MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 126817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015576	GC	4	8	180695	180702	0 %	0 %	50 %	50 %	333988815
5002	NC_015576	ACG	3	9	180780	180788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988815
5003	NC_015576	CGA	2	6	180796	180801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988815
5004	NC_015576	CGA	2	6	180805	180810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988815
5005	NC_015576	TAC	2	6	180866	180871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015576	GAC	2	6	180883	180888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015576	GCGTGC	2	12	180906	180917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015576	GCT	2	6	180925	180930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988816
5009	NC_015576	CGG	2	6	180935	180940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988816
5010	NC_015576	CGG	2	6	180950	180955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988816
5011	NC_015576	CCG	2	6	181007	181012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988816
5012	NC_015576	GTC	2	6	181064	181069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988816
5013	NC_015576	CGCTG	2	10	181089	181098	0 %	20 %	40 %	40 %	333988816
5014	NC_015576	TGG	2	6	181127	181132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988816
5015	NC_015576	CTG	2	6	181159	181164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988816
5016	NC_015576	CGG	2	6	181166	181171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988816
5017	NC_015576	CTC	2	6	181180	181185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988816
5018	NC_015576	CGC	2	6	181197	181202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988816
5019	NC_015576	GC	3	6	181230	181235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_015576	GCA	2	6	181349	181354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_015576	CGCC	2	8	181372	181379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5022	NC_015576	TGC	2	6	181396	181401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988817
5023	NC_015576	CGA	3	9	181432	181440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988817
5024	NC_015576	CGC	2	6	181543	181548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988817
5025	NC_015576	AC	3	6	181658	181663	50 %	0 %	0 %	50 %	333988818
5026	NC_015576	CAT	2	6	181694	181699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988818
5027	NC_015576	TCA	2	6	181720	181725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988818
5028	NC_015576	CGA	2	6	181730	181735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5029	NC_015576	GC	4	8	181743	181750	0 %	0 %	50 %	50 %	333988818
5030	NC_015576	CTT	2	6	181766	181771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988818
5031	NC_015576	CCG	2	6	181772	181777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988818
5032	NC_015576	AAC	2	6	181821	181826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988818
5033	NC_015576	GCG	2	6	181856	181861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988818
5034	NC_015576	TAC	2	6	181872	181877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988818
5035	NC_015576	CGG	2	6	181903	181908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988818
5036	NC_015576	GCC	2	6	181911	181916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988818
5037	NC_015576	CAT	2	6	181919	181924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988818
5038	NC_015576	ACA	2	6	181927	181932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988818
5039	NC_015576	GGC	2	6	182004	182009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988818
5040	NC_015576	CTG	2	6	182019	182024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5041	NC_015576	GAC	2	6	182037	182042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5042	NC_015576	CGA	3	9	182099	182107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5043	NC_015576	CTG	2	6	182121	182126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5044	NC_015576	CAC	2	6	182141	182146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988818
5045	NC_015576	GCC	2	6	182186	182191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988818
5046	NC_015576	TGA	2	6	182209	182214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988818
5047	NC_015576	TGG	2	6	182221	182226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988818
5048	NC_015576	GCC	2	6	182313	182318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988818
5049	NC_015576	CAC	2	6	182324	182329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988818
5050	NC_015576	GGT	2	6	182330	182335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988818
5051	NC_015576	GCCC	2	8	182408	182415	0 %	0 %	25 %	75 %	333988818
5052	NC_015576	GCT	2	6	182426	182431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5053	NC_015576	ACG	2	6	182461	182466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5054	NC_015576	AAG	2	6	182520	182525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988818
5055	NC_015576	GAT	2	6	182528	182533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988818
5056	NC_015576	TGG	2	6	182538	182543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988818
5057	NC_015576	TCG	2	6	182551	182556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5058	NC_015576	TAC	2	6	182562	182567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988818
5059	NC_015576	CGC	2	6	182600	182605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988818
5060	NC_015576	TCGG	2	8	182631	182638	0 %	25 %	50 %	25 %	333988818
5061	NC_015576	GGTGC	2	10	182652	182661	0 %	20 %	60 %	20 %	333988818
5062	NC_015576	CGA	2	6	182669	182674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5063	NC_015576	GGC	2	6	182724	182729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988818
5064	NC_015576	GAG	2	6	182823	182828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988818
5065	NC_015576	ACCG	2	8	182844	182851	25 %	0 %	25 %	50 %	333988818
5066	NC_015576	CCA	2	6	182855	182860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988818
5067	NC_015576	CGGG	2	8	182872	182879	0 %	0 %	75 %	25 %	333988818
5068	NC_015576	CTG	2	6	182910	182915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5069	NC_015576	TCAC	2	8	182917	182924	25 %	25 %	0 %	50 %	333988818
5070	NC_015576	GATG	2	8	182933	182940	25 %	25 %	50 %	0 %	333988818
5071	NC_015576	CGA	3	9	182960	182968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988818
5072	NC_015576	GAG	2	6	183036	183041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988818
5073	NC_015576	TGG	2	6	183151	183156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988818
5074	NC_015576	AGC	2	6	183200	183205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988819
5075	NC_015576	AAC	2	6	183245	183250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988819
5076	NC_015576	CGT	2	6	183348	183353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988819
5077	NC_015576	GAC	2	6	183415	183420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988819
5078	NC_015576	TCC	2	6	183566	183571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988819
5079	NC_015576	ATC	2	6	183653	183658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988819
5080	NC_015576	CGA	2	6	183667	183672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988819
5081	NC_015576	GGCGAG	2	12	183697	183708	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333988819
5082	NC_015576	GGC	2	6	183717	183722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988819
5083	NC_015576	CTCGAT	2	12	183739	183750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333988819
5084	NC_015576	TCG	2	6	183810	183815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988819
5085	NC_015576	GC	3	6	183836	183841	0 %	0 %	50 %	50 %	333988819
5086	NC_015576	GCC	2	6	183904	183909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988819
5087	NC_015576	GGT	3	9	183976	183984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988819
5088	NC_015576	CCGAA	2	10	184007	184016	40 %	0 %	20 %	40 %	333988819
5089	NC_015576	ACG	2	6	184017	184022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988819
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5092	NC_015576	CGG	2	6	184170	184175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988819
5093	NC_015576	GCCG	2	8	184180	184187	0 %	0 %	50 %	50 %	333988819
5094	NC_015576	TCC	2	6	184231	184236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_015576	CGGC	2	8	184268	184275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_015576	GC	3	6	184274	184279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_015576	GCT	2	6	184291	184296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_015576	AGG	2	6	184327	184332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988820
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5100	NC_015576	GCCC	3	12	184346	184357	0 %	0 %	25 %	75 %	333988820
5101	NC_015576	GCC	2	6	184400	184405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
5102	NC_015576	GGCCA	2	10	184412	184421	20 %	0 %	40 %	40 %	333988820
5103	NC_015576	CGC	2	6	184444	184449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
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5105	NC_015576	CGC	2	6	184471	184476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
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5108	NC_015576	CCG	2	6	184512	184517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
5109	NC_015576	GCC	2	6	184520	184525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
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5111	NC_015576	GCC	2	6	184538	184543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
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5119	NC_015576	CCG	2	6	184659	184664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
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5121	NC_015576	CCG	2	6	184689	184694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
5122	NC_015576	CCG	2	6	184698	184703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
5123	NC_015576	CGG	2	6	184723	184728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988820
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5164	NC_015576	CGC	2	6	185615	185620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5169	NC_015576	TCGAG	2	10	185730	185739	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5203	NC_015576	ATC	2	6	187201	187206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5206	NC_015576	ACTG	2	8	187277	187284	25 %	25 %	25 %	25 %	333988822
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5219	NC_015576	CGA	2	6	187790	187795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988822
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5223	NC_015576	G	6	6	187913	187918	0 %	0 %	100 %	0 %	333988822
5224	NC_015576	CGG	2	6	187934	187939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988822
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5229	NC_015576	GAT	2	6	188268	188273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988823
5230	NC_015576	GCC	3	9	188295	188303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988823
5231	NC_015576	CGA	2	6	188390	188395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
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5233	NC_015576	CAG	2	6	188457	188462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
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5236	NC_015576	GTT	2	6	188505	188510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988823
5237	NC_015576	CTG	2	6	188550	188555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988823
5238	NC_015576	CG	3	6	188588	188593	0 %	0 %	50 %	50 %	333988823
5239	NC_015576	GCC	2	6	188607	188612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988823
5240	NC_015576	GC	3	6	188640	188645	0 %	0 %	50 %	50 %	333988823
5241	NC_015576	GCA	2	6	188687	188692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
5242	NC_015576	TGG	2	6	188788	188793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988823
5243	NC_015576	GCA	2	6	188828	188833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
5244	NC_015576	GAA	2	6	188835	188840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988823
5245	NC_015576	GC	3	6	188877	188882	0 %	0 %	50 %	50 %	333988823
5246	NC_015576	ACG	2	6	188915	188920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
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5249	NC_015576	GATCC	2	10	188990	188999	20 %	20 %	20 %	40 %	333988823
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5317	NC_015576	GCC	2	6	191147	191152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5322	NC_015576	CCCG	2	8	191349	191356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5327	NC_015576	CG	4	8	191668	191675	0 %	0 %	50 %	50 %	333988826
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5329	NC_015576	GTC	2	6	191700	191705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988826
5330	NC_015576	GCC	2	6	191750	191755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988826
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5337	NC_015576	TCGA	2	8	191979	191986	25 %	25 %	25 %	25 %	333988826
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5347	NC_015576	CGAT	2	8	192315	192322	25 %	25 %	25 %	25 %	333988826
5348	NC_015576	CAG	2	6	192345	192350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988826
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5350	NC_015576	GCGG	2	8	192461	192468	0 %	0 %	75 %	25 %	333988826
5351	NC_015576	GGGCA	2	10	192505	192514	20 %	0 %	60 %	20 %	333988826
5352	NC_015576	GTT	2	6	192569	192574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988826
5353	NC_015576	CAC	2	6	192599	192604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988826
5354	NC_015576	CGG	2	6	192608	192613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988826
5355	NC_015576	GCT	2	6	192639	192644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5356	NC_015576	GCA	2	6	192664	192669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5357	NC_015576	CGG	2	6	192681	192686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988827
5358	NC_015576	TGCACA	2	12	192741	192752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333988827
5359	NC_015576	CGGC	2	8	192829	192836	0 %	0 %	50 %	50 %	333988827
5360	NC_015576	TGG	2	6	192867	192872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988827
5361	NC_015576	CCA	2	6	192889	192894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988827
5362	NC_015576	GACCT	2	10	192923	192932	20 %	20 %	20 %	40 %	333988827
5363	NC_015576	GCC	2	6	192969	192974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988827
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5482	NC_015576	GCA	2	6	197357	197362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988830
5483	NC_015576	CGA	2	6	197371	197376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988830
5484	NC_015576	CGG	2	6	197422	197427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988830
5485	NC_015576	CGA	2	6	197446	197451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988830
5486	NC_015576	CGC	2	6	197452	197457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988830
5487	NC_015576	GCCCG	2	10	197553	197562	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5488	NC_015576	CG	3	6	197613	197618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5489	NC_015576	GCT	2	6	197689	197694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988831
5490	NC_015576	GCC	2	6	197783	197788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988831
5491	NC_015576	GCCA	2	8	197858	197865	25 %	0 %	25 %	50 %	333988831
5492	NC_015576	CGG	2	6	197953	197958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988831
5493	NC_015576	GCCGGC	2	12	197962	197973	0 %	0 %	50 %	50 %	333988831
5494	NC_015576	CGG	2	6	198018	198023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988831
5495	NC_015576	TGTTCA	2	12	198024	198035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333988831
5496	NC_015576	AGC	3	9	198081	198089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988831
5497	NC_015576	GGC	2	6	198097	198102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988831
5498	NC_015576	CCA	2	6	198129	198134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988831
5499	NC_015576	GCCG	2	8	198173	198180	0 %	0 %	50 %	50 %	333988831
5500	NC_015576	AGC	2	6	198195	198200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988831

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