MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma suis KI3806

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015153	TTTTGA	2	12	2295	2306	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325989362
2	NC_015153	ATGTAA	2	12	4295	4306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989364
3	NC_015153	AGATTT	2	12	9507	9518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989371
4	NC_015153	AAAGAT	2	12	10351	10362	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989371
5	NC_015153	AAGAAA	2	12	10908	10919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989372
6	NC_015153	AGGGGA	2	12	16505	16516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325989376
7	NC_015153	TAGAAG	2	12	17463	17474	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989377
8	NC_015153	ACATCA	2	12	18360	18371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325989379
9	NC_015153	TAAATC	2	12	20489	20500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015153	TAGATT	2	12	20511	20522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015153	ACTAAC	2	12	20545	20556	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015153	TGGAAA	2	12	21388	21399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989381
13	NC_015153	TATTTA	2	12	27050	27061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325989384
14	NC_015153	AACTTA	2	12	31037	31048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989388
15	NC_015153	TTAAAA	2	12	35737	35748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015153	TGAAAA	2	12	36584	36595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989392
17	NC_015153	AGAAAA	2	12	36889	36900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989393
18	NC_015153	TTAAAA	2	12	38590	38601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015153	TGAAGA	2	12	39245	39256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989395
20	NC_015153	GAAAGT	2	12	41331	41342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015153	AAAGAG	2	12	42985	42996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325989399
22	NC_015153	AGAAAA	2	12	44275	44286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989400
23	NC_015153	AATTCA	2	12	44399	44410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989400
24	NC_015153	CTTTAG	2	12	44458	44469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989401
25	NC_015153	AAATTC	2	12	44652	44663	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989401
26	NC_015153	CTTATT	2	12	45226	45237	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989402
27	NC_015153	TAGGAA	2	12	46393	46404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989404
28	NC_015153	CTGAAG	2	12	47979	47990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989406
29	NC_015153	AGAAAA	2	12	53266	53277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989412
30	NC_015153	CTCTTT	2	12	54387	54398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325989412
31	NC_015153	TCAAGA	2	12	54695	54706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989412
32	NC_015153	TTAGTT	2	12	59468	59479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325989417
33	NC_015153	AAATTC	2	12	60290	60301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989418
34	NC_015153	AAATAA	2	12	61338	61349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325989419
35	NC_015153	AAGTAA	2	12	61975	61986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989419
36	NC_015153	GAGAAG	2	12	62301	62312	50 %	0 %	50 %	0 %	325989419
37	NC_015153	AAAAGA	2	12	62537	62548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989420
38	NC_015153	AGATGC	2	12	63108	63119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989420
39	NC_015153	TATTTT	2	12	66183	66194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	325989423
40	NC_015153	TTGCTT	2	12	66387	66398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325989423
41	NC_015153	GTCTGG	2	12	74646	74657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325989431
42	NC_015153	AATCCT	2	12	77017	77028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015153	ATTCAG	2	12	80565	80576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989436
44	NC_015153	AATAGC	2	12	81379	81390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989438
45	NC_015153	AAAGAA	2	12	82739	82750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989439
46	NC_015153	AAAGAA	2	12	83285	83296	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989439
47	NC_015153	GAAAAT	2	12	84306	84317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989440
48	NC_015153	AACAGG	2	12	84623	84634	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325989441
49	NC_015153	AAAGAA	2	12	89425	89436	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989447
50	NC_015153	ATTCAG	2	12	89576	89587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989447
51	NC_015153	AAGGAA	2	12	91273	91284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325989448
52	NC_015153	TTTTTG	2	12	92431	92442	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	325989449
53	NC_015153	CTTTTA	2	12	93804	93815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989449
54	NC_015153	TGTTCT	2	12	94070	94081	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325989449
55	NC_015153	TAGCTT	2	12	94524	94535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989450
56	NC_015153	TTCTTT	2	12	96479	96490	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325989453
57	NC_015153	GAAACT	2	12	99225	99236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989458
58	NC_015153	AAGAAA	2	12	102229	102240	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989463
59	NC_015153	ATGTCT	2	12	102596	102607	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015153	ATGGTG	2	12	103704	103715	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325989465
61	NC_015153	AACACT	2	12	105680	105691	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325989468
62	NC_015153	ATGGAA	2	12	105924	105935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989468
63	NC_015153	GAATCT	2	12	108269	108280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015153	TAAAAA	2	12	109925	109936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015153	TACTTC	2	12	110697	110708	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325989476
66	NC_015153	AGAAAA	2	12	112145	112156	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989477
67	NC_015153	AAAAAC	2	12	113326	113337	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325989479
68	NC_015153	AAAAAG	2	12	113755	113766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989480
69	NC_015153	AGTCTT	2	12	118719	118730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989489
70	NC_015153	TTGGAG	2	12	121027	121038	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325989495
71	NC_015153	GAGATG	2	12	124424	124435	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325989500
72	NC_015153	AGAATG	2	12	129900	129911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989508
73	NC_015153	ACAAAA	2	12	130174	130185	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015153	AAAAAC	2	12	132586	132597	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325989513
75	NC_015153	TTGAAA	2	12	134528	134539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989516
76	NC_015153	AGATAA	2	12	136863	136874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989520
77	NC_015153	AAAAAG	2	12	140507	140518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015153	TCTTCC	2	12	141606	141617	0 %	50 %	0 %	50 %	325989528
79	NC_015153	TAGGAA	2	12	144747	144758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015153	AATTTC	2	12	148420	148431	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325989537
81	NC_015153	AACTTG	2	12	148475	148486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989537
82	NC_015153	CAAAAA	2	12	150975	150986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325989541
83	NC_015153	AGTTCA	2	12	152936	152947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989544
84	NC_015153	TCAAAG	2	12	154100	154111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989546
85	NC_015153	CAGGAT	2	12	154954	154965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989547
86	NC_015153	AAAAAG	2	12	157152	157163	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989549
87	NC_015153	AGATAA	2	12	162681	162692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989559
88	NC_015153	TTAGAG	2	12	163180	163191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325989560
89	NC_015153	AAAAAG	2	12	163587	163598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989560
90	NC_015153	AGATTT	2	12	167675	167686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989569
91	NC_015153	TAAAGA	2	12	169235	169246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989571
92	NC_015153	TAGGTT	2	12	170273	170284	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325989573
93	NC_015153	AAAGAA	2	12	171195	171206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989574
94	NC_015153	AAAAAG	2	12	171406	171417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989574
95	NC_015153	GGAGAA	2	12	173062	173073	50 %	0 %	50 %	0 %	325989577
96	NC_015153	ATATTT	2	12	175526	175537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015153	AGAAAT	2	12	177724	177735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989582
98	NC_015153	TTCTGA	2	12	181515	181526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989584
99	NC_015153	ATTTAG	2	12	183734	183745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015153	AAAGAT	2	12	185950	185961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989585
101	NC_015153	TGACTT	2	12	187916	187927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989588
102	NC_015153	TATGAG	2	12	189078	189089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325989589
103	NC_015153	TCTAAA	2	12	190223	190234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989590
104	NC_015153	GAAACA	2	12	191409	191420	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325989591
105	NC_015153	AAGGTA	2	12	192525	192536	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989592
106	NC_015153	AGCTAG	2	12	193387	193398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989592
107	NC_015153	TAGAAA	2	12	194475	194486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989595
108	NC_015153	TTTAAG	2	12	194504	194515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989595
109	NC_015153	TTTTCA	2	12	197038	197049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989599
110	NC_015153	AAAACT	2	12	203036	203047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325989604
111	NC_015153	TTTAAA	2	12	205162	205173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015153	AATTGA	2	12	205778	205789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989606
113	NC_015153	AAAAGA	2	12	207732	207743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989607
114	NC_015153	TTGAAG	2	12	210503	210514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325989609
115	NC_015153	GAAAAA	2	12	213991	214002	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989612
116	NC_015153	TAACTT	2	12	216179	216190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325989615
117	NC_015153	AATAGT	2	12	217135	217146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989615
118	NC_015153	ATTTTT	2	12	217254	217265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	325989615
119	NC_015153	TTACTT	2	12	217564	217575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989615
120	NC_015153	TTTGTA	2	12	217721	217732	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325989615
121	NC_015153	TTTAGG	2	12	219274	219285	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325989617
122	NC_015153	TTTAGG	2	12	220303	220314	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325989619
123	NC_015153	CTTCAG	2	12	222068	222079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325989622
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240	NC_015153	GATTTA	2	12	452527	452538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989868
241	NC_015153	TCAGCT	2	12	460983	460994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325989877
242	NC_015153	ATTATC	2	12	463501	463512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325989879
243	NC_015153	TTCCTA	2	12	467140	467151	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325989884
244	NC_015153	TGAACT	2	12	467354	467365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989885
245	NC_015153	TTTTTC	2	12	467798	467809	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325989886
246	NC_015153	ACTTCA	2	12	468417	468428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325989886
247	NC_015153	GAACTA	2	12	472032	472043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989894
248	NC_015153	TTTTCC	2	12	473363	473374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325989900
249	NC_015153	CTGTTT	2	12	476167	476178	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325989907
250	NC_015153	GAACTA	2	12	477592	477603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989911
251	NC_015153	ATGGAT	2	12	478639	478650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325989914
252	NC_015153	TCCAAC	2	12	480078	480089	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325989916
253	NC_015153	CTTTGT	2	12	480787	480798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325989919
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255	NC_015153	AAAAGA	2	12	483801	483812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015153	TTTTCT	2	12	484031	484042	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325989923
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258	NC_015153	TTTAGC	2	12	484597	484608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989924
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262	NC_015153	TCTTTT	2	12	498451	498462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325989944
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268	NC_015153	ACCCCC	2	12	517808	517819	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
269	NC_015153	CCTTTC	2	12	519438	519449	0 %	50 %	0 %	50 %	325989982
270	NC_015153	CAACTA	2	12	520454	520465	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325989983
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275	NC_015153	AATGGA	2	12	534540	534551	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989998
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277	NC_015153	ACTTCT	2	12	538853	538864	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325990002
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281	NC_015153	GCTATA	2	12	549508	549519	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325990005
282	NC_015153	GGAAGA	2	12	549754	549765	50 %	0 %	50 %	0 %	325990005
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300	NC_015153	AAAGAG	2	12	575787	575798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015153	TCTCTT	2	12	576498	576509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325990026
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310	NC_015153	AAACTT	2	12	590564	590575	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325990043
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321	NC_015153	TTTTTA	2	12	607427	607438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_015153	GTTGTA	2	12	608570	608581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325990070
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324	NC_015153	ATTTAA	2	12	614133	614144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_015153	ATTCAG	2	12	616609	616620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325990079
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338	NC_015153	CTAAAA	2	12	645964	645975	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325990101
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345	NC_015153	ATAAAA	2	12	650326	650337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_015153	AGGATG	2	12	653311	653322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325990102
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350	NC_015153	GCAAAA	2	12	665202	665213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325990113
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352	NC_015153	TGTTCT	2	12	671400	671411	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325990119
353	NC_015153	AGAAAA	2	12	678776	678787	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325990127
354	NC_015153	AAATAA	2	12	682410	682421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325990132
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356	NC_015153	CTGTCG	2	12	684144	684155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325990134
357	NC_015153	ATTCTT	2	12	685164	685175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325990135
358	NC_015153	TTTCTT	2	12	685787	685798	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325990135
359	NC_015153	TATTTC	2	12	689558	689569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325990139
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.