MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 5244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	AT	3	6	323	328	50 %	50 %	0 %	0 %	333909896
2	NC_015562	GA	3	6	939	944	50 %	0 %	50 %	0 %	333909896
3	NC_015562	TA	3	6	994	999	50 %	50 %	0 %	0 %	333909896
4	NC_015562	GA	3	6	1757	1762	50 %	0 %	50 %	0 %	333909897
5	NC_015562	TA	3	6	3058	3063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015562	TC	3	6	4064	4069	0 %	50 %	0 %	50 %	333909899
7	NC_015562	TG	3	6	4195	4200	0 %	50 %	50 %	0 %	333909899
8	NC_015562	CT	3	6	5159	5164	0 %	50 %	0 %	50 %	333909900
9	NC_015562	TA	3	6	5647	5652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015562	TA	3	6	6288	6293	50 %	50 %	0 %	0 %	333909901
11	NC_015562	AG	3	6	6346	6351	50 %	0 %	50 %	0 %	333909901
12	NC_015562	CA	3	6	7174	7179	50 %	0 %	0 %	50 %	333909903
13	NC_015562	GA	3	6	7264	7269	50 %	0 %	50 %	0 %	333909903
14	NC_015562	AT	3	6	7480	7485	50 %	50 %	0 %	0 %	333909903
15	NC_015562	AT	3	6	7621	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	333909903
16	NC_015562	TA	3	6	8271	8276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015562	TA	3	6	8727	8732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015562	TC	3	6	9672	9677	0 %	50 %	0 %	50 %	333909904
19	NC_015562	CT	3	6	10004	10009	0 %	50 %	0 %	50 %	333909904
20	NC_015562	AT	3	6	10995	11000	50 %	50 %	0 %	0 %	333909905
21	NC_015562	CT	3	6	11650	11655	0 %	50 %	0 %	50 %	333909906
22	NC_015562	AT	3	6	12308	12313	50 %	50 %	0 %	0 %	333909906
23	NC_015562	TC	3	6	12331	12336	0 %	50 %	0 %	50 %	333909906
24	NC_015562	TA	3	6	12471	12476	50 %	50 %	0 %	0 %	333909906
25	NC_015562	TC	3	6	12999	13004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015562	AT	3	6	13681	13686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015562	GA	3	6	13990	13995	50 %	0 %	50 %	0 %	333909908
28	NC_015562	GA	4	8	14129	14136	50 %	0 %	50 %	0 %	333909908
29	NC_015562	GA	4	8	14223	14230	50 %	0 %	50 %	0 %	333909908
30	NC_015562	GA	3	6	14440	14445	50 %	0 %	50 %	0 %	333909908
31	NC_015562	AT	3	6	14856	14861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015562	AT	3	6	15057	15062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015562	TA	3	6	15079	15084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015562	AG	3	6	15497	15502	50 %	0 %	50 %	0 %	333909909
35	NC_015562	AT	4	8	16218	16225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015562	AG	3	6	16406	16411	50 %	0 %	50 %	0 %	333909910
37	NC_015562	CA	3	6	16477	16482	50 %	0 %	0 %	50 %	333909910
38	NC_015562	GA	3	6	16512	16517	50 %	0 %	50 %	0 %	333909910
39	NC_015562	AG	3	6	16538	16543	50 %	0 %	50 %	0 %	333909910
40	NC_015562	AG	3	6	16577	16582	50 %	0 %	50 %	0 %	333909910
41	NC_015562	AG	3	6	16665	16670	50 %	0 %	50 %	0 %	333909910
42	NC_015562	GA	3	6	16788	16793	50 %	0 %	50 %	0 %	333909910
43	NC_015562	TA	3	6	17399	17404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015562	AG	3	6	18242	18247	50 %	0 %	50 %	0 %	333909911
45	NC_015562	CT	3	6	18771	18776	0 %	50 %	0 %	50 %	333909911
46	NC_015562	AT	3	6	18801	18806	50 %	50 %	0 %	0 %	333909911
47	NC_015562	TC	3	6	18856	18861	0 %	50 %	0 %	50 %	333909911
48	NC_015562	GA	3	6	19133	19138	50 %	0 %	50 %	0 %	333909911
49	NC_015562	AG	3	6	19562	19567	50 %	0 %	50 %	0 %	333909911
50	NC_015562	AT	3	6	20346	20351	50 %	50 %	0 %	0 %	333909912
51	NC_015562	CT	3	6	20399	20404	0 %	50 %	0 %	50 %	333909912
52	NC_015562	CT	3	6	20622	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	333909912
53	NC_015562	TG	3	6	21001	21006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015562	TA	3	6	21174	21179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015562	CA	3	6	21185	21190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015562	TC	3	6	21344	21349	0 %	50 %	0 %	50 %	333909913
57	NC_015562	AC	3	6	21577	21582	50 %	0 %	0 %	50 %	333909914
58	NC_015562	AT	3	6	21916	21921	50 %	50 %	0 %	0 %	333909914
59	NC_015562	CT	3	6	22719	22724	0 %	50 %	0 %	50 %	333909915
60	NC_015562	AT	3	6	22917	22922	50 %	50 %	0 %	0 %	333909915
61	NC_015562	TA	3	6	23228	23233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015562	TA	3	6	23422	23427	50 %	50 %	0 %	0 %	333909916
63	NC_015562	AT	3	6	24609	24614	50 %	50 %	0 %	0 %	333909917
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65	NC_015562	CA	3	6	25420	25425	50 %	0 %	0 %	50 %	333909917
66	NC_015562	TA	3	6	25984	25989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015562	GA	4	8	26318	26325	50 %	0 %	50 %	0 %	333909918
68	NC_015562	GA	3	6	27003	27008	50 %	0 %	50 %	0 %	333909918
69	NC_015562	GA	3	6	27260	27265	50 %	0 %	50 %	0 %	333909918
70	NC_015562	AG	4	8	27637	27644	50 %	0 %	50 %	0 %	333909918
71	NC_015562	AG	3	6	27727	27732	50 %	0 %	50 %	0 %	333909918
72	NC_015562	GA	3	6	27769	27774	50 %	0 %	50 %	0 %	333909918
73	NC_015562	TA	3	6	28112	28117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015562	TA	3	6	28415	28420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015562	AT	3	6	28816	28821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015562	AT	4	8	28882	28889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015562	AT	3	6	28990	28995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015562	AT	3	6	29102	29107	50 %	50 %	0 %	0 %	333909919
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83	NC_015562	TC	3	6	31340	31345	0 %	50 %	0 %	50 %	333909920
84	NC_015562	TC	3	6	31927	31932	0 %	50 %	0 %	50 %	333909921
85	NC_015562	AT	3	6	31998	32003	50 %	50 %	0 %	0 %	333909921
86	NC_015562	TA	3	6	33292	33297	50 %	50 %	0 %	0 %	333909922
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89	NC_015562	AG	3	6	33878	33883	50 %	0 %	50 %	0 %	333909923
90	NC_015562	TA	3	6	34885	34890	50 %	50 %	0 %	0 %	333909923
91	NC_015562	GA	3	6	35092	35097	50 %	0 %	50 %	0 %	333909923
92	NC_015562	AT	3	6	35218	35223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015562	AT	3	6	35339	35344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015562	AT	4	8	35711	35718	50 %	50 %	0 %	0 %	333909924
95	NC_015562	AG	3	6	35893	35898	50 %	0 %	50 %	0 %	333909924
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98	NC_015562	TA	3	6	37060	37065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015562	TA	3	6	37093	37098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015562	TA	3	6	37173	37178	50 %	50 %	0 %	0 %	333909926
101	NC_015562	AT	3	6	37609	37614	50 %	50 %	0 %	0 %	333909926
102	NC_015562	TA	3	6	37746	37751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_015562	CT	4	8	40129	40136	0 %	50 %	0 %	50 %	333909928
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109	NC_015562	GA	3	6	41150	41155	50 %	0 %	50 %	0 %	333909929
110	NC_015562	AG	3	6	41546	41551	50 %	0 %	50 %	0 %	333909929
111	NC_015562	AT	3	6	41659	41664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015562	AT	3	6	42024	42029	50 %	50 %	0 %	0 %	333909930
113	NC_015562	TC	3	6	42144	42149	0 %	50 %	0 %	50 %	333909930
114	NC_015562	AT	3	6	42184	42189	50 %	50 %	0 %	0 %	333909930
115	NC_015562	AC	3	6	42321	42326	50 %	0 %	0 %	50 %	333909930
116	NC_015562	TA	3	6	42598	42603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015562	AT	3	6	42820	42825	50 %	50 %	0 %	0 %	333909931
118	NC_015562	TA	3	6	42945	42950	50 %	50 %	0 %	0 %	333909931
119	NC_015562	CT	3	6	43138	43143	0 %	50 %	0 %	50 %	333909931
120	NC_015562	GT	3	6	43432	43437	0 %	50 %	50 %	0 %	333909931
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122	NC_015562	CT	3	6	44159	44164	0 %	50 %	0 %	50 %	333909932
123	NC_015562	CT	3	6	44934	44939	0 %	50 %	0 %	50 %	333909932
124	NC_015562	AT	3	6	45418	45423	50 %	50 %	0 %	0 %	333909933
125	NC_015562	GA	3	6	45688	45693	50 %	0 %	50 %	0 %	333909933
126	NC_015562	AG	3	6	45727	45732	50 %	0 %	50 %	0 %	333909933
127	NC_015562	GA	3	6	45755	45760	50 %	0 %	50 %	0 %	333909933
128	NC_015562	TA	4	8	46426	46433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015562	AT	3	6	46743	46748	50 %	50 %	0 %	0 %	333909934
130	NC_015562	AT	3	6	47238	47243	50 %	50 %	0 %	0 %	333909934
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132	NC_015562	TC	3	6	51308	51313	0 %	50 %	0 %	50 %	333909936
133	NC_015562	AT	3	6	51909	51914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015562	TA	3	6	52013	52018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015562	AT	4	8	52094	52101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015562	AT	3	6	52185	52190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015562	TA	3	6	52213	52218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015562	AT	3	6	52493	52498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015562	AG	3	6	52639	52644	50 %	0 %	50 %	0 %	333909937
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141	NC_015562	AG	3	6	52792	52797	50 %	0 %	50 %	0 %	333909937
142	NC_015562	TG	3	6	52973	52978	0 %	50 %	50 %	0 %	333909937
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145	NC_015562	TG	3	6	53764	53769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015562	AT	3	6	53849	53854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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