MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_013946	A	6	6	2260001	2260006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50002	NC_013946	ACT	2	6	2260022	2260027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50003	NC_013946	CTGGG	2	10	2260119	2260128	0 %	20 %	60 %	20 %	291296583
50004	NC_013946	GGCCT	2	10	2260131	2260140	0 %	20 %	40 %	40 %	291296583
50005	NC_013946	GCCCC	2	10	2260147	2260156	0 %	0 %	20 %	80 %	291296583
50006	NC_013946	AGC	2	6	2260165	2260170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50007	NC_013946	CGG	2	6	2260202	2260207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296583
50008	NC_013946	G	6	6	2260206	2260211	0 %	0 %	100 %	0 %	291296583
50009	NC_013946	GCCT	2	8	2260254	2260261	0 %	25 %	25 %	50 %	291296583
50010	NC_013946	CAG	2	6	2260308	2260313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50011	NC_013946	GCG	2	6	2260315	2260320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296583
50012	NC_013946	CAG	2	6	2260332	2260337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50013	NC_013946	C	6	6	2260351	2260356	0 %	0 %	0 %	100 %	291296583
50014	NC_013946	AGGC	2	8	2260375	2260382	25 %	0 %	50 %	25 %	291296583
50015	NC_013946	TGC	2	6	2260399	2260404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50016	NC_013946	CAC	2	6	2260424	2260429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296583
50017	NC_013946	GCG	2	6	2260438	2260443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296583
50018	NC_013946	GCG	2	6	2260489	2260494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296583
50019	NC_013946	GAA	2	6	2260506	2260511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296583
50020	NC_013946	GGA	2	6	2260583	2260588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296583
50021	NC_013946	CAG	2	6	2260709	2260714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50022	NC_013946	GCAG	2	8	2260788	2260795	25 %	0 %	50 %	25 %	291296583
50023	NC_013946	GCTCGA	2	12	2260805	2260816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50024	NC_013946	CGGCC	2	10	2260829	2260838	0 %	0 %	40 %	60 %	291296583
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50026	NC_013946	GCTTT	2	10	2260897	2260906	0 %	60 %	20 %	20 %	291296583
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50028	NC_013946	AGGA	2	8	2261050	2261057	50 %	0 %	50 %	0 %	291296583
50029	NC_013946	CAG	2	6	2261112	2261117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296583
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50031	NC_013946	CAGACC	2	12	2261310	2261321	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291296583
50032	NC_013946	CTG	2	6	2261378	2261383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50033	NC_013946	TG	3	6	2261388	2261393	0 %	50 %	50 %	0 %	291296583
50034	NC_013946	CGA	2	6	2261417	2261422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296583
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50036	NC_013946	CGA	2	6	2261618	2261623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296583
50037	NC_013946	CCT	2	6	2261755	2261760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296584
50038	NC_013946	CCG	2	6	2261784	2261789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296584
50039	NC_013946	CAG	2	6	2261794	2261799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296584
50040	NC_013946	TGGC	2	8	2261810	2261817	0 %	25 %	50 %	25 %	291296584
50041	NC_013946	CGGCC	2	10	2261952	2261961	0 %	0 %	40 %	60 %	291296584
50042	NC_013946	T	6	6	2261962	2261967	0 %	100 %	0 %	0 %	291296584
50043	NC_013946	G	6	6	2261971	2261976	0 %	0 %	100 %	0 %	291296584
50044	NC_013946	GTGG	2	8	2262013	2262020	0 %	25 %	75 %	0 %	291296584
50045	NC_013946	C	6	6	2262081	2262086	0 %	0 %	0 %	100 %	291296584
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50047	NC_013946	CCGC	2	8	2262228	2262235	0 %	0 %	25 %	75 %	291296584
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50050	NC_013946	GGTGCC	2	12	2262454	2262465	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291296584
50051	NC_013946	GTG	2	6	2262475	2262480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296584
50052	NC_013946	CACCC	2	10	2262502	2262511	20 %	0 %	0 %	80 %	291296584
50053	NC_013946	CGC	2	6	2262544	2262549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296584
50054	NC_013946	GCCCTG	2	12	2262554	2262565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291296584
50055	NC_013946	TGGTGC	2	12	2262576	2262587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291296584
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50060	NC_013946	G	6	6	2262735	2262740	0 %	0 %	100 %	0 %	291296584
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50064	NC_013946	CGC	2	6	2262963	2262968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296585
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50070	NC_013946	TGG	2	6	2263154	2263159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296585
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50089	NC_013946	GCC	2	6	2263855	2263860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296585
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50101	NC_013946	AAAG	2	8	2264447	2264454	75 %	0 %	25 %	0 %	291296586
50102	NC_013946	CCG	2	6	2264527	2264532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296586
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50109	NC_013946	AAGA	2	8	2264916	2264923	75 %	0 %	25 %	0 %	291296586
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50117	NC_013946	CTT	2	6	2265209	2265214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296586
50118	NC_013946	GCG	2	6	2265244	2265249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296586
50119	NC_013946	C	7	7	2265334	2265340	0 %	0 %	0 %	100 %	291296586
50120	NC_013946	CACC	2	8	2265365	2265372	25 %	0 %	0 %	75 %	291296586
50121	NC_013946	CTG	2	6	2265408	2265413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296586
50122	NC_013946	TGG	2	6	2265448	2265453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296586
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50124	NC_013946	CGA	2	6	2265572	2265577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296586
50125	NC_013946	TGC	2	6	2265592	2265597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296586
50126	NC_013946	ACT	2	6	2265607	2265612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296586
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50129	NC_013946	TCA	2	6	2265913	2265918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296586
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50147	NC_013946	GCC	2	6	2266650	2266655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296588
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50168	NC_013946	TGGG	2	8	2267938	2267945	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50169	NC_013946	GGC	2	6	2268053	2268058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50173	NC_013946	TGG	2	6	2268327	2268332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296590
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50223	NC_013946	TGGGG	2	10	2270472	2270481	0 %	20 %	80 %	0 %	291296592
50224	NC_013946	G	6	6	2270478	2270483	0 %	0 %	100 %	0 %	291296592
50225	NC_013946	ACGG	2	8	2270493	2270500	25 %	0 %	50 %	25 %	291296592
50226	NC_013946	CCA	2	6	2270554	2270559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296592
50227	NC_013946	C	6	6	2270634	2270639	0 %	0 %	0 %	100 %	291296592
50228	NC_013946	CT	3	6	2270687	2270692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50229	NC_013946	GAC	2	6	2270732	2270737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296593
50230	NC_013946	ATC	2	6	2270757	2270762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296593
50231	NC_013946	AGGCCG	2	12	2270781	2270792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291296593
50232	NC_013946	AGG	2	6	2270793	2270798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296593
50233	NC_013946	TGG	2	6	2270802	2270807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296593
50234	NC_013946	CCG	2	6	2270826	2270831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296593
50235	NC_013946	CGA	2	6	2270872	2270877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296593
50236	NC_013946	A	6	6	2270943	2270948	100 %	0 %	0 %	0 %	291296594
50237	NC_013946	C	6	6	2270972	2270977	0 %	0 %	0 %	100 %	291296594
50238	NC_013946	ACC	2	6	2271047	2271052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296594
50239	NC_013946	TGG	2	6	2271066	2271071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296594
50240	NC_013946	GC	3	6	2271140	2271145	0 %	0 %	50 %	50 %	291296594
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50242	NC_013946	G	6	6	2271217	2271222	0 %	0 %	100 %	0 %	291296594
50243	NC_013946	G	7	7	2271279	2271285	0 %	0 %	100 %	0 %	291296594
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50248	NC_013946	CCCATG	2	12	2271568	2271579	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291296595
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50265	NC_013946	CCACC	2	10	2272814	2272823	20 %	0 %	0 %	80 %	291296596
50266	NC_013946	AG	3	6	2272951	2272956	50 %	0 %	50 %	0 %	291296596
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50268	NC_013946	A	6	6	2272997	2273002	100 %	0 %	0 %	0 %	291296596
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50271	NC_013946	GCAA	2	8	2273078	2273085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50272	NC_013946	GGT	2	6	2273319	2273324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296597
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50344	NC_013946	CAA	2	6	2276901	2276906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296599
50345	NC_013946	CCCA	2	8	2276907	2276914	25 %	0 %	0 %	75 %	291296599
50346	NC_013946	GTA	2	6	2276979	2276984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296600
50347	NC_013946	TCA	2	6	2277002	2277007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296600
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50349	NC_013946	GTT	2	6	2277066	2277071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296600
50350	NC_013946	CAC	3	9	2277201	2277209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296600
50351	NC_013946	TCC	2	6	2277226	2277231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296600
50352	NC_013946	CGCC	2	8	2277369	2277376	0 %	0 %	25 %	75 %	291296601
50353	NC_013946	CAT	2	6	2277451	2277456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296601
50354	NC_013946	G	6	6	2277492	2277497	0 %	0 %	100 %	0 %	291296601
50355	NC_013946	CTT	2	6	2277516	2277521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296601
50356	NC_013946	CGG	2	6	2277546	2277551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296601
50357	NC_013946	GGGCTT	2	12	2277556	2277567	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291296601
50358	NC_013946	TTGGGC	2	12	2277581	2277592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291296601
50359	NC_013946	CCA	2	6	2277696	2277701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296601
50360	NC_013946	TTG	2	6	2277737	2277742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296601
50361	NC_013946	GCA	2	6	2277765	2277770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296601
50362	NC_013946	CAG	2	6	2277850	2277855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296601
50363	NC_013946	AGGCCC	2	12	2277890	2277901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291296601
50364	NC_013946	GAT	2	6	2277922	2277927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296601
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50379	NC_013946	ACC	2	6	2278806	2278811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296602
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50382	NC_013946	CCA	3	9	2279015	2279023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296603
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50384	NC_013946	CCA	2	6	2279057	2279062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296603
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50386	NC_013946	C	6	6	2279107	2279112	0 %	0 %	0 %	100 %	291296603
50387	NC_013946	CTGC	2	8	2279179	2279186	0 %	25 %	25 %	50 %	291296603
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50389	NC_013946	CAATC	2	10	2279267	2279276	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50390	NC_013946	CAG	2	6	2279373	2279378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50391	NC_013946	GC	3	6	2279388	2279393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50392	NC_013946	GCC	2	6	2279412	2279417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50393	NC_013946	CT	3	6	2279444	2279449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50394	NC_013946	CGG	2	6	2279491	2279496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50399	NC_013946	CGGG	3	12	2279758	2279769	0 %	0 %	75 %	25 %	291296604
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50407	NC_013946	TCG	2	6	2280180	2280185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296605
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50414	NC_013946	CAAAGG	2	12	2280542	2280553	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	291296605
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50430	NC_013946	CCCA	2	8	2281512	2281519	25 %	0 %	0 %	75 %	291296606
50431	NC_013946	AGC	2	6	2281606	2281611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50432	NC_013946	CCGCC	2	10	2281680	2281689	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
50433	NC_013946	T	6	6	2281728	2281733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50434	NC_013946	TTC	2	6	2281746	2281751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50435	NC_013946	GCAACC	2	12	2281801	2281812	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291296607
50436	NC_013946	CACC	2	8	2281821	2281828	25 %	0 %	0 %	75 %	291296607
50437	NC_013946	CAA	2	6	2281890	2281895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296607
50438	NC_013946	CGC	2	6	2281914	2281919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296607
50439	NC_013946	ACCC	2	8	2281926	2281933	25 %	0 %	0 %	75 %	291296607
50440	NC_013946	A	6	6	2281945	2281950	100 %	0 %	0 %	0 %	291296607
50441	NC_013946	GCC	2	6	2281960	2281965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296607
50442	NC_013946	GCT	2	6	2281968	2281973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296607
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50449	NC_013946	CGC	2	6	2282302	2282307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296607
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50451	NC_013946	CGGCC	2	10	2282370	2282379	0 %	0 %	40 %	60 %	291296607
50452	NC_013946	TGCA	2	8	2282449	2282456	25 %	25 %	25 %	25 %	291296607
50453	NC_013946	TCA	2	6	2282471	2282476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296607
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50455	NC_013946	TGA	2	6	2282636	2282641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296607
50456	NC_013946	AAG	2	6	2282642	2282647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296607
50457	NC_013946	GCCCC	2	10	2282865	2282874	0 %	0 %	20 %	80 %	291296608
50458	NC_013946	GGC	2	6	2282878	2282883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296608
50459	NC_013946	CTGGA	2	10	2282894	2282903	20 %	20 %	40 %	20 %	291296608
50460	NC_013946	GCCA	2	8	2282960	2282967	25 %	0 %	25 %	50 %	291296608
50461	NC_013946	CAC	2	6	2282977	2282982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296608
50462	NC_013946	CAA	2	6	2282995	2283000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296608
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50464	NC_013946	GCC	2	6	2283059	2283064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296608
50465	NC_013946	CGCC	2	8	2283151	2283158	0 %	0 %	25 %	75 %	291296608
50466	NC_013946	TGATAT	2	12	2283211	2283222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291296608
50467	NC_013946	TGG	2	6	2283228	2283233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296608
50468	NC_013946	CTA	2	6	2283244	2283249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296608
50469	NC_013946	GTG	2	6	2283308	2283313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296608
50470	NC_013946	ATC	2	6	2283320	2283325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296608
50471	NC_013946	CTG	2	6	2283341	2283346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296608
50472	NC_013946	GGT	2	6	2283391	2283396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296608
50473	NC_013946	CCG	2	6	2283405	2283410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296608
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50475	NC_013946	CAG	2	6	2283452	2283457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296608
50476	NC_013946	GCC	2	6	2283466	2283471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296608
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50479	NC_013946	GCC	2	6	2283573	2283578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296608
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50481	NC_013946	GTG	2	6	2283689	2283694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296608
50482	NC_013946	CTG	2	6	2283724	2283729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296608
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50485	NC_013946	CAT	2	6	2283850	2283855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296608
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50499	NC_013946	G	6	6	2284249	2284254	0 %	0 %	100 %	0 %	291296608
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