MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015572	TAC	2	6	163683	163688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981893
3002	NC_015572	CTA	2	6	163919	163924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981893
3003	NC_015572	T	6	6	163938	163943	0 %	100 %	0 %	0 %	333981893
3004	NC_015572	ATC	2	6	163956	163961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981893
3005	NC_015572	GTT	2	6	163977	163982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981893
3006	NC_015572	TAA	2	6	164018	164023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981893
3007	NC_015572	T	6	6	164040	164045	0 %	100 %	0 %	0 %	333981893
3008	NC_015572	TCA	2	6	164080	164085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981893
3009	NC_015572	GTT	2	6	164094	164099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981893
3010	NC_015572	T	6	6	164133	164138	0 %	100 %	0 %	0 %	333981893
3011	NC_015572	AAT	2	6	164171	164176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015572	GCC	2	6	164268	164273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_015572	CGCT	2	8	164295	164302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_015572	AGT	2	6	164306	164311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015572	AAC	2	6	164378	164383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015572	GTC	2	6	164462	164467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981894
3017	NC_015572	TGGG	2	8	164547	164554	0 %	25 %	75 %	0 %	333981894
3018	NC_015572	GC	3	6	164620	164625	0 %	0 %	50 %	50 %	333981894
3019	NC_015572	TTG	2	6	164636	164641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981894
3020	NC_015572	TTG	2	6	164697	164702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981894
3021	NC_015572	A	6	6	164730	164735	100 %	0 %	0 %	0 %	333981894
3022	NC_015572	CCG	2	6	164752	164757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981894
3023	NC_015572	CGCCC	2	10	164792	164801	0 %	0 %	20 %	80 %	333981894
3024	NC_015572	CGG	2	6	164806	164811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981894
3025	NC_015572	GCC	2	6	164834	164839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981894
3026	NC_015572	TTC	2	6	164876	164881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981894
3027	NC_015572	AAC	2	6	164934	164939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981894
3028	NC_015572	CGA	2	6	165043	165048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015572	ATT	2	6	165104	165109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981895
3030	NC_015572	GCG	2	6	165136	165141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981895
3031	NC_015572	AGA	2	6	165174	165179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981895
3032	NC_015572	GGC	2	6	165185	165190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981895
3033	NC_015572	GAA	2	6	165193	165198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981895
3034	NC_015572	GGC	2	6	165199	165204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981895
3035	NC_015572	GCC	2	6	165288	165293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981895
3036	NC_015572	TCG	2	6	165413	165418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981895
3037	NC_015572	TGG	2	6	165445	165450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981895
3038	NC_015572	CGG	3	9	165453	165461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981895
3039	NC_015572	GTG	2	6	165499	165504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981895
3040	NC_015572	CCGC	2	8	165518	165525	0 %	0 %	25 %	75 %	333981895
3041	NC_015572	A	6	6	165568	165573	100 %	0 %	0 %	0 %	333981895
3042	NC_015572	CGA	2	6	165579	165584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981895
3043	NC_015572	T	6	6	165588	165593	0 %	100 %	0 %	0 %	333981895
3044	NC_015572	CGG	2	6	165624	165629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981895
3045	NC_015572	CGA	2	6	165639	165644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981895
3046	NC_015572	TTG	2	6	165725	165730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981895
3047	NC_015572	GGGAGC	2	12	165755	165766	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333981895
3048	NC_015572	GGC	2	6	165850	165855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981895
3049	NC_015572	GCC	2	6	165882	165887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981895
3050	NC_015572	GCC	2	6	165889	165894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981895
3051	NC_015572	CGGC	2	8	166042	166049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_015572	ATT	2	6	166056	166061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015572	CCG	2	6	166075	166080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_015572	G	7	7	166103	166109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_015572	TGT	2	6	166208	166213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981896
3056	NC_015572	CCGG	2	8	166347	166354	0 %	0 %	50 %	50 %	333981896
3057	NC_015572	ACA	2	6	166451	166456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981896
3058	NC_015572	ATGCG	2	10	166468	166477	20 %	20 %	40 %	20 %	333981896
3059	NC_015572	GCCG	2	8	166486	166493	0 %	0 %	50 %	50 %	333981896
3060	NC_015572	TTA	2	6	166568	166573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981896
3061	NC_015572	CCG	2	6	166629	166634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981896
3062	NC_015572	AAAC	2	8	166776	166783	75 %	0 %	0 %	25 %	333981896
3063	NC_015572	CGG	2	6	166820	166825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981896
3064	NC_015572	GCA	2	6	166905	166910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981896
3065	NC_015572	GAG	2	6	166969	166974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981896
3066	NC_015572	GC	3	6	166977	166982	0 %	0 %	50 %	50 %	333981896
3067	NC_015572	GGC	2	6	167181	167186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981896
3068	NC_015572	AATC	2	8	167247	167254	50 %	25 %	0 %	25 %	333981896
3069	NC_015572	CCG	2	6	167297	167302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981896
3070	NC_015572	GTT	2	6	167316	167321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981896
3071	NC_015572	GGA	2	6	167361	167366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981896
3072	NC_015572	GTG	2	6	167398	167403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981896
3073	NC_015572	CCG	2	6	167453	167458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981896
3074	NC_015572	ACC	2	6	167462	167467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981896
3075	NC_015572	CGA	2	6	167472	167477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981896
3076	NC_015572	TACGTG	2	12	167479	167490	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333981896
3077	NC_015572	TGG	2	6	167519	167524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981896
3078	NC_015572	ACG	2	6	167561	167566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981896
3079	NC_015572	CCG	2	6	167645	167650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981896
3080	NC_015572	GAA	2	6	167683	167688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981896
3081	NC_015572	GTG	2	6	167761	167766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981896
3082	NC_015572	CGC	2	6	167789	167794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981896
3083	NC_015572	T	6	6	167799	167804	0 %	100 %	0 %	0 %	333981896
3084	NC_015572	ACG	2	6	167852	167857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981896
3085	NC_015572	TGG	2	6	167879	167884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981896
3086	NC_015572	ACG	2	6	167903	167908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981896
3087	NC_015572	AGC	2	6	167930	167935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981896
3088	NC_015572	CAT	2	6	167970	167975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981896
3089	NC_015572	GCC	2	6	167978	167983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981896
3090	NC_015572	TGG	2	6	168143	168148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981896
3091	NC_015572	GCT	2	6	168198	168203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981896
3092	NC_015572	AAT	2	6	168388	168393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015572	AGTC	2	8	168414	168421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_015572	AAAG	2	8	168509	168516	75 %	0 %	25 %	0 %	333981897
3095	NC_015572	T	6	6	168534	168539	0 %	100 %	0 %	0 %	333981897
3096	NC_015572	TTA	2	6	168557	168562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981897
3097	NC_015572	CTG	2	6	168563	168568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981897
3098	NC_015572	AAT	2	6	168576	168581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981897
3099	NC_015572	TCA	2	6	168638	168643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981897
3100	NC_015572	T	7	7	168703	168709	0 %	100 %	0 %	0 %	333981897
3101	NC_015572	GTT	2	6	168835	168840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981897
3102	NC_015572	GCA	2	6	168887	168892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981897
3103	NC_015572	CTG	2	6	168904	168909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981897
3104	NC_015572	T	6	6	168954	168959	0 %	100 %	0 %	0 %	333981897
3105	NC_015572	TTTG	2	8	168965	168972	0 %	75 %	25 %	0 %	333981897
3106	NC_015572	TGAC	2	8	169075	169082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_015572	GCG	2	6	169147	169152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_015572	GGC	2	6	169202	169207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981898
3109	NC_015572	GCA	2	6	169266	169271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981898
3110	NC_015572	GGC	2	6	169348	169353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981898
3111	NC_015572	ACGA	2	8	169382	169389	50 %	0 %	25 %	25 %	333981898
3112	NC_015572	GATC	2	8	169392	169399	25 %	25 %	25 %	25 %	333981898
3113	NC_015572	T	6	6	169420	169425	0 %	100 %	0 %	0 %	333981898
3114	NC_015572	ATC	2	6	169459	169464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981898
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3116	NC_015572	GCA	2	6	169530	169535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981898
3117	NC_015572	GCT	2	6	169582	169587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981898
3118	NC_015572	CGG	2	6	169638	169643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981898
3119	NC_015572	CGG	2	6	169666	169671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981898
3120	NC_015572	TGCC	2	8	169674	169681	0 %	25 %	25 %	50 %	333981898
3121	NC_015572	GCA	2	6	169716	169721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981898
3122	NC_015572	CGA	2	6	169737	169742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981898
3123	NC_015572	CGGG	2	8	169779	169786	0 %	0 %	75 %	25 %	333981898
3124	NC_015572	TTGC	2	8	169885	169892	0 %	50 %	25 %	25 %	333981898
3125	NC_015572	GCT	2	6	169953	169958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981898
3126	NC_015572	TCCG	2	8	169980	169987	0 %	25 %	25 %	50 %	333981898
3127	NC_015572	TCA	2	6	170025	170030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981898
3128	NC_015572	GTC	2	6	170041	170046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981898
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3130	NC_015572	TCC	2	6	170206	170211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333981898
3131	NC_015572	GGTATC	2	12	170224	170235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333981898
3132	NC_015572	GCA	2	6	170242	170247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981898
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3134	NC_015572	TCG	2	6	170279	170284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981898
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3138	NC_015572	CGT	2	6	170436	170441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981898
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3154	NC_015572	CAC	2	6	170947	170952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981898
3155	NC_015572	CAG	2	6	170984	170989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981898
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3157	NC_015572	GCCCGG	2	12	171106	171117	0 %	0 %	50 %	50 %	333981898
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3233	NC_015572	CGT	2	6	174915	174920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981901
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3235	NC_015572	CGG	2	6	175056	175061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981901
3236	NC_015572	CGA	2	6	175080	175085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981901
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3240	NC_015572	AGG	2	6	175187	175192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981901
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3242	NC_015572	CTG	2	6	175322	175327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981901
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3454	NC_015572	TTGT	2	8	185470	185477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3466	NC_015572	ATTT	2	8	185792	185799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3467	NC_015572	CTAAG	2	10	185807	185816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3468	NC_015572	GAG	2	6	185841	185846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3471	NC_015572	TCTA	2	8	185873	185880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3472	NC_015572	CGG	2	6	185882	185887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3491	NC_015572	TGGT	2	8	186943	186950	0 %	50 %	50 %	0 %	333981908
3492	NC_015572	TTA	2	6	187066	187071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981908
3493	NC_015572	ATGCC	2	10	187153	187162	20 %	20 %	20 %	40 %	333981908
3494	NC_015572	CGAT	2	8	187171	187178	25 %	25 %	25 %	25 %	333981908
3495	NC_015572	TAAC	2	8	187251	187258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3496	NC_015572	TTG	2	6	187271	187276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_015572	GCC	2	6	187294	187299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3498	NC_015572	GGC	2	6	187309	187314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_015572	A	8	8	187341	187348	100 %	0 %	0 %	0 %	333981909
3500	NC_015572	TTA	2	6	187353	187358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981909

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