MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	CCTC	2	8	116	123	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
2	NC_014214	CCTC	2	8	494	501	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
3	NC_014214	GGTT	2	8	776	783	0 %	50 %	50 %	0 %	297567865
4	NC_014214	CGGG	2	8	1924	1931	0 %	0 %	75 %	25 %	297567865
5	NC_014214	CAGC	2	8	2195	2202	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
6	NC_014214	GCGG	2	8	2364	2371	0 %	0 %	75 %	25 %	297567866
7	NC_014214	AGCC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
8	NC_014214	TCCA	2	8	2605	2612	25 %	25 %	0 %	50 %	297567866
9	NC_014214	TCCC	2	8	2878	2885	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_014214	CCGC	2	8	3457	3464	0 %	0 %	25 %	75 %	297567870
11	NC_014214	ACGA	2	8	3821	3828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014214	GCGA	2	8	4064	4071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014214	CGGG	2	8	4452	4459	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
14	NC_014214	GGGC	2	8	4524	4531	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
15	NC_014214	AAAG	2	8	4734	4741	75 %	0 %	25 %	0 %	297567871
16	NC_014214	CCTT	2	8	5373	5380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014214	TACC	2	8	5443	5450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014214	CGAG	2	8	6604	6611	25 %	0 %	50 %	25 %	297567873
19	NC_014214	CCGC	2	8	6943	6950	0 %	0 %	25 %	75 %	297567874
20	NC_014214	CCGC	2	8	7258	7265	0 %	0 %	25 %	75 %	297567874
21	NC_014214	CGGT	2	8	7287	7294	0 %	25 %	50 %	25 %	297567874
22	NC_014214	CGGT	2	8	7329	7336	0 %	25 %	50 %	25 %	297567874
23	NC_014214	GAGC	2	8	7502	7509	25 %	0 %	50 %	25 %	297567874
24	NC_014214	CTTC	2	8	7802	7809	0 %	50 %	0 %	50 %	297567875
25	NC_014214	CGCC	2	8	8154	8161	0 %	0 %	25 %	75 %	297567875
26	NC_014214	CGCT	2	8	8794	8801	0 %	25 %	25 %	50 %	297567875
27	NC_014214	CGCT	2	8	9228	9235	0 %	25 %	25 %	50 %	297567876
28	NC_014214	CCCG	2	8	9401	9408	0 %	0 %	25 %	75 %	297567876
29	NC_014214	CCAC	2	8	9500	9507	25 %	0 %	0 %	75 %	297567876
30	NC_014214	CTTC	2	8	9839	9846	0 %	50 %	0 %	50 %	297567877
31	NC_014214	CCGA	2	8	10280	10287	25 %	0 %	25 %	50 %	297567878
32	NC_014214	CCCG	2	8	11449	11456	0 %	0 %	25 %	75 %	297567882
33	NC_014214	AAAC	2	8	12143	12150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014214	GGTA	2	8	12870	12877	25 %	25 %	50 %	0 %	297567887
35	NC_014214	CTGC	2	8	13293	13300	0 %	25 %	25 %	50 %	297567888
36	NC_014214	CTGC	2	8	13452	13459	0 %	25 %	25 %	50 %	297567888
37	NC_014214	ACCC	2	8	13811	13818	25 %	0 %	0 %	75 %	297567888
38	NC_014214	CAGG	2	8	14815	14822	25 %	0 %	50 %	25 %	297567889
39	NC_014214	GAGC	2	8	15186	15193	25 %	0 %	50 %	25 %	297567890
40	NC_014214	TATT	2	8	16265	16272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014214	CCGC	2	8	18090	18097	0 %	0 %	25 %	75 %	297567893
42	NC_014214	AGGT	2	8	18353	18360	25 %	25 %	50 %	0 %	297567893
43	NC_014214	CTGG	2	8	18749	18756	0 %	25 %	50 %	25 %	297567894
44	NC_014214	GCTC	2	8	18848	18855	0 %	25 %	25 %	50 %	297567894
45	NC_014214	CGCT	2	8	19245	19252	0 %	25 %	25 %	50 %	297567894
46	NC_014214	CGGG	2	8	20788	20795	0 %	0 %	75 %	25 %	297567897
47	NC_014214	CCCA	2	8	20934	20941	25 %	0 %	0 %	75 %	297567897
48	NC_014214	TCGG	2	8	21049	21056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014214	GCAA	2	8	21088	21095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014214	CGAG	2	8	21263	21270	25 %	0 %	50 %	25 %	297567898
51	NC_014214	CCCG	2	8	21597	21604	0 %	0 %	25 %	75 %	297567898
52	NC_014214	GTGG	2	8	21750	21757	0 %	25 %	75 %	0 %	297567898
53	NC_014214	GGCG	2	8	22755	22762	0 %	0 %	75 %	25 %	297567899
54	NC_014214	CTGG	2	8	23317	23324	0 %	25 %	50 %	25 %	297567899
55	NC_014214	CGCC	2	8	23404	23411	0 %	0 %	25 %	75 %	297567899
56	NC_014214	GGGT	2	8	23780	23787	0 %	25 %	75 %	0 %	297567900
57	NC_014214	GGCT	2	8	24417	24424	0 %	25 %	50 %	25 %	297567901
58	NC_014214	CTGG	2	8	24944	24951	0 %	25 %	50 %	25 %	297567902
59	NC_014214	GCTC	2	8	25043	25050	0 %	25 %	25 %	50 %	297567902
60	NC_014214	CGCT	2	8	25440	25447	0 %	25 %	25 %	50 %	297567902
61	NC_014214	CGCC	2	8	25681	25688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_014214	CTTC	2	8	26089	26096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014214	TTCC	2	8	26209	26216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014214	CCTG	2	8	27151	27158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014214	CCAG	2	8	27644	27651	25 %	0 %	25 %	50 %	297567904
66	NC_014214	CCCG	2	8	28832	28839	0 %	0 %	25 %	75 %	297567904
67	NC_014214	GCAG	2	8	28856	28863	25 %	0 %	50 %	25 %	297567904
68	NC_014214	GGGA	2	8	29394	29401	25 %	0 %	75 %	0 %	297567905
69	NC_014214	GGCC	2	8	29622	29629	0 %	0 %	50 %	50 %	297567905
70	NC_014214	GGCA	2	8	29687	29694	25 %	0 %	50 %	25 %	297567905
71	NC_014214	CCCG	2	8	29910	29917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_014214	CCGC	2	8	30369	30376	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_014214	GGCC	2	8	30905	30912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014214	TTCT	2	8	31452	31459	0 %	75 %	0 %	25 %	297567906
75	NC_014214	CCCT	2	8	31746	31753	0 %	25 %	0 %	75 %	297567906
76	NC_014214	TGCT	2	8	31934	31941	0 %	50 %	25 %	25 %	297567906
77	NC_014214	CCCG	2	8	32046	32053	0 %	0 %	25 %	75 %	297567906
78	NC_014214	TTCC	2	8	32280	32287	0 %	50 %	0 %	50 %	297567906
79	NC_014214	GCTC	2	8	33635	33642	0 %	25 %	25 %	50 %	297567908
80	NC_014214	AGGG	2	8	33787	33794	25 %	0 %	75 %	0 %	297567908
81	NC_014214	AGTA	2	8	34393	34400	50 %	25 %	25 %	0 %	297567909
82	NC_014214	GCGG	2	8	34680	34687	0 %	0 %	75 %	25 %	297567909
83	NC_014214	CTGG	2	8	35396	35403	0 %	25 %	50 %	25 %	297567910
84	NC_014214	CCCA	2	8	36132	36139	25 %	0 %	0 %	75 %	297567910
85	NC_014214	CTGG	2	8	36488	36495	0 %	25 %	50 %	25 %	297567910
86	NC_014214	CACC	2	8	36629	36636	25 %	0 %	0 %	75 %	297567910
87	NC_014214	GGGA	2	8	36772	36779	25 %	0 %	75 %	0 %	297567910
88	NC_014214	ACCA	2	8	36983	36990	50 %	0 %	0 %	50 %	297567911
89	NC_014214	ACCG	2	8	37058	37065	25 %	0 %	25 %	50 %	297567911
90	NC_014214	GGTC	2	8	37161	37168	0 %	25 %	50 %	25 %	297567911
91	NC_014214	CGTG	2	8	37270	37277	0 %	25 %	50 %	25 %	297567911
92	NC_014214	GAGG	2	8	37429	37436	25 %	0 %	75 %	0 %	297567911
93	NC_014214	CTGG	2	8	37447	37454	0 %	25 %	50 %	25 %	297567911
94	NC_014214	CGCC	2	8	37997	38004	0 %	0 %	25 %	75 %	297567912
95	NC_014214	GAGG	2	8	38405	38412	25 %	0 %	75 %	0 %	297567913
96	NC_014214	CCCG	2	8	38910	38917	0 %	0 %	25 %	75 %	297567913
97	NC_014214	GGCG	2	8	39259	39266	0 %	0 %	75 %	25 %	297567913
98	NC_014214	CCCG	2	8	39966	39973	0 %	0 %	25 %	75 %	297567913
99	NC_014214	ACCG	2	8	40502	40509	25 %	0 %	25 %	50 %	297567913
100	NC_014214	CAGC	2	8	40665	40672	25 %	0 %	25 %	50 %	297567914
101	NC_014214	CGGT	2	8	41234	41241	0 %	25 %	50 %	25 %	297567914
102	NC_014214	CAGC	2	8	41518	41525	25 %	0 %	25 %	50 %	297567914
103	NC_014214	CCGC	2	8	41652	41659	0 %	0 %	25 %	75 %	297567914
104	NC_014214	CGCC	2	8	42884	42891	0 %	0 %	25 %	75 %	297567915
105	NC_014214	CAGC	2	8	43118	43125	25 %	0 %	25 %	50 %	297567915
106	NC_014214	CAGC	2	8	43232	43239	25 %	0 %	25 %	50 %	297567915
107	NC_014214	GCCT	2	8	43502	43509	0 %	25 %	25 %	50 %	297567916
108	NC_014214	GAAG	2	8	43716	43723	50 %	0 %	50 %	0 %	297567916
109	NC_014214	CCGC	3	12	43813	43824	0 %	0 %	25 %	75 %	297567916
110	NC_014214	GTCC	2	8	44011	44018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014214	CGCT	2	8	44307	44314	0 %	25 %	25 %	50 %	297567917
112	NC_014214	GCCC	2	8	45042	45049	0 %	0 %	25 %	75 %	297567918
113	NC_014214	GGGC	2	8	45357	45364	0 %	0 %	75 %	25 %	297567918
114	NC_014214	GCCT	2	8	45560	45567	0 %	25 %	25 %	50 %	297567918
115	NC_014214	GCCC	2	8	46464	46471	0 %	0 %	25 %	75 %	297567918
116	NC_014214	CCTG	2	8	47334	47341	0 %	25 %	25 %	50 %	297567920
117	NC_014214	GAGC	2	8	47357	47364	25 %	0 %	50 %	25 %	297567920
118	NC_014214	AGCC	2	8	47460	47467	25 %	0 %	25 %	50 %	297567920
119	NC_014214	GGCG	2	8	47508	47515	0 %	0 %	75 %	25 %	297567920
120	NC_014214	CGCC	2	8	47702	47709	0 %	0 %	25 %	75 %	297567920
121	NC_014214	AGAC	2	8	47799	47806	50 %	0 %	25 %	25 %	297567920
122	NC_014214	GGTA	2	8	47846	47853	25 %	25 %	50 %	0 %	297567920
123	NC_014214	AGCC	2	8	48805	48812	25 %	0 %	25 %	50 %	297567921
124	NC_014214	GCTG	2	8	49550	49557	0 %	25 %	50 %	25 %	297567922
125	NC_014214	CGGG	2	8	49908	49915	0 %	0 %	75 %	25 %	297567923
126	NC_014214	CAGA	2	8	50068	50075	50 %	0 %	25 %	25 %	297567923
127	NC_014214	GGCA	2	8	50076	50083	25 %	0 %	50 %	25 %	297567923
128	NC_014214	CCGC	2	8	50336	50343	0 %	0 %	25 %	75 %	297567924
129	NC_014214	GGCG	2	8	51690	51697	0 %	0 %	75 %	25 %	297567925
130	NC_014214	ACTC	2	8	51958	51965	25 %	25 %	0 %	50 %	297567925
131	NC_014214	CGCT	2	8	52231	52238	0 %	25 %	25 %	50 %	297567926
132	NC_014214	CCCG	2	8	52416	52423	0 %	0 %	25 %	75 %	297567926
133	NC_014214	ACCG	2	8	52600	52607	25 %	0 %	25 %	50 %	297567926
134	NC_014214	GACC	2	8	53535	53542	25 %	0 %	25 %	50 %	297567926
135	NC_014214	ACCT	2	8	53596	53603	25 %	25 %	0 %	50 %	297567926
136	NC_014214	GCCC	2	8	53860	53867	0 %	0 %	25 %	75 %	297567926
137	NC_014214	CGGG	2	8	55419	55426	0 %	0 %	75 %	25 %	297567926
138	NC_014214	CGGG	2	8	56804	56811	0 %	0 %	75 %	25 %	297567927
139	NC_014214	CGGG	2	8	57355	57362	0 %	0 %	75 %	25 %	297567928
140	NC_014214	TCCG	2	8	57931	57938	0 %	25 %	25 %	50 %	297567928
141	NC_014214	CGCT	2	8	58055	58062	0 %	25 %	25 %	50 %	297567928
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143	NC_014214	GGCG	2	8	58507	58514	0 %	0 %	75 %	25 %	297567928
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.