MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014122	TTAGC	2	10	149746	149755	20 %	40 %	20 %	20 %	296108847
4003	NC_014122	TC	3	6	149756	149761	0 %	50 %	0 %	50 %	296108847
4004	NC_014122	A	6	6	149768	149773	100 %	0 %	0 %	0 %	296108847
4005	NC_014122	TGA	2	6	149804	149809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108847
4006	NC_014122	TA	4	8	149813	149820	50 %	50 %	0 %	0 %	296108847
4007	NC_014122	A	8	8	149835	149842	100 %	0 %	0 %	0 %	296108847
4008	NC_014122	TAG	2	6	149848	149853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108847
4009	NC_014122	A	6	6	149873	149878	100 %	0 %	0 %	0 %	296108847
4010	NC_014122	AG	3	6	149888	149893	50 %	0 %	50 %	0 %	296108847
4011	NC_014122	TG	3	6	149908	149913	0 %	50 %	50 %	0 %	296108847
4012	NC_014122	AGA	2	6	149920	149925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108847
4013	NC_014122	GATT	2	8	149944	149951	25 %	50 %	25 %	0 %	296108847
4014	NC_014122	AT	4	8	149961	149968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014122	TAA	2	6	149988	149993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014122	AT	3	6	150033	150038	50 %	50 %	0 %	0 %	296108848
4017	NC_014122	GCTTTA	2	12	150039	150050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296108848
4018	NC_014122	CTAT	2	8	150055	150062	25 %	50 %	0 %	25 %	296108848
4019	NC_014122	ATA	2	6	150097	150102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108848
4020	NC_014122	CAA	2	6	150121	150126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108848
4021	NC_014122	AGA	2	6	150194	150199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108848
4022	NC_014122	AAT	2	6	150207	150212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108848
4023	NC_014122	GTTA	2	8	150237	150244	25 %	50 %	25 %	0 %	296108848
4024	NC_014122	ATG	2	6	150268	150273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108848
4025	NC_014122	AAG	2	6	150274	150279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108848
4026	NC_014122	TAAAT	2	10	150305	150314	60 %	40 %	0 %	0 %	296108848
4027	NC_014122	T	6	6	150314	150319	0 %	100 %	0 %	0 %	296108848
4028	NC_014122	TCAGAT	2	12	150366	150377	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296108848
4029	NC_014122	AAGA	2	8	150384	150391	75 %	0 %	25 %	0 %	296108848
4030	NC_014122	A	6	6	150398	150403	100 %	0 %	0 %	0 %	296108848
4031	NC_014122	AT	3	6	150430	150435	50 %	50 %	0 %	0 %	296108848
4032	NC_014122	AAT	2	6	150441	150446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108848
4033	NC_014122	T	6	6	150459	150464	0 %	100 %	0 %	0 %	296108848
4034	NC_014122	GAT	2	6	150504	150509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108848
4035	NC_014122	A	6	6	150536	150541	100 %	0 %	0 %	0 %	296108848
4036	NC_014122	ATTTT	2	10	150651	150660	20 %	80 %	0 %	0 %	296108848
4037	NC_014122	ACT	2	6	150696	150701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108848
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4039	NC_014122	AAAG	2	8	150768	150775	75 %	0 %	25 %	0 %	296108848
4040	NC_014122	GGCT	2	8	150792	150799	0 %	25 %	50 %	25 %	296108848
4041	NC_014122	AGA	2	6	150833	150838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108848
4042	NC_014122	TTAGAT	2	12	150852	150863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296108848
4043	NC_014122	AGA	2	6	150878	150883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108848
4044	NC_014122	GTT	2	6	150905	150910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108848
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4049	NC_014122	AATT	2	8	151108	151115	50 %	50 %	0 %	0 %	296108848
4050	NC_014122	AGA	2	6	151127	151132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108848
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4053	NC_014122	TTAA	2	8	151206	151213	50 %	50 %	0 %	0 %	296108848
4054	NC_014122	GAA	2	6	151224	151229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108848
4055	NC_014122	TGG	2	6	151277	151282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296108848
4056	NC_014122	GAAT	2	8	151286	151293	50 %	25 %	25 %	0 %	296108848
4057	NC_014122	AG	3	6	151302	151307	50 %	0 %	50 %	0 %	296108849
4058	NC_014122	AAAT	2	8	151343	151350	75 %	25 %	0 %	0 %	296108849
4059	NC_014122	ATAAAA	2	12	151361	151372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296108849
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4061	NC_014122	ATTTA	2	10	151383	151392	40 %	60 %	0 %	0 %	296108849
4062	NC_014122	TAA	2	6	151419	151424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108849
4063	NC_014122	GAAA	2	8	151535	151542	75 %	0 %	25 %	0 %	296108849
4064	NC_014122	ATA	2	6	151556	151561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108849
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4093	NC_014122	TTA	2	6	152502	152507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108850
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4095	NC_014122	AGT	2	6	152555	152560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108851
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4105	NC_014122	ATT	2	6	152899	152904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108851
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4109	NC_014122	TA	3	6	152995	153000	50 %	50 %	0 %	0 %	296108851
4110	NC_014122	AAAT	2	8	153001	153008	75 %	25 %	0 %	0 %	296108851
4111	NC_014122	A	6	6	153051	153056	100 %	0 %	0 %	0 %	296108851
4112	NC_014122	TTCT	2	8	153062	153069	0 %	75 %	0 %	25 %	296108851
4113	NC_014122	TTTC	2	8	153071	153078	0 %	75 %	0 %	25 %	296108851
4114	NC_014122	T	6	6	153145	153150	0 %	100 %	0 %	0 %	296108851
4115	NC_014122	TTA	2	6	153156	153161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108851
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4119	NC_014122	A	6	6	153265	153270	100 %	0 %	0 %	0 %	296108851
4120	NC_014122	AATTT	2	10	153289	153298	40 %	60 %	0 %	0 %	296108851
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4254	NC_014122	A	6	6	157984	157989	100 %	0 %	0 %	0 %	296108853
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4356	NC_014122	T	6	6	161176	161181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4366	NC_014122	ATTG	2	8	161551	161558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4367	NC_014122	AGA	2	6	161568	161573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4368	NC_014122	A	6	6	161578	161583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_014122	AGA	2	6	161591	161596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4371	NC_014122	TAA	2	6	161665	161670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_014122	ATA	2	6	161671	161676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_014122	A	6	6	161676	161681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_014122	GAA	2	6	161697	161702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_014122	A	6	6	161708	161713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_014122	GCTAAC	2	12	161754	161765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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