MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_013946	CTGG	2	8	2214613	2214620	0 %	25 %	50 %	25 %	291296540
49002	NC_013946	CCGC	2	8	2214635	2214642	0 %	0 %	25 %	75 %	291296540
49003	NC_013946	AGCC	2	8	2214649	2214656	25 %	0 %	25 %	50 %	291296540
49004	NC_013946	TCC	2	6	2214684	2214689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49005	NC_013946	GCTC	2	8	2214720	2214727	0 %	25 %	25 %	50 %	291296541
49006	NC_013946	CGC	2	6	2214748	2214753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296541
49007	NC_013946	C	6	6	2214788	2214793	0 %	0 %	0 %	100 %	291296541
49008	NC_013946	G	6	6	2214795	2214800	0 %	0 %	100 %	0 %	291296541
49009	NC_013946	CGG	2	6	2214857	2214862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296541
49010	NC_013946	CGC	2	6	2214910	2214915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296541
49011	NC_013946	CAG	2	6	2214961	2214966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296541
49012	NC_013946	C	6	6	2214969	2214974	0 %	0 %	0 %	100 %	291296541
49013	NC_013946	GGC	2	6	2214991	2214996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296541
49014	NC_013946	GGC	2	6	2215030	2215035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296541
49015	NC_013946	GGCT	2	8	2215074	2215081	0 %	25 %	50 %	25 %	291296541
49016	NC_013946	GCACC	2	10	2215086	2215095	20 %	0 %	20 %	60 %	291296541
49017	NC_013946	CGC	2	6	2215096	2215101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296541
49018	NC_013946	CCT	2	6	2215128	2215133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296541
49019	NC_013946	CCCG	2	8	2215254	2215261	0 %	0 %	25 %	75 %	291296541
49020	NC_013946	C	6	6	2215292	2215297	0 %	0 %	0 %	100 %	291296541
49021	NC_013946	GT	3	6	2215337	2215342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49022	NC_013946	TGC	2	6	2215344	2215349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49023	NC_013946	GCT	2	6	2215385	2215390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49024	NC_013946	CCA	2	6	2215452	2215457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49025	NC_013946	CAG	2	6	2215542	2215547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296542
49026	NC_013946	CTC	2	6	2215548	2215553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296542
49027	NC_013946	GAG	2	6	2215623	2215628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296542
49028	NC_013946	GAA	2	6	2215662	2215667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296542
49029	NC_013946	GCA	2	6	2215738	2215743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49030	NC_013946	TGG	2	6	2215786	2215791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49031	NC_013946	CGA	2	6	2215796	2215801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49032	NC_013946	GGTTCA	2	12	2215838	2215849	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291296543
49033	NC_013946	GCC	2	6	2215864	2215869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296543
49034	NC_013946	GAA	2	6	2215877	2215882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296543
49035	NC_013946	TCT	2	6	2215897	2215902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296543
49036	NC_013946	TCG	3	9	2215927	2215935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296543
49037	NC_013946	CAACC	2	10	2216028	2216037	40 %	0 %	0 %	60 %	291296543
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49039	NC_013946	GTA	2	6	2216136	2216141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296544
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49041	NC_013946	GGTTC	2	10	2216187	2216196	0 %	40 %	40 %	20 %	291296544
49042	NC_013946	GCA	2	6	2216243	2216248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296544
49043	NC_013946	TCC	2	6	2216263	2216268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296544
49044	NC_013946	GAG	2	6	2216353	2216358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296544
49045	NC_013946	GTC	2	6	2216373	2216378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296544
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49047	NC_013946	C	7	7	2216418	2216424	0 %	0 %	0 %	100 %	291296544
49048	NC_013946	GCA	2	6	2216444	2216449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296544
49049	NC_013946	GGCTG	2	10	2216480	2216489	0 %	20 %	60 %	20 %	291296544
49050	NC_013946	CCA	2	6	2216501	2216506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296544
49051	NC_013946	GCAC	2	8	2216509	2216516	25 %	0 %	25 %	50 %	291296544
49052	NC_013946	C	6	6	2216578	2216583	0 %	0 %	0 %	100 %	291296544
49053	NC_013946	CTC	2	6	2216649	2216654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296544
49054	NC_013946	GCA	2	6	2216681	2216686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296544
49055	NC_013946	GGGTG	2	10	2216693	2216702	0 %	20 %	80 %	0 %	291296544
49056	NC_013946	TTG	2	6	2216728	2216733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296544
49057	NC_013946	CTT	2	6	2216786	2216791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296544
49058	NC_013946	GCTT	2	8	2216881	2216888	0 %	50 %	25 %	25 %	291296544
49059	NC_013946	CG	3	6	2216977	2216982	0 %	0 %	50 %	50 %	291296544
49060	NC_013946	AGC	2	6	2217039	2217044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296544
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49062	NC_013946	GCA	3	9	2217074	2217082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296544
49063	NC_013946	CAG	2	6	2217111	2217116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296544
49064	NC_013946	GTC	2	6	2217117	2217122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296544
49065	NC_013946	TCG	2	6	2217169	2217174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296544
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49068	NC_013946	CTG	2	6	2217357	2217362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296544
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49084	NC_013946	CTC	2	6	2217912	2217917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296544
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49086	NC_013946	GCC	2	6	2217952	2217957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296544
49087	NC_013946	GTGG	2	8	2217972	2217979	0 %	25 %	75 %	0 %	291296544
49088	NC_013946	TTGC	2	8	2218002	2218009	0 %	50 %	25 %	25 %	291296544
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49102	NC_013946	GCT	2	6	2218682	2218687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49103	NC_013946	CA	3	6	2218701	2218706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49104	NC_013946	CAG	2	6	2218762	2218767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49105	NC_013946	C	6	6	2218837	2218842	0 %	0 %	0 %	100 %	291296545
49106	NC_013946	TGC	2	6	2218849	2218854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296545
49107	NC_013946	GCA	2	6	2218858	2218863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296545
49108	NC_013946	GCC	2	6	2218884	2218889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296545
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49113	NC_013946	C	6	6	2219332	2219337	0 %	0 %	0 %	100 %	291296545
49114	NC_013946	CGG	2	6	2219403	2219408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296545
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49117	NC_013946	CTT	2	6	2219518	2219523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296545
49118	NC_013946	GCA	2	6	2219530	2219535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296545
49119	NC_013946	GTG	2	6	2219567	2219572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296545
49120	NC_013946	CAG	2	6	2219591	2219596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296545
49121	NC_013946	TGC	2	6	2219631	2219636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296545
49122	NC_013946	TCC	2	6	2219643	2219648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296545
49123	NC_013946	CCT	2	6	2219662	2219667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296545
49124	NC_013946	GGGGGC	2	12	2219778	2219789	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	291296545
49125	NC_013946	G	7	7	2219802	2219808	0 %	0 %	100 %	0 %	291296545
49126	NC_013946	C	7	7	2219855	2219861	0 %	0 %	0 %	100 %	291296545
49127	NC_013946	CGCTG	2	10	2219875	2219884	0 %	20 %	40 %	40 %	291296545
49128	NC_013946	GCCC	2	8	2219930	2219937	0 %	0 %	25 %	75 %	291296545
49129	NC_013946	TCC	2	6	2219949	2219954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296545
49130	NC_013946	C	6	6	2219997	2220002	0 %	0 %	0 %	100 %	291296545
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49133	NC_013946	CGG	2	6	2220046	2220051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296545
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49137	NC_013946	GCC	2	6	2220274	2220279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296545
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49145	NC_013946	C	6	6	2221019	2221024	0 %	0 %	0 %	100 %	291296546
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49148	NC_013946	GC	3	6	2221072	2221077	0 %	0 %	50 %	50 %	291296546
49149	NC_013946	CAC	2	6	2221166	2221171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296546
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49154	NC_013946	GTG	2	6	2221299	2221304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296546
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49160	NC_013946	GCTG	2	8	2221560	2221567	0 %	25 %	50 %	25 %	291296546
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49164	NC_013946	CA	3	6	2221663	2221668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49165	NC_013946	CCGG	2	8	2221690	2221697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49166	NC_013946	TCC	2	6	2221729	2221734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296547
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49181	NC_013946	TTC	2	6	2222391	2222396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49203	NC_013946	GATCAA	2	12	2223600	2223611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291296550
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49216	NC_013946	GGC	2	6	2224461	2224466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296550
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49219	NC_013946	A	7	7	2224695	2224701	100 %	0 %	0 %	0 %	291296551
49220	NC_013946	GGGCCG	2	12	2224705	2224716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296551
49221	NC_013946	CAA	3	9	2224840	2224848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296551
49222	NC_013946	GCT	2	6	2224849	2224854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296551
49223	NC_013946	CGAGCT	2	12	2225038	2225049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291296551
49224	NC_013946	CAG	2	6	2225054	2225059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296551
49225	NC_013946	G	6	6	2225101	2225106	0 %	0 %	100 %	0 %	291296551
49226	NC_013946	TGC	2	6	2225111	2225116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296551
49227	NC_013946	A	6	6	2225234	2225239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49228	NC_013946	A	6	6	2225282	2225287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49229	NC_013946	TGGC	2	8	2225295	2225302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49230	NC_013946	GACC	2	8	2225512	2225519	25 %	0 %	25 %	50 %	291296552
49231	NC_013946	GC	3	6	2225595	2225600	0 %	0 %	50 %	50 %	291296552
49232	NC_013946	GGT	2	6	2225641	2225646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296552
49233	NC_013946	CCA	2	6	2225668	2225673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296552
49234	NC_013946	GCT	2	6	2225743	2225748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296552
49235	NC_013946	CCG	2	6	2225809	2225814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296552
49236	NC_013946	CTCG	2	8	2225833	2225840	0 %	25 %	25 %	50 %	291296552
49237	NC_013946	GCT	2	6	2225842	2225847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296552
49238	NC_013946	TGC	2	6	2225886	2225891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296552
49239	NC_013946	GCT	2	6	2225906	2225911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296552
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49242	NC_013946	GCG	2	6	2226124	2226129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296552
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49266	NC_013946	GGA	2	6	2226931	2226936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296552
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49305	NC_013946	CTG	2	6	2228563	2228568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296553
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49333	NC_013946	GGCGGT	2	12	2229690	2229701	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	291296553
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49344	NC_013946	GGGTT	2	10	2230230	2230239	0 %	40 %	60 %	0 %	291296554
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49346	NC_013946	ACC	2	6	2230375	2230380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296555
49347	NC_013946	G	6	6	2230431	2230436	0 %	0 %	100 %	0 %	291296555
49348	NC_013946	CAG	2	6	2230458	2230463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296555
49349	NC_013946	CGCC	2	8	2230487	2230494	0 %	0 %	25 %	75 %	291296555
49350	NC_013946	TCCCC	2	10	2230496	2230505	0 %	20 %	0 %	80 %	291296555
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49352	NC_013946	GCA	2	6	2230601	2230606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296555
49353	NC_013946	GGC	2	6	2230611	2230616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296555
49354	NC_013946	TGGGC	2	10	2230619	2230628	0 %	20 %	60 %	20 %	291296555
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