MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 plasmid pMP1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015517	ATATAA	2	12	489	500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015517	AAAAGA	2	12	4910	4921	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332687282
3	NC_015517	AAGAAA	2	12	12986	12997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332687291
4	NC_015517	ATATAG	2	12	13286	13297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332687291
5	NC_015517	TTTTTG	2	12	15093	15104	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332687293
6	NC_015517	TTTTAG	2	12	15794	15805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015517	TTATAT	2	12	18250	18261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687296
8	NC_015517	AATTGA	2	12	18430	18441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332687296
9	NC_015517	TGCTTT	2	12	21058	21069	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332687298
10	NC_015517	CTTAAC	2	12	22564	22575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332687298
11	NC_015517	TAAAAC	2	12	23131	23142	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687299
12	NC_015517	TTTTGT	2	12	24221	24232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332687300
13	NC_015517	AGCAAA	2	12	24325	24336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332687300
14	NC_015517	TGAAAT	2	12	25633	25644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015517	AAATTT	2	12	26334	26345	50 %	50 %	0 %	0 %	332687302
16	NC_015517	TTTATT	2	12	27690	27701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015517	ATAACT	2	12	29051	29062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687304
18	NC_015517	TTTTAG	2	12	33949	33960	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687309
19	NC_015517	TACAAT	2	12	35055	35066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687310
20	NC_015517	ACGAAA	2	12	35869	35880	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332687311
21	NC_015517	CTCCTT	2	12	36414	36425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015517	ATTCTT	2	12	36578	36589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015517	AGGACT	2	12	37321	37332	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015517	TAATTG	2	12	38081	38092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015517	AAAATT	2	12	39591	39602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015517	TTATGC	2	12	41288	41299	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332687314
27	NC_015517	TTTTTA	2	12	43339	43350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687316
28	NC_015517	ACCAAG	2	12	46379	46390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332687319
29	NC_015517	ATATTG	2	12	48147	48158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015517	AAAATA	2	12	51777	51788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332687323
31	NC_015517	TGATTT	2	12	51889	51900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687323
32	NC_015517	CTAATG	2	12	58844	58855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687330
33	NC_015517	TATCAA	2	12	59516	59527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687330
34	NC_015517	ATAAAT	2	12	60095	60106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015517	TGAAAA	2	12	60478	60489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332687331
36	NC_015517	TGATTT	2	12	60613	60624	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687331
37	NC_015517	ATTTGA	2	12	64641	64652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332687335
38	NC_015517	GGAAAA	2	12	66603	66614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332687337
39	NC_015517	TAAAAA	2	12	69054	69065	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015517	AATTTT	2	12	69593	69604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687339
41	NC_015517	GTTAAA	2	12	72153	72164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015517	CTTTTT	2	12	72567	72578	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015517	GTAAAA	2	12	78652	78663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332687345
44	NC_015517	GAAAAA	2	12	79118	79129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332687346
45	NC_015517	TCAAAA	2	12	80234	80245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687347
46	NC_015517	ATTAGG	2	12	80506	80517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332687348
47	NC_015517	TTCTAT	2	12	80641	80652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332687348
48	NC_015517	TTTTTA	2	12	81298	81309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687349
49	NC_015517	GTCCAA	2	12	82353	82364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332687349
50	NC_015517	AATTAC	2	12	83877	83888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687350
51	NC_015517	TATTTT	2	12	86765	86776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015517	ATTTTT	2	12	90087	90098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687354
53	NC_015517	ATTTTT	2	12	91777	91788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687356
54	NC_015517	AATAGA	2	12	93390	93401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015517	TTTTGA	2	12	94369	94380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687360
56	NC_015517	ATTTAT	2	12	96346	96357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687361
57	NC_015517	ATGTTG	2	12	96843	96854	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332687361
58	NC_015517	GATTAT	2	12	98956	98967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332687362
59	NC_015517	ATTTAA	2	12	100321	100332	50 %	50 %	0 %	0 %	332687363
60	NC_015517	AATTTT	2	12	100756	100767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015517	GTTAAC	2	12	100977	100988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015517	AATTTA	2	12	100989	101000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015517	GAAATA	2	12	102142	102153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332687364
64	NC_015517	ATATTT	2	12	103619	103630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687365
65	NC_015517	AATAAA	2	12	104370	104381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015517	TAAAAA	2	12	104406	104417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015517	ATATTT	2	12	104542	104553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015517	CAATTG	2	12	108229	108240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687368
69	NC_015517	TTATAT	2	12	109405	109416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015517	TTTAAT	2	12	111304	111315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687370
71	NC_015517	ATATTA	2	12	111863	111874	50 %	50 %	0 %	0 %	332687370
72	NC_015517	TATAAA	2	12	113278	113289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015517	ATTAAA	2	12	116674	116685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015517	CATCTT	2	12	117734	117745	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332687374
75	NC_015517	TAATAT	2	12	118459	118470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015517	AAGATG	2	12	119922	119933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332687375
77	NC_015517	TTTTAA	2	12	120981	120992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015517	TGATAA	2	12	124977	124988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332687379
79	NC_015517	ATTAAT	2	12	125791	125802	50 %	50 %	0 %	0 %	332687379
80	NC_015517	ATTAAA	2	12	126352	126363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332687379
81	NC_015517	AAATAA	2	12	127396	127407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015517	ATATAA	2	12	128251	128262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015517	TAATAT	2	12	128287	128298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015517	GCAATT	2	12	129426	129437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687381
85	NC_015517	AATTTA	2	12	136635	136646	50 %	50 %	0 %	0 %	332687388
86	NC_015517	CACAAT	2	12	138191	138202	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332687389
87	NC_015517	AAATAA	2	12	138692	138703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332687389
88	NC_015517	GTAAAG	2	12	139467	139478	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332687389
89	NC_015517	ACATTG	2	12	148109	148120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687396
90	NC_015517	CCTGTT	2	12	148418	148429	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	332687396
91	NC_015517	TTGCAT	2	12	148719	148730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332687396
92	NC_015517	CTTTTG	2	12	149377	149388	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332687397
93	NC_015517	CTGTTT	2	12	149857	149868	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332687397
94	NC_015517	AATACA	2	12	150930	150941	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687399
95	NC_015517	CTACAC	2	12	151824	151835	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332687400
96	NC_015517	ATAAAA	2	12	152415	152426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332687400
97	NC_015517	ATTAAA	2	12	154116	154127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015517	TTTTTG	2	12	158028	158039	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332687405
99	NC_015517	TAATTA	2	12	158488	158499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015517	AAAGAC	2	12	158697	158708	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332687406
101	NC_015517	ATTAAA	2	12	159358	159369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332687406
102	NC_015517	TTTATT	2	12	160653	160664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015517	AGGATA	2	12	163551	163562	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332687411
104	NC_015517	ACATAA	2	12	166613	166624	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687413
105	NC_015517	TATTGA	2	12	167339	167350	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332687413
106	NC_015517	TCATTA	2	12	167780	167791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332687413
107	NC_015517	AATACT	2	12	172269	172280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687418
108	NC_015517	TAATTT	2	12	174892	174903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687419
109	NC_015517	AACCAA	2	12	174953	174964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332687419
110	NC_015517	GCTTCA	2	12	176809	176820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332687420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.