MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47005	NC_013946	GCG	2	6	2126214	2126219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296462
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47220	NC_013946	TGG	2	6	2135394	2135399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47221	NC_013946	TA	4	8	2135403	2135410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47222	NC_013946	CTA	2	6	2135430	2135435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47223	NC_013946	TG	3	6	2135441	2135446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47224	NC_013946	ATA	2	6	2135502	2135507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47225	NC_013946	AT	3	6	2135536	2135541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47226	NC_013946	ACC	2	6	2135809	2135814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296468
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47228	NC_013946	CTG	2	6	2135937	2135942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296468
47229	NC_013946	CGG	2	6	2135983	2135988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296468
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47231	NC_013946	G	6	6	2136122	2136127	0 %	0 %	100 %	0 %	291296468
47232	NC_013946	ATG	2	6	2136142	2136147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296468
47233	NC_013946	GCG	2	6	2136180	2136185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296468
47234	NC_013946	CTC	2	6	2136192	2136197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296468
47235	NC_013946	GGT	2	6	2136203	2136208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296468
47236	NC_013946	GCCC	2	8	2136304	2136311	0 %	0 %	25 %	75 %	291296468
47237	NC_013946	TCA	2	6	2136323	2136328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296468
47238	NC_013946	CGG	2	6	2136421	2136426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296468
47239	NC_013946	TCG	3	9	2136442	2136450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296468
47240	NC_013946	GCCA	2	8	2136476	2136483	25 %	0 %	25 %	50 %	291296468
47241	NC_013946	CAG	2	6	2136519	2136524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296468
47242	NC_013946	GTT	2	6	2136573	2136578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296468
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47247	NC_013946	ACC	2	6	2136733	2136738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296468
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47254	NC_013946	G	7	7	2136958	2136964	0 %	0 %	100 %	0 %	291296468
47255	NC_013946	GCT	2	6	2137265	2137270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296469
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47258	NC_013946	CCCA	2	8	2137313	2137320	25 %	0 %	0 %	75 %	291296469
47259	NC_013946	GAC	2	6	2137422	2137427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296469
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47261	NC_013946	CG	3	6	2137441	2137446	0 %	0 %	50 %	50 %	291296469
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47263	NC_013946	TCA	2	6	2137552	2137557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296469
47264	NC_013946	GCG	3	9	2137580	2137588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296469
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47266	NC_013946	CAT	2	6	2137730	2137735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296469
47267	NC_013946	GGCG	2	8	2137847	2137854	0 %	0 %	75 %	25 %	291296469
47268	NC_013946	GTTGTA	2	12	2137972	2137983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47273	NC_013946	TTCA	2	8	2138348	2138355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47274	NC_013946	T	6	6	2138378	2138383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47275	NC_013946	T	6	6	2138393	2138398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47276	NC_013946	GCAA	2	8	2138456	2138463	50 %	0 %	25 %	25 %	291296471
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47278	NC_013946	GA	3	6	2138727	2138732	50 %	0 %	50 %	0 %	291296471
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47283	NC_013946	GCA	2	6	2138946	2138951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47298	NC_013946	GCGG	2	8	2139735	2139742	0 %	0 %	75 %	25 %	291296472
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47305	NC_013946	GGCCTG	2	12	2140162	2140173	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291296472
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47312	NC_013946	CAG	2	6	2140438	2140443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296472
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47327	NC_013946	TCC	2	6	2141255	2141260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47328	NC_013946	AGG	2	6	2141283	2141288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47329	NC_013946	CAGCGG	2	12	2141324	2141335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291296474
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47339	NC_013946	TGG	3	9	2141662	2141670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296474
47340	NC_013946	TCC	2	6	2141740	2141745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296474
47341	NC_013946	TGC	2	6	2141797	2141802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296474
47342	NC_013946	GCC	2	6	2141830	2141835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296474
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47344	NC_013946	CTG	2	6	2141928	2141933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296474
47345	NC_013946	GCG	2	6	2141950	2141955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296474
47346	NC_013946	GGA	2	6	2141960	2141965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296474
47347	NC_013946	TGC	2	6	2142061	2142066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296474
47348	NC_013946	CCCTC	2	10	2142085	2142094	0 %	20 %	0 %	80 %	291296474
47349	NC_013946	CAGCC	2	10	2142119	2142128	20 %	0 %	20 %	60 %	291296474
47350	NC_013946	GAG	2	6	2142291	2142296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296474
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47352	NC_013946	CGA	2	6	2142443	2142448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296474
47353	NC_013946	CTG	2	6	2142477	2142482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296474
47354	NC_013946	ATC	2	6	2142603	2142608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296474
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47465	NC_013946	CG	3	6	2147445	2147450	0 %	0 %	50 %	50 %	291296478
47466	NC_013946	CCTC	2	8	2147500	2147507	0 %	25 %	0 %	75 %	291296478
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47472	NC_013946	CCG	2	6	2147744	2147749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296478
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47474	NC_013946	GGT	2	6	2147777	2147782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296478
47475	NC_013946	TGG	2	6	2147803	2147808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296478
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47490	NC_013946	ACC	2	6	2148321	2148326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47491	NC_013946	ATG	2	6	2148341	2148346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296479
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47498	NC_013946	TGC	2	6	2148753	2148758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296479
47499	NC_013946	ACC	2	6	2148785	2148790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296479
47500	NC_013946	TGG	2	6	2148885	2148890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296479

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