MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 61282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015416	AAG	2	6	49762	49767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015416	ATT	2	6	49818	49823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506365
1003	NC_015416	CTT	2	6	49949	49954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506365
1004	NC_015416	GCTG	2	8	49985	49992	0 %	25 %	50 %	25 %	330506365
1005	NC_015416	GACCT	2	10	50029	50038	20 %	20 %	20 %	40 %	330506365
1006	NC_015416	CAT	2	6	50057	50062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506365
1007	NC_015416	TAT	3	9	50086	50094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506365
1008	NC_015416	CCA	2	6	50161	50166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506365
1009	NC_015416	TAT	2	6	50176	50181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506365
1010	NC_015416	GGCA	2	8	50257	50264	25 %	0 %	50 %	25 %	330506365
1011	NC_015416	GGA	2	6	50332	50337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506365
1012	NC_015416	GAAC	2	8	50369	50376	50 %	0 %	25 %	25 %	330506365
1013	NC_015416	TGG	2	6	50468	50473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506365
1014	NC_015416	TAA	2	6	50495	50500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506365
1015	NC_015416	CACCAT	2	12	50576	50587	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330506365
1016	NC_015416	CTG	2	6	50603	50608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506365
1017	NC_015416	GCG	2	6	50732	50737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506365
1018	NC_015416	CCGG	2	8	50797	50804	0 %	0 %	50 %	50 %	330506365
1019	NC_015416	G	6	6	51129	51134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015416	TTA	2	6	51167	51172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015416	AAC	2	6	51193	51198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015416	CAC	2	6	51208	51213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_015416	GGA	2	6	51231	51236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015416	GTC	2	6	51270	51275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015416	ATT	2	6	51288	51293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015416	CAG	2	6	51315	51320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015416	TCA	2	6	51322	51327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015416	TGC	2	6	51332	51337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015416	AGG	2	6	51492	51497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506366
1030	NC_015416	TAC	2	6	51530	51535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506366
1031	NC_015416	GAT	2	6	51542	51547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506366
1032	NC_015416	CGG	2	6	51562	51567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506366
1033	NC_015416	AGA	2	6	51610	51615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506366
1034	NC_015416	GAT	2	6	51625	51630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506366
1035	NC_015416	AAG	2	6	51641	51646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506366
1036	NC_015416	GCG	2	6	51672	51677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506367
1037	NC_015416	AGC	2	6	51678	51683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506367
1038	NC_015416	TCT	2	6	51701	51706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506367
1039	NC_015416	A	6	6	51766	51771	100 %	0 %	0 %	0 %	330506367
1040	NC_015416	AGT	2	6	51837	51842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506367
1041	NC_015416	CAT	2	6	51843	51848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506367
1042	NC_015416	GGA	2	6	51876	51881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506367
1043	NC_015416	ATTTC	2	10	51937	51946	20 %	60 %	0 %	20 %	330506367
1044	NC_015416	CTA	2	6	51968	51973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506367
1045	NC_015416	ACG	2	6	52061	52066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506367
1046	NC_015416	ACC	2	6	52081	52086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506367
1047	NC_015416	CGTG	2	8	52251	52258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_015416	GC	3	6	52270	52275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_015416	GCC	2	6	52292	52297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_015416	GCC	2	6	52341	52346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_015416	CTA	2	6	52354	52359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015416	ATTTAT	2	12	52411	52422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015416	ATG	2	6	52424	52429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015416	TCA	2	6	52443	52448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015416	ATG	2	6	52517	52522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015416	GCA	2	6	52607	52612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015416	TC	3	6	52628	52633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_015416	TTG	2	6	52712	52717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015416	TCAG	2	8	52791	52798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_015416	AGG	2	6	52810	52815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015416	TG	3	6	52855	52860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015416	TC	3	6	52969	52974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_015416	CAG	2	6	53066	53071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015416	CTC	2	6	53108	53113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_015416	TCG	2	6	53121	53126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015416	GA	3	6	53143	53148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015416	TCC	2	6	53193	53198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_015416	AT	3	6	53223	53228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015416	TTA	2	6	53319	53324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015416	TTA	2	6	53551	53556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015416	TCC	2	6	53585	53590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_015416	TAT	2	6	53627	53632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015416	TGC	2	6	53655	53660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015416	TAC	2	6	53661	53666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015416	AGC	2	6	53670	53675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015416	ATT	2	6	53694	53699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015416	ACT	2	6	53700	53705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015416	CAT	2	6	53712	53717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506368
1079	NC_015416	ATC	2	6	53734	53739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506368
1080	NC_015416	TTC	2	6	53748	53753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506368
1081	NC_015416	GAA	2	6	53772	53777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506368
1082	NC_015416	CTC	2	6	53853	53858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506368
1083	NC_015416	GCT	2	6	53889	53894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506368
1084	NC_015416	TGT	2	6	54029	54034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506368
1085	NC_015416	CTG	2	6	54082	54087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506368
1086	NC_015416	TGCAT	2	10	54105	54114	20 %	40 %	20 %	20 %	330506368
1087	NC_015416	GCT	2	6	54115	54120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506368
1088	NC_015416	CGC	2	6	54186	54191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506368
1089	NC_015416	CA	3	6	54197	54202	50 %	0 %	0 %	50 %	330506368
1090	NC_015416	AGCT	2	8	54279	54286	25 %	25 %	25 %	25 %	330506368
1091	NC_015416	GAA	2	6	54321	54326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506368
1092	NC_015416	TATCT	2	10	54327	54336	20 %	60 %	0 %	20 %	330506368
1093	NC_015416	TTGG	2	8	54353	54360	0 %	50 %	50 %	0 %	330506368
1094	NC_015416	CG	3	6	54376	54381	0 %	0 %	50 %	50 %	330506368
1095	NC_015416	CATG	2	8	54431	54438	25 %	25 %	25 %	25 %	330506368
1096	NC_015416	ATT	2	6	54580	54585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015416	GAA	2	6	54669	54674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506369
1098	NC_015416	CAG	2	6	54742	54747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506369
1099	NC_015416	CGA	2	6	54812	54817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506369
1100	NC_015416	TGGG	2	8	55034	55041	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015416	CTC	2	6	55047	55052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_015416	TCT	2	6	55139	55144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015416	GCAG	2	8	55244	55251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_015416	G	7	7	55327	55333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015416	CTCG	2	8	55337	55344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_015416	CCT	2	6	55431	55436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506370
1107	NC_015416	CTG	2	6	55479	55484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506370
1108	NC_015416	GGA	2	6	55518	55523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506370
1109	NC_015416	G	6	6	55529	55534	0 %	0 %	100 %	0 %	330506370
1110	NC_015416	CAAG	2	8	55568	55575	50 %	0 %	25 %	25 %	330506370
1111	NC_015416	TGG	2	6	55607	55612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506370
1112	NC_015416	CCG	2	6	55629	55634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506370
1113	NC_015416	GGAC	2	8	55663	55670	25 %	0 %	50 %	25 %	330506370
1114	NC_015416	TGG	2	6	55692	55697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506370
1115	NC_015416	CCG	2	6	55716	55721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506370
1116	NC_015416	TGC	2	6	55793	55798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506370
1117	NC_015416	CG	3	6	55860	55865	0 %	0 %	50 %	50 %	330506370
1118	NC_015416	CCG	2	6	55905	55910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506370
1119	NC_015416	TCT	2	6	55981	55986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506370
1120	NC_015416	GAG	2	6	56001	56006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506370
1121	NC_015416	TGG	2	6	56045	56050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015416	GA	3	6	56135	56140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015416	A	6	6	56156	56161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015416	ATG	2	6	56183	56188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015416	TTC	2	6	56263	56268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506371
1126	NC_015416	GCT	2	6	56272	56277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506371
1127	NC_015416	TC	3	6	56287	56292	0 %	50 %	0 %	50 %	330506371
1128	NC_015416	TCC	2	6	56323	56328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506371
1129	NC_015416	TCC	3	9	56335	56343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506371
1130	NC_015416	T	6	6	56355	56360	0 %	100 %	0 %	0 %	330506371
1131	NC_015416	ATC	2	6	56367	56372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506371
1132	NC_015416	AAGG	2	8	56451	56458	50 %	0 %	50 %	0 %	330506371
1133	NC_015416	ACCA	2	8	56541	56548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_015416	ATT	2	6	56656	56661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015416	A	6	6	56764	56769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015416	ATTC	2	8	56863	56870	25 %	50 %	0 %	25 %	330506372
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1142	NC_015416	CAT	2	6	57291	57296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506373
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1148	NC_015416	TGG	2	6	57543	57548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_015416	ATC	2	6	57572	57577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_015416	CAAT	2	8	57611	57618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1151	NC_015416	TAT	2	6	57637	57642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_015416	AAT	2	6	57687	57692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_015416	TCT	2	6	57788	57793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1154	NC_015416	TGCAA	2	10	57812	57821	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1155	NC_015416	CAAAC	2	10	57842	57851	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1156	NC_015416	GC	3	6	57913	57918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1157	NC_015416	ACT	2	6	57928	57933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_015416	CAC	2	6	57935	57940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1161	NC_015416	GGCT	2	8	58070	58077	0 %	25 %	50 %	25 %	330506374
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1165	NC_015416	ATG	2	6	58183	58188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506374
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1169	NC_015416	TCC	2	6	58584	58589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506374
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1242	NC_015416	GCG	2	6	61940	61945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506374
1243	NC_015416	AAATA	2	10	61955	61964	80 %	20 %	0 %	0 %	330506374
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1250	NC_015416	TCCT	2	8	62456	62463	0 %	50 %	0 %	50 %	330506374
1251	NC_015416	AG	3	6	62466	62471	50 %	0 %	50 %	0 %	330506374
1252	NC_015416	AGTCC	2	10	62583	62592	20 %	20 %	20 %	40 %	330506374
1253	NC_015416	TC	3	6	62622	62627	0 %	50 %	0 %	50 %	330506374
1254	NC_015416	AGA	2	6	62662	62667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506374
1255	NC_015416	CTT	2	6	62704	62709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506374
1256	NC_015416	TGC	2	6	62748	62753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506374
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1258	NC_015416	GGGC	2	8	62777	62784	0 %	0 %	75 %	25 %	330506374
1259	NC_015416	TCT	2	6	62850	62855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506374
1260	NC_015416	TGA	2	6	62876	62881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506374
1261	NC_015416	TTC	2	6	62971	62976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506374
1262	NC_015416	TGCA	2	8	63027	63034	25 %	25 %	25 %	25 %	330506374
1263	NC_015416	GAC	2	6	63139	63144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506374
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1279	NC_015416	TCT	2	6	64277	64282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506374
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1282	NC_015416	CAG	2	6	64444	64449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506374
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1287	NC_015416	GAA	2	6	64856	64861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506374
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1291	NC_015416	GCA	2	6	65008	65013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506374
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1298	NC_015416	TGA	2	6	65469	65474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506374
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1314	NC_015416	CTGG	2	8	66398	66405	0 %	25 %	50 %	25 %	330506374
1315	NC_015416	CGA	2	6	66483	66488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506374
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1320	NC_015416	GA	3	6	66662	66667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1321	NC_015416	TCC	2	6	66679	66684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1322	NC_015416	GCA	2	6	66769	66774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506375
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1334	NC_015416	GAG	2	6	67309	67314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506376
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1342	NC_015416	GTC	2	6	67971	67976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506377
1343	NC_015416	GGAG	2	8	68032	68039	25 %	0 %	75 %	0 %	330506377
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1353	NC_015416	TC	3	6	68306	68311	0 %	50 %	0 %	50 %	330506377
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1367	NC_015416	AAG	2	6	68874	68879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506377
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1369	NC_015416	AG	3	6	68933	68938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1370	NC_015416	CTC	2	6	68987	68992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506378
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1374	NC_015416	G	6	6	69151	69156	0 %	0 %	100 %	0 %	330506378
1375	NC_015416	GAAAC	2	10	69270	69279	60 %	0 %	20 %	20 %	330506378
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1379	NC_015416	GAG	3	9	69342	69350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506378
1380	NC_015416	GAG	2	6	69365	69370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506378
1381	NC_015416	CAC	2	6	69371	69376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506378
1382	NC_015416	AGT	2	6	69428	69433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506378
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1384	NC_015416	GAAA	2	8	69471	69478	75 %	0 %	25 %	0 %	330506378
1385	NC_015416	TGAT	2	8	69481	69488	25 %	50 %	25 %	0 %	330506378
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1500	NC_015416	T	7	7	75187	75193	0 %	100 %	0 %	0 %	330506385

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