MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014811	GCGCT	2	10	3093	3102	0 %	20 %	40 %	40 %	315441478
2	NC_014811	ACGGG	2	10	4038	4047	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014811	TCGAC	2	10	5438	5447	20 %	20 %	20 %	40 %	315441480
4	NC_014811	GTCAT	2	10	6996	7005	20 %	40 %	20 %	20 %	315441482
5	NC_014811	TTGCC	2	10	7569	7578	0 %	40 %	20 %	40 %	315441482
6	NC_014811	CACGC	2	10	7871	7880	20 %	0 %	20 %	60 %	315441483
7	NC_014811	CGGCG	2	10	9085	9094	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014811	GCCGC	2	10	9155	9164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014811	CAGCG	3	15	12825	12839	20 %	0 %	40 %	40 %	315441487
10	NC_014811	GGGGT	2	10	14495	14504	0 %	20 %	80 %	0 %	315441488
11	NC_014811	CGAGC	2	10	15221	15230	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014811	TGCGA	2	10	15892	15901	20 %	20 %	40 %	20 %	315441489
13	NC_014811	CGACG	2	10	16006	16015	20 %	0 %	40 %	40 %	315441489
14	NC_014811	GGGCG	2	10	23448	23457	0 %	0 %	80 %	20 %	315441500
15	NC_014811	CCAGC	2	10	26556	26565	20 %	0 %	20 %	60 %	315441503
16	NC_014811	CCGGT	2	10	26698	26707	0 %	20 %	40 %	40 %	315441503
17	NC_014811	ATCCC	2	10	27567	27576	20 %	20 %	0 %	60 %	315441505
18	NC_014811	TTGAT	2	10	27718	27727	20 %	60 %	20 %	0 %	315441505
19	NC_014811	CGAGA	2	10	30738	30747	40 %	0 %	40 %	20 %	315441508
20	NC_014811	GTCGA	2	10	32087	32096	20 %	20 %	40 %	20 %	315441509
21	NC_014811	GGCCC	2	10	33209	33218	0 %	0 %	40 %	60 %	315441510
22	NC_014811	CGGAT	2	10	34024	34033	20 %	20 %	40 %	20 %	315441510
23	NC_014811	CGCGG	2	10	34287	34296	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014811	TCGTG	2	10	34563	34572	0 %	40 %	40 %	20 %	315441511
25	NC_014811	CGGTG	2	10	35350	35359	0 %	20 %	60 %	20 %	315441511
26	NC_014811	CCCGG	2	10	35779	35788	0 %	0 %	40 %	60 %	315441511
27	NC_014811	GTGCG	2	10	36356	36365	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014811	GACAG	2	10	36763	36772	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014811	GCGTC	2	10	38726	38735	0 %	20 %	40 %	40 %	315441513
30	NC_014811	GAAGT	2	10	39023	39032	40 %	20 %	40 %	0 %	315441513
31	NC_014811	CGCTT	2	10	42056	42065	0 %	40 %	20 %	40 %	315441517
32	NC_014811	AGCCG	2	10	46640	46649	20 %	0 %	40 %	40 %	315441520
33	NC_014811	TGACC	2	10	49252	49261	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014811	AACTC	2	10	54810	54819	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014811	CGGAC	2	10	54952	54961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014811	CGGGT	2	10	55771	55780	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014811	GGCGG	2	10	56279	56288	0 %	0 %	80 %	20 %	315441527
38	NC_014811	AGCCA	2	10	57228	57237	40 %	0 %	20 %	40 %	315441528
39	NC_014811	AGCGC	2	10	59234	59243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014811	CGATC	2	10	60776	60785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014811	GTGGC	2	10	60815	60824	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014811	CCCGT	2	10	60903	60912	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014811	GCGCT	2	10	61359	61368	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014811	CACGC	2	10	62370	62379	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014811	AAGTC	2	10	62950	62959	40 %	20 %	20 %	20 %	315441531
46	NC_014811	GGCGA	2	10	63012	63021	20 %	0 %	60 %	20 %	315441531
47	NC_014811	AGGTC	2	10	63437	63446	20 %	20 %	40 %	20 %	315441532
48	NC_014811	GACGC	2	10	65427	65436	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014811	ATCGG	2	10	65525	65534	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014811	GGCGT	2	10	66259	66268	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014811	TGGTG	2	10	66692	66701	0 %	40 %	60 %	0 %	315441534
52	NC_014811	TCGCT	2	10	67211	67220	0 %	40 %	20 %	40 %	315441534
53	NC_014811	TCGGG	2	10	67518	67527	0 %	20 %	60 %	20 %	315441535
54	NC_014811	TCGGG	2	10	68299	68308	0 %	20 %	60 %	20 %	315441535
55	NC_014811	ATTGC	2	10	69700	69709	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014811	GCGCC	2	10	69911	69920	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_014811	CACAA	2	10	70605	70614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014811	CCCAT	2	10	70979	70988	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_014811	AGGCC	2	10	72293	72302	20 %	0 %	40 %	40 %	315441537
60	NC_014811	GTACG	2	10	72388	72397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014811	ATCGG	2	10	72772	72781	20 %	20 %	40 %	20 %	315441538
62	NC_014811	GGGCA	2	10	72803	72812	20 %	0 %	60 %	20 %	315441538
63	NC_014811	GTCGC	2	10	72841	72850	0 %	20 %	40 %	40 %	315441538
64	NC_014811	TCGGC	2	10	73063	73072	0 %	20 %	40 %	40 %	315441538
65	NC_014811	ACCGA	2	10	75908	75917	40 %	0 %	20 %	40 %	315441540
66	NC_014811	ACGTG	2	10	76480	76489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014811	ACCGA	2	10	77097	77106	40 %	0 %	20 %	40 %	315441541
68	NC_014811	GCATT	2	10	77466	77475	20 %	40 %	20 %	20 %	315441541
69	NC_014811	CAAGC	2	10	78942	78951	40 %	0 %	20 %	40 %	315441542
70	NC_014811	CGGGC	2	10	78971	78980	0 %	0 %	60 %	40 %	315441542
71	NC_014811	GGCGA	2	10	79126	79135	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014811	GGGAC	2	10	79312	79321	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014811	GTCAG	2	10	80546	80555	20 %	20 %	40 %	20 %	315441544
74	NC_014811	CGGGC	2	10	80925	80934	0 %	0 %	60 %	40 %	315441544
75	NC_014811	GACAT	2	10	82109	82118	40 %	20 %	20 %	20 %	315441545
76	NC_014811	CGTTG	2	10	83624	83633	0 %	40 %	40 %	20 %	315441547
77	NC_014811	ATGGG	2	10	85618	85627	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014811	ACTGG	2	10	86294	86303	20 %	20 %	40 %	20 %	315441549
79	NC_014811	GCGGG	2	10	86883	86892	0 %	0 %	80 %	20 %	315441549
80	NC_014811	GCGCC	2	10	90115	90124	0 %	0 %	40 %	60 %	315441553
81	NC_014811	GTGAT	2	10	93000	93009	20 %	40 %	40 %	0 %	315441558
82	NC_014811	GCACG	2	10	93314	93323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014811	GTGGA	2	10	93591	93600	20 %	20 %	60 %	0 %	315441559
84	NC_014811	CGGCA	2	10	95314	95323	20 %	0 %	40 %	40 %	315441561
85	NC_014811	ACGCG	2	10	96639	96648	20 %	0 %	40 %	40 %	315441563
86	NC_014811	TAGCG	2	10	98476	98485	20 %	20 %	40 %	20 %	315441566
87	NC_014811	CGGCG	2	10	99255	99264	0 %	0 %	60 %	40 %	315441566
88	NC_014811	TGCGC	2	10	100343	100352	0 %	20 %	40 %	40 %	315441567
89	NC_014811	GCCAA	2	10	100885	100894	40 %	0 %	20 %	40 %	315441568
90	NC_014811	GCGCG	2	10	101032	101041	0 %	0 %	60 %	40 %	315441568
91	NC_014811	AGCGC	2	10	102929	102938	20 %	0 %	40 %	40 %	315441571
92	NC_014811	GGCGG	2	10	108598	108607	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014811	TCTCC	2	10	108951	108960	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_014811	TTCGA	2	10	110097	110106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014811	GCCAC	2	10	110234	110243	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014811	CCGCG	2	10	110341	110350	0 %	0 %	40 %	60 %	315441578
97	NC_014811	TGCTG	2	10	111298	111307	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014811	GCCGG	2	10	111507	111516	0 %	0 %	60 %	40 %	315441580
99	NC_014811	CGCAC	2	10	111935	111944	20 %	0 %	20 %	60 %	315441580
100	NC_014811	CACGA	2	10	112724	112733	40 %	0 %	20 %	40 %	315441580
101	NC_014811	GAAAC	2	10	113670	113679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014811	GCGTG	2	10	113831	113840	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014811	CGGTG	2	10	114753	114762	0 %	20 %	60 %	20 %	315441581
104	NC_014811	CGGCC	2	10	117997	118006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_014811	GATGA	2	10	119179	119188	40 %	20 %	40 %	0 %	315441585
106	NC_014811	GCTGG	2	10	119382	119391	0 %	20 %	60 %	20 %	315441585
107	NC_014811	AACGC	2	10	119603	119612	40 %	0 %	20 %	40 %	315441585
108	NC_014811	GCGCG	2	10	120114	120123	0 %	0 %	60 %	40 %	315441585
109	NC_014811	GCGCG	2	10	122013	122022	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014811	CTTGT	2	10	122538	122547	0 %	60 %	20 %	20 %	315441588
111	NC_014811	CCGAG	2	10	123013	123022	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014811	CCCAC	2	10	123363	123372	20 %	0 %	0 %	80 %	315441589
113	NC_014811	CCCAC	2	10	123381	123390	20 %	0 %	0 %	80 %	315441589
114	NC_014811	GACGT	2	10	123603	123612	20 %	20 %	40 %	20 %	315441589
115	NC_014811	CGATG	2	10	130151	130160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014811	GCCGG	2	10	131106	131115	0 %	0 %	60 %	40 %	315441593
117	NC_014811	CGCAC	2	10	131565	131574	20 %	0 %	20 %	60 %	315441593
118	NC_014811	TGCTG	2	10	137386	137395	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014811	GCCGG	2	10	137595	137604	0 %	0 %	60 %	40 %	315441597
120	NC_014811	CGCAC	2	10	138023	138032	20 %	0 %	20 %	60 %	315441597
121	NC_014811	CACGA	2	10	138812	138821	40 %	0 %	20 %	40 %	315441597
122	NC_014811	GATCC	2	10	140679	140688	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014811	GTTGT	2	10	141216	141225	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014811	GCGTT	2	10	141639	141648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014811	GCGGT	2	10	141691	141700	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014811	CAGCC	2	10	143924	143933	20 %	0 %	20 %	60 %	315441600
127	NC_014811	GCCAC	2	10	144058	144067	20 %	0 %	20 %	60 %	315441600
128	NC_014811	GCCCG	2	10	144273	144282	0 %	0 %	40 %	60 %	315441600
129	NC_014811	GTGCT	2	10	146168	146177	0 %	40 %	40 %	20 %	315441602
130	NC_014811	CGGTG	2	10	146692	146701	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014811	GTCGC	2	10	146973	146982	0 %	20 %	40 %	40 %	315441603
132	NC_014811	GGCGC	2	10	147019	147028	0 %	0 %	60 %	40 %	315441603
133	NC_014811	CGGCG	2	10	147138	147147	0 %	0 %	60 %	40 %	315441603
134	NC_014811	CGGCG	2	10	149261	149270	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014811	CGGCG	2	10	151121	151130	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014811	CGGCC	2	10	151925	151934	0 %	0 %	40 %	60 %	315441605
137	NC_014811	GCCGC	2	10	152121	152130	0 %	0 %	40 %	60 %	315441605
138	NC_014811	CTCGT	2	10	154129	154138	0 %	40 %	20 %	40 %	315441605
139	NC_014811	AGCGG	2	10	154803	154812	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014811	GATCA	2	10	155432	155441	40 %	20 %	20 %	20 %	315441606
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142	NC_014811	TCGAC	2	10	155986	155995	20 %	20 %	20 %	40 %	315441606
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159	NC_014811	ACCCA	2	10	165893	165902	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
160	NC_014811	AGTCG	2	10	166685	166694	20 %	20 %	40 %	20 %	315441620
161	NC_014811	GGCCC	2	10	166923	166932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
162	NC_014811	GATCG	2	10	168350	168359	20 %	20 %	40 %	20 %	315441622
163	NC_014811	AGGTC	2	10	168931	168940	20 %	20 %	40 %	20 %	315441623
164	NC_014811	ACCCA	2	10	169456	169465	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
165	NC_014811	GTGGG	2	10	170305	170314	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014811	CGTCG	2	10	171063	171072	0 %	20 %	40 %	40 %	315441625
167	NC_014811	GGGAG	2	10	171140	171149	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014811	GTCGG	2	10	171223	171232	0 %	20 %	60 %	20 %	315441626
169	NC_014811	ACCGC	2	10	172118	172127	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
170	NC_014811	GGTGT	2	10	172131	172140	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014811	CGCAC	2	10	174689	174698	20 %	0 %	20 %	60 %	315441631
172	NC_014811	TTGCA	2	10	176025	176034	20 %	40 %	20 %	20 %	315441633
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175	NC_014811	CGCAG	2	10	179958	179967	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_014811	GCGGA	2	10	179986	179995	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_014811	CGCAG	2	10	181676	181685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
180	NC_014811	GCGGA	2	10	181704	181713	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
181	NC_014811	GCGCC	2	10	181866	181875	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
182	NC_014811	CGGCG	2	10	186604	186613	0 %	0 %	60 %	40 %	315441641
183	NC_014811	CGGGG	2	10	187458	187467	0 %	0 %	80 %	20 %	315441642
184	NC_014811	CGCAG	2	10	187860	187869	20 %	0 %	40 %	40 %	315441642
185	NC_014811	CAGCG	2	10	189257	189266	20 %	0 %	40 %	40 %	315441645
186	NC_014811	GGGCG	2	10	189278	189287	0 %	0 %	80 %	20 %	315441645
187	NC_014811	GCAAG	2	10	190224	190233	40 %	0 %	40 %	20 %	315441646
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189	NC_014811	GCAAG	2	10	194984	194993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
190	NC_014811	GCGTG	2	10	195324	195333	0 %	20 %	60 %	20 %	315441652
191	NC_014811	ATCGG	2	10	198149	198158	20 %	20 %	40 %	20 %	315441656
192	NC_014811	GCCTG	2	10	198167	198176	0 %	20 %	40 %	40 %	315441656
193	NC_014811	CGGTG	2	10	202780	202789	0 %	20 %	60 %	20 %	315441661
194	NC_014811	ATCGC	2	10	205141	205150	20 %	20 %	20 %	40 %	315441663
195	NC_014811	ACCAC	2	10	205837	205846	40 %	0 %	0 %	60 %	315441663
196	NC_014811	CCCTT	2	10	208630	208639	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
197	NC_014811	ATGGC	2	10	209130	209139	20 %	20 %	40 %	20 %	315441668
198	NC_014811	CGCGC	2	10	209438	209447	0 %	0 %	40 %	60 %	315441668
199	NC_014811	GACAG	2	10	210653	210662	40 %	0 %	40 %	20 %	315441670

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.