MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 45985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	AAT	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014212	CGG	2	6	108	113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014212	CAG	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564485
4	NC_014212	ACG	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564485
5	NC_014212	CGG	2	6	233	238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564485
6	NC_014212	AAG	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564485
7	NC_014212	GTG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564485
8	NC_014212	AAC	2	6	480	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564485
9	NC_014212	CGC	2	6	497	502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564485
10	NC_014212	AGG	2	6	784	789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564485
11	NC_014212	ATC	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564485
12	NC_014212	TCC	2	6	843	848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564485
13	NC_014212	CGT	2	6	1084	1089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564485
14	NC_014212	GCC	2	6	1119	1124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564485
15	NC_014212	GAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564485
16	NC_014212	CGA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564485
17	NC_014212	CGC	2	6	1239	1244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564485
18	NC_014212	GGT	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564485
19	NC_014212	TTC	2	6	1326	1331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564485
20	NC_014212	ACC	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564485
21	NC_014212	CAA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564485
22	NC_014212	ACA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014212	CTA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014212	TAC	3	9	1671	1679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014212	AGA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014212	AGG	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014212	CAA	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564486
28	NC_014212	GAG	2	6	2186	2191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564486
29	NC_014212	TGA	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564486
30	NC_014212	AAC	2	6	2567	2572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564486
31	NC_014212	CTG	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564486
32	NC_014212	GAG	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564486
33	NC_014212	TGG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564486
34	NC_014212	GTG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564486
35	NC_014212	GGA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564486
36	NC_014212	AGG	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014212	CGG	2	6	3095	3100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564487
38	NC_014212	ACG	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564487
39	NC_014212	TGA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564487
40	NC_014212	TCA	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564487
41	NC_014212	CGG	2	6	3386	3391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564487
42	NC_014212	ACA	2	6	3403	3408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564487
43	NC_014212	CTG	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564487
44	NC_014212	GAG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564487
45	NC_014212	GGA	2	6	3800	3805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564487
46	NC_014212	TGG	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564487
47	NC_014212	TGA	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564487
48	NC_014212	TCC	2	6	4144	4149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564487
49	NC_014212	CCT	2	6	4238	4243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564488
50	NC_014212	GGA	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564488
51	NC_014212	GGA	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564488
52	NC_014212	GTT	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564488
53	NC_014212	TGA	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564488
54	NC_014212	GGT	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
55	NC_014212	CAA	3	9	4653	4661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564488
56	NC_014212	GAC	2	6	4786	4791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564488
57	NC_014212	CGG	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564488
58	NC_014212	GGA	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564488
59	NC_014212	TGG	2	6	4913	4918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
60	NC_014212	GGT	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
61	NC_014212	CGG	2	6	5337	5342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564488
62	NC_014212	GCC	2	6	5344	5349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564488
63	NC_014212	TTG	2	6	5449	5454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564488
64	NC_014212	GTG	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
65	NC_014212	GAC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564488
66	NC_014212	GTC	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014212	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
68	NC_014212	GAT	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564489
69	NC_014212	GGT	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
70	NC_014212	GCT	2	6	5868	5873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
71	NC_014212	TCG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
72	NC_014212	GAA	2	6	5923	5928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564489
73	NC_014212	TTC	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564489
74	NC_014212	GGT	2	6	6208	6213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
75	NC_014212	TGA	2	6	6228	6233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564489
76	NC_014212	GTT	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564489
77	NC_014212	AGG	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564489
78	NC_014212	TCG	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
79	NC_014212	CGG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564489
80	NC_014212	CAC	2	6	6385	6390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564489
81	NC_014212	CAC	2	6	6460	6465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564489
82	NC_014212	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
83	NC_014212	ATC	2	6	6505	6510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564489
84	NC_014212	ACG	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564489
85	NC_014212	TCG	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
86	NC_014212	GCG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564489
87	NC_014212	GGC	2	6	6687	6692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564489
88	NC_014212	TGC	2	6	6695	6700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
89	NC_014212	GGT	2	6	6865	6870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
90	NC_014212	CCT	2	6	7028	7033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014212	AGG	2	6	7194	7199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014212	TCC	2	6	7550	7555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014212	GAC	2	6	7662	7667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014212	GCA	2	6	7674	7679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014212	TCA	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014212	TTC	2	6	7752	7757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014212	GCT	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014212	TCA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014212	GCG	2	6	8295	8300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014212	CTG	2	6	8341	8346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014212	GTC	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014212	CGT	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014212	CCA	2	6	8440	8445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014212	CGC	2	6	8641	8646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014212	AGA	2	6	8792	8797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564490
106	NC_014212	CTC	2	6	8871	8876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
107	NC_014212	CGG	2	6	8935	8940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564490
108	NC_014212	GTA	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564490
109	NC_014212	CTC	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
110	NC_014212	CTC	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
111	NC_014212	CAG	2	6	9106	9111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564490
112	NC_014212	CCT	2	6	9113	9118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
113	NC_014212	CCT	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
114	NC_014212	AGC	2	6	9595	9600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564490
115	NC_014212	GCG	2	6	9639	9644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564490
116	NC_014212	GGT	2	6	9698	9703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564490
117	NC_014212	GGT	2	6	9879	9884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564490
118	NC_014212	CCT	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014212	TTC	2	6	9988	9993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014212	AGG	2	6	10002	10007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014212	CGC	2	6	10094	10099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564491
122	NC_014212	ATG	2	6	10165	10170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564491
123	NC_014212	CTG	2	6	10182	10187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564491
124	NC_014212	GCC	2	6	10196	10201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564491
125	NC_014212	CGG	2	6	10207	10212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564491
126	NC_014212	AGG	2	6	10222	10227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564491
127	NC_014212	GCT	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564491
128	NC_014212	GAC	2	6	10269	10274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564491
129	NC_014212	ACC	2	6	10275	10280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564491
130	NC_014212	GGT	2	6	10346	10351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564491
131	NC_014212	CTG	2	6	10374	10379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564491
132	NC_014212	GGT	2	6	10670	10675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564491
133	NC_014212	CCT	3	9	10892	10900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564491
134	NC_014212	TCC	2	6	10915	10920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564491
135	NC_014212	TCG	2	6	11116	11121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014212	CTG	2	6	11158	11163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564492
137	NC_014212	CGA	3	9	11181	11189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564492
138	NC_014212	GGA	2	6	11203	11208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564492
139	NC_014212	TCA	2	6	11249	11254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564492
140	NC_014212	AGA	2	6	11325	11330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564492
141	NC_014212	CAC	2	6	11442	11447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564492
142	NC_014212	TGC	2	6	11504	11509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564492
143	NC_014212	CAT	2	6	11520	11525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564492
144	NC_014212	GGA	2	6	11612	11617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564492
145	NC_014212	CTA	2	6	11628	11633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564492
146	NC_014212	GAT	2	6	11969	11974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014212	GTG	2	6	12096	12101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564493
148	NC_014212	CAG	2	6	12102	12107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564493
149	NC_014212	GGT	2	6	12122	12127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564493
150	NC_014212	TAC	2	6	12171	12176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564493
151	NC_014212	GGC	2	6	12200	12205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564493
152	NC_014212	CCA	2	6	12233	12238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564493
153	NC_014212	ACT	2	6	12310	12315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564493
154	NC_014212	GTG	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564493
155	NC_014212	TGC	2	6	12388	12393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564493
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157	NC_014212	GCT	2	6	12645	12650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564494
158	NC_014212	GGA	3	9	12651	12659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564494
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162	NC_014212	GCT	2	6	12930	12935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564494
163	NC_014212	GAG	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564494
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201	NC_014212	ATG	2	6	15529	15534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564498
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247	NC_014212	ATA	2	6	18738	18743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_014212	ATT	2	6	18762	18767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_014212	AGG	2	6	18856	18861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_014212	CAG	2	6	19195	19200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564501
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257	NC_014212	AGG	2	6	19256	19261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564501
258	NC_014212	AAG	2	6	19270	19275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564501
259	NC_014212	AGC	2	6	19308	19313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564501
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261	NC_014212	GAG	2	6	19372	19377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564501
262	NC_014212	AGC	2	6	19451	19456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564501
263	NC_014212	AAG	2	6	19507	19512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564501
264	NC_014212	GAA	2	6	19548	19553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014212	TAG	2	6	19645	19650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564502
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273	NC_014212	GCA	2	6	20150	20155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_014212	TTG	2	6	20270	20275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564503
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285	NC_014212	ACC	2	6	21671	21676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564504
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379	NC_014212	TGA	2	6	28789	28794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564511
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494	NC_014212	ACT	2	6	35539	35544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_014212	CCA	2	6	35610	35615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564517
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500	NC_014212	ACC	2	6	35872	35877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564517

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