MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanosaeta concilii GP6 plasmid pGP6

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015430	TAC	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015430	GTT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015430	GCT	2	6	142	147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506029
4	NC_015430	TTA	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506029
5	NC_015430	TAC	2	6	309	314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506029
6	NC_015430	CTG	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015430	TGA	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015430	TCT	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015430	ATG	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506030
10	NC_015430	ATC	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506030
11	NC_015430	GAA	2	6	825	830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506030
12	NC_015430	GGA	2	6	959	964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506030
13	NC_015430	ATA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506030
14	NC_015430	GGT	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015430	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015430	ATA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015430	CTC	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015430	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506031
19	NC_015430	GCT	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
20	NC_015430	TCA	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506031
21	NC_015430	GGC	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506031
22	NC_015430	AGC	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506031
23	NC_015430	TCT	2	6	1824	1829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506031
24	NC_015430	ATC	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506031
25	NC_015430	CTG	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
26	NC_015430	GGC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506031
27	NC_015430	GCT	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
28	NC_015430	GCT	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
29	NC_015430	TAG	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015430	ATC	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015430	CTG	2	6	2493	2498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506032
32	NC_015430	GCC	2	6	2527	2532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506032
33	NC_015430	GTT	2	6	2745	2750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015430	GCT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506033
35	NC_015430	TTA	2	6	2964	2969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506033
36	NC_015430	TAC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506033
37	NC_015430	CTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015430	TGA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015430	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015430	GAG	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015430	ATA	2	6	3446	3451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015430	ACC	2	6	3495	3500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015430	CTC	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015430	AAG	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015430	ACC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015430	TAT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506034
47	NC_015430	TCC	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506034
48	NC_015430	CAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506034
49	NC_015430	TTC	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
50	NC_015430	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506034
51	NC_015430	TGC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506034
52	NC_015430	TCA	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506034
53	NC_015430	TGT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506034
54	NC_015430	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506034
55	NC_015430	TTC	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
56	NC_015430	GCA	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506034
57	NC_015430	GCT	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506034
58	NC_015430	CTT	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
59	NC_015430	TAA	2	6	5339	5344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506034
60	NC_015430	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506034
61	NC_015430	CTT	2	6	5642	5647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
62	NC_015430	TTG	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015430	TCT	2	6	5952	5957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506035
64	NC_015430	CTT	2	6	5996	6001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506035
65	NC_015430	GTG	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506035
66	NC_015430	CAT	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506035
67	NC_015430	ATC	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506035
68	NC_015430	TGC	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506035
69	NC_015430	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506035
70	NC_015430	TGC	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506035
71	NC_015430	ATG	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506035
72	NC_015430	TGC	2	6	6563	6568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506035
73	NC_015430	TGA	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015430	TAC	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015430	ATT	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015430	GCC	2	6	6957	6962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015430	TCC	2	6	7020	7025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015430	AGC	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015430	TTC	2	6	7165	7170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015430	AAG	2	6	7183	7188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015430	CTC	3	9	7277	7285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506036
82	NC_015430	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506036
83	NC_015430	CCA	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506036
84	NC_015430	ATT	2	6	7493	7498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015430	TTA	2	6	7548	7553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015430	ATC	2	6	7661	7666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
87	NC_015430	GGC	2	6	7727	7732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506037
88	NC_015430	CTG	2	6	7788	7793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
89	NC_015430	TAG	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506037
90	NC_015430	CAG	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506037
91	NC_015430	TCA	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
92	NC_015430	TCT	2	6	7934	7939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
93	NC_015430	AAT	2	6	7983	7988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506037
94	NC_015430	TAC	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
95	NC_015430	TCG	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
96	NC_015430	GCA	2	6	8234	8239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506037
97	NC_015430	CAA	2	6	8289	8294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506037
98	NC_015430	TTC	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
99	NC_015430	GAA	2	6	8494	8499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506037
100	NC_015430	CCT	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506037
101	NC_015430	CTT	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
102	NC_015430	TTC	2	6	8614	8619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
103	NC_015430	TCA	2	6	8648	8653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
104	NC_015430	TTA	2	6	8703	8708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506037
105	NC_015430	GCT	2	6	8789	8794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
106	NC_015430	CAT	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
107	NC_015430	CCG	2	6	8879	8884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506037
108	NC_015430	GCA	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506037
109	NC_015430	ACC	2	6	8923	8928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506037
110	NC_015430	CTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
111	NC_015430	ATT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506037
112	NC_015430	AGG	2	6	9310	9315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506037
113	NC_015430	AGG	2	6	9319	9324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506037
114	NC_015430	CTT	2	6	9340	9345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
115	NC_015430	TGC	3	9	9379	9387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
116	NC_015430	TCC	2	6	9484	9489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506037
117	NC_015430	CCT	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506037
118	NC_015430	TCA	2	6	9569	9574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
119	NC_015430	CCG	2	6	9851	9856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506037
120	NC_015430	TCT	2	6	9917	9922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015430	CTT	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015430	AAG	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015430	AAG	2	6	10164	10169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506038
124	NC_015430	CCA	2	6	10202	10207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506038
125	NC_015430	GAT	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506038
126	NC_015430	CAG	2	6	10402	10407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506038
127	NC_015430	ATT	2	6	10410	10415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506038
128	NC_015430	GAT	2	6	10464	10469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506038
129	NC_015430	ACC	2	6	10529	10534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506038
130	NC_015430	TGG	2	6	10563	10568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506038
131	NC_015430	TCT	2	6	10697	10702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015430	TAT	2	6	10795	10800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015430	TGA	2	6	10862	10867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506039
134	NC_015430	TCT	2	6	10997	11002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506039
135	NC_015430	TGA	2	6	11198	11203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506039
136	NC_015430	TCT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506039
137	NC_015430	AAT	2	6	11442	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015430	TCG	2	6	11638	11643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506040
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142	NC_015430	ATT	2	6	11982	11987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015430	TTC	2	6	12098	12103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015430	GCA	2	6	12237	12242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_015430	AGA	2	6	12420	12425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506041
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152	NC_015430	ATT	2	6	13025	13030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015430	CAG	2	6	13123	13128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506043
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173	NC_015430	ATC	2	6	14908	14913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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204	NC_015430	CTC	2	6	17930	17935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
205	NC_015430	ATT	2	6	17952	17957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.