MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 33259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014658	TA	3	6	240396	240401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_014658	ATG	2	6	240429	240434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136471
6503	NC_014658	AAT	2	6	240437	240442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136471
6504	NC_014658	TAA	2	6	240451	240456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136471
6505	NC_014658	A	6	6	240465	240470	100 %	0 %	0 %	0 %	312136471
6506	NC_014658	CTG	2	6	240508	240513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136471
6507	NC_014658	GA	3	6	240611	240616	50 %	0 %	50 %	0 %	312136471
6508	NC_014658	CTA	2	6	240682	240687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136471
6509	NC_014658	AAACAT	2	12	240707	240718	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312136471
6510	NC_014658	GTT	2	6	240725	240730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136471
6511	NC_014658	A	6	6	240743	240748	100 %	0 %	0 %	0 %	312136471
6512	NC_014658	A	6	6	240750	240755	100 %	0 %	0 %	0 %	312136471
6513	NC_014658	AAG	2	6	240796	240801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136471
6514	NC_014658	AAAT	2	8	240826	240833	75 %	25 %	0 %	0 %	312136471
6515	NC_014658	T	6	6	240836	240841	0 %	100 %	0 %	0 %	312136471
6516	NC_014658	ATA	2	6	240856	240861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136471
6517	NC_014658	TGC	2	6	240875	240880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136471
6518	NC_014658	AATT	2	8	240886	240893	50 %	50 %	0 %	0 %	312136471
6519	NC_014658	ATT	2	6	240912	240917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136471
6520	NC_014658	CAA	2	6	240935	240940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136471
6521	NC_014658	GTA	2	6	240984	240989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136471
6522	NC_014658	CAA	2	6	241000	241005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136471
6523	NC_014658	CAC	2	6	241006	241011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136471
6524	NC_014658	ATT	2	6	241022	241027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136471
6525	NC_014658	A	6	6	241087	241092	100 %	0 %	0 %	0 %	312136471
6526	NC_014658	A	6	6	241176	241181	100 %	0 %	0 %	0 %	312136472
6527	NC_014658	A	7	7	241183	241189	100 %	0 %	0 %	0 %	312136472
6528	NC_014658	GAA	2	6	241223	241228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136472
6529	NC_014658	A	7	7	241265	241271	100 %	0 %	0 %	0 %	312136472
6530	NC_014658	TAAAA	2	10	241375	241384	80 %	20 %	0 %	0 %	312136472
6531	NC_014658	AT	3	6	241386	241391	50 %	50 %	0 %	0 %	312136472
6532	NC_014658	AT	3	6	241404	241409	50 %	50 %	0 %	0 %	312136472
6533	NC_014658	A	6	6	241505	241510	100 %	0 %	0 %	0 %	312136472
6534	NC_014658	CTA	2	6	241731	241736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136472
6535	NC_014658	ATA	2	6	241743	241748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136472
6536	NC_014658	AT	3	6	241760	241765	50 %	50 %	0 %	0 %	312136472
6537	NC_014658	A	6	6	241775	241780	100 %	0 %	0 %	0 %	312136472
6538	NC_014658	TA	3	6	241793	241798	50 %	50 %	0 %	0 %	312136472
6539	NC_014658	TAC	2	6	241807	241812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136472
6540	NC_014658	TAGA	2	8	241842	241849	50 %	25 %	25 %	0 %	312136472
6541	NC_014658	AAT	2	6	241919	241924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136473
6542	NC_014658	GTG	2	6	242005	242010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136473
6543	NC_014658	AAT	2	6	242108	242113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136473
6544	NC_014658	CTG	2	6	242116	242121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136473
6545	NC_014658	TAC	2	6	242159	242164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136473
6546	NC_014658	A	7	7	242193	242199	100 %	0 %	0 %	0 %	312136473
6547	NC_014658	ATT	2	6	242223	242228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136473
6548	NC_014658	TAAAT	2	10	242270	242279	60 %	40 %	0 %	0 %	312136473
6549	NC_014658	A	7	7	242397	242403	100 %	0 %	0 %	0 %	312136473
6550	NC_014658	TAGAA	2	10	242408	242417	60 %	20 %	20 %	0 %	312136473
6551	NC_014658	CTT	2	6	242446	242451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136473
6552	NC_014658	CTA	2	6	242494	242499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136473
6553	NC_014658	AAATAA	2	12	242536	242547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136473
6554	NC_014658	TAG	2	6	242566	242571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136473
6555	NC_014658	TAT	2	6	242669	242674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136473
6556	NC_014658	AT	3	6	242673	242678	50 %	50 %	0 %	0 %	312136473
6557	NC_014658	CAT	2	6	242735	242740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136473
6558	NC_014658	GTT	2	6	242784	242789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136473
6559	NC_014658	TTG	2	6	242825	242830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136473
6560	NC_014658	TTA	2	6	242892	242897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136474
6561	NC_014658	TCA	2	6	242927	242932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136474
6562	NC_014658	ACA	2	6	242942	242947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136474
6563	NC_014658	ATT	2	6	242957	242962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136474
6564	NC_014658	T	7	7	242988	242994	0 %	100 %	0 %	0 %	312136474
6565	NC_014658	AAC	2	6	242995	243000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136474
6566	NC_014658	ACA	2	6	243032	243037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136474
6567	NC_014658	ATT	2	6	243047	243052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136474
6568	NC_014658	T	7	7	243139	243145	0 %	100 %	0 %	0 %	312136474
6569	NC_014658	TTATT	2	10	243162	243171	20 %	80 %	0 %	0 %	312136474
6570	NC_014658	TCT	2	6	243203	243208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136474
6571	NC_014658	T	6	6	243230	243235	0 %	100 %	0 %	0 %	312136474
6572	NC_014658	TCA	2	6	243237	243242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136474
6573	NC_014658	TCT	2	6	243285	243290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136475
6574	NC_014658	ATT	2	6	243342	243347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136475
6575	NC_014658	CTTG	2	8	243363	243370	0 %	50 %	25 %	25 %	312136475
6576	NC_014658	TC	3	6	243422	243427	0 %	50 %	0 %	50 %	312136475
6577	NC_014658	TCT	2	6	243434	243439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136475
6578	NC_014658	T	6	6	243484	243489	0 %	100 %	0 %	0 %	312136475
6579	NC_014658	ATT	2	6	243521	243526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136475
6580	NC_014658	ATTA	2	8	243530	243537	50 %	50 %	0 %	0 %	312136475
6581	NC_014658	TTC	2	6	243539	243544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136475
6582	NC_014658	CAC	2	6	243638	243643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136475
6583	NC_014658	TCA	2	6	243675	243680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136475
6584	NC_014658	CAGGTG	2	12	243688	243699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312136475
6585	NC_014658	ATC	2	6	243762	243767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136475
6586	NC_014658	TGA	2	6	243845	243850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136475
6587	NC_014658	CAAT	2	8	243874	243881	50 %	25 %	0 %	25 %	312136475
6588	NC_014658	TA	3	6	243923	243928	50 %	50 %	0 %	0 %	312136475
6589	NC_014658	T	6	6	243940	243945	0 %	100 %	0 %	0 %	312136475
6590	NC_014658	TCA	2	6	243987	243992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136475
6591	NC_014658	T	7	7	244008	244014	0 %	100 %	0 %	0 %	312136475
6592	NC_014658	T	6	6	244016	244021	0 %	100 %	0 %	0 %	312136475
6593	NC_014658	CTG	2	6	244039	244044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136475
6594	NC_014658	AGG	2	6	244047	244052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136475
6595	NC_014658	ATCC	2	8	244067	244074	25 %	25 %	0 %	50 %	312136475
6596	NC_014658	T	7	7	244127	244133	0 %	100 %	0 %	0 %	312136475
6597	NC_014658	TTCC	2	8	244144	244151	0 %	50 %	0 %	50 %	312136475
6598	NC_014658	ATT	2	6	244161	244166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136475
6599	NC_014658	ATT	2	6	244254	244259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136476
6600	NC_014658	AT	3	6	244309	244314	50 %	50 %	0 %	0 %	312136476
6601	NC_014658	TAT	2	6	244337	244342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136476
6602	NC_014658	TAC	2	6	244357	244362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136476
6603	NC_014658	CAC	2	6	244372	244377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136476
6604	NC_014658	TGT	2	6	244399	244404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136476
6605	NC_014658	AGG	2	6	244406	244411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136476
6606	NC_014658	ATA	2	6	244446	244451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136476
6607	NC_014658	T	6	6	244452	244457	0 %	100 %	0 %	0 %	312136476
6608	NC_014658	TCC	2	6	244520	244525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136476
6609	NC_014658	GTT	2	6	244562	244567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136476
6610	NC_014658	ATTG	2	8	244574	244581	25 %	50 %	25 %	0 %	312136476
6611	NC_014658	T	6	6	244678	244683	0 %	100 %	0 %	0 %	312136476
6612	NC_014658	TAT	2	6	244727	244732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136476
6613	NC_014658	TTC	2	6	244742	244747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136476
6614	NC_014658	ATT	2	6	244754	244759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136476
6615	NC_014658	TAA	2	6	244766	244771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136476
6616	NC_014658	CTT	2	6	244844	244849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136477
6617	NC_014658	ATTAT	2	10	244880	244889	40 %	60 %	0 %	0 %	312136477
6618	NC_014658	CTT	2	6	244890	244895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136477
6619	NC_014658	TAT	2	6	244903	244908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136477
6620	NC_014658	TCT	2	6	244943	244948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136477
6621	NC_014658	CAT	2	6	244981	244986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136477
6622	NC_014658	AGG	2	6	245026	245031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136477
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6624	NC_014658	TAA	2	6	245119	245124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136477
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6987	NC_014658	GCAA	2	8	258664	258671	50 %	0 %	25 %	25 %	312136497
6988	NC_014658	CAA	2	6	258737	258742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136497
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6996	NC_014658	A	6	6	258995	259000	100 %	0 %	0 %	0 %	312136497
6997	NC_014658	A	6	6	259005	259010	100 %	0 %	0 %	0 %	312136497
6998	NC_014658	TTAA	2	8	259081	259088	50 %	50 %	0 %	0 %	312136497
6999	NC_014658	CTG	2	6	259097	259102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136497
7000	NC_014658	AT	3	6	259116	259121	50 %	50 %	0 %	0 %	312136497

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