MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 59856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014507	AT	3	6	4	9	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014507	TAAA	2	8	15	22	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014507	A	7	7	27	33	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014507	TTA	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014507	GAA	2	6	101	106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014507	ATA	2	6	209	214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014507	GTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014507	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014507	AGC	2	6	327	332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014507	TTTTG	2	10	382	391	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014507	ATAA	2	8	411	418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014507	TAA	2	6	422	427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014507	GAGGG	2	10	441	450	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014507	TTC	2	6	485	490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
15	NC_014507	CGG	2	6	515	520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352169
16	NC_014507	ATA	2	6	541	546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352169
17	NC_014507	CA	3	6	583	588	50 %	0 %	0 %	50 %	307352169
18	NC_014507	AGATC	2	10	614	623	40 %	20 %	20 %	20 %	307352169
19	NC_014507	GAAAC	2	10	658	667	60 %	0 %	20 %	20 %	307352169
20	NC_014507	AC	3	6	808	813	50 %	0 %	0 %	50 %	307352169
21	NC_014507	ACA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
22	NC_014507	TTG	2	6	943	948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352169
23	NC_014507	A	6	6	1001	1006	100 %	0 %	0 %	0 %	307352169
24	NC_014507	TCC	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
25	NC_014507	GAA	3	9	1143	1151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
26	NC_014507	TCC	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
27	NC_014507	TGA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352169
28	NC_014507	CAG	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352169
29	NC_014507	CTT	2	6	1467	1472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
30	NC_014507	CAA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
31	NC_014507	GATC	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	307352169
32	NC_014507	GAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
33	NC_014507	CGG	2	6	1807	1812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014507	AGGA	2	8	1943	1950	50 %	0 %	50 %	0 %	307352170
35	NC_014507	AGGA	2	8	1979	1986	50 %	0 %	50 %	0 %	307352170
36	NC_014507	GA	4	8	2074	2081	50 %	0 %	50 %	0 %	307352170
37	NC_014507	CAC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352170
38	NC_014507	TCG	3	9	2174	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352170
39	NC_014507	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352170
40	NC_014507	A	8	8	2306	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	307352170
41	NC_014507	GA	3	6	2358	2363	50 %	0 %	50 %	0 %	307352171
42	NC_014507	TTCG	2	8	2366	2373	0 %	50 %	25 %	25 %	307352171
43	NC_014507	GGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
44	NC_014507	TCGA	2	8	2512	2519	25 %	25 %	25 %	25 %	307352171
45	NC_014507	ACT	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
46	NC_014507	GAA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352171
47	NC_014507	AT	3	6	2721	2726	50 %	50 %	0 %	0 %	307352171
48	NC_014507	TTC	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352171
49	NC_014507	AAC	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352171
50	NC_014507	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352171
51	NC_014507	ATC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
52	NC_014507	AT	3	6	2962	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	307352171
53	NC_014507	CCG	2	6	2999	3004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
54	NC_014507	TG	3	6	3092	3097	0 %	50 %	50 %	0 %	307352171
55	NC_014507	GGA	2	6	3102	3107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
56	NC_014507	TGCAG	2	10	3112	3121	20 %	20 %	40 %	20 %	307352171
57	NC_014507	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
58	NC_014507	CGC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
59	NC_014507	CCTGC	2	10	3279	3288	0 %	20 %	20 %	60 %	307352171
60	NC_014507	CAT	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
61	NC_014507	TGT	2	6	3390	3395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352171
62	NC_014507	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352171
63	NC_014507	T	7	7	3520	3526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014507	A	8	8	3602	3609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014507	TAA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014507	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014507	TA	3	6	3654	3659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014507	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014507	TACA	2	8	3704	3711	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014507	A	6	6	3711	3716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014507	AAT	2	6	3719	3724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014507	GAAT	2	8	3831	3838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014507	ATA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
74	NC_014507	TCT	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352172
75	NC_014507	GCA	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
76	NC_014507	CCG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
77	NC_014507	TAC	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
78	NC_014507	CAG	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
79	NC_014507	GCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
80	NC_014507	CCG	2	6	4127	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
81	NC_014507	GT	3	6	4158	4163	0 %	50 %	50 %	0 %	307352172
82	NC_014507	GTC	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
83	NC_014507	TACA	2	8	4255	4262	50 %	25 %	0 %	25 %	307352172
84	NC_014507	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
85	NC_014507	CTC	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
86	NC_014507	TCC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
87	NC_014507	ATA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
88	NC_014507	TCC	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
89	NC_014507	TCC	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
90	NC_014507	AGA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
91	NC_014507	GTA	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
92	NC_014507	GAA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
93	NC_014507	GATC	2	8	5074	5081	25 %	25 %	25 %	25 %	307352172
94	NC_014507	GAC	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
95	NC_014507	TGA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
96	NC_014507	TGA	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
97	NC_014507	TC	3	6	5253	5258	0 %	50 %	0 %	50 %	307352172
98	NC_014507	AT	3	6	5288	5293	50 %	50 %	0 %	0 %	307352172
99	NC_014507	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
100	NC_014507	GGTG	2	8	5397	5404	0 %	25 %	75 %	0 %	307352172
101	NC_014507	GGA	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
102	NC_014507	CGT	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
103	NC_014507	GTA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
104	NC_014507	GCC	2	6	5571	5576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
105	NC_014507	CGG	2	6	5598	5603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
106	NC_014507	TGT	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352172
107	NC_014507	GAG	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
108	NC_014507	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
109	NC_014507	TC	3	6	5851	5856	0 %	50 %	0 %	50 %	307352172
110	NC_014507	AGA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
111	NC_014507	AGA	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
112	NC_014507	AGG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
113	NC_014507	CTTC	2	8	6141	6148	0 %	50 %	0 %	50 %	307352172
114	NC_014507	AAGG	2	8	6225	6232	50 %	0 %	50 %	0 %	307352172
115	NC_014507	AT	3	6	6237	6242	50 %	50 %	0 %	0 %	307352172
116	NC_014507	AT	3	6	6299	6304	50 %	50 %	0 %	0 %	307352172
117	NC_014507	GAC	2	6	6326	6331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
118	NC_014507	GGC	2	6	6340	6345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
119	NC_014507	C	6	6	6410	6415	0 %	0 %	0 %	100 %	307352172
120	NC_014507	GAA	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
121	NC_014507	AGC	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
122	NC_014507	ATT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352172
123	NC_014507	CCT	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
124	NC_014507	GAACCA	2	12	6544	6555	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307352172
125	NC_014507	ATG	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
126	NC_014507	AGC	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
127	NC_014507	GCT	3	9	6611	6619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
128	NC_014507	TAAT	2	8	6646	6653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014507	A	6	6	6670	6675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014507	TTATA	2	10	6696	6705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014507	GGT	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014507	GAA	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352173
133	NC_014507	T	6	6	6807	6812	0 %	100 %	0 %	0 %	307352173
134	NC_014507	CCT	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
135	NC_014507	TTG	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352173
136	NC_014507	CGG	2	6	7181	7186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352173
137	NC_014507	GAT	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352173
138	NC_014507	TCC	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
139	NC_014507	GGA	2	6	7349	7354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352173
140	NC_014507	TCT	2	6	7361	7366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352173
141	NC_014507	CGA	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352173
142	NC_014507	GTG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352173
143	NC_014507	TGTA	2	8	7501	7508	25 %	50 %	25 %	0 %	307352173
144	NC_014507	AGGC	2	8	7511	7518	25 %	0 %	50 %	25 %	307352173
145	NC_014507	ATA	2	6	7541	7546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014507	TA	3	6	7545	7550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014507	TTTTTG	2	12	7551	7562	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014507	CAA	2	6	7622	7627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014507	A	6	6	7652	7657	100 %	0 %	0 %	0 %	307352174
150	NC_014507	TCGAT	2	10	7693	7702	20 %	40 %	20 %	20 %	307352174
151	NC_014507	GAT	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
152	NC_014507	GAT	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
153	NC_014507	GTT	2	6	7856	7861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352174
154	NC_014507	GGC	2	6	7877	7882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352174
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156	NC_014507	TCC	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352174
157	NC_014507	GAC	2	6	7982	7987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352174
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160	NC_014507	TTC	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352174
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162	NC_014507	TGC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352174
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166	NC_014507	GA	3	6	8422	8427	50 %	0 %	50 %	0 %	307352174
167	NC_014507	CTG	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352174
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169	NC_014507	T	7	7	8450	8456	0 %	100 %	0 %	0 %	307352174
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173	NC_014507	T	6	6	8597	8602	0 %	100 %	0 %	0 %	307352174
174	NC_014507	A	8	8	8624	8631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014507	TTA	2	6	8645	8650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014507	TCT	2	6	8703	8708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_014507	T	7	7	8753	8759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014507	TCA	2	6	8847	8852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_014507	TAA	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352175
181	NC_014507	T	6	6	8894	8899	0 %	100 %	0 %	0 %	307352175
182	NC_014507	AAT	2	6	8956	8961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352175
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232	NC_014507	T	8	8	11538	11545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_014507	ATC	2	6	11656	11661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352179
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248	NC_014507	GAG	2	6	12557	12562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352180
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267	NC_014507	TC	4	8	13512	13519	0 %	50 %	0 %	50 %	307352180
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401	NC_014507	TCT	2	6	19595	19600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352186
402	NC_014507	GTC	2	6	19605	19610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352186
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434	NC_014507	CGG	2	6	21299	21304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_014507	ATTA	2	8	21353	21360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_014507	CTC	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352190
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