MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 3078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014214	G	6	6	121128	121133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014214	CCCCT	2	10	121141	121150	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3003	NC_014214	TG	4	8	121193	121200	0 %	50 %	50 %	0 %	297567986
3004	NC_014214	GGAG	2	8	121215	121222	25 %	0 %	75 %	0 %	297567986
3005	NC_014214	TCG	2	6	121256	121261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567986
3006	NC_014214	GGA	2	6	121278	121283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567986
3007	NC_014214	CCT	2	6	121320	121325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567986
3008	NC_014214	CGG	2	6	121492	121497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567986
3009	NC_014214	GTG	2	6	121513	121518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567986
3010	NC_014214	TCC	2	6	121648	121653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567987
3011	NC_014214	CCT	2	6	121712	121717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567987
3012	NC_014214	CCG	2	6	121769	121774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567987
3013	NC_014214	CGC	2	6	121792	121797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567987
3014	NC_014214	ACCA	2	8	121798	121805	50 %	0 %	0 %	50 %	297567987
3015	NC_014214	CCA	2	6	121844	121849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567987
3016	NC_014214	ATC	2	6	121870	121875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567987
3017	NC_014214	TA	3	6	121887	121892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014214	AGG	2	6	121905	121910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014214	GAAC	2	8	121917	121924	50 %	0 %	25 %	25 %	297567988
3020	NC_014214	CCG	2	6	121973	121978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567988
3021	NC_014214	CAG	2	6	122014	122019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567988
3022	NC_014214	TGC	2	6	122084	122089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567988
3023	NC_014214	GCCTG	2	10	122168	122177	0 %	20 %	40 %	40 %	297567988
3024	NC_014214	TCT	2	6	122277	122282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567989
3025	NC_014214	CTC	2	6	122284	122289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567989
3026	NC_014214	C	6	6	122305	122310	0 %	0 %	0 %	100 %	297567989
3027	NC_014214	GGT	2	6	122311	122316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567989
3028	NC_014214	GTG	2	6	122339	122344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567989
3029	NC_014214	CTG	3	9	122345	122353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567989
3030	NC_014214	GAA	2	6	122354	122359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567989
3031	NC_014214	CACC	2	8	122379	122386	25 %	0 %	0 %	75 %	297567989
3032	NC_014214	CCGC	2	8	122401	122408	0 %	0 %	25 %	75 %	297567989
3033	NC_014214	GCT	2	6	122479	122484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567989
3034	NC_014214	AGCGAC	2	12	122507	122518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014214	CGC	2	6	122567	122572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567990
3036	NC_014214	GCC	2	6	122602	122607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567990
3037	NC_014214	ACT	2	6	122647	122652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567990
3038	NC_014214	GAG	2	6	122664	122669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567990
3039	NC_014214	C	8	8	122677	122684	0 %	0 %	0 %	100 %	297567990
3040	NC_014214	CGC	2	6	122769	122774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567990
3041	NC_014214	CCT	2	6	122821	122826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567990
3042	NC_014214	GCT	2	6	122870	122875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567990
3043	NC_014214	CTG	2	6	122925	122930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567990
3044	NC_014214	CCTGGC	2	12	122939	122950	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567990
3045	NC_014214	TGC	2	6	122962	122967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567990
3046	NC_014214	GGC	2	6	123071	123076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567990
3047	NC_014214	GGC	2	6	123080	123085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567990
3048	NC_014214	GGC	2	6	123161	123166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567990
3049	NC_014214	GCA	2	6	123178	123183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567990
3050	NC_014214	CCA	2	6	123235	123240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567990
3051	NC_014214	G	6	6	123259	123264	0 %	0 %	100 %	0 %	297567990
3052	NC_014214	ACC	2	6	123265	123270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567990
3053	NC_014214	GGC	2	6	123287	123292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567990
3054	NC_014214	GCA	2	6	123377	123382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567990
3055	NC_014214	GAG	2	6	123405	123410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567990
3056	NC_014214	GAG	2	6	123426	123431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567990
3057	NC_014214	CG	3	6	123438	123443	0 %	0 %	50 %	50 %	297567990
3058	NC_014214	GGA	2	6	123541	123546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567991
3059	NC_014214	CGC	3	9	123569	123577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567991
3060	NC_014214	CCT	2	6	123634	123639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567991
3061	NC_014214	GGA	2	6	123652	123657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567991
3062	NC_014214	CG	3	6	123695	123700	0 %	0 %	50 %	50 %	297567991
3063	NC_014214	CGA	2	6	123748	123753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567991
3064	NC_014214	CCG	2	6	123763	123768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567991
3065	NC_014214	TGG	2	6	123777	123782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567991
3066	NC_014214	GGA	2	6	123868	123873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567991
3067	NC_014214	GGT	2	6	123874	123879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567991
3068	NC_014214	AGC	2	6	123919	123924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567991
3069	NC_014214	GCC	2	6	123984	123989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567991
3070	NC_014214	CCG	2	6	124048	124053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567991
3071	NC_014214	GGA	2	6	124060	124065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567991
3072	NC_014214	CCG	2	6	124083	124088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567991
3073	NC_014214	AAG	2	6	124100	124105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567991
3074	NC_014214	A	6	6	124116	124121	100 %	0 %	0 %	0 %	297567991
3075	NC_014214	GGCC	2	8	124150	124157	0 %	0 %	50 %	50 %	297567991
3076	NC_014214	GGC	2	6	124242	124247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567991
3077	NC_014214	CGC	3	9	124283	124291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567991
3078	NC_014214	CCACG	2	10	124360	124369	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.