MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 chromosome

Total Repeats: 970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014253	ATGTAA	2	12	1313	1324	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298673979
2	NC_014253	CAGAAC	2	12	4866	4877	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298673983
3	NC_014253	AAAGTA	2	12	10472	10483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298673987
4	NC_014253	TCCAGC	2	12	10632	10643	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298673987
5	NC_014253	CTTTTT	2	12	10922	10933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014253	TAAAAT	2	12	17325	17336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014253	TGCCCT	2	12	19752	19763	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298673996
8	NC_014253	AATCTT	2	12	26001	26012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014253	TAAAAA	2	12	26150	26161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014253	AACAGA	2	12	26601	26612	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298674004
11	NC_014253	TATCCG	2	12	26856	26867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674005
12	NC_014253	CATTAT	2	12	27134	27145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674005
13	NC_014253	GACCTT	2	12	32793	32804	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674010
14	NC_014253	TTTAAA	2	12	33714	33725	50 %	50 %	0 %	0 %	298674010
15	NC_014253	TTGGTT	2	12	35447	35458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298674013
16	NC_014253	GAACTT	2	12	38242	38253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674014
17	NC_014253	ACTTTT	2	12	42739	42750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298674019
18	NC_014253	TTAAAA	2	12	45651	45662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298674021
19	NC_014253	ATTGTC	2	12	47146	47157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298674022
20	NC_014253	ACGGGT	2	12	48929	48940	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014253	TGTCTG	2	12	50424	50435	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014253	TGATTT	2	12	54157	54168	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014253	TATTGA	2	12	59452	59463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298674030
24	NC_014253	TTCTGC	2	12	64620	64631	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298674035
25	NC_014253	AATTTT	2	12	65231	65242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014253	TATATC	2	12	68358	68369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674038
27	NC_014253	TTCCAT	2	12	68936	68947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298674039
28	NC_014253	ATGGAT	2	12	69911	69922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298674039
29	NC_014253	AGAAAC	2	12	74568	74579	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298674044
30	NC_014253	TGTGGT	2	12	75885	75896	0 %	50 %	50 %	0 %	298674045
31	NC_014253	ATTTTC	2	12	92162	92173	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298674062
32	NC_014253	TGGGCA	2	12	96075	96086	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298674065
33	NC_014253	ATTTTT	2	12	96835	96846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	298674066
34	NC_014253	ATAAAA	2	12	97887	97898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298674066
35	NC_014253	GCTAAG	2	12	99573	99584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298674070
36	NC_014253	ACATTT	2	12	100678	100689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674071
37	NC_014253	TTCATT	2	12	107803	107814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298674078
38	NC_014253	ATTTTC	2	12	108266	108277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298674079
39	NC_014253	CCAGAA	2	12	110639	110650	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298674081
40	NC_014253	TTTTGC	2	12	110769	110780	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298674081
41	NC_014253	TGCATC	2	12	111238	111249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674082
42	NC_014253	GTAGTG	2	12	111817	111828	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014253	AAAAGG	2	12	112111	112122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014253	CAATCG	2	12	112474	112485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298674083
45	NC_014253	TTCATC	2	12	116263	116274	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298674088
46	NC_014253	AACAGA	2	12	118848	118859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298674091
47	NC_014253	CTACTT	2	12	120347	120358	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298674093
48	NC_014253	ACAATA	2	12	122880	122891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298674097
49	NC_014253	AAAATA	2	12	123159	123170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014253	CCAGAA	2	12	127761	127772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298674104
51	NC_014253	AAACCA	2	12	129685	129696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298674106
52	NC_014253	TTTATT	2	12	130058	130069	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014253	TTGAAT	2	12	131299	131310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298674108
54	NC_014253	TGTTTC	2	12	134874	134885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298674112
55	NC_014253	TTGATG	2	12	137214	137225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298674113
56	NC_014253	ATTTTA	2	12	137472	137483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298674113
57	NC_014253	ATTTTG	2	12	138094	138105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298674114
58	NC_014253	CTAATC	2	12	139010	139021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298674114
59	NC_014253	TTATCA	2	12	140043	140054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674116
60	NC_014253	CTTTAA	2	12	140149	140160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674116
61	NC_014253	TACCAG	2	12	146293	146304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298674122
62	NC_014253	CAATTT	2	12	146618	146629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674122
63	NC_014253	TCAAAA	2	12	150933	150944	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298674125
64	NC_014253	TGAAAA	2	12	151421	151432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014253	ATGATA	2	12	152149	152160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298674126
66	NC_014253	AAAATT	2	12	152459	152470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298674126
67	NC_014253	GATACT	2	12	152955	152966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674126
68	NC_014253	AGATCA	2	12	154231	154242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298674127
69	NC_014253	ATTCAA	2	12	156091	156102	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298674129
70	NC_014253	TAAATA	2	12	156284	156295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298674129
71	NC_014253	GATAAT	2	12	156558	156569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298674129
72	NC_014253	CAGATA	2	12	162036	162047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298674134
73	NC_014253	ATTCTA	2	12	164268	164279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674136
74	NC_014253	CATATA	2	12	164658	164669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298674136
75	NC_014253	ATCAAA	2	12	168779	168790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298674140
76	NC_014253	ACAGAA	2	12	170473	170484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014253	ATTTAT	2	12	175304	175315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298674146
78	NC_014253	TTTTAT	2	12	176437	176448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	298674148
79	NC_014253	CTCCAT	2	12	176782	176793	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	298674148
80	NC_014253	GGTTTT	2	12	177918	177929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298674149
81	NC_014253	ATTTTT	2	12	184398	184409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	298674157
82	NC_014253	TTCTTT	2	12	185300	185311	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298674157
83	NC_014253	GTGTCC	2	12	185911	185922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298674158
84	NC_014253	TGTAAT	2	12	193735	193746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298674164
85	NC_014253	CTGGAA	2	12	194461	194472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298674165
86	NC_014253	ATGACA	2	12	196166	196177	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298674167
87	NC_014253	TACAAA	2	12	200015	200026	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298674173
88	NC_014253	TTTTTC	2	12	200658	200669	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298674174
89	NC_014253	TATTAA	2	12	201301	201312	50 %	50 %	0 %	0 %	298674175
90	NC_014253	GTTGCA	2	12	205696	205707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298674179
91	NC_014253	TGAAGG	2	12	209800	209811	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298674184
92	NC_014253	TTGGGT	2	12	212387	212398	0 %	50 %	50 %	0 %	298674187
93	NC_014253	GATTTG	2	12	212780	212791	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298674187
94	NC_014253	GCTTAT	2	12	213660	213671	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298674188
95	NC_014253	GATTTA	2	12	214946	214957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298674189
96	NC_014253	TCGATT	2	12	215297	215308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298674190
97	NC_014253	TTATCA	2	12	215945	215956	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674190
98	NC_014253	TGCACC	2	12	221001	221012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298674196
99	NC_014253	CGTTTT	2	12	222392	222403	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298674198
100	NC_014253	GTTTTC	2	12	225862	225873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298674201
101	NC_014253	TATACC	2	12	228001	228012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298674204
102	NC_014253	TAAATC	2	12	228767	228778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014253	AAAATT	2	12	231323	231334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298674207
104	NC_014253	CTTGAC	2	12	232282	232293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674209
105	NC_014253	TCAGGT	2	12	238214	238225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298674215
106	NC_014253	TAGAAA	2	12	240456	240467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298674217
107	NC_014253	TTTGCA	2	12	240581	240592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298674217
108	NC_014253	TTTAAA	2	12	240684	240695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014253	AGGAAA	2	12	242943	242954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298674220
110	NC_014253	TGAATT	2	12	243489	243500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298674220
111	NC_014253	GAAGTC	2	12	245926	245937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014253	TAAAAA	2	12	256725	256736	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298674234
113	NC_014253	TATTCC	2	12	259334	259345	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298674236
114	NC_014253	TTCTAT	2	12	263270	263281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298674241
115	NC_014253	TATCAT	2	12	264217	264228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674241
116	NC_014253	CTTGGA	2	12	272046	272057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298674254
117	NC_014253	TTGATA	2	12	273062	273073	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298674255
118	NC_014253	ACGAAA	2	12	273104	273115	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298674255
119	NC_014253	ATTGAC	2	12	276457	276468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674258
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131	NC_014253	TTCTTT	2	12	301581	301592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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229	NC_014253	TATCAA	2	12	507440	507451	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298674472
230	NC_014253	AAGTTT	2	12	508146	508157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
231	NC_014253	ATATCA	2	12	509421	509432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298674473
232	NC_014253	CCAACT	2	12	509815	509826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
233	NC_014253	CTGGGT	2	12	510390	510401	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298674474
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235	NC_014253	CAGATG	2	12	513134	513145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298674477
236	NC_014253	ATTTAC	2	12	514993	515004	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674478
237	NC_014253	ACAAAA	2	12	519839	519850	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	298674481
238	NC_014253	ATTGAG	2	12	521207	521218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
239	NC_014253	TGGAAT	2	12	522337	522348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298674483
240	NC_014253	ACCGGT	2	12	530380	530391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298674491
241	NC_014253	ACTGAT	2	12	535657	535668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674495
242	NC_014253	TGAACT	2	12	535695	535706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674495
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246	NC_014253	AATTAA	2	12	545428	545439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_014253	AGGAGA	2	12	546302	546313	50 %	0 %	50 %	0 %	298674504
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331	NC_014253	ATATCC	2	12	727974	727985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298674714
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337	NC_014253	TTCGAC	2	12	736812	736823	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674721
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340	NC_014253	TCCAGT	2	12	751723	751734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674733
341	NC_014253	ATAAAG	2	12	754231	754242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298674737
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343	NC_014253	ATCTAC	2	12	758559	758570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298674741
344	NC_014253	AATTAT	2	12	763971	763982	50 %	50 %	0 %	0 %	298674745
345	NC_014253	ATATCT	2	12	764168	764179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298674745
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348	NC_014253	GAAAGA	2	12	775244	775255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
349	NC_014253	AAGTTT	2	12	777671	777682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
350	NC_014253	CAGGTG	2	12	778647	778658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298674757
351	NC_014253	TGAACT	2	12	781918	781929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674760
352	NC_014253	GTACAT	2	12	781937	781948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674760
353	NC_014253	CTGTCA	2	12	787318	787329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674764
354	NC_014253	ATGTTG	2	12	788056	788067	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298674765
355	NC_014253	CCTTAA	2	12	790355	790366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298674767
356	NC_014253	TATTTA	2	12	793280	793291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_014253	CAGTTA	2	12	794440	794451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298674772
358	NC_014253	TGTTTT	2	12	795857	795868	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
359	NC_014253	ACCATT	2	12	801629	801640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298674782
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377	NC_014253	TGTTAT	2	12	833677	833688	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298674823
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380	NC_014253	ACTGCT	2	12	838826	838837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
381	NC_014253	TAATTC	2	12	839661	839672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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389	NC_014253	TCCCGT	2	12	854504	854515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298674840
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451	NC_014253	ACGGAA	2	12	980453	980464	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298674957
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453	NC_014253	CCTTGA	2	12	989194	989205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674966
454	NC_014253	TGGATA	2	12	991203	991214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298674967
455	NC_014253	ACACTG	2	12	992879	992890	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298674968
456	NC_014253	CGTGAA	2	12	995427	995438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298674971
457	NC_014253	CGTCAT	2	12	1006985	1006996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298674980
458	NC_014253	AAAGAA	2	12	1007151	1007162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298674980
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460	NC_014253	TAAACC	2	12	1016840	1016851	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298674993
461	NC_014253	TTTCTT	2	12	1020981	1020992	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298674998
462	NC_014253	TACCGG	2	12	1021809	1021820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298674999
463	NC_014253	AAAGGT	2	12	1029960	1029971	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298675006
464	NC_014253	TTTAAG	2	12	1030118	1030129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298675006
465	NC_014253	GATATA	2	12	1033754	1033765	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298675010
466	NC_014253	ACGTTT	2	12	1036013	1036024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298675011
467	NC_014253	GGATGA	2	12	1041292	1041303	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298675016
468	NC_014253	TGTGGA	2	12	1041350	1041361	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298675016
469	NC_014253	TATTGT	2	12	1044421	1044432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
470	NC_014253	TTTTTC	2	12	1045984	1045995	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
471	NC_014253	CTGTCT	2	12	1047521	1047532	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298675019
472	NC_014253	ATTAAT	2	12	1047730	1047741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_014253	AGCAAA	2	12	1048888	1048899	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298675020
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477	NC_014253	ATCTTC	2	12	1052761	1052772	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298675024
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486	NC_014253	TTTTAT	2	12	1074346	1074357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_014253	TTTTTG	2	12	1074452	1074463	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298675045
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492	NC_014253	ACTTTA	2	12	1086127	1086138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298675058
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499	NC_014253	TCCACC	2	12	1098707	1098718	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	298675067
500	NC_014253	TCAATA	2	12	1100130	1100141	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298675068

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