MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma suis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015155	TTTTGA	2	12	1592	1603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325972869
2	NC_015155	ATGTAA	2	12	3595	3606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325972871
3	NC_015155	AAAGAG	2	12	3849	3860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
4	NC_015155	AGATTT	2	12	8806	8817	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325972878
5	NC_015155	AAAGAT	2	12	9650	9661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325972878
6	NC_015155	AAGAAA	2	12	10207	10218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972879
7	NC_015155	AGGGGA	2	12	15806	15817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325972883
8	NC_015155	TAGAAG	2	12	16764	16775	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325972884
9	NC_015155	ACATCA	2	12	17662	17673	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325972886
10	NC_015155	TAAATC	2	12	19791	19802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015155	TAGATT	2	12	19813	19824	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015155	ACTAAC	2	12	19847	19858	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015155	TGGAAA	2	12	20690	20701	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325972888
14	NC_015155	ATTTCT	2	12	21285	21296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325972889
15	NC_015155	TATTTA	2	12	26352	26363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972891
16	NC_015155	GAAAAA	2	12	29986	29997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015155	AACTTA	2	12	30340	30351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325972895
18	NC_015155	TTAAAA	2	12	34991	35002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015155	TAGATG	2	12	36721	36732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972900
20	NC_015155	TTAAAA	2	12	36999	37010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015155	TGAAAA	2	12	37846	37857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325972901
22	NC_015155	AGAAAA	2	12	38151	38162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972902
23	NC_015155	TTAAAA	2	12	39839	39850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015155	TGAAGA	2	12	40494	40505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325972906
25	NC_015155	AAAGAG	2	12	44213	44224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972910
26	NC_015155	TAGTTC	2	12	45167	45178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325972911
27	NC_015155	AATTGA	2	12	47662	47673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325972914
28	NC_015155	ACCTCC	2	12	49356	49367	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325972917
29	NC_015155	AGAAAA	2	12	49983	49994	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972917
30	NC_015155	CTTTAG	2	12	50165	50176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325972918
31	NC_015155	AAATTC	2	12	50359	50370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325972918
32	NC_015155	TAAAGC	2	12	50547	50558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325972918
33	NC_015155	ATTCAG	2	12	50927	50938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325972919
34	NC_015155	AAGGAG	2	12	51907	51918	50 %	0 %	50 %	0 %	325972920
35	NC_015155	TAGGAA	2	12	52082	52093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325972921
36	NC_015155	CTGAAG	2	12	53098	53109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325972922
37	NC_015155	AGAAAA	2	12	58378	58389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972928
38	NC_015155	CTCTTT	2	12	59499	59510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972928
39	NC_015155	TCAAGA	2	12	59807	59818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325972928
40	NC_015155	TTAGTT	2	12	64598	64609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325972933
41	NC_015155	AAATTC	2	12	65420	65431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325972934
42	NC_015155	AAATAA	2	12	66468	66479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325972935
43	NC_015155	AAGTAA	2	12	67105	67116	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325972935
44	NC_015155	GAGAAG	2	12	67431	67442	50 %	0 %	50 %	0 %	325972935
45	NC_015155	AAAGAA	2	12	67667	67678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972936
46	NC_015155	AGATGC	2	12	68237	68248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325972936
47	NC_015155	TTGCTT	2	12	71516	71527	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325972939
48	NC_015155	GTCTGG	2	12	79775	79786	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325972947
49	NC_015155	AATCCT	2	12	82146	82157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972948
50	NC_015155	AAATAG	2	12	83373	83384	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325972950
51	NC_015155	GGAGAA	2	12	85146	85157	50 %	0 %	50 %	0 %	325972953
52	NC_015155	ATTCAG	2	12	85680	85691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325972954
53	NC_015155	TTGGAG	2	12	88425	88436	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325972957
54	NC_015155	AAAGAA	2	12	93110	93121	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972963
55	NC_015155	AAGGAA	2	12	94952	94963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972964
56	NC_015155	TTTTTG	2	12	96110	96121	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	325972965
57	NC_015155	CTTTTA	2	12	97483	97494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325972965
58	NC_015155	TGTTCT	2	12	97749	97760	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325972965
59	NC_015155	TAGCTT	2	12	98203	98214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325972966
60	NC_015155	TTCTTT	2	12	100158	100169	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325972968
61	NC_015155	GAAACT	2	12	102904	102915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325972973
62	NC_015155	AAGAAA	2	12	105908	105919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972978
63	NC_015155	ATGTCT	2	12	106275	106286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015155	ATGGTG	2	12	107383	107394	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325972980
65	NC_015155	AACACT	2	12	109360	109371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325972984
66	NC_015155	ATGGAA	2	12	109604	109615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325972984
67	NC_015155	TAAAAA	2	12	112506	112517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325972990
68	NC_015155	AAAAAT	2	12	113264	113275	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325972992
69	NC_015155	TGAAGT	2	12	113578	113589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972992
70	NC_015155	AGAAAA	2	12	114705	114716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972993
71	NC_015155	AAAAAC	2	12	115886	115897	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325972995
72	NC_015155	AAAAAG	2	12	116315	116326	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325972995
73	NC_015155	AGTCTT	2	12	121279	121290	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325973002
74	NC_015155	GAGATG	2	12	126985	126996	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325973012
75	NC_015155	GAAAGA	2	12	127391	127402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325973013
76	NC_015155	AGAATG	2	12	130438	130449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325973017
77	NC_015155	ACAAAA	2	12	130708	130719	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325973018
78	NC_015155	TTGAAA	2	12	135592	135603	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325973026
79	NC_015155	AAAAAG	2	12	141552	141563	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973035
80	NC_015155	TAAAAA	2	12	142748	142759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325973036
81	NC_015155	AAAAGA	2	12	144279	144290	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973037
82	NC_015155	TAGGAA	2	12	145769	145780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015155	AATTTC	2	12	149445	149456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325973043
84	NC_015155	AACTTG	2	12	149500	149511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325973043
85	NC_015155	CAAAAA	2	12	152002	152013	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325973045
86	NC_015155	AGTTCA	2	12	153973	153984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325973047
87	NC_015155	TCAAAG	2	12	155138	155149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325973048
88	NC_015155	CAGGAT	2	12	155993	156004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015155	GAAAAA	2	12	156847	156858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973050
90	NC_015155	AAAAAG	2	12	158194	158205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973052
91	NC_015155	GTTGGT	2	12	165251	165262	0 %	50 %	50 %	0 %	325973062
92	NC_015155	AAAAAG	2	12	165829	165840	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973063
93	NC_015155	CTAAAG	2	12	167477	167488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325973065
94	NC_015155	CAACTA	2	12	167819	167830	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325973065
95	NC_015155	AGAAAA	2	12	171372	171383	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973070
96	NC_015155	AGAAAT	2	12	180210	180221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325973086
97	NC_015155	TCAAAA	2	12	182096	182107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325973089
98	NC_015155	AGCTGC	2	12	184377	184388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325973093
99	NC_015155	CTTTAG	2	12	185301	185312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015155	GAAATT	2	12	185436	185447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325973095
101	NC_015155	GTTATG	2	12	185881	185892	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325973095
102	NC_015155	GAAGGT	2	12	186637	186648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325973096
103	NC_015155	AAAGTA	2	12	187539	187550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325973097
104	NC_015155	AGATAA	2	12	188194	188205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325973097
105	NC_015155	AGTGAA	2	12	191680	191691	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325973101
106	NC_015155	ATTCAG	2	12	191774	191785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325973101
107	NC_015155	GAAGAT	2	12	192931	192942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325973102
108	NC_015155	AGGAAG	2	12	194796	194807	50 %	0 %	50 %	0 %	325973104
109	NC_015155	GGAAGA	2	12	199883	199894	50 %	0 %	50 %	0 %	325973110
110	NC_015155	ATTTAG	2	12	200851	200862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325973111
111	NC_015155	AGATAA	2	12	203561	203572	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325973114
112	NC_015155	TTAGAG	2	12	204060	204071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325973115
113	NC_015155	AAAAAG	2	12	204467	204478	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973115
114	NC_015155	AGATTT	2	12	208555	208566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325973122
115	NC_015155	TAAAGA	2	12	210115	210126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325973124
116	NC_015155	TAGGTT	2	12	211153	211164	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325973126
117	NC_015155	AAAGAA	2	12	212075	212086	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973127
118	NC_015155	AAAAAG	2	12	212286	212297	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325973127
119	NC_015155	GGAGAA	2	12	213942	213953	50 %	0 %	50 %	0 %	325973130
120	NC_015155	ATATTT	2	12	216407	216418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325973135
121	NC_015155	AGAAAT	2	12	218604	218615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325973138
122	NC_015155	ATTTAG	2	12	224613	224624	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325973141
123	NC_015155	AAAGAT	2	12	226830	226841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325973143
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135	NC_015155	AATTGA	2	12	246658	246669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325973163
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155	NC_015155	TGAATT	2	12	296900	296911	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325973213
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229	NC_015155	GCTAGC	2	12	419687	419698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325973352
230	NC_015155	TTCTTT	2	12	420539	420550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325973353
231	NC_015155	TCTTTT	2	12	421092	421103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325973353
232	NC_015155	AAGCTA	2	12	421726	421737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325973354
233	NC_015155	TTTCGA	2	12	422296	422307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325973355
234	NC_015155	CCTACA	2	12	423485	423496	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325973356
235	NC_015155	AACTGA	2	12	424573	424584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325973357
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341	NC_015155	AATTTA	2	12	616030	616041	50 %	50 %	0 %	0 %	325973587
342	NC_015155	GAAACT	2	12	616195	616206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
343	NC_015155	TTTCTT	2	12	617340	617351	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325973590
344	NC_015155	CTAAAA	2	12	617634	617645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325973590
345	NC_015155	ACCTCC	2	12	618376	618387	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325973591
346	NC_015155	GGATTG	2	12	619672	619683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325973593
347	NC_015155	GAATTT	2	12	621349	621360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325973596
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349	NC_015155	TTTGTG	2	12	626169	626180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
350	NC_015155	GGAGAA	2	12	630574	630585	50 %	0 %	50 %	0 %	325973612
351	NC_015155	TCCTTG	2	12	630642	630653	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325973612
352	NC_015155	CAGTTA	2	12	630936	630947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325973613
353	NC_015155	TTTTTA	2	12	634507	634518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.