MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_014658	CAG	2	6	58794	58799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136284
1503	NC_014658	GTAG	2	8	58811	58818	25 %	25 %	50 %	0 %	312136284
1504	NC_014658	AT	3	6	58857	58862	50 %	50 %	0 %	0 %	312136284
1505	NC_014658	TAC	2	6	58911	58916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136285
1506	NC_014658	ATT	2	6	58979	58984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136285
1507	NC_014658	ATT	2	6	59002	59007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136285
1508	NC_014658	ATT	2	6	59015	59020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136285
1509	NC_014658	CTT	2	6	59025	59030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136285
1510	NC_014658	ATT	2	6	59101	59106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136286
1511	NC_014658	TAT	2	6	59128	59133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136286
1512	NC_014658	T	7	7	59162	59168	0 %	100 %	0 %	0 %	312136286
1513	NC_014658	TTC	2	6	59186	59191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136286
1514	NC_014658	T	7	7	59267	59273	0 %	100 %	0 %	0 %	312136286
1515	NC_014658	T	7	7	59290	59296	0 %	100 %	0 %	0 %	312136286
1516	NC_014658	AGC	2	6	59309	59314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136286
1517	NC_014658	TAT	2	6	59315	59320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136286
1518	NC_014658	T	6	6	59340	59345	0 %	100 %	0 %	0 %	312136286
1519	NC_014658	TCA	2	6	59355	59360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136286
1520	NC_014658	TAC	2	6	59366	59371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136286
1521	NC_014658	T	6	6	59408	59413	0 %	100 %	0 %	0 %	312136286
1522	NC_014658	ATC	2	6	59528	59533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136286
1523	NC_014658	ATAAAA	2	12	59588	59599	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136286
1524	NC_014658	TCA	2	6	59622	59627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136286
1525	NC_014658	TAA	2	6	59632	59637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136286
1526	NC_014658	TGT	2	6	59677	59682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136286
1527	NC_014658	ATTT	2	8	59719	59726	25 %	75 %	0 %	0 %	312136286
1528	NC_014658	AT	3	6	59731	59736	50 %	50 %	0 %	0 %	312136286
1529	NC_014658	TCA	2	6	59745	59750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136286
1530	NC_014658	ATTGT	2	10	59757	59766	20 %	60 %	20 %	0 %	312136286
1531	NC_014658	T	7	7	59834	59840	0 %	100 %	0 %	0 %	312136286
1532	NC_014658	AAT	2	6	59963	59968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136287
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1534	NC_014658	ATTT	2	8	60056	60063	25 %	75 %	0 %	0 %	312136287
1535	NC_014658	T	6	6	60080	60085	0 %	100 %	0 %	0 %	312136287
1536	NC_014658	T	6	6	60092	60097	0 %	100 %	0 %	0 %	312136287
1537	NC_014658	TA	3	6	60101	60106	50 %	50 %	0 %	0 %	312136287
1538	NC_014658	AAAT	2	8	60124	60131	75 %	25 %	0 %	0 %	312136287
1539	NC_014658	TCT	2	6	60139	60144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136287
1540	NC_014658	ATTT	2	8	60193	60200	25 %	75 %	0 %	0 %	312136288
1541	NC_014658	ATA	2	6	60227	60232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136288
1542	NC_014658	TTG	2	6	60251	60256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136288
1543	NC_014658	AGA	2	6	60261	60266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136288
1544	NC_014658	TAAG	2	8	60272	60279	50 %	25 %	25 %	0 %	312136288
1545	NC_014658	GAA	2	6	60304	60309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136288
1546	NC_014658	ATT	2	6	60310	60315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136288
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1549	NC_014658	ATTCT	2	10	60344	60353	20 %	60 %	0 %	20 %	312136288
1550	NC_014658	TGC	2	6	60375	60380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136288
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1554	NC_014658	TTG	2	6	60479	60484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136288
1555	NC_014658	TTC	2	6	60510	60515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136288
1556	NC_014658	TAAA	2	8	60545	60552	75 %	25 %	0 %	0 %	312136288
1557	NC_014658	GTT	2	6	60559	60564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136288
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1559	NC_014658	ATA	2	6	60680	60685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136288
1560	NC_014658	ATA	2	6	60710	60715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136288
1561	NC_014658	T	6	6	60746	60751	0 %	100 %	0 %	0 %	312136288
1562	NC_014658	CAA	2	6	60752	60757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136288
1563	NC_014658	CAT	2	6	60765	60770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136288
1564	NC_014658	AAG	2	6	60797	60802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136288
1565	NC_014658	ATTTAA	2	12	60813	60824	50 %	50 %	0 %	0 %	312136288
1566	NC_014658	A	6	6	60823	60828	100 %	0 %	0 %	0 %	312136288
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1571	NC_014658	ATT	2	6	60949	60954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136288
1572	NC_014658	TA	3	6	60995	61000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_014658	AAT	2	6	61279	61284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136289
1583	NC_014658	CTAG	2	8	61306	61313	25 %	25 %	25 %	25 %	312136289
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1593	NC_014658	A	6	6	61651	61656	100 %	0 %	0 %	0 %	312136289
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1597	NC_014658	ATT	2	6	61746	61751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136289
1598	NC_014658	AAT	2	6	61819	61824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136290
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1601	NC_014658	TAT	2	6	61921	61926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136290
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1603	NC_014658	TA	3	6	62032	62037	50 %	50 %	0 %	0 %	312136290
1604	NC_014658	T	7	7	62083	62089	0 %	100 %	0 %	0 %	312136290
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1606	NC_014658	ATA	2	6	62122	62127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136290
1607	NC_014658	TGGA	2	8	62136	62143	25 %	25 %	50 %	0 %	312136290
1608	NC_014658	GTA	2	6	62159	62164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136290
1609	NC_014658	CAA	2	6	62175	62180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136290
1610	NC_014658	T	6	6	62192	62197	0 %	100 %	0 %	0 %	312136290
1611	NC_014658	AT	3	6	62274	62279	50 %	50 %	0 %	0 %	312136290
1612	NC_014658	TCCA	2	8	62303	62310	25 %	25 %	0 %	50 %	312136290
1613	NC_014658	T	8	8	62311	62318	0 %	100 %	0 %	0 %	312136290
1614	NC_014658	T	6	6	62457	62462	0 %	100 %	0 %	0 %	312136290
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1617	NC_014658	TTTG	2	8	62506	62513	0 %	75 %	25 %	0 %	312136290
1618	NC_014658	T	7	7	62521	62527	0 %	100 %	0 %	0 %	312136290
1619	NC_014658	CAA	2	6	62548	62553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136290
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1622	NC_014658	TCT	2	6	62587	62592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136290
1623	NC_014658	ATT	2	6	62613	62618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014658	TTA	2	6	62668	62673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_014658	A	6	6	62682	62687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014658	TA	3	6	62698	62703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014658	TGA	2	6	62719	62724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136291
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1629	NC_014658	A	6	6	62761	62766	100 %	0 %	0 %	0 %	312136291
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