MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 13607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_014448	CTT	2	6	833594	833599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373456
13503	NC_014448	TAA	2	6	833623	833628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373456
13504	NC_014448	ACC	2	6	833664	833669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304373456
13505	NC_014448	TGT	2	6	833679	833684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373456
13506	NC_014448	GAG	2	6	833732	833737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304373456
13507	NC_014448	GTA	2	6	833782	833787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373456
13508	NC_014448	AGA	2	6	833831	833836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373456
13509	NC_014448	TAA	2	6	833972	833977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373456
13510	NC_014448	AGC	2	6	834045	834050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304373456
13511	NC_014448	ACC	2	6	834093	834098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304373456
13512	NC_014448	TCT	2	6	834226	834231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373456
13513	NC_014448	TTA	2	6	834307	834312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373456
13514	NC_014448	CTT	2	6	834337	834342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373456
13515	NC_014448	GAT	2	6	834458	834463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373456
13516	NC_014448	TTC	2	6	834507	834512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373456
13517	NC_014448	AAG	2	6	834572	834577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373456
13518	NC_014448	ATT	2	6	834582	834587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373456
13519	NC_014448	ATA	2	6	834666	834671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373456
13520	NC_014448	TCA	2	6	834682	834687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373456
13521	NC_014448	TTG	2	6	834689	834694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373456
13522	NC_014448	TTG	2	6	834919	834924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373456
13523	NC_014448	AAC	2	6	835005	835010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373456
13524	NC_014448	ATT	2	6	835140	835145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373456
13525	NC_014448	TAA	2	6	835245	835250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373456
13526	NC_014448	GTT	2	6	835410	835415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373456
13527	NC_014448	TTG	2	6	835424	835429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373456
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13529	NC_014448	CTG	2	6	835469	835474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304373456
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13531	NC_014448	TAA	2	6	835577	835582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373457
13532	NC_014448	AGA	2	6	835770	835775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373457
13533	NC_014448	AGA	2	6	835783	835788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373457
13534	NC_014448	AAT	2	6	835793	835798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373457
13535	NC_014448	AAT	2	6	835802	835807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373457
13536	NC_014448	CAC	2	6	835837	835842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304373457
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13538	NC_014448	TGA	2	6	835882	835887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373457
13539	NC_014448	CTT	2	6	835924	835929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373457
13540	NC_014448	TCT	3	9	835965	835973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373457
13541	NC_014448	TAA	2	6	836027	836032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373457
13542	NC_014448	TAA	2	6	836054	836059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373457
13543	NC_014448	TGC	2	6	836171	836176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304373457
13544	NC_014448	AAT	2	6	836281	836286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373457
13545	NC_014448	ATA	2	6	836514	836519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_014448	TAA	2	6	836523	836528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_014448	AGG	2	6	836549	836554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_014448	TAT	3	9	836581	836589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_014448	GCA	2	6	836611	836616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_014448	TAA	2	6	836644	836649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_014448	TAA	3	9	836679	836687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_014448	AGG	2	6	836691	836696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_014448	ATT	2	6	836698	836703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_014448	GAT	2	6	836737	836742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_014448	GAT	2	6	836746	836751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_014448	TAA	2	6	836752	836757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_014448	AAT	2	6	836760	836765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_014448	AAT	2	6	836809	836814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_014448	TTA	2	6	836816	836821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_014448	TAC	2	6	836918	836923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13564	NC_014448	GTT	2	6	837136	837141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373458
13565	NC_014448	TGT	2	6	837216	837221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373458
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13569	NC_014448	AAC	2	6	837605	837610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373458
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13573	NC_014448	TAA	2	6	837801	837806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373458
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13592	NC_014448	TAA	2	6	838946	838951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373459
13593	NC_014448	GTA	2	6	839020	839025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373459
13594	NC_014448	TTA	2	6	839039	839044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373459
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13599	NC_014448	CTG	2	6	839183	839188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365897174
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13601	NC_014448	GAA	2	6	839408	839413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_014448	ATA	2	6	839446	839451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_014448	ATT	2	6	839476	839481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_014448	TGA	2	6	839495	839500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_014448	AAT	2	6	839504	839509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_014448	AAT	2	6	839561	839566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_014448	AAT	2	6	839580	839585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.