MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Micromonospora aurantiaca ATCC 27029 chromosome

Total Repeats: 217682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014391	CT	3	6	100462	100467	0 %	50 %	0 %	50 %	302864608
3002	NC_014391	GC	3	6	100477	100482	0 %	0 %	50 %	50 %	302864608
3003	NC_014391	CGGC	2	8	100517	100524	0 %	0 %	50 %	50 %	302864608
3004	NC_014391	GCT	2	6	100539	100544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864608
3005	NC_014391	TCG	2	6	100562	100567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864608
3006	NC_014391	AGC	2	6	100607	100612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864608
3007	NC_014391	CGCCGA	2	12	100613	100624	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302864608
3008	NC_014391	GAA	2	6	100683	100688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302864608
3009	NC_014391	GCGG	2	8	100722	100729	0 %	0 %	75 %	25 %	302864608
3010	NC_014391	CGC	3	9	100740	100748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864608
3011	NC_014391	CGGC	2	8	100749	100756	0 %	0 %	50 %	50 %	302864608
3012	NC_014391	GCCG	2	8	100779	100786	0 %	0 %	50 %	50 %	302864608
3013	NC_014391	GCC	2	6	100807	100812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864608
3014	NC_014391	GCGG	2	8	100813	100820	0 %	0 %	75 %	25 %	302864608
3015	NC_014391	ACC	2	6	100823	100828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864608
3016	NC_014391	GCA	2	6	100833	100838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864608
3017	NC_014391	GAT	2	6	100845	100850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302864608
3018	NC_014391	CAG	2	6	100867	100872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864608
3019	NC_014391	CTC	2	6	100911	100916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302864608
3020	NC_014391	CGC	2	6	100926	100931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864608
3021	NC_014391	CGC	2	6	100935	100940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864608
3022	NC_014391	TGG	2	6	101024	101029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864608
3023	NC_014391	GGC	2	6	101052	101057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864608
3024	NC_014391	CGGGC	2	10	101065	101074	0 %	0 %	60 %	40 %	302864608
3025	NC_014391	AAG	2	6	101116	101121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302864608
3026	NC_014391	CGT	2	6	101127	101132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864608
3027	NC_014391	GCCCGG	2	12	101141	101152	0 %	0 %	50 %	50 %	302864608
3028	NC_014391	GAA	2	6	101166	101171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302864608
3029	NC_014391	CCGGCC	2	12	101198	101209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864608
3030	NC_014391	AGGTCG	2	12	101285	101296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	302864608
3031	NC_014391	GAC	2	6	101305	101310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864608
3032	NC_014391	GC	3	6	101312	101317	0 %	0 %	50 %	50 %	302864608
3033	NC_014391	GTG	2	6	101425	101430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864608
3034	NC_014391	GAG	2	6	101500	101505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864608
3035	NC_014391	CTC	2	6	101559	101564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302864608
3036	NC_014391	CAGAG	2	10	101612	101621	40 %	0 %	40 %	20 %	302864608
3037	NC_014391	GCC	2	6	101670	101675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864608
3038	NC_014391	GTG	2	6	101678	101683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864608
3039	NC_014391	TCCCGA	2	12	101699	101710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302864608
3040	NC_014391	CCG	2	6	101716	101721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864608
3041	NC_014391	AGC	2	6	101749	101754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_014391	TGT	2	6	101789	101794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014391	GT	3	6	101811	101816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014391	TGG	2	6	101818	101823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_014391	CGC	2	6	101830	101835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_014391	GTCGC	2	10	101867	101876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3047	NC_014391	ACGA	2	8	101936	101943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_014391	GTGGC	2	10	101964	101973	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3049	NC_014391	GCA	2	6	101978	101983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014391	GC	3	6	102027	102032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_014391	GTG	2	6	102057	102062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014391	CGG	2	6	102082	102087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_014391	GCG	3	9	102099	102107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014391	TAG	2	6	102142	102147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014391	GTG	2	6	102163	102168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_014391	GGC	2	6	102189	102194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_014391	TGG	2	6	102241	102246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864609
3058	NC_014391	ATC	2	6	102324	102329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864609
3059	NC_014391	CGT	2	6	102373	102378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_014391	ACC	2	6	102434	102439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_014391	CA	3	6	102441	102446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_014391	CAGG	2	8	102504	102511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_014391	CCA	2	6	102533	102538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_014391	TGA	2	6	102645	102650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014391	TGC	2	6	102676	102681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_014391	CAA	2	6	102685	102690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_014391	GCA	2	6	102782	102787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_014391	AG	3	6	102845	102850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014391	CGGC	2	8	102863	102870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_014391	CGT	2	6	102887	102892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_014391	CCA	2	6	102905	102910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_014391	CCG	2	6	102988	102993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_014391	CGGA	2	8	103006	103013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_014391	ATC	2	6	103104	103109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_014391	TC	3	6	103128	103133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_014391	GAC	2	6	103146	103151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_014391	TGT	2	6	103267	103272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014391	TGC	2	6	103292	103297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_014391	C	6	6	103418	103423	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3080	NC_014391	TGC	2	6	103424	103429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_014391	AGC	2	6	103506	103511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_014391	TGC	2	6	103538	103543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_014391	GGCA	2	8	103580	103587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_014391	AAG	2	6	103589	103594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014391	ATC	2	6	103701	103706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_014391	GGCG	2	8	103783	103790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_014391	AGCGT	2	10	103795	103804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3088	NC_014391	CG	3	6	103821	103826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_014391	AGCG	2	8	103827	103834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_014391	GGGC	2	8	103865	103872	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_014391	CGG	3	9	103917	103925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864610
3092	NC_014391	CGG	2	6	103936	103941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864610
3093	NC_014391	GCC	2	6	103965	103970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864610
3094	NC_014391	GGC	2	6	103982	103987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864610
3095	NC_014391	CAC	2	6	104087	104092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864610
3096	NC_014391	CCGG	2	8	104105	104112	0 %	0 %	50 %	50 %	302864610
3097	NC_014391	TCG	2	6	104124	104129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864610
3098	NC_014391	CACGCC	2	12	104201	104212	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	302864610
3099	NC_014391	GCA	2	6	104242	104247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864610
3100	NC_014391	GC	3	6	104254	104259	0 %	0 %	50 %	50 %	302864610
3101	NC_014391	CGGGC	2	10	104384	104393	0 %	0 %	60 %	40 %	302864610
3102	NC_014391	CAG	2	6	104396	104401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864610
3103	NC_014391	CGG	2	6	104407	104412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864610
3104	NC_014391	TCG	2	6	104445	104450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864610
3105	NC_014391	ACGA	2	8	104508	104515	50 %	0 %	25 %	25 %	302864610
3106	NC_014391	GTT	2	6	104578	104583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302864611
3107	NC_014391	CTC	3	9	104605	104613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302864611
3108	NC_014391	CGGT	2	8	104625	104632	0 %	25 %	50 %	25 %	302864611
3109	NC_014391	CGT	2	6	104682	104687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864611
3110	NC_014391	GCA	2	6	104694	104699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864611
3111	NC_014391	AGC	2	6	104732	104737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864611
3112	NC_014391	CGGTGG	2	12	104742	104753	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	302864611
3113	NC_014391	GGC	2	6	104847	104852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864612
3114	NC_014391	CCG	2	6	104853	104858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864612
3115	NC_014391	GAT	2	6	104890	104895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302864612
3116	NC_014391	GGT	2	6	104929	104934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864612
3117	NC_014391	AGC	2	6	104942	104947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864612
3118	NC_014391	ACC	2	6	104990	104995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864612
3119	NC_014391	GCT	2	6	105021	105026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864612
3120	NC_014391	GCC	2	6	105099	105104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864612
3121	NC_014391	TCC	2	6	105200	105205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302864612
3122	NC_014391	ACC	3	9	105221	105229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864612
3123	NC_014391	CCG	2	6	105279	105284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864612
3124	NC_014391	GGCTTC	2	12	105287	105298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864612
3125	NC_014391	GGT	2	6	105310	105315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864612
3126	NC_014391	CCG	3	9	105333	105341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864612
3127	NC_014391	GCTG	2	8	105360	105367	0 %	25 %	50 %	25 %	302864612
3128	NC_014391	TGG	2	6	105380	105385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864612
3129	NC_014391	CGA	2	6	105390	105395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864612
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3140	NC_014391	GCA	2	6	105720	105725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864612
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3143	NC_014391	CCG	2	6	105776	105781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3144	NC_014391	GGC	2	6	105797	105802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3146	NC_014391	TCC	2	6	105833	105838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3147	NC_014391	GGCG	2	8	105839	105846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3148	NC_014391	CCG	2	6	105848	105853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3149	NC_014391	CGGG	2	8	105862	105869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3150	NC_014391	ACC	2	6	105898	105903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3151	NC_014391	CGGG	2	8	105909	105916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3152	NC_014391	CTG	2	6	105949	105954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_014391	CCG	2	6	105957	105962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3154	NC_014391	CCGG	2	8	105996	106003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3155	NC_014391	ACC	2	6	106048	106053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3156	NC_014391	GTG	2	6	106129	106134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_014391	GCCGG	2	10	106151	106160	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3158	NC_014391	G	6	6	106180	106185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_014391	GCTC	2	8	106188	106195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3162	NC_014391	CGG	2	6	106288	106293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3239	NC_014391	GAG	2	6	108815	108820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864615
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3247	NC_014391	GCG	2	6	109182	109187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864615
3248	NC_014391	TCG	2	6	109233	109238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864615
3249	NC_014391	TCGAG	2	10	109263	109272	20 %	20 %	40 %	20 %	302864615
3250	NC_014391	CG	3	6	109386	109391	0 %	0 %	50 %	50 %	302864615
3251	NC_014391	CGA	2	6	109402	109407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864615
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3253	NC_014391	ACC	2	6	109466	109471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864615
3254	NC_014391	CG	3	6	109472	109477	0 %	0 %	50 %	50 %	302864615
3255	NC_014391	GCT	2	6	109486	109491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864615
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3257	NC_014391	GGCGAG	2	12	109523	109534	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	302864615
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3269	NC_014391	AGCG	2	8	109916	109923	25 %	0 %	50 %	25 %	302864615
3270	NC_014391	CTG	2	6	109930	109935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864615
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3273	NC_014391	GAG	2	6	110003	110008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864615
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3279	NC_014391	ACG	2	6	110224	110229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3280	NC_014391	GCG	2	6	110230	110235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3281	NC_014391	GCC	3	9	110249	110257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3282	NC_014391	GTG	2	6	110275	110280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864616
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3313	NC_014391	CTTCTG	2	12	111007	111018	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3322	NC_014391	GCCC	2	8	111249	111256	0 %	0 %	25 %	75 %	302864617
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3370	NC_014391	GGC	2	6	112429	112434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864618
3371	NC_014391	GCTGGC	2	12	112453	112464	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302864618
3372	NC_014391	TGA	2	6	112485	112490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302864618
3373	NC_014391	GCTC	2	8	112521	112528	0 %	25 %	25 %	50 %	302864618
3374	NC_014391	CTG	2	6	112565	112570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864618
3375	NC_014391	CGC	2	6	112582	112587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864618
3376	NC_014391	CGG	2	6	112605	112610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864618
3377	NC_014391	TCGT	2	8	112622	112629	0 %	50 %	25 %	25 %	302864618
3378	NC_014391	GGT	3	9	112642	112650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864618
3379	NC_014391	GGT	2	6	112663	112668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864618
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3383	NC_014391	CCA	2	6	112758	112763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864618
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3390	NC_014391	CGG	2	6	112962	112967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864618
3391	NC_014391	CCGG	2	8	113049	113056	0 %	0 %	50 %	50 %	302864618
3392	NC_014391	GGT	2	6	113068	113073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864618
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3396	NC_014391	GCCG	2	8	113158	113165	0 %	0 %	50 %	50 %	302864618
3397	NC_014391	GGT	2	6	113185	113190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864618
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3399	NC_014391	CTG	3	9	113216	113224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864618
3400	NC_014391	CGC	2	6	113240	113245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864618
3401	NC_014391	GACG	2	8	113264	113271	25 %	0 %	50 %	25 %	302864618
3402	NC_014391	GTG	2	6	113285	113290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864618
3403	NC_014391	CGA	2	6	113296	113301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864618
3404	NC_014391	TCG	2	6	113316	113321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864618
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3406	NC_014391	ACCG	2	8	113421	113428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3407	NC_014391	GTC	2	6	113435	113440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3483	NC_014391	GTCCTC	2	12	116288	116299	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302864620
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3489	NC_014391	TCGC	2	8	116490	116497	0 %	25 %	25 %	50 %	302864620
3490	NC_014391	GTC	2	6	116535	116540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864620
3491	NC_014391	GCG	3	9	116565	116573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864620
3492	NC_014391	CGG	2	6	116594	116599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864620
3493	NC_014391	CCT	2	6	116619	116624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3494	NC_014391	GAAA	2	8	116709	116716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_014391	CCGA	2	8	116726	116733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3496	NC_014391	GCG	2	6	116737	116742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_014391	GGT	2	6	116792	116797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_014391	TCG	2	6	116813	116818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_014391	CGGT	2	8	116842	116849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3500	NC_014391	CCG	2	6	116862	116867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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