MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 5233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	CCA	2	6	31	36	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014213	CCG	2	6	67	72	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014213	TGA	2	6	190	195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014213	GAG	2	6	240	245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014213	CTT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014213	CTC	2	6	434	439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567558
7	NC_014213	CTC	2	6	443	448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567558
8	NC_014213	CTG	3	9	569	577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567558
9	NC_014213	GAG	2	6	611	616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567558
10	NC_014213	GTG	2	6	877	882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567559
11	NC_014213	GGC	2	6	957	962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567559
12	NC_014213	ACC	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567559
13	NC_014213	TGG	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567559
14	NC_014213	GGC	2	6	1110	1115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567559
15	NC_014213	TCC	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567559
16	NC_014213	ATG	2	6	1300	1305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567559
17	NC_014213	GAT	2	6	1323	1328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567559
18	NC_014213	CTG	3	9	1378	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567559
19	NC_014213	GCC	2	6	1516	1521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567559
20	NC_014213	CTT	2	6	1530	1535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567559
21	NC_014213	CGG	2	6	1551	1556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567559
22	NC_014213	TGG	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567559
23	NC_014213	CAT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567559
24	NC_014213	AGG	2	6	1637	1642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567559
25	NC_014213	AGG	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567559
26	NC_014213	CCG	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
27	NC_014213	GCC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
28	NC_014213	GTA	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567560
29	NC_014213	CAC	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567560
30	NC_014213	AGC	3	9	1911	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567560
31	NC_014213	GGT	2	6	1933	1938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
32	NC_014213	GGT	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
33	NC_014213	GGT	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
34	NC_014213	CGG	2	6	2096	2101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567560
35	NC_014213	CCT	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567560
36	NC_014213	GCG	2	6	2248	2253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567560
37	NC_014213	CGA	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567560
38	NC_014213	GCC	2	6	2447	2452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
39	NC_014213	GAA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567560
40	NC_014213	GCC	2	6	2591	2596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
41	NC_014213	TGG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567560
42	NC_014213	GGA	2	6	2851	2856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567560
43	NC_014213	GGC	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567560
44	NC_014213	CCG	2	6	2955	2960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567560
45	NC_014213	GAG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567560
46	NC_014213	GGA	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567561
47	NC_014213	GCT	2	6	3046	3051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567561
48	NC_014213	CTC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567561
49	NC_014213	GGT	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
50	NC_014213	TCA	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567561
51	NC_014213	CAC	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567561
52	NC_014213	TGG	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
53	NC_014213	AGA	2	6	3388	3393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567561
54	NC_014213	CTG	3	9	3548	3556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567561
55	NC_014213	GGA	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567561
56	NC_014213	TGG	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
57	NC_014213	TGG	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
58	NC_014213	CCA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567561
59	NC_014213	CAT	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567561
60	NC_014213	CGA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567561
61	NC_014213	GGT	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567561
62	NC_014213	GAG	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567561
63	NC_014213	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567561
64	NC_014213	AAC	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567561
65	NC_014213	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567561
66	NC_014213	GCG	2	6	4284	4289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567561
67	NC_014213	CTG	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567562
68	NC_014213	GCC	2	6	4350	4355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567562
69	NC_014213	CGG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567562
70	NC_014213	GGA	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567562
71	NC_014213	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567562
72	NC_014213	ACT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567562
73	NC_014213	CAC	2	6	4619	4624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567562
74	NC_014213	CCG	2	6	4640	4645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567562
75	NC_014213	TGG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567562
76	NC_014213	GCT	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567562
77	NC_014213	CGG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567563
78	NC_014213	CTG	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
79	NC_014213	AGG	2	6	5092	5097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567563
80	NC_014213	CTG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
81	NC_014213	ACC	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567563
82	NC_014213	GGC	2	6	5255	5260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567563
83	NC_014213	GCT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
84	NC_014213	TCC	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567563
85	NC_014213	TGG	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567563
86	NC_014213	TGG	4	12	5430	5441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567563
87	NC_014213	TGC	3	9	5445	5453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567563
88	NC_014213	CTT	2	6	5482	5487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567563
89	NC_014213	ACT	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014213	TGC	2	6	5595	5600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
91	NC_014213	AAG	3	9	5648	5656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567564
92	NC_014213	TTG	2	6	5660	5665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297567564
93	NC_014213	CTG	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
94	NC_014213	CGG	2	6	5784	5789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567564
95	NC_014213	GAG	2	6	5807	5812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
96	NC_014213	TGC	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
97	NC_014213	CGC	2	6	5888	5893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567564
98	NC_014213	CGA	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567564
99	NC_014213	GGA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
100	NC_014213	GGC	2	6	5995	6000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567564
101	NC_014213	GCA	2	6	6064	6069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567564
102	NC_014213	TGG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567564
103	NC_014213	GCT	2	6	6241	6246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
104	NC_014213	GCT	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
105	NC_014213	CTG	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567564
106	NC_014213	ATG	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567564
107	NC_014213	AGG	2	6	6735	6740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
108	NC_014213	CCG	2	6	6741	6746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567564
109	NC_014213	GAG	2	6	6788	6793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
110	NC_014213	AAC	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567564
111	NC_014213	ACC	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567564
112	NC_014213	GGC	2	6	7065	7070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567564
113	NC_014213	GGC	2	6	7084	7089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567564
114	NC_014213	AGG	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
115	NC_014213	AGA	2	6	7192	7197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567564
116	NC_014213	GGA	2	6	7213	7218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567564
117	NC_014213	GAA	2	6	7314	7319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567565
118	NC_014213	CTG	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567565
119	NC_014213	CTT	2	6	7354	7359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567565
120	NC_014213	GCT	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567565
121	NC_014213	GCG	2	6	7560	7565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567565
122	NC_014213	CCA	2	6	7590	7595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567565
123	NC_014213	AAC	2	6	7633	7638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567565
124	NC_014213	CTT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567565
125	NC_014213	CGC	2	6	7735	7740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567565
126	NC_014213	CAG	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567565
127	NC_014213	CTC	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567565
128	NC_014213	CGG	2	6	7984	7989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567565
129	NC_014213	GCG	2	6	8049	8054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567565
130	NC_014213	CTA	2	6	8272	8277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567565
131	NC_014213	CGG	3	9	8506	8514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567565
132	NC_014213	TTG	2	6	8621	8626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297567566
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261	NC_014213	CTT	2	6	17286	17291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567572
262	NC_014213	GCC	2	6	17401	17406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567572
263	NC_014213	GCT	2	6	17505	17510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567572
264	NC_014213	CAC	2	6	17544	17549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567572
265	NC_014213	CGG	2	6	17627	17632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567572
266	NC_014213	CTG	2	6	17710	17715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567572
267	NC_014213	TGA	2	6	17783	17788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567572
268	NC_014213	GTG	2	6	17827	17832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567572
269	NC_014213	GCT	2	6	17850	17855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567572
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277	NC_014213	CTG	2	6	18312	18317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567573
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285	NC_014213	TGG	2	6	18683	18688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567574
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291	NC_014213	GCT	2	6	19203	19208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567574
292	NC_014213	GCT	2	6	19269	19274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567574
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381	NC_014213	CAG	2	6	25649	25654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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387	NC_014213	CAT	2	6	26051	26056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_014213	TGC	2	6	31247	31252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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