MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 56940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_015387	CAC	2	6	137546	137551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949674
3503	NC_015387	CCT	2	6	137629	137634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949674
3504	NC_015387	TCC	2	6	137700	137705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949674
3505	NC_015387	AGCG	2	8	137708	137715	25 %	0 %	50 %	25 %	328949674
3506	NC_015387	CGGG	2	8	137734	137741	0 %	0 %	75 %	25 %	328949674
3507	NC_015387	GC	3	6	137744	137749	0 %	0 %	50 %	50 %	328949674
3508	NC_015387	CGG	2	6	137754	137759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949674
3509	NC_015387	TGCG	2	8	137799	137806	0 %	25 %	50 %	25 %	328949674
3510	NC_015387	GAG	2	6	137813	137818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949674
3511	NC_015387	CGC	2	6	137828	137833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949674
3512	NC_015387	CAAG	2	8	137836	137843	50 %	0 %	25 %	25 %	328949674
3513	NC_015387	ACA	2	6	137850	137855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949674
3514	NC_015387	GGA	2	6	137950	137955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949674
3515	NC_015387	GGA	2	6	137959	137964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949674
3516	NC_015387	CGC	2	6	137980	137985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949674
3517	NC_015387	GC	3	6	138031	138036	0 %	0 %	50 %	50 %	328949674
3518	NC_015387	GCC	2	6	138120	138125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949674
3519	NC_015387	GGC	3	9	138126	138134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949674
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3521	NC_015387	GTA	2	6	138174	138179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949675
3522	NC_015387	AGG	2	6	138193	138198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949675
3523	NC_015387	CTT	2	6	138206	138211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949675
3524	NC_015387	CG	3	6	138261	138266	0 %	0 %	50 %	50 %	328949675
3525	NC_015387	GAG	2	6	138276	138281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949675
3526	NC_015387	ACC	2	6	138298	138303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949675
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3529	NC_015387	CTC	2	6	138432	138437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949675
3530	NC_015387	GGGA	2	8	138457	138464	25 %	0 %	75 %	0 %	328949675
3531	NC_015387	CTC	2	6	138474	138479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949675
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3533	NC_015387	CGC	2	6	138489	138494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949675
3534	NC_015387	CG	3	6	138553	138558	0 %	0 %	50 %	50 %	328949675
3535	NC_015387	GCT	2	6	138568	138573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949675
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3537	NC_015387	CGG	2	6	138589	138594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949675
3538	NC_015387	GGGGAC	2	12	138639	138650	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	328949675
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3541	NC_015387	GGC	2	6	138762	138767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949675
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3543	NC_015387	AGGTG	2	10	138806	138815	20 %	20 %	60 %	0 %	328949675
3544	NC_015387	CGGG	2	8	138848	138855	0 %	0 %	75 %	25 %	328949675
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3552	NC_015387	CCT	3	9	139079	139087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949675
3553	NC_015387	GTC	2	6	139104	139109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949675
3554	NC_015387	GTG	2	6	139132	139137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949675
3555	NC_015387	GAG	2	6	139162	139167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949675
3556	NC_015387	GTC	2	6	139179	139184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949675
3557	NC_015387	CCT	2	6	139196	139201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949675
3558	NC_015387	GGC	2	6	139209	139214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949675
3559	NC_015387	GCG	2	6	139219	139224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949675
3560	NC_015387	CGGC	2	8	139241	139248	0 %	0 %	50 %	50 %	328949675
3561	NC_015387	GCG	2	6	139252	139257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949675
3562	NC_015387	CCG	2	6	139262	139267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949675
3563	NC_015387	CGA	2	6	139331	139336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949675
3564	NC_015387	GTCCG	2	10	139344	139353	0 %	20 %	40 %	40 %	328949675
3565	NC_015387	CCGG	2	8	139521	139528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_015387	GTA	2	6	139534	139539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015387	C	6	6	139638	139643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3568	NC_015387	CGGG	2	8	139650	139657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_015387	G	6	6	139655	139660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015387	CGC	2	6	139674	139679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_015387	GAT	2	6	139695	139700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949676
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3573	NC_015387	C	7	7	139725	139731	0 %	0 %	0 %	100 %	328949676
3574	NC_015387	CAG	2	6	139747	139752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949676
3575	NC_015387	CTG	2	6	139753	139758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949676
3576	NC_015387	GCGCC	2	10	139848	139857	0 %	0 %	40 %	60 %	328949676
3577	NC_015387	TGC	2	6	139892	139897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949676
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3585	NC_015387	GCC	2	6	140182	140187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949676
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3588	NC_015387	TGG	2	6	140261	140266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949676
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3591	NC_015387	GATC	2	8	140382	140389	25 %	25 %	25 %	25 %	328949676
3592	NC_015387	GCT	2	6	140415	140420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949676
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3596	NC_015387	ACG	2	6	140543	140548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949676
3597	NC_015387	CGC	2	6	140565	140570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949676
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3601	NC_015387	CG	3	6	140739	140744	0 %	0 %	50 %	50 %	328949676
3602	NC_015387	GCG	3	9	140742	140750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949676
3603	NC_015387	GTGGAG	2	12	140785	140796	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	328949676
3604	NC_015387	TGG	3	9	140821	140829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949677
3605	NC_015387	GCG	2	6	140877	140882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949677
3606	NC_015387	CG	3	6	140911	140916	0 %	0 %	50 %	50 %	328949677
3607	NC_015387	GCG	2	6	140938	140943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949677
3608	NC_015387	GTG	2	6	141012	141017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949677
3609	NC_015387	CTC	2	6	141030	141035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949677
3610	NC_015387	GGCGG	2	10	141038	141047	0 %	0 %	80 %	20 %	328949677
3611	NC_015387	GCG	2	6	141128	141133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949677
3612	NC_015387	CCA	2	6	141139	141144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949677
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3616	NC_015387	GC	3	6	141287	141292	0 %	0 %	50 %	50 %	328949677
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3619	NC_015387	GC	3	6	141331	141336	0 %	0 %	50 %	50 %	328949677
3620	NC_015387	GTG	2	6	141342	141347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949677
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3622	NC_015387	TGC	2	6	141379	141384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949677
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3998	NC_015387	CG	3	6	156002	156007	0 %	0 %	50 %	50 %	328949693
3999	NC_015387	TCT	2	6	156048	156053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949693
4000	NC_015387	AGA	2	6	156066	156071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949693

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