MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 50717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015562	AGG	2	6	18101	18106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909911
502	NC_015562	GGA	2	6	18171	18176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909911
503	NC_015562	A	6	6	18212	18217	100 %	0 %	0 %	0 %	333909911
504	NC_015562	AG	3	6	18242	18247	50 %	0 %	50 %	0 %	333909911
505	NC_015562	TGG	2	6	18302	18307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909911
506	NC_015562	AAT	2	6	18356	18361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909911
507	NC_015562	AGA	2	6	18410	18415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909911
508	NC_015562	ATA	2	6	18445	18450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909911
509	NC_015562	AGG	2	6	18530	18535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909911
510	NC_015562	GGCAG	2	10	18536	18545	20 %	0 %	60 %	20 %	333909911
511	NC_015562	GAGTT	2	10	18613	18622	20 %	40 %	40 %	0 %	333909911
512	NC_015562	TCCA	2	8	18646	18653	25 %	25 %	0 %	50 %	333909911
513	NC_015562	AGG	2	6	18704	18709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909911
514	NC_015562	AAGGA	2	10	18756	18765	60 %	0 %	40 %	0 %	333909911
515	NC_015562	CT	3	6	18771	18776	0 %	50 %	0 %	50 %	333909911
516	NC_015562	TGT	2	6	18785	18790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909911
517	NC_015562	AT	3	6	18801	18806	50 %	50 %	0 %	0 %	333909911
518	NC_015562	AAG	2	6	18817	18822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909911
519	NC_015562	TC	3	6	18856	18861	0 %	50 %	0 %	50 %	333909911
520	NC_015562	GAT	2	6	18867	18872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909911
521	NC_015562	ATT	2	6	18876	18881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909911
522	NC_015562	GAG	2	6	18882	18887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909911
523	NC_015562	CAT	2	6	18969	18974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909911
524	NC_015562	GTTT	2	8	19024	19031	0 %	75 %	25 %	0 %	333909911
525	NC_015562	AGG	2	6	19076	19081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909911
526	NC_015562	GA	3	6	19133	19138	50 %	0 %	50 %	0 %	333909911
527	NC_015562	AGA	2	6	19187	19192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909911
528	NC_015562	CAT	2	6	19274	19279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909911
529	NC_015562	GAA	2	6	19308	19313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909911
530	NC_015562	A	7	7	19332	19338	100 %	0 %	0 %	0 %	333909911
531	NC_015562	A	6	6	19349	19354	100 %	0 %	0 %	0 %	333909911
532	NC_015562	G	6	6	19468	19473	0 %	0 %	100 %	0 %	333909911
533	NC_015562	AGA	2	6	19505	19510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909911
534	NC_015562	GGAAA	2	10	19513	19522	60 %	0 %	40 %	0 %	333909911
535	NC_015562	ATT	2	6	19524	19529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909911
536	NC_015562	AG	3	6	19562	19567	50 %	0 %	50 %	0 %	333909911
537	NC_015562	TTG	2	6	19623	19628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015562	ATAAAA	2	12	19664	19675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015562	T	6	6	19678	19683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015562	ATTT	2	8	19684	19691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015562	AAATC	2	10	19698	19707	60 %	20 %	0 %	20 %	333909912
542	NC_015562	AGGG	2	8	19724	19731	25 %	0 %	75 %	0 %	333909912
543	NC_015562	T	7	7	19732	19738	0 %	100 %	0 %	0 %	333909912
544	NC_015562	TTC	2	6	19760	19765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909912
545	NC_015562	TCG	2	6	19820	19825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333909912
546	NC_015562	T	6	6	19830	19835	0 %	100 %	0 %	0 %	333909912
547	NC_015562	TCT	2	6	19894	19899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909912
548	NC_015562	TAAA	2	8	19990	19997	75 %	25 %	0 %	0 %	333909912
549	NC_015562	CCA	2	6	20003	20008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909912
550	NC_015562	CAG	2	6	20028	20033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909912
551	NC_015562	CAA	2	6	20040	20045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909912
552	NC_015562	CAT	2	6	20055	20060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909912
553	NC_015562	T	6	6	20067	20072	0 %	100 %	0 %	0 %	333909912
554	NC_015562	T	6	6	20126	20131	0 %	100 %	0 %	0 %	333909912
555	NC_015562	AAT	2	6	20172	20177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909912
556	NC_015562	CTTT	2	8	20184	20191	0 %	75 %	0 %	25 %	333909912
557	NC_015562	T	6	6	20189	20194	0 %	100 %	0 %	0 %	333909912
558	NC_015562	CCT	2	6	20255	20260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909912
559	NC_015562	CAT	2	6	20290	20295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909912
560	NC_015562	TAA	2	6	20305	20310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909912
561	NC_015562	AT	3	6	20346	20351	50 %	50 %	0 %	0 %	333909912
562	NC_015562	CT	3	6	20399	20404	0 %	50 %	0 %	50 %	333909912
563	NC_015562	GCA	2	6	20414	20419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909912
564	NC_015562	TTC	2	6	20446	20451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909912
565	NC_015562	TCCA	2	8	20475	20482	25 %	25 %	0 %	50 %	333909912
566	NC_015562	CTT	3	9	20487	20495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909912
567	NC_015562	CAA	2	6	20502	20507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909912
568	NC_015562	T	6	6	20537	20542	0 %	100 %	0 %	0 %	333909912
569	NC_015562	GCT	2	6	20543	20548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333909912
570	NC_015562	TCTT	2	8	20574	20581	0 %	75 %	0 %	25 %	333909912
571	NC_015562	CAA	2	6	20583	20588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909912
572	NC_015562	CT	3	6	20622	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	333909912
573	NC_015562	ATC	2	6	20701	20706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909912
574	NC_015562	CTCC	2	8	20813	20820	0 %	25 %	0 %	75 %	333909912
575	NC_015562	CACAAC	2	12	20833	20844	50 %	0 %	0 %	50 %	333909912
576	NC_015562	ATG	2	6	20887	20892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015562	TAA	2	6	20934	20939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015562	TTTC	2	8	20962	20969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_015562	TTTAG	2	10	20975	20984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015562	TG	3	6	21001	21006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015562	GCT	2	6	21044	21049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_015562	GCTTC	2	10	21054	21063	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_015562	AAT	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015562	ACT	2	6	21134	21139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015562	A	6	6	21141	21146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015562	TA	3	6	21174	21179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015562	CA	3	6	21185	21190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015562	TAT	2	6	21195	21200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909913
589	NC_015562	CTA	2	6	21205	21210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909913
590	NC_015562	ATT	2	6	21263	21268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909913
591	NC_015562	ATT	2	6	21273	21278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909913
592	NC_015562	CAAC	2	8	21286	21293	50 %	0 %	0 %	50 %	333909913
593	NC_015562	TC	3	6	21344	21349	0 %	50 %	0 %	50 %	333909913
594	NC_015562	ATAGTT	2	12	21385	21396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015562	T	6	6	21406	21411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015562	TAA	2	6	21439	21444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015562	T	6	6	21453	21458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015562	ACAA	2	8	21516	21523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_015562	T	6	6	21558	21563	0 %	100 %	0 %	0 %	333909914
600	NC_015562	AC	3	6	21577	21582	50 %	0 %	0 %	50 %	333909914
601	NC_015562	CAA	2	6	21619	21624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909914
602	NC_015562	TGTA	2	8	21678	21685	25 %	50 %	25 %	0 %	333909914
603	NC_015562	T	6	6	21730	21735	0 %	100 %	0 %	0 %	333909914
604	NC_015562	TCTTT	2	10	21782	21791	0 %	80 %	0 %	20 %	333909914
605	NC_015562	TTA	3	9	21829	21837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909914
606	NC_015562	TCA	2	6	21846	21851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909914
607	NC_015562	AT	3	6	21916	21921	50 %	50 %	0 %	0 %	333909914
608	NC_015562	CAC	2	6	21925	21930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909914
609	NC_015562	GTT	2	6	21975	21980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909914
610	NC_015562	CTT	2	6	22021	22026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909914
611	NC_015562	T	6	6	22089	22094	0 %	100 %	0 %	0 %	333909914
612	NC_015562	GTT	2	6	22130	22135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909914
613	NC_015562	ACA	2	6	22242	22247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909914
614	NC_015562	TCA	2	6	22251	22256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909914
615	NC_015562	CTA	2	6	22290	22295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909914
616	NC_015562	TCC	2	6	22338	22343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909914
617	NC_015562	ATA	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909914
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619	NC_015562	T	6	6	22421	22426	0 %	100 %	0 %	0 %	333909915
620	NC_015562	TAAT	2	8	22444	22451	50 %	50 %	0 %	0 %	333909915
621	NC_015562	AAT	2	6	22458	22463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909915
622	NC_015562	ATC	2	6	22476	22481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909915
623	NC_015562	ATA	2	6	22485	22490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909915
624	NC_015562	GCA	2	6	22506	22511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909915
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626	NC_015562	CAA	2	6	22768	22773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909915
627	NC_015562	TCAAC	2	10	22795	22804	40 %	20 %	0 %	40 %	333909915
628	NC_015562	TTG	2	6	22837	22842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909915
629	NC_015562	AGT	2	6	22851	22856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909915
630	NC_015562	A	7	7	22872	22878	100 %	0 %	0 %	0 %	333909915
631	NC_015562	CTT	2	6	22884	22889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909915
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633	NC_015562	ATC	2	6	22935	22940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909915
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