MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 1421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014002	CAGGT	2	10	711092	711101	20 %	20 %	40 %	20 %	294495361
502	NC_014002	CCCTG	2	10	711864	711873	0 %	20 %	20 %	60 %	294495362
503	NC_014002	ATCTT	2	10	714071	714080	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
504	NC_014002	TGTGA	2	10	714181	714190	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014002	TGCAT	2	10	714513	714522	20 %	40 %	20 %	20 %	294495365
506	NC_014002	CTTTC	2	10	715186	715195	0 %	60 %	0 %	40 %	294495366
507	NC_014002	TGTGG	2	10	716605	716614	0 %	40 %	60 %	0 %	294495366
508	NC_014002	CATCT	2	10	717894	717903	20 %	40 %	0 %	40 %	294495367
509	NC_014002	AAACT	2	10	720670	720679	60 %	20 %	0 %	20 %	294495370
510	NC_014002	ACTGT	2	10	721300	721309	20 %	40 %	20 %	20 %	294495371
511	NC_014002	TATTT	2	10	721884	721893	20 %	80 %	0 %	0 %	294495372
512	NC_014002	CATTT	2	10	722725	722734	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
513	NC_014002	GGAAC	2	10	725342	725351	40 %	0 %	40 %	20 %	294495375
514	NC_014002	ATGCA	2	10	727622	727631	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_014002	ATTGA	2	10	728743	728752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014002	ACTCC	2	10	729473	729482	20 %	20 %	0 %	60 %	294495380
517	NC_014002	TGTTA	2	10	732743	732752	20 %	60 %	20 %	0 %	294495384
518	NC_014002	TGAAA	2	10	735741	735750	60 %	20 %	20 %	0 %	294495388
519	NC_014002	TCCAC	2	10	736306	736315	20 %	20 %	0 %	60 %	294495388
520	NC_014002	AATGC	2	10	738972	738981	40 %	20 %	20 %	20 %	294495392
521	NC_014002	GGTTT	2	10	740428	740437	0 %	60 %	40 %	0 %	294495393
522	NC_014002	TTTTA	2	10	741287	741296	20 %	80 %	0 %	0 %	294495394
523	NC_014002	GGCAG	2	10	742271	742280	20 %	0 %	60 %	20 %	294495395
524	NC_014002	TCAGC	2	10	742362	742371	20 %	20 %	20 %	40 %	294495395
525	NC_014002	CCAAT	2	10	743928	743937	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
526	NC_014002	AATTT	2	10	744804	744813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014002	GAAAA	2	10	751296	751305	80 %	0 %	20 %	0 %	294495402
528	NC_014002	TGTTT	2	10	751657	751666	0 %	80 %	20 %	0 %	294495403
529	NC_014002	TAAAT	2	10	755184	755193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014002	ATCCT	2	10	756129	756138	20 %	40 %	0 %	40 %	294495408
531	NC_014002	ATTTT	2	10	765763	765772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014002	TCCAA	2	10	766897	766906	40 %	20 %	0 %	40 %	294495420
533	NC_014002	TTGGT	2	10	767498	767507	0 %	60 %	40 %	0 %	294495420
534	NC_014002	TTTTC	2	10	769366	769375	0 %	80 %	0 %	20 %	294495421
535	NC_014002	AGATG	2	10	773220	773229	40 %	20 %	40 %	0 %	294495423
536	NC_014002	TACAT	2	10	773381	773390	40 %	40 %	0 %	20 %	294495424
537	NC_014002	CCGGT	2	10	773497	773506	0 %	20 %	40 %	40 %	294495424
538	NC_014002	TCCGG	2	10	776473	776482	0 %	20 %	40 %	40 %	294495426
539	NC_014002	CATGT	2	10	777276	777285	20 %	40 %	20 %	20 %	294495426
540	NC_014002	CGATG	2	10	780432	780441	20 %	20 %	40 %	20 %	294495429
541	NC_014002	ATGAC	2	10	781427	781436	40 %	20 %	20 %	20 %	294495430
542	NC_014002	TGCAA	2	10	782792	782801	40 %	20 %	20 %	20 %	294495431
543	NC_014002	TCCAT	2	10	783063	783072	20 %	40 %	0 %	40 %	294495431
544	NC_014002	AGAAT	2	10	786754	786763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014002	AGCAT	2	10	786927	786936	40 %	20 %	20 %	20 %	294495437
546	NC_014002	GAAAA	2	10	787438	787447	80 %	0 %	20 %	0 %	294495437
547	NC_014002	GAAAT	2	10	788561	788570	60 %	20 %	20 %	0 %	294495439
548	NC_014002	AATTT	2	10	788899	788908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014002	AATTC	2	10	790384	790393	40 %	40 %	0 %	20 %	294495440
550	NC_014002	CATAT	2	10	792372	792381	40 %	40 %	0 %	20 %	294495441
551	NC_014002	CTGTC	2	10	793781	793790	0 %	40 %	20 %	40 %	294495442
552	NC_014002	TCATA	2	10	797619	797628	40 %	40 %	0 %	20 %	294495446
553	NC_014002	AATAA	2	10	797692	797701	80 %	20 %	0 %	0 %	294495446
554	NC_014002	TGGCA	2	10	798636	798645	20 %	20 %	40 %	20 %	294495446
555	NC_014002	CTATA	2	10	799430	799439	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
556	NC_014002	AATAA	2	10	799757	799766	80 %	20 %	0 %	0 %	294495447
557	NC_014002	TTTTG	2	10	799814	799823	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014002	GTTTT	2	10	802665	802674	0 %	80 %	20 %	0 %	294495450
559	NC_014002	TTTCA	2	10	803183	803192	20 %	60 %	0 %	20 %	294495451
560	NC_014002	AAAAT	2	10	803241	803250	80 %	20 %	0 %	0 %	294495451
561	NC_014002	GGCCA	2	10	804864	804873	20 %	0 %	40 %	40 %	294495453
562	NC_014002	GTATC	2	10	805726	805735	20 %	40 %	20 %	20 %	294495453
563	NC_014002	ACCTT	2	10	806242	806251	20 %	40 %	0 %	40 %	294495453
564	NC_014002	TTTCA	2	10	807455	807464	20 %	60 %	0 %	20 %	294495455
565	NC_014002	CTGGT	2	10	811308	811317	0 %	40 %	40 %	20 %	294495458
566	NC_014002	AATGA	2	10	815786	815795	60 %	20 %	20 %	0 %	294495461
567	NC_014002	GCACA	2	10	816669	816678	40 %	0 %	20 %	40 %	294495462
568	NC_014002	TCCAT	2	10	819790	819799	20 %	40 %	0 %	40 %	294495464
569	NC_014002	GCAGT	2	10	820698	820707	20 %	20 %	40 %	20 %	294495466
570	NC_014002	CAATA	2	10	821099	821108	60 %	20 %	0 %	20 %	294495466
571	NC_014002	AAGAT	2	10	822220	822229	60 %	20 %	20 %	0 %	294495468
572	NC_014002	TCCAG	2	10	827641	827650	20 %	20 %	20 %	40 %	294495478
573	NC_014002	CCTGT	2	10	828846	828855	0 %	40 %	20 %	40 %	294495479
574	NC_014002	TACAG	2	10	829453	829462	40 %	20 %	20 %	20 %	294495480
575	NC_014002	TCCCA	2	10	830823	830832	20 %	20 %	0 %	60 %	294495483
576	NC_014002	TCCGC	2	10	832528	832537	0 %	20 %	20 %	60 %	294495484
577	NC_014002	AACAG	2	10	834259	834268	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
578	NC_014002	TATCA	2	10	837906	837915	40 %	40 %	0 %	20 %	294495491
579	NC_014002	CTTTT	2	10	839769	839778	0 %	80 %	0 %	20 %	294495493
580	NC_014002	TTCAC	2	10	840068	840077	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
581	NC_014002	GCTAT	2	10	840110	840119	20 %	40 %	20 %	20 %	294495494
582	NC_014002	GTTTG	2	10	842310	842319	0 %	60 %	40 %	0 %	294495496
583	NC_014002	TGAAC	2	10	844539	844548	40 %	20 %	20 %	20 %	294495499
584	NC_014002	AGTAT	2	10	844628	844637	40 %	40 %	20 %	0 %	294495500
585	NC_014002	GGTAT	2	10	848448	848457	20 %	40 %	40 %	0 %	294495504
586	NC_014002	GTCAT	2	10	849618	849627	20 %	40 %	20 %	20 %	294495505
587	NC_014002	AAATT	2	10	851593	851602	60 %	40 %	0 %	0 %	294495506
588	NC_014002	TTTTC	2	10	852986	852995	0 %	80 %	0 %	20 %	294495506
589	NC_014002	AGACG	2	10	853101	853110	40 %	0 %	40 %	20 %	294495506
590	NC_014002	GTTAT	2	10	853567	853576	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014002	AGCAG	2	10	854642	854651	40 %	0 %	40 %	20 %	294495508
592	NC_014002	AAAAG	2	10	855068	855077	80 %	0 %	20 %	0 %	294495508
593	NC_014002	CCTGT	2	10	856429	856438	0 %	40 %	20 %	40 %	294495509
594	NC_014002	GAATT	2	10	856646	856655	40 %	40 %	20 %	0 %	294495510
595	NC_014002	AAGAT	2	10	859303	859312	60 %	20 %	20 %	0 %	294495513
596	NC_014002	CCTGT	2	10	859978	859987	0 %	40 %	20 %	40 %	294495513
597	NC_014002	CAGTA	2	10	860691	860700	40 %	20 %	20 %	20 %	294495514
598	NC_014002	CACAT	2	10	861537	861546	40 %	20 %	0 %	40 %	294495514
599	NC_014002	TCTTT	2	10	865319	865328	0 %	80 %	0 %	20 %	294495518
600	NC_014002	GGGGT	2	10	867276	867285	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014002	GGGGT	2	10	867414	867423	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014002	TTTCA	2	10	867512	867521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
603	NC_014002	TTATT	2	10	868423	868432	20 %	80 %	0 %	0 %	294495521
604	NC_014002	TGATA	2	10	868440	868449	40 %	40 %	20 %	0 %	294495521
605	NC_014002	AGATG	2	10	869116	869125	40 %	20 %	40 %	0 %	294495522
606	NC_014002	GGCAT	2	10	870845	870854	20 %	20 %	40 %	20 %	294495524
607	NC_014002	ATGAA	2	10	874145	874154	60 %	20 %	20 %	0 %	294495526
608	NC_014002	AAGGG	2	10	875316	875325	40 %	0 %	60 %	0 %	294495526
609	NC_014002	AAGAG	2	10	881810	881819	60 %	0 %	40 %	0 %	294495533
610	NC_014002	CCTCT	2	10	884619	884628	0 %	40 %	0 %	60 %	294495536
611	NC_014002	TTCTT	2	10	885307	885316	0 %	80 %	0 %	20 %	294495538
612	NC_014002	ATTCT	2	10	885718	885727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_014002	CTATT	2	10	886444	886453	20 %	60 %	0 %	20 %	294495540
614	NC_014002	ATATT	2	10	887988	887997	40 %	60 %	0 %	0 %	294495542
615	NC_014002	GTATC	2	10	889139	889148	20 %	40 %	20 %	20 %	294495543
616	NC_014002	TATTT	2	10	889160	889169	20 %	80 %	0 %	0 %	294495543
617	NC_014002	TAGGT	2	10	891165	891174	20 %	40 %	40 %	0 %	294495543
618	NC_014002	CGTAT	2	10	891637	891646	20 %	40 %	20 %	20 %	294495544
619	NC_014002	CGTTT	2	10	894634	894643	0 %	60 %	20 %	20 %	294495548
620	NC_014002	TCTTT	2	10	894768	894777	0 %	80 %	0 %	20 %	294495548
621	NC_014002	TTCTT	2	10	895904	895913	0 %	80 %	0 %	20 %	294495549
622	NC_014002	GGTTT	2	10	897336	897345	0 %	60 %	40 %	0 %	294495551
623	NC_014002	CCATA	2	10	897578	897587	40 %	20 %	0 %	40 %	294495551
624	NC_014002	CCATT	2	10	900686	900695	20 %	40 %	0 %	40 %	294495555
625	NC_014002	AATAA	2	10	901363	901372	80 %	20 %	0 %	0 %	294495555
626	NC_014002	TAAAA	2	10	902111	902120	80 %	20 %	0 %	0 %	294495557
627	NC_014002	GGATT	2	10	902499	902508	20 %	40 %	40 %	0 %	294495557
628	NC_014002	AAAAT	2	10	904318	904327	80 %	20 %	0 %	0 %	294495558
629	NC_014002	GCTCA	2	10	905253	905262	20 %	20 %	20 %	40 %	294495560
630	NC_014002	ATATC	2	10	905432	905441	40 %	40 %	0 %	20 %	294495560
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