MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 plasmid pFS01

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013888	TA	3	6	931	936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013888	TG	3	6	966	971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013888	TA	3	6	1398	1403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013888	AG	3	6	1478	1483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013888	AT	3	6	1607	1612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013888	TA	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013888	TA	3	6	1991	1996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013888	TC	3	6	2471	2476	0 %	50 %	0 %	50 %	289193303
9	NC_013888	AT	3	6	2550	2555	50 %	50 %	0 %	0 %	289193303
10	NC_013888	TA	3	6	3336	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	289193304
11	NC_013888	AC	3	6	4143	4148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013888	AT	3	6	4321	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013888	AT	3	6	4508	4513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013888	AT	3	6	4524	4529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013888	AG	3	6	4647	4652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013888	TA	4	8	4653	4660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013888	TA	3	6	4823	4828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013888	TA	3	6	5049	5054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013888	AT	4	8	5238	5245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013888	TA	4	8	5336	5343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013888	TA	3	6	5497	5502	50 %	50 %	0 %	0 %	289193305
22	NC_013888	AT	3	6	5728	5733	50 %	50 %	0 %	0 %	289193306
23	NC_013888	TG	3	6	6305	6310	0 %	50 %	50 %	0 %	289193306
24	NC_013888	TA	3	6	6607	6612	50 %	50 %	0 %	0 %	289193306
25	NC_013888	AG	3	6	6620	6625	50 %	0 %	50 %	0 %	289193306
26	NC_013888	AT	3	6	8095	8100	50 %	50 %	0 %	0 %	289193307
27	NC_013888	GA	4	8	8182	8189	50 %	0 %	50 %	0 %	289193307
28	NC_013888	AT	3	6	9437	9442	50 %	50 %	0 %	0 %	289193310
29	NC_013888	TA	3	6	9712	9717	50 %	50 %	0 %	0 %	289193311
30	NC_013888	AG	3	6	9876	9881	50 %	0 %	50 %	0 %	289193312
31	NC_013888	AG	3	6	9975	9980	50 %	0 %	50 %	0 %	289193312
32	NC_013888	TG	3	6	11889	11894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013888	AG	3	6	12146	12151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.