MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	AAAC	2	8	172	179	75 %	0 %	0 %	25 %	298676128
2	NC_014254	TGAT	2	8	1348	1355	25 %	50 %	25 %	0 %	298676128
3	NC_014254	ATTG	2	8	1661	1668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014254	ATCT	2	8	1930	1937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014254	TGCA	2	8	2184	2191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014254	ACTG	2	8	2451	2458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014254	AAAT	2	8	2538	2545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014254	TTAA	2	8	2556	2563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014254	TCAT	2	8	2769	2776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014254	ATAC	2	8	2981	2988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014254	ATAC	2	8	3380	3387	50 %	25 %	0 %	25 %	298676129
12	NC_014254	TTCA	2	8	3525	3532	25 %	50 %	0 %	25 %	298676129
13	NC_014254	TACA	2	8	3649	3656	50 %	25 %	0 %	25 %	298676129
14	NC_014254	ACCA	2	8	5736	5743	50 %	0 %	0 %	50 %	298676130
15	NC_014254	ATGG	2	8	6116	6123	25 %	25 %	50 %	0 %	298676130
16	NC_014254	CAGC	2	8	6413	6420	25 %	0 %	25 %	50 %	298676130
17	NC_014254	CCAG	2	8	6751	6758	25 %	0 %	25 %	50 %	298676130
18	NC_014254	ACCA	2	8	7089	7096	50 %	0 %	0 %	50 %	298676130
19	NC_014254	CCAG	2	8	7430	7437	25 %	0 %	25 %	50 %	298676130
20	NC_014254	CCAG	2	8	7769	7776	25 %	0 %	25 %	50 %	298676131
21	NC_014254	TTTG	2	8	8142	8149	0 %	75 %	25 %	0 %	298676131
22	NC_014254	GTAT	2	8	8461	8468	25 %	50 %	25 %	0 %	298676131
23	NC_014254	CAGC	2	8	8469	8476	25 %	0 %	25 %	50 %	298676131
24	NC_014254	AACA	2	8	8918	8925	75 %	0 %	0 %	25 %	298676131
25	NC_014254	ACAG	2	8	8958	8965	50 %	0 %	25 %	25 %	298676131
26	NC_014254	TTTG	2	8	9528	9535	0 %	75 %	25 %	0 %	298676132
27	NC_014254	CTAA	2	8	9712	9719	50 %	25 %	0 %	25 %	298676132
28	NC_014254	AAAT	2	8	9984	9991	75 %	25 %	0 %	0 %	298676132
29	NC_014254	GGCG	2	8	10468	10475	0 %	0 %	75 %	25 %	298676132
30	NC_014254	AAAG	2	8	10912	10919	75 %	0 %	25 %	0 %	298676132
31	NC_014254	TGAT	2	8	11075	11082	25 %	50 %	25 %	0 %	298676132
32	NC_014254	TTCG	2	8	11614	11621	0 %	50 %	25 %	25 %	298676132
33	NC_014254	GTCT	2	8	11990	11997	0 %	50 %	25 %	25 %	298676132
34	NC_014254	TCCT	2	8	12452	12459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014254	AAGG	2	8	12740	12747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014254	GAAA	2	8	13222	13229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014254	ACAA	2	8	13302	13309	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014254	ACAA	2	8	13420	13427	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014254	TTGA	2	8	13428	13435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014254	ATCA	2	8	13438	13445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014254	CAAG	2	8	13651	13658	50 %	0 %	25 %	25 %	298676133
42	NC_014254	CTTT	2	8	14695	14702	0 %	75 %	0 %	25 %	298676133
43	NC_014254	TGAT	2	8	15118	15125	25 %	50 %	25 %	0 %	298676133
44	NC_014254	TTAT	2	8	15156	15163	25 %	75 %	0 %	0 %	298676133
45	NC_014254	ATGT	2	8	15405	15412	25 %	50 %	25 %	0 %	298676134
46	NC_014254	AAGA	2	8	15760	15767	75 %	0 %	25 %	0 %	298676134
47	NC_014254	ATCA	2	8	15883	15890	50 %	25 %	0 %	25 %	298676134
48	NC_014254	CAGT	2	8	16114	16121	25 %	25 %	25 %	25 %	298676134
49	NC_014254	ATCA	2	8	17105	17112	50 %	25 %	0 %	25 %	298676135
50	NC_014254	GACT	2	8	17113	17120	25 %	25 %	25 %	25 %	298676135
51	NC_014254	CTTT	2	8	17180	17187	0 %	75 %	0 %	25 %	298676135
52	NC_014254	CCTG	2	8	17480	17487	0 %	25 %	25 %	50 %	298676135
53	NC_014254	CCAT	2	8	17854	17861	25 %	25 %	0 %	50 %	298676135
54	NC_014254	TAAC	2	8	18054	18061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014254	GACA	2	8	18130	18137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014254	GTTT	2	8	18917	18924	0 %	75 %	25 %	0 %	298676136
57	NC_014254	CATC	2	8	19002	19009	25 %	25 %	0 %	50 %	298676136
58	NC_014254	AGGA	2	8	19579	19586	50 %	0 %	50 %	0 %	298676136
59	NC_014254	CCCA	2	8	20262	20269	25 %	0 %	0 %	75 %	298676136
60	NC_014254	ATTA	2	8	20641	20648	50 %	50 %	0 %	0 %	298676136
61	NC_014254	GTAG	2	8	20803	20810	25 %	25 %	50 %	0 %	298676136
62	NC_014254	TTTC	2	8	21234	21241	0 %	75 %	0 %	25 %	298676136
63	NC_014254	TGAT	2	8	21521	21528	25 %	50 %	25 %	0 %	298676136
64	NC_014254	TCAA	2	8	21542	21549	50 %	25 %	0 %	25 %	298676136
65	NC_014254	TCTG	2	8	21787	21794	0 %	50 %	25 %	25 %	298676136
66	NC_014254	ACCA	2	8	22236	22243	50 %	0 %	0 %	50 %	298676136
67	NC_014254	CCAT	2	8	22765	22772	25 %	25 %	0 %	50 %	298676136
68	NC_014254	AATG	2	8	23138	23145	50 %	25 %	25 %	0 %	298676136
69	NC_014254	GGAT	2	8	23164	23171	25 %	25 %	50 %	0 %	298676136
70	NC_014254	GATA	2	8	23249	23256	50 %	25 %	25 %	0 %	298676136
71	NC_014254	AAAT	2	8	23465	23472	75 %	25 %	0 %	0 %	298676136
72	NC_014254	TTGT	2	8	23642	23649	0 %	75 %	25 %	0 %	298676136
73	NC_014254	CTTT	2	8	23811	23818	0 %	75 %	0 %	25 %	298676136
74	NC_014254	TATT	2	8	24084	24091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014254	TAAT	2	8	24263	24270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014254	TCTG	2	8	24622	24629	0 %	50 %	25 %	25 %	298676137
77	NC_014254	TAAC	2	8	25697	25704	50 %	25 %	0 %	25 %	298676138
78	NC_014254	TAGA	2	8	26162	26169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014254	ACCA	2	8	26217	26224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014254	TGAT	2	8	26349	26356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014254	TTTC	2	8	26405	26412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014254	TATC	2	8	27029	27036	25 %	50 %	0 %	25 %	298676139
83	NC_014254	GGAT	2	8	27270	27277	25 %	25 %	50 %	0 %	298676139
84	NC_014254	GGTT	2	8	28504	28511	0 %	50 %	50 %	0 %	298676140
85	NC_014254	ATGT	2	8	29424	29431	25 %	50 %	25 %	0 %	298676141
86	NC_014254	TTTC	2	8	29438	29445	0 %	75 %	0 %	25 %	298676141
87	NC_014254	TTTC	2	8	30146	30153	0 %	75 %	0 %	25 %	298676141
88	NC_014254	CTTT	2	8	31982	31989	0 %	75 %	0 %	25 %	298676142
89	NC_014254	ATAA	2	8	32185	32192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014254	CAAC	2	8	32796	32803	50 %	0 %	0 %	50 %	298676143
91	NC_014254	CAGA	2	8	33327	33334	50 %	0 %	25 %	25 %	298676143
92	NC_014254	TTTA	2	8	33588	33595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014254	TATC	2	8	33745	33752	25 %	50 %	0 %	25 %	298676144
94	NC_014254	TTGG	2	8	33807	33814	0 %	50 %	50 %	0 %	298676144
95	NC_014254	TGTT	2	8	34248	34255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014254	ATTA	2	8	34278	34285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014254	ATTT	2	8	34617	34624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014254	TTAT	2	8	35235	35242	25 %	75 %	0 %	0 %	298676145
99	NC_014254	TAAA	2	8	36529	36536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014254	TCAA	2	8	37018	37025	50 %	25 %	0 %	25 %	298676147
101	NC_014254	ATAA	2	8	37632	37639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014254	AAGA	2	8	37995	38002	75 %	0 %	25 %	0 %	298676148
103	NC_014254	GTTT	2	8	38143	38150	0 %	75 %	25 %	0 %	298676148
104	NC_014254	CAAA	2	8	38901	38908	75 %	0 %	0 %	25 %	298676148
105	NC_014254	ATGA	2	8	39093	39100	50 %	25 %	25 %	0 %	298676149
106	NC_014254	GAAT	2	8	39191	39198	50 %	25 %	25 %	0 %	298676149
107	NC_014254	TATC	2	8	39342	39349	25 %	50 %	0 %	25 %	298676149
108	NC_014254	AAAC	2	8	39609	39616	75 %	0 %	0 %	25 %	298676149
109	NC_014254	AATT	2	8	39770	39777	50 %	50 %	0 %	0 %	298676149
110	NC_014254	ATTC	2	8	40526	40533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014254	CAAA	2	8	40583	40590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014254	ATTT	2	8	40627	40634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014254	TAAC	2	8	41268	41275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014254	GATT	2	8	41292	41299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014254	GATT	2	8	41454	41461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014254	TGAT	2	8	41954	41961	25 %	50 %	25 %	0 %	298676150
117	NC_014254	TTTG	2	8	42059	42066	0 %	75 %	25 %	0 %	298676150
118	NC_014254	CTAC	2	8	42410	42417	25 %	25 %	0 %	50 %	298676150
119	NC_014254	ATTA	2	8	42418	42425	50 %	50 %	0 %	0 %	298676150
120	NC_014254	AAAT	2	8	42712	42719	75 %	25 %	0 %	0 %	298676150
121	NC_014254	ATAA	2	8	43231	43238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014254	TTTA	2	8	43358	43365	25 %	75 %	0 %	0 %	298676151
123	NC_014254	TTAT	2	8	43526	43533	25 %	75 %	0 %	0 %	298676151
124	NC_014254	TTTA	2	8	43874	43881	25 %	75 %	0 %	0 %	298676151
125	NC_014254	ATTA	2	8	44141	44148	50 %	50 %	0 %	0 %	298676151
126	NC_014254	TCTA	2	8	44660	44667	25 %	50 %	0 %	25 %	298676151
127	NC_014254	AATT	2	8	45130	45137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014254	GTAA	2	8	45203	45210	50 %	25 %	25 %	0 %	298676152
129	NC_014254	TTAA	2	8	46160	46167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014254	TAAA	2	8	46599	46606	75 %	25 %	0 %	0 %	298676153
131	NC_014254	TAAA	2	8	46719	46726	75 %	25 %	0 %	0 %	298676153
132	NC_014254	ATTT	2	8	46779	46786	25 %	75 %	0 %	0 %	298676153
133	NC_014254	AAAT	2	8	46840	46847	75 %	25 %	0 %	0 %	298676153
134	NC_014254	TATG	2	8	46984	46991	25 %	50 %	25 %	0 %	298676153
135	NC_014254	ATTA	2	8	47510	47517	50 %	50 %	0 %	0 %	298676154
136	NC_014254	ATTT	2	8	48347	48354	25 %	75 %	0 %	0 %	298676154
137	NC_014254	ATAA	2	8	48356	48363	75 %	25 %	0 %	0 %	298676154
138	NC_014254	TAAA	2	8	48673	48680	75 %	25 %	0 %	0 %	298676154
139	NC_014254	TAAA	2	8	49016	49023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014254	TATT	2	8	49050	49057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014254	TGTA	2	8	49198	49205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014254	AGAT	2	8	49234	49241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014254	TTCC	2	8	49357	49364	0 %	50 %	0 %	50 %	298676155
144	NC_014254	CCAG	2	8	49415	49422	25 %	0 %	25 %	50 %	298676155
145	NC_014254	TTTG	2	8	49931	49938	0 %	75 %	25 %	0 %	298676155
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445	NC_014254	TTAT	2	8	163900	163907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.