MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 28207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
2	NC_015562	TTA	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
3	NC_015562	TAT	3	9	145	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
4	NC_015562	ATT	2	6	204	209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015562	TGA	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909896
6	NC_015562	GCA	3	9	396	404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
7	NC_015562	GCG	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333909896
8	NC_015562	AAT	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
9	NC_015562	AAT	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
10	NC_015562	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
11	NC_015562	TTG	2	6	787	792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
12	NC_015562	TAA	2	6	847	852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
13	NC_015562	AAG	2	6	853	858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909896
14	NC_015562	GTT	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
15	NC_015562	AGC	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
16	NC_015562	ATC	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909896
17	NC_015562	TGG	2	6	1073	1078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909896
18	NC_015562	TTG	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
19	NC_015562	GCA	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
20	NC_015562	TAA	2	6	1228	1233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015562	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015562	AAT	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015562	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909897
24	NC_015562	TAT	2	6	1491	1496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
25	NC_015562	TTA	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
26	NC_015562	ATT	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
27	NC_015562	GTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
28	NC_015562	TGA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
29	NC_015562	AAG	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
30	NC_015562	AGT	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
31	NC_015562	TGT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
32	NC_015562	GTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
33	NC_015562	TGT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
34	NC_015562	AGA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
35	NC_015562	ATG	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
36	NC_015562	AAG	3	9	2312	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
37	NC_015562	AGA	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
38	NC_015562	GAA	3	9	2333	2341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
39	NC_015562	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
40	NC_015562	ACA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909897
41	NC_015562	CAA	2	6	2535	2540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909897
42	NC_015562	TAC	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909897
43	NC_015562	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
44	NC_015562	GCA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909897
45	NC_015562	ATA	2	6	2740	2745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015562	ATT	2	6	2851	2856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015562	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015562	ATT	2	6	2893	2898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015562	TGG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015562	GTG	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015562	TCC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909898
52	NC_015562	TTG	2	6	3428	3433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909898
53	NC_015562	ATC	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909898
54	NC_015562	CTT	2	6	3641	3646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909898
55	NC_015562	TCC	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909898
56	NC_015562	ACA	2	6	3796	3801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909898
57	NC_015562	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909899
58	NC_015562	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909899
59	NC_015562	TGA	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909899
60	NC_015562	TCA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909899
61	NC_015562	CTT	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909899
62	NC_015562	AAC	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909899
63	NC_015562	TCT	2	6	4698	4703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909899
64	NC_015562	ATT	2	6	4783	4788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909899
65	NC_015562	AAG	2	6	4928	4933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
66	NC_015562	ACA	2	6	4953	4958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909900
67	NC_015562	AAT	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
68	NC_015562	TCA	3	9	5063	5071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909900
69	NC_015562	GAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
70	NC_015562	GAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909900
71	NC_015562	TAT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909900
72	NC_015562	GGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909900
73	NC_015562	GAA	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
74	NC_015562	GAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
75	NC_015562	ATA	2	6	5447	5452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
76	NC_015562	TAC	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909900
77	NC_015562	TAA	2	6	5625	5630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
78	NC_015562	AAT	2	6	5683	5688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015562	TTG	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909901
80	NC_015562	ATT	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
81	NC_015562	AGA	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
82	NC_015562	ATT	2	6	6001	6006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
83	NC_015562	AAG	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
84	NC_015562	GAA	2	6	6078	6083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
85	NC_015562	TAA	2	6	6085	6090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909901
86	NC_015562	AGA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
87	NC_015562	ATT	2	6	6153	6158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
88	NC_015562	TGG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909901
89	NC_015562	GCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909901
90	NC_015562	TTG	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909901
91	NC_015562	AGA	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
92	NC_015562	ATT	2	6	6326	6331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
93	NC_015562	TCT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909901
94	NC_015562	GTT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909901
95	NC_015562	AGA	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
96	NC_015562	GAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015562	GTT	2	6	6507	6512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909902
98	NC_015562	TAT	2	6	6528	6533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909902
99	NC_015562	AAT	2	6	6619	6624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909902
100	NC_015562	ATT	2	6	6688	6693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909902
101	NC_015562	AGA	2	6	6724	6729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909902
102	NC_015562	CAA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909902
103	NC_015562	TGT	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909902
104	NC_015562	GTG	2	6	7152	7157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909903
105	NC_015562	ATT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909903
106	NC_015562	TAA	2	6	7392	7397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909903
107	NC_015562	ACC	2	6	7455	7460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909903
108	NC_015562	CAA	2	6	7533	7538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909903
109	NC_015562	TGT	2	6	7675	7680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909903
110	NC_015562	ATG	2	6	7722	7727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909903
111	NC_015562	TAA	2	6	7767	7772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909903
112	NC_015562	AGG	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909903
113	NC_015562	GAA	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909903
114	NC_015562	ATA	2	6	7910	7915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909903
115	NC_015562	ACT	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015562	TTA	2	6	8350	8355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015562	ACA	2	6	8416	8421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015562	TAC	2	6	8424	8429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015562	TCA	2	6	8487	8492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015562	GAA	2	6	8629	8634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015562	ATT	2	6	8643	8648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015562	ATT	2	6	8809	8814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015562	AAT	2	6	8850	8855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015562	TGA	2	6	9103	9108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015562	TGA	2	6	9144	9149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015562	TTG	2	6	9429	9434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909904
127	NC_015562	GTT	2	6	9443	9448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909904
128	NC_015562	CAA	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909904
129	NC_015562	CAC	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909904
130	NC_015562	AGG	2	6	9680	9685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909904
131	NC_015562	CTC	2	6	9692	9697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909904
132	NC_015562	TTA	2	6	9730	9735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909904
133	NC_015562	CAA	3	9	9851	9859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909904
134	NC_015562	CCA	2	6	9879	9884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909904
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262	NC_015562	TGT	2	6	18785	18790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909911
263	NC_015562	AAG	2	6	18817	18822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909911
264	NC_015562	GAT	2	6	18867	18872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909911
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267	NC_015562	CAT	2	6	18969	18974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909911
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270	NC_015562	CAT	2	6	19274	19279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909911
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274	NC_015562	TTG	2	6	19623	19628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015562	TTC	2	6	19760	19765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909912
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