MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 chromosome

Total Repeats: 48581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_014253	CTT	2	6	2238913	2238918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676123
48502	NC_014253	CA	3	6	2238947	2238952	50 %	0 %	0 %	50 %	298676123
48503	NC_014253	TGT	2	6	2238984	2238989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676123
48504	NC_014253	T	7	7	2239029	2239035	0 %	100 %	0 %	0 %	298676123
48505	NC_014253	ACTG	2	8	2239074	2239081	25 %	25 %	25 %	25 %	298676123
48506	NC_014253	GAT	2	6	2239168	2239173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676123
48507	NC_014253	ATT	2	6	2239199	2239204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676123
48508	NC_014253	TTTCCC	2	12	2239208	2239219	0 %	50 %	0 %	50 %	298676123
48509	NC_014253	TGA	2	6	2239269	2239274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676123
48510	NC_014253	AAAT	2	8	2239317	2239324	75 %	25 %	0 %	0 %	298676123
48511	NC_014253	CTG	2	6	2239429	2239434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298676124
48512	NC_014253	TAT	2	6	2239466	2239471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676124
48513	NC_014253	AAATCA	2	12	2239480	2239491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298676124
48514	NC_014253	TA	3	6	2239505	2239510	50 %	50 %	0 %	0 %	298676124
48515	NC_014253	CAA	2	6	2239525	2239530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676124
48516	NC_014253	CAA	2	6	2239562	2239567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676124
48517	NC_014253	T	6	6	2239580	2239585	0 %	100 %	0 %	0 %	298676124
48518	NC_014253	TAAA	2	8	2239689	2239696	75 %	25 %	0 %	0 %	298676124
48519	NC_014253	A	7	7	2239701	2239707	100 %	0 %	0 %	0 %	298676124
48520	NC_014253	CTA	2	6	2239771	2239776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676124
48521	NC_014253	CCT	2	6	2239797	2239802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298676124
48522	NC_014253	AAG	2	6	2239869	2239874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676124
48523	NC_014253	ATA	2	6	2239896	2239901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676124
48524	NC_014253	GCC	2	6	2239926	2239931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298676124
48525	NC_014253	T	6	6	2239952	2239957	0 %	100 %	0 %	0 %	298676124
48526	NC_014253	CCA	2	6	2239965	2239970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298676124
48527	NC_014253	TCA	2	6	2239995	2240000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676124
48528	NC_014253	TA	4	8	2240032	2240039	50 %	50 %	0 %	0 %	298676124
48529	NC_014253	ACC	2	6	2240045	2240050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298676124
48530	NC_014253	AGA	3	9	2240088	2240096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676124
48531	NC_014253	AT	3	6	2240102	2240107	50 %	50 %	0 %	0 %	298676124
48532	NC_014253	TAA	2	6	2240165	2240170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676124
48533	NC_014253	AATA	2	8	2240184	2240191	75 %	25 %	0 %	0 %	298676124
48534	NC_014253	T	7	7	2240193	2240199	0 %	100 %	0 %	0 %	298676124
48535	NC_014253	GAT	2	6	2240211	2240216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676124
48536	NC_014253	TTTC	2	8	2240235	2240242	0 %	75 %	0 %	25 %	298676124
48537	NC_014253	T	7	7	2240260	2240266	0 %	100 %	0 %	0 %	298676124
48538	NC_014253	CTA	2	6	2240282	2240287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48539	NC_014253	ATA	2	6	2240322	2240327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48540	NC_014253	AT	3	6	2240380	2240385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48541	NC_014253	TA	3	6	2240407	2240412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48542	NC_014253	AT	3	6	2240420	2240425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48543	NC_014253	ATA	2	6	2240463	2240468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48544	NC_014253	TAA	3	9	2240494	2240502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48545	NC_014253	GAA	2	6	2240510	2240515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48546	NC_014253	GAA	2	6	2240537	2240542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48547	NC_014253	GTG	2	6	2240598	2240603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298676125
48548	NC_014253	ACATT	2	10	2240613	2240622	40 %	40 %	0 %	20 %	298676125
48549	NC_014253	CATTTT	2	12	2240663	2240674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298676125
48550	NC_014253	GAT	2	6	2240840	2240845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676125
48551	NC_014253	GAT	2	6	2240881	2240886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676125
48552	NC_014253	ATA	2	6	2240916	2240921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676125
48553	NC_014253	ATTA	2	8	2240971	2240978	50 %	50 %	0 %	0 %	298676125
48554	NC_014253	ATAC	2	8	2241092	2241099	50 %	25 %	0 %	25 %	298676126
48555	NC_014253	TAC	2	6	2241159	2241164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676126
48556	NC_014253	GATT	2	8	2241188	2241195	25 %	50 %	25 %	0 %	298676126
48557	NC_014253	CTT	2	6	2241266	2241271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676126
48558	NC_014253	AGC	2	6	2241300	2241305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676126
48559	NC_014253	CTT	2	6	2241319	2241324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676126
48560	NC_014253	ACC	2	6	2241414	2241419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298676126
48561	NC_014253	CAAAAT	2	12	2241485	2241496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298676126
48562	NC_014253	ATG	2	6	2241500	2241505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676126
48563	NC_014253	GGAAT	2	10	2241512	2241521	40 %	20 %	40 %	0 %	298676126
48564	NC_014253	AGC	2	6	2241537	2241542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676126
48565	NC_014253	ATT	2	6	2241561	2241566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676126
48566	NC_014253	T	6	6	2241714	2241719	0 %	100 %	0 %	0 %	298676126
48567	NC_014253	GAA	2	6	2241877	2241882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676126
48568	NC_014253	CAT	2	6	2241900	2241905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676126
48569	NC_014253	CTT	2	6	2241914	2241919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676126
48570	NC_014253	CAT	2	6	2242001	2242006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676126
48571	NC_014253	CAT	2	6	2242049	2242054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676126
48572	NC_014253	TAA	2	6	2242071	2242076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676126
48573	NC_014253	TCAT	2	8	2242108	2242115	25 %	50 %	0 %	25 %	298676126
48574	NC_014253	TTA	2	6	2242141	2242146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48575	NC_014253	TAA	2	6	2242181	2242186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48576	NC_014253	TGACCC	2	12	2242199	2242210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48577	NC_014253	ATT	2	6	2242212	2242217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48578	NC_014253	TAT	2	6	2242241	2242246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48579	NC_014253	TTA	2	6	2242262	2242267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48580	NC_014253	AATT	2	8	2242268	2242275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48581	NC_014253	AATT	2	8	2242309	2242316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.