAA	2	6	21665	21670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988658
561	NC_015576	CAG	2	6	21674	21679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
562	NC_015576	CAG	2	6	21788	21793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
563	NC_015576	GGT	2	6	21841	21846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988658
564	NC_015576	AGC	2	6	21852	21857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
565	NC_015576	GGC	2	6	21922	21927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988658
566	NC_015576	GCG	2	6	21933	21938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988658
567	NC_015576	ATC	2	6	21969	21974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988658
568	NC_015576	CCA	2	6	22000	22005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988658
569	NC_015576	GCA	3	9	22009	22017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
570	NC_015576	GGCC	2	8	22126	22133	0 %	0 %	50 %	50 %	333988658
571	NC_015576	CGA	2	6	22135	22140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
572	NC_015576	CGA	2	6	22156	22161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
573	NC_015576	CAG	3	9	22178	22186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988658
574	NC_015576	CCG	2	6	22231	22236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988658
575	NC_015576	TCG	2	6	22260	22265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988658
576	NC_015576	GCC	2	6	22283	22288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988659
577	NC_015576	CGG	2	6	22318	22323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988659
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579	NC_015576	GGGCC	2	10	22379	22388	0 %	0 %	60 %	40 %	333988659
580	NC_015576	CGGT	2	8	22395	22402	0 %	25 %	50 %	25 %	333988659
581	NC_015576	GCCGG	2	10	22403	22412	0 %	0 %	60 %	40 %	333988659
582	NC_015576	GC	3	6	22421	22426	0 %	0 %	50 %	50 %	333988659
583	NC_015576	ACC	2	6	22438	22443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988659
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587	NC_015576	CGT	2	6	22527	22532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988659
588	NC_015576	CGGC	2	8	22542	22549	0 %	0 %	50 %	50 %	333988659
589	NC_015576	CTG	2	6	22564	22569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988659
590	NC_015576	GC	3	6	22570	22575	0 %	0 %	50 %	50 %	333988659
591	NC_015576	TGG	2	6	22576	22581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988659
592	NC_015576	TCA	2	6	22599	22604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988659
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595	NC_015576	CAG	2	6	22678	22683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
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598	NC_015576	CAG	2	6	22813	22818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
599	NC_015576	CAG	2	6	22822	22827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
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601	NC_015576	GCG	2	6	22863	22868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988659
602	NC_015576	GCA	2	6	22893	22898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
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604	NC_015576	TCG	3	9	22973	22981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988659
605	NC_015576	GTCGAC	2	12	23026	23037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333988659
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608	NC_015576	GC	3	6	23106	23111	0 %	0 %	50 %	50 %	333988659
609	NC_015576	CAG	2	6	23188	23193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
610	NC_015576	CCT	2	6	23295	23300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988659
611	NC_015576	TCG	2	6	23318	23323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988659
612	NC_015576	GTC	2	6	23344	23349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988659
613	NC_015576	GCA	2	6	23379	23384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
614	NC_015576	CG	3	6	23391	23396	0 %	0 %	50 %	50 %	333988659
615	NC_015576	CCAGCC	2	12	23412	23423	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333988659
616	NC_015576	G	6	6	23424	23429	0 %	0 %	100 %	0 %	333988659
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619	NC_015576	CAG	2	6	23542	23547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
620	NC_015576	TCG	4	12	23561	23572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988659
621	NC_015576	GCG	2	6	23585	23590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988659
622	NC_015576	GCCC	2	8	23625	23632	0 %	0 %	25 %	75 %	333988659
623	NC_015576	GCCAGC	2	12	23642	23653	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333988659
624	NC_015576	GTT	2	6	23683	23688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988659
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626	NC_015576	GCA	2	6	23727	23732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988659
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