MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 35622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_014122	ATTT	2	8	1324437	1324444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35502	NC_014122	TTAA	2	8	1324474	1324481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35503	NC_014122	TTC	2	6	1324542	1324547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35504	NC_014122	ATT	3	9	1324567	1324575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35505	NC_014122	TCA	2	6	1324576	1324581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35506	NC_014122	AAG	2	6	1324590	1324595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35507	NC_014122	T	6	6	1324607	1324612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35508	NC_014122	AGT	2	6	1324623	1324628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35509	NC_014122	TAC	2	6	1324635	1324640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35510	NC_014122	TTA	2	6	1324643	1324648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35511	NC_014122	T	7	7	1324763	1324769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35512	NC_014122	TTTA	2	8	1324791	1324798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35513	NC_014122	GTA	2	6	1324855	1324860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35514	NC_014122	A	7	7	1324875	1324881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35515	NC_014122	T	6	6	1324899	1324904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35516	NC_014122	TAAAA	2	10	1324911	1324920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35517	NC_014122	T	6	6	1324936	1324941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35518	NC_014122	TAA	2	6	1324950	1324955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35519	NC_014122	TAA	2	6	1324978	1324983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35520	NC_014122	A	6	6	1325004	1325009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35521	NC_014122	TTTTA	2	10	1325010	1325019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35522	NC_014122	T	6	6	1325041	1325046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35523	NC_014122	GAT	2	6	1325095	1325100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35524	NC_014122	AAATCT	2	12	1325117	1325128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35525	NC_014122	T	6	6	1325144	1325149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35526	NC_014122	AAT	2	6	1325150	1325155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35527	NC_014122	T	7	7	1325190	1325196	0 %	100 %	0 %	0 %	296110126
35528	NC_014122	CTT	2	6	1325200	1325205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110126
35529	NC_014122	TTC	2	6	1325210	1325215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110126
35530	NC_014122	CT	4	8	1325230	1325237	0 %	50 %	0 %	50 %	296110126
35531	NC_014122	CAA	2	6	1325281	1325286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110126
35532	NC_014122	TAT	2	6	1325311	1325316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296110126
35533	NC_014122	TTAC	2	8	1325322	1325329	25 %	50 %	0 %	25 %	296110126
35534	NC_014122	T	6	6	1325333	1325338	0 %	100 %	0 %	0 %	296110126
35535	NC_014122	T	6	6	1325367	1325372	0 %	100 %	0 %	0 %	296110126
35536	NC_014122	TTC	2	6	1325396	1325401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110126
35537	NC_014122	TTC	2	6	1325420	1325425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110126
35538	NC_014122	TTTA	2	8	1325438	1325445	25 %	75 %	0 %	0 %	296110126
35539	NC_014122	CAT	2	6	1325452	1325457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110126
35540	NC_014122	ATTCAT	2	12	1325500	1325511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296110126
35541	NC_014122	TAAA	2	8	1325537	1325544	75 %	25 %	0 %	0 %	296110126
35542	NC_014122	T	6	6	1325546	1325551	0 %	100 %	0 %	0 %	296110126
35543	NC_014122	A	7	7	1325612	1325618	100 %	0 %	0 %	0 %	296110126
35544	NC_014122	TA	4	8	1325635	1325642	50 %	50 %	0 %	0 %	296110126
35545	NC_014122	TCA	2	6	1325685	1325690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110126
35546	NC_014122	TAC	2	6	1325746	1325751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110126
35547	NC_014122	CTT	2	6	1325782	1325787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110126
35548	NC_014122	ATC	2	6	1325822	1325827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296110126
35549	NC_014122	TTC	2	6	1325870	1325875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296110126
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35553	NC_014122	T	7	7	1326107	1326113	0 %	100 %	0 %	0 %	296110126
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35556	NC_014122	T	6	6	1326280	1326285	0 %	100 %	0 %	0 %	296110126
35557	NC_014122	AAT	2	6	1326287	1326292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110126
35558	NC_014122	TTTA	2	8	1326302	1326309	25 %	75 %	0 %	0 %	296110126
35559	NC_014122	CAA	3	9	1326358	1326366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296110126
35560	NC_014122	T	7	7	1326382	1326388	0 %	100 %	0 %	0 %	296110126
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35563	NC_014122	TCT	2	6	1326456	1326461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35564	NC_014122	TAT	2	6	1326471	1326476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35565	NC_014122	TATATT	2	12	1326482	1326493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35567	NC_014122	A	6	6	1326657	1326662	100 %	0 %	0 %	0 %	296110127
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35570	NC_014122	AT	3	6	1326745	1326750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35571	NC_014122	TA	3	6	1326812	1326817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35572	NC_014122	ATA	2	6	1326849	1326854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110128
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35581	NC_014122	TA	3	6	1327006	1327011	50 %	50 %	0 %	0 %	296110128
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35591	NC_014122	T	7	7	1327222	1327228	0 %	100 %	0 %	0 %	296110128
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35594	NC_014122	TTAT	2	8	1327283	1327290	25 %	75 %	0 %	0 %	296110128
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35602	NC_014122	ATA	2	6	1327559	1327564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296110128
35603	NC_014122	TCCC	2	8	1327587	1327594	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35604	NC_014122	T	6	6	1327610	1327615	0 %	100 %	0 %	0 %	296110129
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35622	NC_014122	AAAC	2	8	1328154	1328161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.