MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 21248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015435	CGA	2	6	15	20	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833868
2	NC_015435	TCA	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833868
3	NC_015435	CCT	2	6	69	74	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833868
4	NC_015435	AAG	2	6	244	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
5	NC_015435	AAC	2	6	253	258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833868
6	NC_015435	AGA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
7	NC_015435	TGA	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
8	NC_015435	ATT	2	6	526	531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833868
9	NC_015435	AAG	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
10	NC_015435	GAA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
11	NC_015435	TCC	2	6	612	617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833868
12	NC_015435	AAG	2	6	648	653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
13	NC_015435	TCC	2	6	658	663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833868
14	NC_015435	GCT	2	6	712	717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833868
15	NC_015435	GCT	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833868
16	NC_015435	CTT	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833868
17	NC_015435	AGA	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
18	NC_015435	AGA	2	6	937	942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
19	NC_015435	ATG	2	6	1048	1053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
20	NC_015435	TGA	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
21	NC_015435	TGA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
22	NC_015435	TTA	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833869
23	NC_015435	AGG	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833869
24	NC_015435	TCC	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833870
25	NC_015435	ATA	2	6	1739	1744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833870
26	NC_015435	CTA	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833870
27	NC_015435	CAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833870
28	NC_015435	CCT	2	6	2197	2202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833870
29	NC_015435	CCG	2	6	2516	2521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833870
30	NC_015435	ATG	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833871
31	NC_015435	TCA	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833871
32	NC_015435	ATC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833871
33	NC_015435	CGG	2	6	2962	2967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833871
34	NC_015435	CAT	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833872
35	NC_015435	CTT	2	6	3123	3128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833872
36	NC_015435	AGT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833872
37	NC_015435	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833872
38	NC_015435	ATA	2	6	3456	3461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833872
39	NC_015435	TCA	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833872
40	NC_015435	ACT	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833872
41	NC_015435	ACA	2	6	3720	3725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833872
42	NC_015435	CTT	2	6	3799	3804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833872
43	NC_015435	TTC	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833873
44	NC_015435	TTG	2	6	4131	4136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833873
45	NC_015435	TCC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833873
46	NC_015435	CTT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833873
47	NC_015435	CTT	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833874
48	NC_015435	AGA	2	6	4549	4554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833874
49	NC_015435	CAA	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833874
50	NC_015435	AGG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833874
51	NC_015435	CAT	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833874
52	NC_015435	AGG	2	6	4846	4851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833874
53	NC_015435	TGA	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833874
54	NC_015435	AAT	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833874
55	NC_015435	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833874
56	NC_015435	TGA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833874
57	NC_015435	CCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833874
58	NC_015435	GAT	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833874
59	NC_015435	GAA	2	6	5433	5438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833875
60	NC_015435	GTA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833875
61	NC_015435	ATT	2	6	5763	5768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833875
62	NC_015435	AAG	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833875
63	NC_015435	GAT	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833875
64	NC_015435	ATA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833875
65	NC_015435	GGA	2	6	5872	5877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833875
66	NC_015435	ACT	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015435	AAT	2	6	6124	6129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833876
68	NC_015435	AGG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833876
69	NC_015435	TCA	2	6	6316	6321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833876
70	NC_015435	GGT	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833876
71	NC_015435	ATC	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833876
72	NC_015435	ATA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833876
73	NC_015435	TAG	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833876
74	NC_015435	TGG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833876
75	NC_015435	GCA	2	6	6631	6636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833876
76	NC_015435	TCA	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833876
77	NC_015435	CTC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833876
78	NC_015435	GAG	2	6	6911	6916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833876
79	NC_015435	TAG	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833877
80	NC_015435	ATA	2	6	7367	7372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833877
81	NC_015435	TGA	2	6	7489	7494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833878
82	NC_015435	TCC	2	6	7537	7542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833878
83	NC_015435	AGA	2	6	7685	7690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833878
84	NC_015435	AAG	2	6	7698	7703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833878
85	NC_015435	GAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833878
86	NC_015435	TAA	2	6	7897	7902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833878
87	NC_015435	GAT	2	6	7935	7940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833878
88	NC_015435	TAG	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833878
89	NC_015435	GAT	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833878
90	NC_015435	GAT	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833878
91	NC_015435	GAG	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833878
92	NC_015435	ATG	3	9	8277	8285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833878
93	NC_015435	GAG	2	6	8294	8299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833878
94	NC_015435	GCC	2	6	8325	8330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833878
95	NC_015435	GCG	2	6	8337	8342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833878
96	NC_015435	CTT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833878
97	NC_015435	ATT	2	6	8547	8552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833878
98	NC_015435	GAT	2	6	8705	8710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015435	AGA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015435	AAG	2	6	9184	9189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833879
101	NC_015435	CTG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833879
102	NC_015435	GCT	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833879
103	NC_015435	TTC	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833879
104	NC_015435	ATA	2	6	9386	9391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833879
105	NC_015435	ATA	2	6	9530	9535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833879
106	NC_015435	ATG	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833879
107	NC_015435	TCA	2	6	9622	9627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833879
108	NC_015435	ACT	2	6	9639	9644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833879
109	NC_015435	TAT	2	6	9910	9915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833880
110	NC_015435	TAG	2	6	9947	9952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833880
111	NC_015435	TCG	2	6	9991	9996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833880
112	NC_015435	CTG	2	6	10162	10167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833880
113	NC_015435	TTC	2	6	10248	10253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833880
114	NC_015435	GAT	2	6	10369	10374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833880
115	NC_015435	TTA	2	6	10516	10521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833880
116	NC_015435	TCA	2	6	10608	10613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833880
117	NC_015435	GCT	2	6	10752	10757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833881
118	NC_015435	GCT	2	6	10770	10775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833881
119	NC_015435	TAG	2	6	10898	10903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833881
120	NC_015435	CTT	2	6	11064	11069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833881
121	NC_015435	TCA	2	6	11128	11133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833881
122	NC_015435	TCT	2	6	11166	11171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833881
123	NC_015435	TTG	2	6	11217	11222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833881
124	NC_015435	CAT	3	9	11266	11274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833881
125	NC_015435	CCT	2	6	11295	11300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833881
126	NC_015435	ATC	2	6	11327	11332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833881
127	NC_015435	TCC	2	6	11385	11390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833881
128	NC_015435	GTC	2	6	11541	11546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833881
129	NC_015435	AGC	2	6	11714	11719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833881
130	NC_015435	TCC	2	6	11861	11866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833881
131	NC_015435	TAT	2	6	11885	11890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833881
132	NC_015435	ACT	2	6	11894	11899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833881
133	NC_015435	CGC	2	6	12068	12073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833881
134	NC_015435	CAG	2	6	12082	12087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833881
135	NC_015435	TCC	2	6	12089	12094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833881
136	NC_015435	AAT	2	6	12098	12103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833881
137	NC_015435	ATG	2	6	12154	12159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833882
138	NC_015435	AGT	2	6	12257	12262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833882
139	NC_015435	ATT	3	9	12493	12501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833882
140	NC_015435	CGT	2	6	12555	12560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833882
141	NC_015435	ATT	2	6	12835	12840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833882
142	NC_015435	TTC	2	6	12863	12868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833882
143	NC_015435	TAT	2	6	12972	12977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833882
144	NC_015435	TCA	2	6	13099	13104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833882
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146	NC_015435	CTT	2	6	13211	13216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015435	TTC	3	9	13351	13359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833883
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149	NC_015435	CCT	2	6	13515	13520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833883
150	NC_015435	TTC	2	6	13696	13701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833883
151	NC_015435	ATT	2	6	13713	13718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833883
152	NC_015435	AAT	2	6	13747	13752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833883
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159	NC_015435	CTA	2	6	14472	14477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833884
160	NC_015435	TTC	2	6	14478	14483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833884
161	NC_015435	TAT	2	6	14500	14505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833884
162	NC_015435	CTA	2	6	14655	14660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833884
163	NC_015435	TAT	2	6	14800	14805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833884
164	NC_015435	AAT	2	6	14815	14820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833884
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182	NC_015435	GTG	2	6	16871	16876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_015435	CCT	2	6	21728	21733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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241	NC_015435	ATA	2	6	21893	21898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833891
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251	NC_015435	CTT	2	6	22796	22801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833891
252	NC_015435	CAT	2	6	22866	22871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833891
253	NC_015435	AAT	2	6	22911	22916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833891
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255	NC_015435	TAA	2	6	23195	23200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833892
256	NC_015435	TAA	2	6	23245	23250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833892
257	NC_015435	AGG	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833892
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261	NC_015435	TAT	2	6	23597	23602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833893
262	NC_015435	ATT	2	6	23701	23706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833893
263	NC_015435	TAT	2	6	23781	23786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833893
264	NC_015435	GGC	2	6	23851	23856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833893
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272	NC_015435	CTC	2	6	24400	24405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833894
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275	NC_015435	GAT	2	6	24501	24506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015435	TGG	2	6	24540	24545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833895
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500	NC_015435	AAG	2	6	42506	42511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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