MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 4132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014122	CATA	2	8	248	255	50 %	25 %	0 %	25 %	296108689
2	NC_014122	TTTA	2	8	645	652	25 %	75 %	0 %	0 %	296108689
3	NC_014122	TTAT	2	8	805	812	25 %	75 %	0 %	0 %	296108689
4	NC_014122	TATC	2	8	983	990	25 %	50 %	0 %	25 %	296108689
5	NC_014122	ATTA	2	8	1145	1152	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
6	NC_014122	TAAA	2	8	1300	1307	75 %	25 %	0 %	0 %	296108690
7	NC_014122	TAAA	2	8	1675	1682	75 %	25 %	0 %	0 %	296108690
8	NC_014122	AGGA	2	8	1933	1940	50 %	0 %	50 %	0 %	296108690
9	NC_014122	TAAT	2	8	2094	2101	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
10	NC_014122	TTTA	3	12	2234	2245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014122	CTAT	2	8	2457	2464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014122	ATAC	2	8	2649	2656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014122	GTAA	2	8	2734	2741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014122	AGTT	2	8	2960	2967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014122	TAAA	2	8	3283	3290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014122	CATC	2	8	3534	3541	25 %	25 %	0 %	50 %	296108691
17	NC_014122	AAAT	2	8	5641	5648	75 %	25 %	0 %	0 %	296108694
18	NC_014122	GAAT	2	8	6089	6096	50 %	25 %	25 %	0 %	296108694
19	NC_014122	ATAA	2	8	6171	6178	75 %	25 %	0 %	0 %	296108694
20	NC_014122	TAGA	2	8	6272	6279	50 %	25 %	25 %	0 %	296108694
21	NC_014122	ATAA	2	8	6391	6398	75 %	25 %	0 %	0 %	296108694
22	NC_014122	TAAA	2	8	7382	7389	75 %	25 %	0 %	0 %	296108697
23	NC_014122	TTTA	2	8	7511	7518	25 %	75 %	0 %	0 %	296108697
24	NC_014122	TATT	2	8	7694	7701	25 %	75 %	0 %	0 %	296108697
25	NC_014122	ATAG	2	8	8081	8088	50 %	25 %	25 %	0 %	296108698
26	NC_014122	AAAG	2	8	8176	8183	75 %	0 %	25 %	0 %	296108698
27	NC_014122	TTAT	2	8	8240	8247	25 %	75 %	0 %	0 %	296108698
28	NC_014122	ACTA	2	8	8803	8810	50 %	25 %	0 %	25 %	296108699
29	NC_014122	AAGA	2	8	9003	9010	75 %	0 %	25 %	0 %	296108699
30	NC_014122	CTTA	2	8	9398	9405	25 %	50 %	0 %	25 %	296108700
31	NC_014122	AACT	2	8	9422	9429	50 %	25 %	0 %	25 %	296108700
32	NC_014122	TCCT	2	8	11802	11809	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
33	NC_014122	TCCT	2	8	11955	11962	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
34	NC_014122	ATAA	2	8	13107	13114	75 %	25 %	0 %	0 %	296108703
35	NC_014122	ATCT	2	8	13854	13861	25 %	50 %	0 %	25 %	296108703
36	NC_014122	ATAG	2	8	14547	14554	50 %	25 %	25 %	0 %	296108704
37	NC_014122	AACT	2	8	15373	15380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014122	TCAA	2	8	15825	15832	50 %	25 %	0 %	25 %	296108707
39	NC_014122	ATTT	2	8	17191	17198	25 %	75 %	0 %	0 %	296108709
40	NC_014122	TATT	2	8	17247	17254	25 %	75 %	0 %	0 %	296108709
41	NC_014122	TAAC	2	8	17373	17380	50 %	25 %	0 %	25 %	296108709
42	NC_014122	TCTT	2	8	17495	17502	0 %	75 %	0 %	25 %	296108709
43	NC_014122	ATTA	2	8	17503	17510	50 %	50 %	0 %	0 %	296108709
44	NC_014122	CTTT	2	8	17654	17661	0 %	75 %	0 %	25 %	296108709
45	NC_014122	GATA	2	8	17719	17726	50 %	25 %	25 %	0 %	296108709
46	NC_014122	TCTA	2	8	18092	18099	25 %	50 %	0 %	25 %	296108709
47	NC_014122	TTAA	2	8	18268	18275	50 %	50 %	0 %	0 %	296108710
48	NC_014122	AAAG	2	8	18363	18370	75 %	0 %	25 %	0 %	296108710
49	NC_014122	AAAT	2	8	19799	19806	75 %	25 %	0 %	0 %	296108711
50	NC_014122	ATCA	2	8	20297	20304	50 %	25 %	0 %	25 %	296108712
51	NC_014122	TAGA	2	8	20671	20678	50 %	25 %	25 %	0 %	296108712
52	NC_014122	TTTA	2	8	22160	22167	25 %	75 %	0 %	0 %	296108714
53	NC_014122	TACT	2	8	22317	22324	25 %	50 %	0 %	25 %	296108714
54	NC_014122	CAAA	2	8	22356	22363	75 %	0 %	0 %	25 %	296108714
55	NC_014122	TGGA	2	8	22541	22548	25 %	25 %	50 %	0 %	296108714
56	NC_014122	ATAA	2	8	22697	22704	75 %	25 %	0 %	0 %	296108714
57	NC_014122	TATT	2	8	23191	23198	25 %	75 %	0 %	0 %	296108714
58	NC_014122	TAAA	2	8	23483	23490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014122	TCCA	2	8	23663	23670	25 %	25 %	0 %	50 %	296108715
60	NC_014122	ATGC	2	8	23854	23861	25 %	25 %	25 %	25 %	296108715
61	NC_014122	AAGG	2	8	24517	24524	50 %	0 %	50 %	0 %	296108715
62	NC_014122	AAGA	2	8	24759	24766	75 %	0 %	25 %	0 %	296108716
63	NC_014122	CTTT	2	8	24820	24827	0 %	75 %	0 %	25 %	296108716
64	NC_014122	AAGA	2	8	24936	24943	75 %	0 %	25 %	0 %	296108716
65	NC_014122	CGGG	2	8	25466	25473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014122	AAAT	2	8	25541	25548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014122	CTTT	2	8	25697	25704	0 %	75 %	0 %	25 %	296108717
68	NC_014122	AAGT	2	8	25978	25985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014122	TTTC	2	8	26129	26136	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014122	ATTC	2	8	27203	27210	25 %	50 %	0 %	25 %	296108718
71	NC_014122	TCTA	2	8	27618	27625	25 %	50 %	0 %	25 %	296108718
72	NC_014122	CATC	2	8	28231	28238	25 %	25 %	0 %	50 %	296108718
73	NC_014122	TAAA	2	8	28272	28279	75 %	25 %	0 %	0 %	296108718
74	NC_014122	GAAT	2	8	28505	28512	50 %	25 %	25 %	0 %	296108718
75	NC_014122	GAAA	2	8	29126	29133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014122	ACTT	2	8	29277	29284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014122	ACTT	2	8	30305	30312	25 %	50 %	0 %	25 %	296108720
78	NC_014122	TAAA	2	8	30467	30474	75 %	25 %	0 %	0 %	296108720
79	NC_014122	CAGC	2	8	30511	30518	25 %	0 %	25 %	50 %	296108720
80	NC_014122	TACA	2	8	30575	30582	50 %	25 %	0 %	25 %	296108720
81	NC_014122	GGTG	2	8	31023	31030	0 %	25 %	75 %	0 %	296108721
82	NC_014122	AGGA	2	8	31523	31530	50 %	0 %	50 %	0 %	296108721
83	NC_014122	TCCA	2	8	31562	31569	25 %	25 %	0 %	50 %	296108721
84	NC_014122	TCTT	2	8	32155	32162	0 %	75 %	0 %	25 %	296108723
85	NC_014122	GTAA	2	8	32858	32865	50 %	25 %	25 %	0 %	296108724
86	NC_014122	TCTT	2	8	33151	33158	0 %	75 %	0 %	25 %	296108724
87	NC_014122	GACA	2	8	33730	33737	50 %	0 %	25 %	25 %	296108725
88	NC_014122	CTTT	2	8	33955	33962	0 %	75 %	0 %	25 %	296108725
89	NC_014122	TCTT	2	8	34207	34214	0 %	75 %	0 %	25 %	296108725
90	NC_014122	CCTT	2	8	34531	34538	0 %	50 %	0 %	50 %	296108725
91	NC_014122	CAGC	2	8	34590	34597	25 %	0 %	25 %	50 %	296108725
92	NC_014122	CTTC	3	12	35299	35310	0 %	50 %	0 %	50 %	296108726
93	NC_014122	ATTT	2	8	35734	35741	25 %	75 %	0 %	0 %	296108727
94	NC_014122	ATTT	2	8	35870	35877	25 %	75 %	0 %	0 %	296108728
95	NC_014122	CAAC	2	8	35898	35905	50 %	0 %	0 %	50 %	296108728
96	NC_014122	CTGT	2	8	37133	37140	0 %	50 %	25 %	25 %	296108729
97	NC_014122	AAAT	2	8	37319	37326	75 %	25 %	0 %	0 %	296108730
98	NC_014122	GTAG	2	8	37367	37374	25 %	25 %	50 %	0 %	296108730
99	NC_014122	AGTA	2	8	38075	38082	50 %	25 %	25 %	0 %	296108730
100	NC_014122	AAGA	2	8	38107	38114	75 %	0 %	25 %	0 %	296108730
101	NC_014122	ATGG	2	8	38243	38250	25 %	25 %	50 %	0 %	296108730
102	NC_014122	TCAA	2	8	39045	39052	50 %	25 %	0 %	25 %	296108730
103	NC_014122	TAGA	2	8	39159	39166	50 %	25 %	25 %	0 %	296108730
104	NC_014122	TGTA	2	8	39310	39317	25 %	50 %	25 %	0 %	296108730
105	NC_014122	AAGA	2	8	39488	39495	75 %	0 %	25 %	0 %	296108730
106	NC_014122	ACTT	2	8	39669	39676	25 %	50 %	0 %	25 %	296108730
107	NC_014122	TCTT	2	8	40160	40167	0 %	75 %	0 %	25 %	296108731
108	NC_014122	ATAA	2	8	40574	40581	75 %	25 %	0 %	0 %	296108731
109	NC_014122	TTTA	2	8	40833	40840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014122	ACTT	2	8	40896	40903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014122	TTAG	2	8	40992	40999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014122	AGTA	2	8	41158	41165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014122	TAAA	2	8	41190	41197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014122	TTAA	2	8	41428	41435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014122	TTAT	2	8	41592	41599	25 %	75 %	0 %	0 %	296108732
116	NC_014122	TTTA	2	8	42019	42026	25 %	75 %	0 %	0 %	296108732
117	NC_014122	TAAG	2	8	42081	42088	50 %	25 %	25 %	0 %	296108732
118	NC_014122	TAGG	2	8	42228	42235	25 %	25 %	50 %	0 %	296108732
119	NC_014122	GTTG	2	8	42552	42559	0 %	50 %	50 %	0 %	296108733
120	NC_014122	ATAA	2	8	42742	42749	75 %	25 %	0 %	0 %	296108733
121	NC_014122	CCTT	2	8	43096	43103	0 %	50 %	0 %	50 %	296108734
122	NC_014122	CTTG	2	8	43180	43187	0 %	50 %	25 %	25 %	296108734
123	NC_014122	ATCT	2	8	44258	44265	25 %	50 %	0 %	25 %	296108735
124	NC_014122	TACT	2	8	44277	44284	25 %	50 %	0 %	25 %	296108735
125	NC_014122	AAGA	2	8	44340	44347	75 %	0 %	25 %	0 %	296108735
126	NC_014122	ATTT	2	8	44942	44949	25 %	75 %	0 %	0 %	296108736
127	NC_014122	ATTA	2	8	44991	44998	50 %	50 %	0 %	0 %	296108736
128	NC_014122	ATAC	2	8	45079	45086	50 %	25 %	0 %	25 %	296108736
129	NC_014122	ATTA	2	8	45149	45156	50 %	50 %	0 %	0 %	296108736
130	NC_014122	TATT	2	8	45292	45299	25 %	75 %	0 %	0 %	296108736
131	NC_014122	ATTT	2	8	48402	48409	25 %	75 %	0 %	0 %	296108740
132	NC_014122	ATTA	2	8	48477	48484	50 %	50 %	0 %	0 %	296108740
133	NC_014122	CTTA	2	8	48616	48623	25 %	50 %	0 %	25 %	296108740
134	NC_014122	GTTT	2	8	48888	48895	0 %	75 %	25 %	0 %	296108740
135	NC_014122	TTAT	2	8	49506	49513	25 %	75 %	0 %	0 %	296108741
136	NC_014122	TAAG	2	8	49737	49744	50 %	25 %	25 %	0 %	296108741
137	NC_014122	AATA	2	8	50002	50009	75 %	25 %	0 %	0 %	296108742
138	NC_014122	CCAC	2	8	50418	50425	25 %	0 %	0 %	75 %	296108742
139	NC_014122	AAAT	2	8	50706	50713	75 %	25 %	0 %	0 %	296108743
140	NC_014122	CCTT	2	8	51036	51043	0 %	50 %	0 %	50 %	296108743
141	NC_014122	CATA	2	8	51372	51379	50 %	25 %	0 %	25 %	296108744
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143	NC_014122	TTTC	2	8	51596	51603	0 %	75 %	0 %	25 %	296108744
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