MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 1709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013887	AATTT	2	10	750	759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013887	ATAAA	2	10	785	794	80 %	20 %	0 %	0 %	289191498
3	NC_013887	AGAAA	2	10	896	905	80 %	0 %	20 %	0 %	289191498
4	NC_013887	AGGAC	2	10	4072	4081	40 %	0 %	40 %	20 %	289191501
5	NC_013887	ATTTT	2	10	6216	6225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013887	CATTT	2	10	6341	6350	20 %	60 %	0 %	20 %	289191503
7	NC_013887	ACATT	2	10	7132	7141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013887	TATAT	2	10	10080	10089	40 %	60 %	0 %	0 %	289191507
9	NC_013887	GAAAA	2	10	11515	11524	80 %	0 %	20 %	0 %	289191508
10	NC_013887	TTGTG	2	10	11894	11903	0 %	60 %	40 %	0 %	289191509
11	NC_013887	TCTCT	2	10	12014	12023	0 %	60 %	0 %	40 %	289191509
12	NC_013887	ACTTA	2	10	12183	12192	40 %	40 %	0 %	20 %	289191509
13	NC_013887	CATCC	2	10	12452	12461	20 %	20 %	0 %	60 %	289191509
14	NC_013887	TAGCA	2	10	15246	15255	40 %	20 %	20 %	20 %	289191513
15	NC_013887	ATTTT	2	10	16619	16628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013887	TTATT	2	10	16629	16638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013887	TAATA	2	10	17888	17897	60 %	40 %	0 %	0 %	289191516
18	NC_013887	ATTGG	2	10	17993	18002	20 %	40 %	40 %	0 %	289191516
19	NC_013887	ATTTT	2	10	19639	19648	20 %	80 %	0 %	0 %	289191519
20	NC_013887	TATAT	2	10	20267	20276	40 %	60 %	0 %	0 %	289191520
21	NC_013887	CTCTT	2	10	21268	21277	0 %	60 %	0 %	40 %	289191520
22	NC_013887	AAAAT	2	10	23053	23062	80 %	20 %	0 %	0 %	289191522
23	NC_013887	ATATT	2	10	26218	26227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013887	GTGAG	2	10	26339	26348	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013887	AGGAG	2	10	26573	26582	40 %	0 %	60 %	0 %	289191527
26	NC_013887	AATTA	2	10	28012	28021	60 %	40 %	0 %	0 %	289191529
27	NC_013887	ATAAA	2	10	31398	31407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013887	TCTTT	2	10	32208	32217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013887	TAACT	2	10	32293	32302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013887	TAAAT	2	10	33635	33644	60 %	40 %	0 %	0 %	289191537
31	NC_013887	TTTCA	2	10	34832	34841	20 %	60 %	0 %	20 %	289191538
32	NC_013887	AATTT	2	10	35572	35581	40 %	60 %	0 %	0 %	289191538
33	NC_013887	CAATC	2	10	35956	35965	40 %	20 %	0 %	40 %	289191538
34	NC_013887	AATTA	2	10	36011	36020	60 %	40 %	0 %	0 %	289191538
35	NC_013887	TTTGG	2	10	37770	37779	0 %	60 %	40 %	0 %	289191540
36	NC_013887	AGTTA	2	10	37807	37816	40 %	40 %	20 %	0 %	289191540
37	NC_013887	ACTTA	2	10	38230	38239	40 %	40 %	0 %	20 %	289191541
38	NC_013887	TTTAA	2	10	38330	38339	40 %	60 %	0 %	0 %	289191541
39	NC_013887	CCACA	2	10	38729	38738	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_013887	ACTAT	2	10	39290	39299	40 %	40 %	0 %	20 %	289191543
41	NC_013887	GTTAA	2	10	39314	39323	40 %	40 %	20 %	0 %	289191543
42	NC_013887	TTAAA	2	10	39678	39687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013887	TAGGG	2	10	40537	40546	20 %	20 %	60 %	0 %	289191544
44	NC_013887	ATTTA	2	10	40647	40656	40 %	60 %	0 %	0 %	289191544
45	NC_013887	GTTGA	2	10	41009	41018	20 %	40 %	40 %	0 %	289191544
46	NC_013887	AGAAT	2	10	42264	42273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013887	TATTT	2	10	49079	49088	20 %	80 %	0 %	0 %	289191551
48	NC_013887	TTATT	2	10	51195	51204	20 %	80 %	0 %	0 %	289191553
49	NC_013887	AATCC	2	10	53353	53362	40 %	20 %	0 %	40 %	289191555
50	NC_013887	AATTT	2	10	53557	53566	40 %	60 %	0 %	0 %	289191555
51	NC_013887	TAATT	2	10	53873	53882	40 %	60 %	0 %	0 %	289191556
52	NC_013887	TTATC	2	10	54215	54224	20 %	60 %	0 %	20 %	289191557
53	NC_013887	ATATA	2	10	54503	54512	60 %	40 %	0 %	0 %	289191558
54	NC_013887	CTATG	2	10	54519	54528	20 %	40 %	20 %	20 %	289191558
55	NC_013887	CATTT	2	10	56981	56990	20 %	60 %	0 %	20 %	289191561
56	NC_013887	ATTTT	2	10	57730	57739	20 %	80 %	0 %	0 %	289191561
57	NC_013887	ATTTA	2	10	58651	58660	40 %	60 %	0 %	0 %	289191563
58	NC_013887	GATTT	2	10	59477	59486	20 %	60 %	20 %	0 %	289191563
59	NC_013887	TTTTA	2	10	59788	59797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013887	ATTTT	2	10	59827	59836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013887	TTCTC	2	10	61128	61137	0 %	60 %	0 %	40 %	289191564
62	NC_013887	GATTG	2	10	62936	62945	20 %	40 %	40 %	0 %	289191566
63	NC_013887	AACTT	2	10	63725	63734	40 %	40 %	0 %	20 %	289191567
64	NC_013887	CCAAT	2	10	64959	64968	40 %	20 %	0 %	40 %	289191567
65	NC_013887	ATATT	2	10	65324	65333	40 %	60 %	0 %	0 %	289191568
66	NC_013887	TTTTA	2	10	66426	66435	20 %	80 %	0 %	0 %	289191569
67	NC_013887	TATTT	2	10	68035	68044	20 %	80 %	0 %	0 %	289191570
68	NC_013887	TGGAT	2	10	68481	68490	20 %	40 %	40 %	0 %	289191571
69	NC_013887	CTCTT	2	10	69252	69261	0 %	60 %	0 %	40 %	289191573
70	NC_013887	GCTTG	2	10	71125	71134	0 %	40 %	40 %	20 %	289191577
71	NC_013887	AATCC	2	10	71776	71785	40 %	20 %	0 %	40 %	289191578
72	NC_013887	TAACC	2	10	72243	72252	40 %	20 %	0 %	40 %	289191579
73	NC_013887	GGCTA	2	10	74560	74569	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013887	GGATG	2	10	76334	76343	20 %	20 %	60 %	0 %	289191586
75	NC_013887	TGTTT	2	10	77868	77877	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013887	TAAAT	2	10	81268	81277	60 %	40 %	0 %	0 %	289191592
77	NC_013887	TTGTG	2	10	83359	83368	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013887	GAAAT	2	10	84001	84010	60 %	20 %	20 %	0 %	289191595
79	NC_013887	TTTTA	2	10	84092	84101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013887	AGATA	2	10	86101	86110	60 %	20 %	20 %	0 %	289191597
81	NC_013887	ACCTT	2	10	87284	87293	20 %	40 %	0 %	40 %	289191598
82	NC_013887	ATTGT	2	10	89025	89034	20 %	60 %	20 %	0 %	289191601
83	NC_013887	ATAAA	2	10	91200	91209	80 %	20 %	0 %	0 %	289191604
84	NC_013887	AAGAG	2	10	91729	91738	60 %	0 %	40 %	0 %	289191604
85	NC_013887	GATAA	2	10	92030	92039	60 %	20 %	20 %	0 %	289191604
86	NC_013887	ATTAT	2	10	92172	92181	40 %	60 %	0 %	0 %	289191605
87	NC_013887	ATTTG	2	10	92298	92307	20 %	60 %	20 %	0 %	289191605
88	NC_013887	ATTTT	2	10	92893	92902	20 %	80 %	0 %	0 %	289191606
89	NC_013887	ATAAA	2	10	94639	94648	80 %	20 %	0 %	0 %	289191607
90	NC_013887	AGAGC	2	10	96127	96136	40 %	0 %	40 %	20 %	289191608
91	NC_013887	GGATG	2	10	96395	96404	20 %	20 %	60 %	0 %	289191609
92	NC_013887	TTGGA	2	10	97012	97021	20 %	40 %	40 %	0 %	289191609
93	NC_013887	TTAGA	2	10	97129	97138	40 %	40 %	20 %	0 %	289191609
94	NC_013887	CAATG	2	10	97226	97235	40 %	20 %	20 %	20 %	289191609
95	NC_013887	ATAAA	2	10	97396	97405	80 %	20 %	0 %	0 %	289191609
96	NC_013887	ATTTT	2	10	97984	97993	20 %	80 %	0 %	0 %	289191610
97	NC_013887	TATTT	2	10	98698	98707	20 %	80 %	0 %	0 %	289191610
98	NC_013887	CCCTC	2	10	100873	100882	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_013887	GGCTC	2	10	101548	101557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013887	TTTTA	2	10	104618	104627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013887	TTATC	2	10	107140	107149	20 %	60 %	0 %	20 %	289191615
102	NC_013887	GAATG	2	10	107159	107168	40 %	20 %	40 %	0 %	289191615
103	NC_013887	AGGAG	2	10	113396	113405	40 %	0 %	60 %	0 %	289191620
104	NC_013887	TAAAA	2	10	114782	114791	80 %	20 %	0 %	0 %	289191621
105	NC_013887	ATAAA	2	10	114829	114838	80 %	20 %	0 %	0 %	289191621
106	NC_013887	TAAAT	2	10	115423	115432	60 %	40 %	0 %	0 %	289191622
107	NC_013887	ATTAC	2	10	118251	118260	40 %	40 %	0 %	20 %	289191626
108	NC_013887	TAGAG	2	10	120965	120974	40 %	20 %	40 %	0 %	289191627
109	NC_013887	AGAGA	2	10	121293	121302	60 %	0 %	40 %	0 %	289191627
110	NC_013887	AAAAT	2	10	121471	121480	80 %	20 %	0 %	0 %	289191627
111	NC_013887	AGAAA	2	10	122346	122355	80 %	0 %	20 %	0 %	289191627
112	NC_013887	ATTTA	2	10	124731	124740	40 %	60 %	0 %	0 %	289191630
113	NC_013887	GAAGA	2	10	125015	125024	60 %	0 %	40 %	0 %	289191630
114	NC_013887	ATACT	2	10	125475	125484	40 %	40 %	0 %	20 %	289191630
115	NC_013887	TACTA	2	10	126178	126187	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013887	GCAGA	2	10	126317	126326	40 %	0 %	40 %	20 %	289191632
117	NC_013887	TTCTT	2	10	128454	128463	0 %	80 %	0 %	20 %	289191634
118	NC_013887	TAAAT	2	10	130692	130701	60 %	40 %	0 %	0 %	289191637
119	NC_013887	TTTTA	2	10	133016	133025	20 %	80 %	0 %	0 %	289191640
120	NC_013887	AGCGA	2	10	133420	133429	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013887	GTCTT	2	10	134487	134496	0 %	60 %	20 %	20 %	289191641
122	NC_013887	GAAGG	2	10	135768	135777	40 %	0 %	60 %	0 %	289191642
123	NC_013887	TGATA	2	10	136457	136466	40 %	40 %	20 %	0 %	289191643
124	NC_013887	AATAT	2	10	137140	137149	60 %	40 %	0 %	0 %	289191644
125	NC_013887	CAAAA	2	10	137651	137660	80 %	0 %	0 %	20 %	289191645
126	NC_013887	ATATT	2	10	138007	138016	40 %	60 %	0 %	0 %	289191645
127	NC_013887	TCAAC	2	10	139795	139804	40 %	20 %	0 %	40 %	289191646
128	NC_013887	CATTG	2	10	140165	140174	20 %	40 %	20 %	20 %	289191647
129	NC_013887	ACTTT	2	10	141817	141826	20 %	60 %	0 %	20 %	289191647
130	NC_013887	ATCTC	2	10	142261	142270	20 %	40 %	0 %	40 %	289191648
131	NC_013887	CCCTC	2	10	142432	142441	0 %	20 %	0 %	80 %	289191648
132	NC_013887	ATAAA	2	10	142965	142974	80 %	20 %	0 %	0 %	289191648
133	NC_013887	ATCTT	2	10	143114	143123	20 %	60 %	0 %	20 %	289191649
134	NC_013887	AGTAG	2	10	146318	146327	40 %	20 %	40 %	0 %	289191652
135	NC_013887	TATAA	2	10	147389	147398	60 %	40 %	0 %	0 %	289191652
136	NC_013887	AAGCT	2	10	147532	147541	40 %	20 %	20 %	20 %	289191653
137	NC_013887	TAGTT	2	10	148451	148460	20 %	60 %	20 %	0 %	289191653
138	NC_013887	CTAAT	2	10	149079	149088	40 %	40 %	0 %	20 %	289191654
139	NC_013887	AAATT	2	10	151047	151056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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