MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_013946	CCAGG	2	10	2191332	2191341	20 %	0 %	40 %	40 %	291296517
48502	NC_013946	TCG	2	6	2191357	2191362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296517
48503	NC_013946	CGGGG	3	15	2191436	2191450	0 %	0 %	80 %	20 %	291296517
48504	NC_013946	GCC	2	6	2191469	2191474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296517
48505	NC_013946	CCA	2	6	2191496	2191501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296517
48506	NC_013946	TGA	2	6	2191538	2191543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296517
48507	NC_013946	CA	3	6	2191621	2191626	50 %	0 %	0 %	50 %	291296517
48508	NC_013946	CCA	2	6	2191715	2191720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296517
48509	NC_013946	CAT	2	6	2191857	2191862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296517
48510	NC_013946	GCG	2	6	2191898	2191903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296517
48511	NC_013946	CGT	2	6	2191934	2191939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296517
48512	NC_013946	GAG	2	6	2191951	2191956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296517
48513	NC_013946	TTC	2	6	2191983	2191988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296517
48514	NC_013946	GTA	2	6	2192031	2192036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296517
48515	NC_013946	GCT	2	6	2192045	2192050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296517
48516	NC_013946	CAC	2	6	2192064	2192069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296517
48517	NC_013946	CG	3	6	2192074	2192079	0 %	0 %	50 %	50 %	291296517
48518	NC_013946	CAG	2	6	2192130	2192135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296517
48519	NC_013946	GAG	2	6	2192238	2192243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296517
48520	NC_013946	TGC	2	6	2192258	2192263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296517
48521	NC_013946	GCC	2	6	2192301	2192306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48522	NC_013946	GC	3	6	2192344	2192349	0 %	0 %	50 %	50 %	291296518
48523	NC_013946	GGCC	2	8	2192387	2192394	0 %	0 %	50 %	50 %	291296518
48524	NC_013946	C	6	6	2192448	2192453	0 %	0 %	0 %	100 %	291296518
48525	NC_013946	CGA	2	6	2192459	2192464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48526	NC_013946	C	7	7	2192480	2192486	0 %	0 %	0 %	100 %	291296518
48527	NC_013946	C	6	6	2192515	2192520	0 %	0 %	0 %	100 %	291296518
48528	NC_013946	CTGG	2	8	2192563	2192570	0 %	25 %	50 %	25 %	291296518
48529	NC_013946	TC	3	6	2192603	2192608	0 %	50 %	0 %	50 %	291296518
48530	NC_013946	TGG	2	6	2192632	2192637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296518
48531	NC_013946	CAG	2	6	2192661	2192666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48532	NC_013946	GTG	2	6	2192667	2192672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296518
48533	NC_013946	TGG	2	6	2192701	2192706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296518
48534	NC_013946	CAT	2	6	2192867	2192872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296518
48535	NC_013946	GCCC	2	8	2192896	2192903	0 %	0 %	25 %	75 %	291296518
48536	NC_013946	TGA	2	6	2192932	2192937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296518
48537	NC_013946	GCTG	2	8	2192963	2192970	0 %	25 %	50 %	25 %	291296518
48538	NC_013946	GGGCAG	2	12	2192994	2193005	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	291296518
48539	NC_013946	CTG	2	6	2193069	2193074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48540	NC_013946	GCG	2	6	2193141	2193146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296518
48541	NC_013946	ACG	2	6	2193175	2193180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48542	NC_013946	CGG	2	6	2193189	2193194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296518
48543	NC_013946	GCC	2	6	2193204	2193209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296518
48544	NC_013946	CAGGCC	2	12	2193402	2193413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291296518
48545	NC_013946	GCA	2	6	2193434	2193439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48546	NC_013946	CTGG	2	8	2193443	2193450	0 %	25 %	50 %	25 %	291296518
48547	NC_013946	GCT	2	6	2193461	2193466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48548	NC_013946	CCCAG	2	10	2193497	2193506	20 %	0 %	20 %	60 %	291296518
48549	NC_013946	C	6	6	2193518	2193523	0 %	0 %	0 %	100 %	291296518
48550	NC_013946	GCT	2	6	2193524	2193529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48551	NC_013946	TGC	2	6	2193550	2193555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296518
48552	NC_013946	CTTT	2	8	2193570	2193577	0 %	75 %	0 %	25 %	291296518
48553	NC_013946	GGA	2	6	2193578	2193583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296518
48554	NC_013946	GC	3	6	2193589	2193594	0 %	0 %	50 %	50 %	291296518
48555	NC_013946	GCC	2	6	2193600	2193605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296518
48556	NC_013946	GGT	2	6	2193608	2193613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296518
48557	NC_013946	CCA	2	6	2193620	2193625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296518
48558	NC_013946	CAAC	2	8	2193643	2193650	50 %	0 %	0 %	50 %	291296518
48559	NC_013946	GAG	2	6	2193672	2193677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296518
48560	NC_013946	GGC	2	6	2193690	2193695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296519
48561	NC_013946	TGCTGG	2	12	2193714	2193725	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291296519
48562	NC_013946	CAG	2	6	2193752	2193757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296519
48563	NC_013946	G	6	6	2193801	2193806	0 %	0 %	100 %	0 %	291296519
48564	NC_013946	T	6	6	2193845	2193850	0 %	100 %	0 %	0 %	291296519
48565	NC_013946	CG	4	8	2193868	2193875	0 %	0 %	50 %	50 %	291296519
48566	NC_013946	GCC	2	6	2193900	2193905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48567	NC_013946	GGC	2	6	2193918	2193923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296519
48568	NC_013946	CTT	2	6	2193964	2193969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296519
48569	NC_013946	GCC	2	6	2194001	2194006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48570	NC_013946	CCG	2	6	2194030	2194035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48571	NC_013946	CGC	2	6	2194051	2194056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48572	NC_013946	CTG	2	6	2194106	2194111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296519
48573	NC_013946	CCG	2	6	2194137	2194142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48574	NC_013946	CCTGG	2	10	2194147	2194156	0 %	20 %	40 %	40 %	291296519
48575	NC_013946	ACA	2	6	2194206	2194211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296519
48576	NC_013946	TCC	2	6	2194287	2194292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296519
48577	NC_013946	GC	3	6	2194321	2194326	0 %	0 %	50 %	50 %	291296519
48578	NC_013946	GCC	2	6	2194332	2194337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48579	NC_013946	CCAG	2	8	2194345	2194352	25 %	0 %	25 %	50 %	291296519
48580	NC_013946	CCT	2	6	2194369	2194374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296519
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48582	NC_013946	GC	3	6	2194469	2194474	0 %	0 %	50 %	50 %	291296519
48583	NC_013946	ACC	3	9	2194475	2194483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296519
48584	NC_013946	CCA	2	6	2194584	2194589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296519
48585	NC_013946	G	6	6	2194638	2194643	0 %	0 %	100 %	0 %	291296519
48586	NC_013946	CCA	2	6	2194644	2194649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296519
48587	NC_013946	AGG	2	6	2194693	2194698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296519
48588	NC_013946	G	6	6	2194761	2194766	0 %	0 %	100 %	0 %	291296519
48589	NC_013946	CGGCC	2	10	2194841	2194850	0 %	0 %	40 %	60 %	291296519
48590	NC_013946	CGG	2	6	2194854	2194859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296519
48591	NC_013946	GCC	2	6	2194862	2194867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48592	NC_013946	ACC	2	6	2194925	2194930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296519
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48594	NC_013946	GCCAGC	2	12	2195102	2195113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291296519
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48597	NC_013946	AGG	2	6	2195175	2195180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296519
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48600	NC_013946	TGC	2	6	2195208	2195213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296519
48601	NC_013946	CGG	2	6	2195218	2195223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296519
48602	NC_013946	ACC	2	6	2195243	2195248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296519
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48607	NC_013946	GGA	2	6	2195509	2195514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296519
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48609	NC_013946	TCA	2	6	2195553	2195558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296519
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48611	NC_013946	GCC	2	6	2195667	2195672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
48612	NC_013946	C	6	6	2195730	2195735	0 %	0 %	0 %	100 %	291296519
48613	NC_013946	CGC	2	6	2195745	2195750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296519
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48617	NC_013946	CGA	2	6	2195947	2195952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296519
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48736	NC_013946	CAG	2	6	2201366	2201371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296525
48737	NC_013946	GCA	2	6	2201377	2201382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296525
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48739	NC_013946	CCT	2	6	2201449	2201454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296525
48740	NC_013946	CGG	2	6	2201491	2201496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296525
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48742	NC_013946	CCCGG	2	10	2201593	2201602	0 %	0 %	40 %	60 %	291296525
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48853	NC_013946	CGG	2	6	2206696	2206701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296531
48854	NC_013946	G	6	6	2206706	2206711	0 %	0 %	100 %	0 %	291296531
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48887	NC_013946	GGCG	2	8	2208193	2208200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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48943	NC_013946	TGG	2	6	2211413	2211418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296538
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48950	NC_013946	GGCC	2	8	2211644	2211651	0 %	0 %	50 %	50 %	291296538
48951	NC_013946	GGT	2	6	2211714	2211719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296538
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48964	NC_013946	CCG	2	6	2212415	2212420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296538
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48967	NC_013946	GAG	2	6	2212564	2212569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296538
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