MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_013946	AAGA	2	8	2170210	2170217	75 %	0 %	25 %	0 %	291296496
48003	NC_013946	ACT	2	6	2170301	2170306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296496
48004	NC_013946	CAG	2	6	2170324	2170329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296496
48005	NC_013946	CGGG	2	8	2170331	2170338	0 %	0 %	75 %	25 %	291296496
48006	NC_013946	ACCA	2	8	2170372	2170379	50 %	0 %	0 %	50 %	291296496
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48011	NC_013946	TGC	2	6	2170665	2170670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296497
48012	NC_013946	TGC	2	6	2170683	2170688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296497
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48014	NC_013946	ATC	2	6	2170748	2170753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296497
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48022	NC_013946	CTGG	2	8	2170909	2170916	0 %	25 %	50 %	25 %	291296497
48023	NC_013946	GGGT	2	8	2170929	2170936	0 %	25 %	75 %	0 %	291296497
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48032	NC_013946	GGCC	2	8	2171265	2171272	0 %	0 %	50 %	50 %	291296497
48033	NC_013946	CTG	2	6	2171294	2171299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296497
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48036	NC_013946	GTG	2	6	2171359	2171364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48037	NC_013946	CTG	2	6	2171389	2171394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296498
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48117	NC_013946	GCC	2	6	2174312	2174317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296501
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48182	NC_013946	CAG	2	6	2176938	2176943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296502
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48186	NC_013946	TGA	2	6	2177054	2177059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296502
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48193	NC_013946	TCG	2	6	2177548	2177553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296502
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48196	NC_013946	CGT	2	6	2177654	2177659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296502
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48200	NC_013946	CAG	2	6	2177997	2178002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296502
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48202	NC_013946	GAT	2	6	2178087	2178092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296502
48203	NC_013946	GGTC	2	8	2178155	2178162	0 %	25 %	50 %	25 %	291296502
48204	NC_013946	CTC	2	6	2178177	2178182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296502
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48207	NC_013946	CAT	2	6	2178347	2178352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48208	NC_013946	GCT	2	6	2178411	2178416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48209	NC_013946	ATC	2	6	2178456	2178461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48212	NC_013946	GCTG	2	8	2178525	2178532	0 %	25 %	50 %	25 %	291296503
48213	NC_013946	GCC	2	6	2178537	2178542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296503
48214	NC_013946	GAG	2	6	2178638	2178643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296503
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48217	NC_013946	ACC	2	6	2178813	2178818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296503
48218	NC_013946	CGG	2	6	2178839	2178844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296503
48219	NC_013946	TGC	2	6	2178855	2178860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296503
48220	NC_013946	CGA	2	6	2178868	2178873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296503
48221	NC_013946	CG	3	6	2178904	2178909	0 %	0 %	50 %	50 %	291296503
48222	NC_013946	CAC	2	6	2178961	2178966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296503
48223	NC_013946	GCA	2	6	2179098	2179103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296503
48224	NC_013946	GAT	2	6	2179132	2179137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296503
48225	NC_013946	TGG	2	6	2179194	2179199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296503
48226	NC_013946	TGG	2	6	2179206	2179211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296503
48227	NC_013946	AGCTCG	2	12	2179233	2179244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291296503
48228	NC_013946	TGC	2	6	2179269	2179274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296503
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48230	NC_013946	C	6	6	2179371	2179376	0 %	0 %	0 %	100 %	291296503
48231	NC_013946	CGA	2	6	2179387	2179392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296503
48232	NC_013946	GCC	2	6	2179412	2179417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296503
48233	NC_013946	CGG	2	6	2179461	2179466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296503
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48235	NC_013946	CGG	2	6	2179561	2179566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296503
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48259	NC_013946	TCA	2	6	2180536	2180541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48322	NC_013946	C	6	6	2183543	2183548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48323	NC_013946	ATC	2	6	2183604	2183609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48340	NC_013946	AGG	2	6	2184396	2184401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296508
48341	NC_013946	GCG	2	6	2184402	2184407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296508
48342	NC_013946	TCG	2	6	2184459	2184464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296508
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48344	NC_013946	GCC	2	6	2184545	2184550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296508
48345	NC_013946	GAG	2	6	2184566	2184571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296508
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48466	NC_013946	GGT	2	6	2189696	2189701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296515
48467	NC_013946	GGCCC	2	10	2189723	2189732	0 %	0 %	40 %	60 %	291296515
48468	NC_013946	C	7	7	2189747	2189753	0 %	0 %	0 %	100 %	291296515
48469	NC_013946	CCT	2	6	2189761	2189766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296515
48470	NC_013946	GCACCA	2	12	2189770	2189781	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291296515
48471	NC_013946	G	6	6	2189808	2189813	0 %	0 %	100 %	0 %	291296515
48472	NC_013946	AAG	2	6	2189826	2189831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296515
48473	NC_013946	TCG	2	6	2189866	2189871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296515
48474	NC_013946	CTG	2	6	2189925	2189930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296515
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48476	NC_013946	GGTGC	2	10	2190072	2190081	0 %	20 %	60 %	20 %	291296515
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48481	NC_013946	GCC	2	6	2190279	2190284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296515
48482	NC_013946	CGC	2	6	2190309	2190314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296515
48483	NC_013946	GGT	2	6	2190395	2190400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296515
48484	NC_013946	GGT	2	6	2190440	2190445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296515
48485	NC_013946	GAG	2	6	2190513	2190518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296515
48486	NC_013946	CTG	2	6	2190531	2190536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296515
48487	NC_013946	GCG	2	6	2190741	2190746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48488	NC_013946	GCG	2	6	2190851	2190856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296516
48489	NC_013946	CCT	2	6	2190879	2190884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296516
48490	NC_013946	GCT	2	6	2190892	2190897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296516
48491	NC_013946	GGCCC	2	10	2190902	2190911	0 %	0 %	40 %	60 %	291296516
48492	NC_013946	CCGC	2	8	2190939	2190946	0 %	0 %	25 %	75 %	291296516
48493	NC_013946	TGG	2	6	2190975	2190980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296516
48494	NC_013946	GCG	2	6	2191049	2191054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296516
48495	NC_013946	TGG	2	6	2191074	2191079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296516
48496	NC_013946	GCT	2	6	2191081	2191086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296516
48497	NC_013946	CTG	2	6	2191121	2191126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296516
48498	NC_013946	GGT	2	6	2191163	2191168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296516
48499	NC_013946	GTG	2	6	2191169	2191174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296516
48500	NC_013946	GTT	2	6	2191240	2191245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296516

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