MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 56940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015387	TCC	2	6	58236	58241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949593
1502	NC_015387	CG	4	8	58294	58301	0 %	0 %	50 %	50 %	328949593
1503	NC_015387	GGCG	2	8	58315	58322	0 %	0 %	75 %	25 %	328949593
1504	NC_015387	GGGGT	2	10	58338	58347	0 %	20 %	80 %	0 %	328949593
1505	NC_015387	GGC	2	6	58349	58354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949593
1506	NC_015387	GAG	2	6	58358	58363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949593
1507	NC_015387	GGC	2	6	58441	58446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949593
1508	NC_015387	GTC	2	6	58475	58480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949593
1509	NC_015387	GCC	2	6	58515	58520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949593
1510	NC_015387	GCG	2	6	58521	58526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949593
1511	NC_015387	GC	3	6	58546	58551	0 %	0 %	50 %	50 %	328949593
1512	NC_015387	TGGGCC	2	12	58554	58565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	328949593
1513	NC_015387	GAG	3	9	58571	58579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949593
1514	NC_015387	GGA	2	6	58588	58593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949593
1515	NC_015387	GCC	2	6	58598	58603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949593
1516	NC_015387	GGA	2	6	58621	58626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949593
1517	NC_015387	CGGGG	2	10	58648	58657	0 %	0 %	80 %	20 %	328949593
1518	NC_015387	GGC	2	6	58658	58663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949593
1519	NC_015387	GAG	2	6	58685	58690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949593
1520	NC_015387	G	6	6	58736	58741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015387	GGT	2	6	58760	58765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015387	CGA	2	6	58818	58823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_015387	GGCGA	2	10	58836	58845	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1524	NC_015387	GAGG	2	8	58949	58956	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015387	TCGCGC	2	12	58989	59000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	328949594
1526	NC_015387	GGCGT	2	10	59009	59018	0 %	20 %	60 %	20 %	328949594
1527	NC_015387	CGT	2	6	59053	59058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949594
1528	NC_015387	CGC	2	6	59104	59109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949594
1529	NC_015387	TGA	2	6	59205	59210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949594
1530	NC_015387	ATA	2	6	59226	59231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949594
1531	NC_015387	GTG	2	6	59270	59275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949594
1532	NC_015387	GGT	2	6	59310	59315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949594
1533	NC_015387	CTGGG	2	10	59465	59474	0 %	20 %	60 %	20 %	328949594
1534	NC_015387	AAG	2	6	59495	59500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949594
1535	NC_015387	CGA	2	6	59521	59526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949594
1536	NC_015387	CGGCG	2	10	59551	59560	0 %	0 %	60 %	40 %	328949594
1537	NC_015387	TAC	2	6	59612	59617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949594
1538	NC_015387	GGA	2	6	59662	59667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949594
1539	NC_015387	CCG	2	6	59669	59674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949594
1540	NC_015387	TGG	2	6	59796	59801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949594
1541	NC_015387	CTC	2	6	59846	59851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949594
1542	NC_015387	ACG	2	6	59868	59873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949594
1543	NC_015387	GAG	2	6	59882	59887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949594
1544	NC_015387	GAA	2	6	59905	59910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949594
1545	NC_015387	GCG	2	6	59951	59956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949594
1546	NC_015387	CG	3	6	59955	59960	0 %	0 %	50 %	50 %	328949594
1547	NC_015387	GGCT	2	8	60004	60011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_015387	GGCCA	2	10	60019	60028	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1549	NC_015387	AGG	2	6	60045	60050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015387	TTGG	2	8	60115	60122	0 %	50 %	50 %	0 %	328949595
1551	NC_015387	TGT	2	6	60165	60170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949595
1552	NC_015387	TGG	2	6	60212	60217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949595
1553	NC_015387	TCG	2	6	60228	60233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949595
1554	NC_015387	CCA	2	6	60291	60296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949595
1555	NC_015387	CGCT	2	8	60342	60349	0 %	25 %	25 %	50 %	328949595
1556	NC_015387	TGA	2	6	60351	60356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949595
1557	NC_015387	CCA	2	6	60363	60368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949595
1558	NC_015387	TGA	2	6	60405	60410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949595
1559	NC_015387	GC	3	6	60427	60432	0 %	0 %	50 %	50 %	328949595
1560	NC_015387	TGC	2	6	60438	60443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949595
1561	NC_015387	GATGC	2	10	60452	60461	20 %	20 %	40 %	20 %	328949595
1562	NC_015387	TGG	2	6	60594	60599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949595
1563	NC_015387	AGG	2	6	60603	60608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949595
1564	NC_015387	CAT	2	6	60688	60693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949595
1565	NC_015387	AACCA	2	10	60704	60713	60 %	0 %	0 %	40 %	328949595
1566	NC_015387	GAT	2	6	60715	60720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949595
1567	NC_015387	TGG	2	6	60732	60737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949595
1568	NC_015387	GAT	2	6	60748	60753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949595
1569	NC_015387	AGG	2	6	60973	60978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949596
1570	NC_015387	GCTC	2	8	60980	60987	0 %	25 %	25 %	50 %	328949596
1571	NC_015387	A	6	6	60993	60998	100 %	0 %	0 %	0 %	328949596
1572	NC_015387	AGG	3	9	61009	61017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949596
1573	NC_015387	ACG	2	6	61051	61056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949596
1574	NC_015387	GTG	2	6	61089	61094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949596
1575	NC_015387	ACCG	2	8	61154	61161	25 %	0 %	25 %	50 %	328949596
1576	NC_015387	GCT	2	6	61214	61219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949596
1577	NC_015387	AAG	2	6	61233	61238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949596
1578	NC_015387	CGCAC	2	10	61273	61282	20 %	0 %	20 %	60 %	328949596
1579	NC_015387	TGC	2	6	61285	61290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949596
1580	NC_015387	GAG	2	6	61341	61346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949596
1581	NC_015387	CGCGC	2	10	61347	61356	0 %	0 %	40 %	60 %	328949596
1582	NC_015387	GGT	2	6	61367	61372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949596
1583	NC_015387	GC	3	6	61391	61396	0 %	0 %	50 %	50 %	328949596
1584	NC_015387	G	6	6	61416	61421	0 %	0 %	100 %	0 %	328949596
1585	NC_015387	GCA	2	6	61424	61429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949596
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1587	NC_015387	CCG	2	6	61514	61519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949596
1588	NC_015387	TTA	2	6	61576	61581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949596
1589	NC_015387	GGAC	2	8	61634	61641	25 %	0 %	50 %	25 %	328949596
1590	NC_015387	GTG	2	6	61644	61649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949596
1591	NC_015387	GGA	2	6	61664	61669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949596
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1593	NC_015387	CG	3	6	61742	61747	0 %	0 %	50 %	50 %	328949596
1594	NC_015387	CG	3	6	61765	61770	0 %	0 %	50 %	50 %	328949596
1595	NC_015387	GGT	2	6	61775	61780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949596
1596	NC_015387	GAT	2	6	61811	61816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949596
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1598	NC_015387	CGG	2	6	61882	61887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949596
1599	NC_015387	CGG	2	6	61900	61905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949596
1600	NC_015387	CGG	2	6	61908	61913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949596
1601	NC_015387	TGC	2	6	61936	61941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949596
1602	NC_015387	GCC	2	6	61949	61954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949596
1603	NC_015387	ACT	2	6	61985	61990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949596
1604	NC_015387	GGT	2	6	62024	62029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949596
1605	NC_015387	GTGC	2	8	62054	62061	0 %	25 %	50 %	25 %	328949596
1606	NC_015387	CG	3	6	62062	62067	0 %	0 %	50 %	50 %	328949596
1607	NC_015387	GAG	2	6	62094	62099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949596
1608	NC_015387	CCA	2	6	62200	62205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949597
1609	NC_015387	CTC	2	6	62230	62235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949597
1610	NC_015387	CGT	2	6	62249	62254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949597
1611	NC_015387	TCG	2	6	62293	62298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949597
1612	NC_015387	CGC	2	6	62304	62309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949597
1613	NC_015387	GC	3	6	62308	62313	0 %	0 %	50 %	50 %	328949597
1614	NC_015387	TCG	2	6	62347	62352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949597
1615	NC_015387	GCC	3	9	62373	62381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949597
1616	NC_015387	AGC	2	6	62428	62433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949597
1617	NC_015387	CTG	2	6	62499	62504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949597
1618	NC_015387	CCG	2	6	62505	62510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949597
1619	NC_015387	G	6	6	62530	62535	0 %	0 %	100 %	0 %	328949597
1620	NC_015387	GGT	2	6	62539	62544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949597
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1622	NC_015387	ATC	2	6	62589	62594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949597
1623	NC_015387	CG	3	6	62606	62611	0 %	0 %	50 %	50 %	328949597
1624	NC_015387	GGT	2	6	62639	62644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949597
1625	NC_015387	CTG	2	6	62652	62657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949597
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