MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_013946	T	6	6	2237758	2237763	0 %	100 %	0 %	0 %	291296560
49502	NC_013946	AGGC	2	8	2237853	2237860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49503	NC_013946	CCG	2	6	2237861	2237866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49504	NC_013946	GAT	2	6	2237905	2237910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296561
49505	NC_013946	CCA	2	6	2237916	2237921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296561
49506	NC_013946	CCA	2	6	2237937	2237942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296561
49507	NC_013946	CAG	2	6	2237947	2237952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296561
49508	NC_013946	CCAG	2	8	2237967	2237974	25 %	0 %	25 %	50 %	291296561
49509	NC_013946	CAGGT	2	10	2238062	2238071	20 %	20 %	40 %	20 %	291296561
49510	NC_013946	GCC	2	6	2238079	2238084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296561
49511	NC_013946	GCA	2	6	2238087	2238092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296561
49512	NC_013946	GCG	2	6	2238123	2238128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296561
49513	NC_013946	GCC	2	6	2238131	2238136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296561
49514	NC_013946	AGA	2	6	2238162	2238167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296561
49515	NC_013946	CAG	2	6	2238169	2238174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296561
49516	NC_013946	A	6	6	2238410	2238415	100 %	0 %	0 %	0 %	291296561
49517	NC_013946	AGG	2	6	2238455	2238460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296561
49518	NC_013946	GCC	2	6	2238461	2238466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296561
49519	NC_013946	GGCC	2	8	2238547	2238554	0 %	0 %	50 %	50 %	291296561
49520	NC_013946	CGC	2	6	2238560	2238565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296561
49521	NC_013946	CAG	2	6	2238586	2238591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296561
49522	NC_013946	GCA	2	6	2238630	2238635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296561
49523	NC_013946	AGGTG	2	10	2238636	2238645	20 %	20 %	60 %	0 %	291296561
49524	NC_013946	GCCC	2	8	2238667	2238674	0 %	0 %	25 %	75 %	291296561
49525	NC_013946	CAA	2	6	2238744	2238749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296561
49526	NC_013946	CTC	2	6	2238754	2238759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49527	NC_013946	CGC	2	6	2238776	2238781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49528	NC_013946	GGA	2	6	2238783	2238788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49529	NC_013946	AGC	2	6	2238811	2238816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49530	NC_013946	GCTC	2	8	2238885	2238892	0 %	25 %	25 %	50 %	291296562
49531	NC_013946	T	6	6	2238920	2238925	0 %	100 %	0 %	0 %	291296562
49532	NC_013946	TTC	2	6	2238988	2238993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296562
49533	NC_013946	T	7	7	2239007	2239013	0 %	100 %	0 %	0 %	291296562
49534	NC_013946	GGA	2	6	2239040	2239045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296562
49535	NC_013946	GGT	2	6	2239061	2239066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296562
49536	NC_013946	TGC	2	6	2239102	2239107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296562
49537	NC_013946	TCA	2	6	2239151	2239156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296562
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49539	NC_013946	TTA	2	6	2239198	2239203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291296562
49540	NC_013946	GCA	2	6	2239225	2239230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296562
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49544	NC_013946	CAG	2	6	2239388	2239393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296563
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49549	NC_013946	G	7	7	2239779	2239785	0 %	0 %	100 %	0 %	291296564
49550	NC_013946	GTT	2	6	2239803	2239808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296564
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49552	NC_013946	GCC	2	6	2239907	2239912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296564
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49555	NC_013946	GGTG	2	8	2239970	2239977	0 %	25 %	75 %	0 %	291296564
49556	NC_013946	TCGGGG	2	12	2240050	2240061	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	291296564
49557	NC_013946	CCA	2	6	2240090	2240095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296564
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49559	NC_013946	TGG	2	6	2240155	2240160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296564
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49562	NC_013946	TGGT	2	8	2240263	2240270	0 %	50 %	50 %	0 %	291296564
49563	NC_013946	CTCCAG	2	12	2240283	2240294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291296564
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49567	NC_013946	GGC	2	6	2240484	2240489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49568	NC_013946	GCC	2	6	2240503	2240508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49569	NC_013946	CCA	2	6	2240509	2240514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49570	NC_013946	AG	3	6	2240520	2240525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49571	NC_013946	GCCT	3	12	2240546	2240557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49572	NC_013946	AGC	2	6	2240596	2240601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49575	NC_013946	T	6	6	2240751	2240756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49577	NC_013946	CG	3	6	2240799	2240804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49578	NC_013946	GCC	2	6	2240818	2240823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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49584	NC_013946	CCG	2	6	2241020	2241025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296565
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49593	NC_013946	CCA	2	6	2241392	2241397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296565
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49602	NC_013946	G	6	6	2241944	2241949	0 %	0 %	100 %	0 %	291296565
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49606	NC_013946	CGC	2	6	2242057	2242062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296565
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49610	NC_013946	ACT	2	6	2242258	2242263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49613	NC_013946	GGC	2	6	2242340	2242345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296566
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49615	NC_013946	GCC	2	6	2242488	2242493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296566
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50000	NC_013946	GCG	2	6	2259898	2259903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296582

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