MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 1209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015562	TGAAAT	2	12	750224	750235	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910614
502	NC_015562	CAACAT	2	12	754024	754035	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333910617
503	NC_015562	TTTAAA	2	12	756449	756460	50 %	50 %	0 %	0 %	333910618
504	NC_015562	CGAGTT	2	12	756758	756769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333910619
505	NC_015562	ACACCA	2	12	758674	758685	50 %	0 %	0 %	50 %	333910621
506	NC_015562	TTCCAA	2	12	758852	758863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910621
507	NC_015562	GGTTTT	2	12	758874	758885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910621
508	NC_015562	TTAAAA	2	12	759912	759923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910622
509	NC_015562	TCTAAT	2	12	760618	760629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910624
510	NC_015562	TGAAAA	2	12	762187	762198	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910626
511	NC_015562	TGGTTC	2	12	762415	762426	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333910626
512	NC_015562	TTGGCA	2	12	767076	767087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333910631
513	NC_015562	ATTTTG	2	12	767425	767436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333910631
514	NC_015562	TTTTAT	2	12	769575	769586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333910632
515	NC_015562	CTATAA	2	12	771146	771157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_015562	AGAATT	2	12	771291	771302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910635
517	NC_015562	AAAGAT	2	12	771729	771740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910635
518	NC_015562	ATTTTT	2	12	781638	781649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015562	CAAAAA	2	12	784300	784311	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333910645
520	NC_015562	AAATAT	2	12	786186	786197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910647
521	NC_015562	AGCTGG	2	12	786722	786733	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333910648
522	NC_015562	TAAATA	2	12	787043	787054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910648
523	NC_015562	TTAAAT	2	12	789496	789507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015562	TGGAGC	2	12	789861	789872	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333910650
525	NC_015562	TAAAAA	2	12	790211	790222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015562	AAACAT	2	12	792177	792188	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333910651
527	NC_015562	TTCAAT	2	12	792700	792711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
528	NC_015562	TCTAAT	2	12	793108	793119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910652
529	NC_015562	AAAGAT	2	12	793174	793185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910652
530	NC_015562	TTTAGA	2	12	793257	793268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333910652
531	NC_015562	TTTATG	2	12	794746	794757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333910654
532	NC_015562	AACATT	2	12	796252	796263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333910656
533	NC_015562	GAAAAG	2	12	798555	798566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910658
534	NC_015562	AGAGGA	2	12	798983	798994	50 %	0 %	50 %	0 %	333910658
535	NC_015562	AAAGAA	3	18	801162	801179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910658
536	NC_015562	TGAAAA	2	12	801833	801844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910659
537	NC_015562	TTTTCG	2	12	802103	802114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_015562	TATTCA	2	12	803394	803405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910661
539	NC_015562	CAAAAA	2	12	806267	806278	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333910665
540	NC_015562	TTTTCT	2	12	810109	810120	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333910668
541	NC_015562	ATTTTA	2	12	810182	810193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910668
542	NC_015562	GAAAAA	2	12	811538	811549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910669
543	NC_015562	TATAAA	2	12	811750	811761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910669
544	NC_015562	AATTCA	2	12	814509	814520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333910673
545	NC_015562	CAACTA	2	12	815827	815838	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015562	ATTTTG	2	12	817152	817163	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015562	TAAGGA	2	12	817816	817827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333910676
548	NC_015562	TTGTTT	2	12	820683	820694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333910678
549	NC_015562	ATTTGG	2	12	823020	823031	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333910681
550	NC_015562	TTAGAT	2	12	824732	824743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333910682
551	NC_015562	AGCTGC	2	12	825596	825607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333910683
552	NC_015562	TGCTAT	2	12	825626	825637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333910683
553	NC_015562	AGAAGG	2	12	826125	826136	50 %	0 %	50 %	0 %	333910684
554	NC_015562	AATATA	2	12	827169	827180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015562	ATGTAG	2	12	827581	827592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910685
556	NC_015562	TTTTTA	2	12	830579	830590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333910690
557	NC_015562	GGATAA	2	12	836737	836748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333910697
558	NC_015562	TTTTTA	2	12	837696	837707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333910699
559	NC_015562	TAAATA	2	12	838257	838268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015562	AATGGA	2	12	838527	838538	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333910700
561	NC_015562	AAAAGA	2	12	838800	838811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910700
562	NC_015562	GCAATG	2	12	838819	838830	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333910700
563	NC_015562	ACTTCA	2	12	840942	840953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910701
564	NC_015562	TAACAA	2	12	843136	843147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333910704
565	NC_015562	TAAAAT	2	12	845745	845756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015562	TAAAAT	2	12	849291	849302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910710
567	NC_015562	TAAAAA	2	12	851410	851421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333910711
568	NC_015562	AATTAA	2	12	855458	855469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015562	AATCCC	2	12	857971	857982	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333910718
570	NC_015562	ATAACT	2	12	859055	859066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333910718
571	NC_015562	GAAATT	2	12	859130	859141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910718
572	NC_015562	TACAAT	2	12	862658	862669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
573	NC_015562	ATTGGT	2	12	863426	863437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333910722
574	NC_015562	CCAATA	2	12	864626	864637	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333910724
575	NC_015562	GTTAAA	2	12	865552	865563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910725
576	NC_015562	ATTTTT	2	12	865894	865905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015562	AGAAGG	2	12	866958	866969	50 %	0 %	50 %	0 %	333910726
578	NC_015562	TCTTTT	2	12	867297	867308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333910727
579	NC_015562	CTATCA	2	12	867513	867524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910727
580	NC_015562	TTATAT	2	12	872565	872576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015562	AAAAAT	2	12	872612	872623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015562	ATTTGA	2	12	873285	873296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333910733
583	NC_015562	AGGAAA	2	12	873773	873784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910734
584	NC_015562	AATTAA	2	12	874060	874071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910734
585	NC_015562	AAAGAA	2	12	878265	878276	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910738
586	NC_015562	ATTAAT	2	12	878847	878858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015562	GTTTTA	2	12	881874	881885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333910744
588	NC_015562	ATTTTT	2	12	882048	882059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015562	TTATTT	2	12	882300	882311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015562	TTTCTT	2	12	884868	884879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333910748
591	NC_015562	TTCAAA	2	12	886037	886048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333910749
592	NC_015562	TTCCAA	2	12	886556	886567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910749
593	NC_015562	TTTTTG	2	12	887400	887411	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333910750
594	NC_015562	TTTCAT	2	12	887430	887441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333910750
595	NC_015562	ATTAAA	2	12	887585	887596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910750
596	NC_015562	ACCCCA	2	12	887789	887800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910750
597	NC_015562	TATATT	2	12	889838	889849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910752
598	NC_015562	TTAACA	2	12	891820	891831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333910755
599	NC_015562	GAAAAA	2	12	892720	892731	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910756
600	NC_015562	CACATT	2	12	894583	894594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910759
601	NC_015562	AATTTC	2	12	894656	894667	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910759
602	NC_015562	CTTTAA	2	12	894718	894729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910759
603	NC_015562	GAATTG	2	12	895313	895324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910760
604	NC_015562	CTTTAA	2	12	896258	896269	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910760
605	NC_015562	CAACTT	2	12	896627	896638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910761
606	NC_015562	TATGTT	2	12	897276	897287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333910761
607	NC_015562	TTTTAT	2	12	898033	898044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015562	ATTTTT	2	12	901151	901162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015562	ACCATA	2	12	904317	904328	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333910767
610	NC_015562	ATTAGA	2	12	907186	907197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910770
611	NC_015562	CTTCAA	2	12	907377	907388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910771
612	NC_015562	CTCTAC	2	12	907545	907556	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333910771
613	NC_015562	TCTTCA	2	12	909071	909082	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333910774
614	NC_015562	TTCTTT	2	12	910164	910175	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333910776
615	NC_015562	ATTTCT	2	12	911006	911017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333910777
616	NC_015562	TATTCC	2	12	911672	911683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333910779
617	NC_015562	AATCTC	2	12	919922	919933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910794
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619	NC_015562	TTGCCC	2	12	924640	924651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333910797
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967	NC_015562	GGAGAT	2	12	1458788	1458799	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333911296
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998	NC_015562	ATGAAG	2	12	1501239	1501250	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333911332
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1000	NC_015562	CCTTAA	2	12	1506421	1506432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911336

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