MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	AG	3	6	1390	1395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014254	AG	3	6	1439	1444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014254	AG	3	6	1489	1494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014254	AG	3	6	1539	1544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014254	AG	3	6	1589	1594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014254	CA	3	6	2190	2195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014254	AT	3	6	2882	2887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014254	TA	3	6	3041	3046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014254	GA	3	6	3455	3460	50 %	0 %	50 %	0 %	298676129
10	NC_014254	TC	3	6	3731	3736	0 %	50 %	0 %	50 %	298676129
11	NC_014254	AG	3	6	3811	3816	50 %	0 %	50 %	0 %	298676129
12	NC_014254	TG	3	6	4307	4312	0 %	50 %	50 %	0 %	298676130
13	NC_014254	AT	3	6	4447	4452	50 %	50 %	0 %	0 %	298676130
14	NC_014254	GA	3	6	7056	7061	50 %	0 %	50 %	0 %	298676130
15	NC_014254	GA	3	6	7396	7401	50 %	0 %	50 %	0 %	298676130
16	NC_014254	GA	3	6	7735	7740	50 %	0 %	50 %	0 %	298676131
17	NC_014254	TA	3	6	8305	8310	50 %	50 %	0 %	0 %	298676131
18	NC_014254	TA	3	6	8566	8571	50 %	50 %	0 %	0 %	298676131
19	NC_014254	AT	3	6	9322	9327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014254	TA	3	6	9343	9348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014254	AT	3	6	10073	10078	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
22	NC_014254	TA	3	6	10088	10093	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
23	NC_014254	TA	3	6	10369	10374	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
24	NC_014254	AT	3	6	10892	10897	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
25	NC_014254	TA	3	6	10954	10959	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
26	NC_014254	AG	3	6	11289	11294	50 %	0 %	50 %	0 %	298676132
27	NC_014254	AT	3	6	11363	11368	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
28	NC_014254	AT	5	10	12027	12036	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
29	NC_014254	CA	3	6	12468	12473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014254	TA	3	6	12926	12931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014254	TA	3	6	13009	13014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014254	AT	3	6	13076	13081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014254	AT	3	6	14989	14994	50 %	50 %	0 %	0 %	298676133
34	NC_014254	GT	3	6	16209	16214	0 %	50 %	50 %	0 %	298676134
35	NC_014254	GA	3	6	16618	16623	50 %	0 %	50 %	0 %	298676134
36	NC_014254	TC	3	6	16645	16650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014254	AT	3	6	16908	16913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014254	AT	4	8	16933	16940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014254	CA	3	6	18626	18631	50 %	0 %	0 %	50 %	298676136
40	NC_014254	AT	3	6	20591	20596	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
41	NC_014254	AT	3	6	20751	20756	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
42	NC_014254	AT	3	6	21552	21557	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
43	NC_014254	TA	3	6	22260	22265	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
44	NC_014254	AT	3	6	24051	24056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014254	TA	3	6	24068	24073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014254	TA	3	6	24285	24290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014254	TA	4	8	24388	24395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014254	TA	3	6	24881	24886	50 %	50 %	0 %	0 %	298676137
49	NC_014254	AG	3	6	24936	24941	50 %	0 %	50 %	0 %	298676137
50	NC_014254	CT	3	6	25161	25166	0 %	50 %	0 %	50 %	298676137
51	NC_014254	AT	3	6	25733	25738	50 %	50 %	0 %	0 %	298676138
52	NC_014254	TA	3	6	26437	26442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014254	AT	3	6	27145	27150	50 %	50 %	0 %	0 %	298676139
54	NC_014254	TG	3	6	30312	30317	0 %	50 %	50 %	0 %	298676141
55	NC_014254	GT	3	6	30697	30702	0 %	50 %	50 %	0 %	298676141
56	NC_014254	TC	3	6	30970	30975	0 %	50 %	0 %	50 %	298676142
57	NC_014254	TG	3	6	31151	31156	0 %	50 %	50 %	0 %	298676142
58	NC_014254	TG	4	8	31200	31207	0 %	50 %	50 %	0 %	298676142
59	NC_014254	TG	3	6	32481	32486	0 %	50 %	50 %	0 %	298676143
60	NC_014254	TC	3	6	32517	32522	0 %	50 %	0 %	50 %	298676143
61	NC_014254	AT	4	8	34194	34201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014254	CA	3	6	34258	34263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014254	TA	3	6	34510	34515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014254	AT	3	6	34518	34523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014254	AT	3	6	36598	36603	50 %	50 %	0 %	0 %	298676147
66	NC_014254	TA	3	6	37044	37049	50 %	50 %	0 %	0 %	298676147
67	NC_014254	CA	3	6	37734	37739	50 %	0 %	0 %	50 %	298676148
68	NC_014254	TA	3	6	39671	39676	50 %	50 %	0 %	0 %	298676149
69	NC_014254	AT	3	6	39796	39801	50 %	50 %	0 %	0 %	298676149
70	NC_014254	AT	4	8	40309	40316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014254	AG	3	6	40639	40644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014254	TA	3	6	40655	40660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014254	AT	4	8	41165	41172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014254	AT	3	6	41784	41789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014254	TC	3	6	43402	43407	0 %	50 %	0 %	50 %	298676151
76	NC_014254	TA	3	6	43782	43787	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
77	NC_014254	TA	3	6	44184	44189	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
78	NC_014254	TA	4	8	44666	44673	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
79	NC_014254	AT	3	6	45088	45093	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
80	NC_014254	AT	3	6	45334	45339	50 %	50 %	0 %	0 %	298676152
81	NC_014254	TA	3	6	45737	45742	50 %	50 %	0 %	0 %	298676152
82	NC_014254	AT	3	6	46536	46541	50 %	50 %	0 %	0 %	298676153
83	NC_014254	TA	4	8	46578	46585	50 %	50 %	0 %	0 %	298676153
84	NC_014254	TA	3	6	47046	47051	50 %	50 %	0 %	0 %	298676153
85	NC_014254	AT	5	10	48640	48649	50 %	50 %	0 %	0 %	298676154
86	NC_014254	AT	3	6	49165	49170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014254	TA	3	6	49285	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	298676155
88	NC_014254	AT	3	6	50121	50126	50 %	50 %	0 %	0 %	298676155
89	NC_014254	AC	3	6	52188	52193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014254	AC	3	6	53252	53257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014254	AT	3	6	53648	53653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014254	AT	3	6	53655	53660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014254	TA	3	6	53918	53923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014254	AT	3	6	54294	54299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014254	AT	3	6	54399	54404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014254	AT	3	6	54682	54687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014254	TA	3	6	54853	54858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014254	TC	3	6	55304	55309	0 %	50 %	0 %	50 %	298676158
99	NC_014254	TG	3	6	56121	56126	0 %	50 %	50 %	0 %	298676158
100	NC_014254	TA	3	6	56368	56373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014254	TA	3	6	56393	56398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014254	AT	3	6	56428	56433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014254	TA	3	6	56500	56505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014254	AT	3	6	57021	57026	50 %	50 %	0 %	0 %	298676159
105	NC_014254	CT	3	6	57502	57507	0 %	50 %	0 %	50 %	298676159
106	NC_014254	TC	3	6	58154	58159	0 %	50 %	0 %	50 %	298676160
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108	NC_014254	CT	3	6	59881	59886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014254	CT	3	6	60220	60225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014254	CT	3	6	60317	60322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014254	TG	3	6	60538	60543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014254	TA	3	6	60653	60658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014254	TA	3	6	60726	60731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014254	AT	3	6	61177	61182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014254	AT	3	6	61942	61947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014254	TA	3	6	62281	62286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014254	AT	3	6	62398	62403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014254	TA	3	6	66594	66599	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
119	NC_014254	TA	3	6	67801	67806	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
120	NC_014254	AT	3	6	68404	68409	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
121	NC_014254	AT	3	6	68517	68522	50 %	50 %	0 %	0 %	298676163
122	NC_014254	TG	3	6	68579	68584	0 %	50 %	50 %	0 %	298676163
123	NC_014254	TG	3	6	68918	68923	0 %	50 %	50 %	0 %	298676163
124	NC_014254	AT	3	6	69235	69240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014254	AT	3	6	69251	69256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014254	AT	3	6	69355	69360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_014254	AT	3	6	69717	69722	50 %	50 %	0 %	0 %	298676164
129	NC_014254	AT	3	6	70596	70601	50 %	50 %	0 %	0 %	298676164
130	NC_014254	AG	3	6	71392	71397	50 %	0 %	50 %	0 %	298676164
131	NC_014254	TA	3	6	71481	71486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014254	TA	3	6	71609	71614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014254	AT	3	6	72002	72007	50 %	50 %	0 %	0 %	298676165
134	NC_014254	TA	3	6	72736	72741	50 %	50 %	0 %	0 %	298676165
135	NC_014254	AT	3	6	73243	73248	50 %	50 %	0 %	0 %	298676165
136	NC_014254	AT	3	6	73482	73487	50 %	50 %	0 %	0 %	298676166
137	NC_014254	TA	3	6	74173	74178	50 %	50 %	0 %	0 %	298676166
138	NC_014254	TA	3	6	74874	74879	50 %	50 %	0 %	0 %	298676167
139	NC_014254	AT	3	6	75006	75011	50 %	50 %	0 %	0 %	298676167
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141	NC_014254	AT	3	6	77605	77610	50 %	50 %	0 %	0 %	298676167
142	NC_014254	TA	3	6	78064	78069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014254	TA	3	6	78081	78086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_014254	TA	3	6	79918	79923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014254	CA	3	6	80309	80314	50 %	0 %	0 %	50 %	298676171
149	NC_014254	GA	3	6	80336	80341	50 %	0 %	50 %	0 %	298676171
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.