MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 5491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013887	AATT	2	8	1632	1639	50 %	50 %	0 %	0 %	289191499
2	NC_013887	AAAG	2	8	1810	1817	75 %	0 %	25 %	0 %	289191499
3	NC_013887	TAGA	2	8	2085	2092	50 %	25 %	25 %	0 %	289191499
4	NC_013887	CTTG	2	8	2584	2591	0 %	50 %	25 %	25 %	289191499
5	NC_013887	TATG	2	8	3190	3197	25 %	50 %	25 %	0 %	289191501
6	NC_013887	GAAA	2	8	3488	3495	75 %	0 %	25 %	0 %	289191501
7	NC_013887	ATTA	2	8	3571	3578	50 %	50 %	0 %	0 %	289191501
8	NC_013887	AGAA	2	8	4341	4348	75 %	0 %	25 %	0 %	289191501
9	NC_013887	AGTT	2	8	4371	4378	25 %	50 %	25 %	0 %	289191501
10	NC_013887	ATAC	2	8	4476	4483	50 %	25 %	0 %	25 %	289191501
11	NC_013887	GAAT	2	8	4681	4688	50 %	25 %	25 %	0 %	289191501
12	NC_013887	TTTC	2	8	4707	4714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013887	TTAG	2	8	5187	5194	25 %	50 %	25 %	0 %	289191502
14	NC_013887	TTGA	2	8	6111	6118	25 %	50 %	25 %	0 %	289191502
15	NC_013887	AGAA	2	8	6138	6145	75 %	0 %	25 %	0 %	289191502
16	NC_013887	AATT	2	8	6156	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013887	AGAA	2	8	6706	6713	75 %	0 %	25 %	0 %	289191503
18	NC_013887	CATG	2	8	7109	7116	25 %	25 %	25 %	25 %	289191504
19	NC_013887	CATC	2	8	8265	8272	25 %	25 %	0 %	50 %	289191506
20	NC_013887	CTTT	2	8	8630	8637	0 %	75 %	0 %	25 %	289191506
21	NC_013887	TTCC	2	8	9149	9156	0 %	50 %	0 %	50 %	289191506
22	NC_013887	ATTT	2	8	9316	9323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013887	ATTA	2	8	9509	9516	50 %	50 %	0 %	0 %	289191507
24	NC_013887	TTTC	2	8	9837	9844	0 %	75 %	0 %	25 %	289191507
25	NC_013887	CTTT	2	8	10215	10222	0 %	75 %	0 %	25 %	289191507
26	NC_013887	TCTT	2	8	10287	10294	0 %	75 %	0 %	25 %	289191507
27	NC_013887	TGAA	2	8	10409	10416	50 %	25 %	25 %	0 %	289191507
28	NC_013887	TAAA	2	8	10989	10996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013887	CTAT	2	8	11069	11076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013887	GTTG	2	8	11407	11414	0 %	50 %	50 %	0 %	289191508
31	NC_013887	CTGC	2	8	12341	12348	0 %	25 %	25 %	50 %	289191509
32	NC_013887	CCTT	2	8	12577	12584	0 %	50 %	0 %	50 %	289191509
33	NC_013887	GCAT	2	8	12735	12742	25 %	25 %	25 %	25 %	289191509
34	NC_013887	AATT	2	8	12907	12914	50 %	50 %	0 %	0 %	289191510
35	NC_013887	ATTT	2	8	12966	12973	25 %	75 %	0 %	0 %	289191510
36	NC_013887	ATGA	2	8	13716	13723	50 %	25 %	25 %	0 %	289191511
37	NC_013887	ATTT	2	8	13925	13932	25 %	75 %	0 %	0 %	289191511
38	NC_013887	ATCT	2	8	14017	14024	25 %	50 %	0 %	25 %	289191512
39	NC_013887	ATTT	2	8	14193	14200	25 %	75 %	0 %	0 %	289191512
40	NC_013887	TAAT	2	8	14798	14805	50 %	50 %	0 %	0 %	289191513
41	NC_013887	AAAT	2	8	15132	15139	75 %	25 %	0 %	0 %	289191513
42	NC_013887	CAAA	2	8	15696	15703	75 %	0 %	0 %	25 %	289191514
43	NC_013887	AAAG	2	8	15715	15722	75 %	0 %	25 %	0 %	289191514
44	NC_013887	ATTA	2	8	15847	15854	50 %	50 %	0 %	0 %	289191514
45	NC_013887	TTAT	2	8	16023	16030	25 %	75 %	0 %	0 %	289191514
46	NC_013887	GCTT	2	8	16310	16317	0 %	50 %	25 %	25 %	289191514
47	NC_013887	TTGA	2	8	16592	16599	25 %	50 %	25 %	0 %	289191514
48	NC_013887	TCAT	2	8	16907	16914	25 %	50 %	0 %	25 %	289191515
49	NC_013887	TATG	2	8	16984	16991	25 %	50 %	25 %	0 %	289191515
50	NC_013887	AAAT	2	8	17380	17387	75 %	25 %	0 %	0 %	289191516
51	NC_013887	CAAT	2	8	17443	17450	50 %	25 %	0 %	25 %	289191516
52	NC_013887	ATAA	2	8	17478	17485	75 %	25 %	0 %	0 %	289191516
53	NC_013887	ATTT	2	8	17964	17971	25 %	75 %	0 %	0 %	289191516
54	NC_013887	TCAA	2	8	18185	18192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013887	TAAA	2	8	18471	18478	75 %	25 %	0 %	0 %	289191517
56	NC_013887	AAAT	2	8	18685	18692	75 %	25 %	0 %	0 %	289191518
57	NC_013887	GAAA	2	8	18813	18820	75 %	0 %	25 %	0 %	289191518
58	NC_013887	TAAA	2	8	18823	18830	75 %	25 %	0 %	0 %	289191518
59	NC_013887	AAAG	2	8	18833	18840	75 %	0 %	25 %	0 %	289191518
60	NC_013887	TCAA	2	8	19180	19187	50 %	25 %	0 %	25 %	289191519
61	NC_013887	TTCA	2	8	19299	19306	25 %	50 %	0 %	25 %	289191519
62	NC_013887	CAAC	2	8	19477	19484	50 %	0 %	0 %	50 %	289191519
63	NC_013887	CCAA	2	8	19705	19712	50 %	0 %	0 %	50 %	289191519
64	NC_013887	TTTA	2	8	19806	19813	25 %	75 %	0 %	0 %	289191519
65	NC_013887	TTGT	2	8	20196	20203	0 %	75 %	25 %	0 %	289191520
66	NC_013887	TATC	2	8	20307	20314	25 %	50 %	0 %	25 %	289191520
67	NC_013887	AATT	2	8	20395	20402	50 %	50 %	0 %	0 %	289191520
68	NC_013887	CTTT	2	8	20780	20787	0 %	75 %	0 %	25 %	289191520
69	NC_013887	CTCC	2	8	21286	21293	0 %	25 %	0 %	75 %	289191520
70	NC_013887	CATC	2	8	21721	21728	25 %	25 %	0 %	50 %	289191521
71	NC_013887	AAAT	2	8	21777	21784	75 %	25 %	0 %	0 %	289191521
72	NC_013887	AAGT	2	8	22109	22116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013887	AATT	2	8	22236	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013887	GAAG	2	8	22498	22505	50 %	0 %	50 %	0 %	289191522
75	NC_013887	AAAG	2	8	22552	22559	75 %	0 %	25 %	0 %	289191522
76	NC_013887	TAAA	2	8	22767	22774	75 %	25 %	0 %	0 %	289191522
77	NC_013887	TTAA	2	8	23063	23070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013887	TTGT	2	8	23143	23150	0 %	75 %	25 %	0 %	289191523
79	NC_013887	GTTG	2	8	23276	23283	0 %	50 %	50 %	0 %	289191523
80	NC_013887	TGCT	2	8	23698	23705	0 %	50 %	25 %	25 %	289191523
81	NC_013887	TAGA	2	8	24095	24102	50 %	25 %	25 %	0 %	289191524
82	NC_013887	CAGC	2	8	24268	24275	25 %	0 %	25 %	50 %	289191524
83	NC_013887	TAGT	2	8	24320	24327	25 %	50 %	25 %	0 %	289191524
84	NC_013887	AAGA	2	8	24599	24606	75 %	0 %	25 %	0 %	289191525
85	NC_013887	GAAA	2	8	24789	24796	75 %	0 %	25 %	0 %	289191525
86	NC_013887	TTTA	2	8	25516	25523	25 %	75 %	0 %	0 %	289191525
87	NC_013887	GCAG	2	8	25908	25915	25 %	0 %	50 %	25 %	289191526
88	NC_013887	TAGA	2	8	26063	26070	50 %	25 %	25 %	0 %	289191526
89	NC_013887	AGAA	2	8	26176	26183	75 %	0 %	25 %	0 %	289191526
90	NC_013887	ATTA	2	8	26235	26242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013887	ATAA	2	8	27202	27209	75 %	25 %	0 %	0 %	289191527
92	NC_013887	TGAT	2	8	27346	27353	25 %	50 %	25 %	0 %	289191528
93	NC_013887	AGGG	2	8	27415	27422	25 %	0 %	75 %	0 %	289191528
94	NC_013887	GAAA	2	8	27741	27748	75 %	0 %	25 %	0 %	289191529
95	NC_013887	AGAA	2	8	28070	28077	75 %	0 %	25 %	0 %	289191530
96	NC_013887	GCTT	2	8	28371	28378	0 %	50 %	25 %	25 %	289191530
97	NC_013887	TCAA	2	8	28541	28548	50 %	25 %	0 %	25 %	289191530
98	NC_013887	ACAG	2	8	28895	28902	50 %	0 %	25 %	25 %	289191530
99	NC_013887	AAGA	2	8	28913	28920	75 %	0 %	25 %	0 %	289191530
100	NC_013887	GAAA	2	8	30089	30096	75 %	0 %	25 %	0 %	289191531
101	NC_013887	AGGA	2	8	30200	30207	50 %	0 %	50 %	0 %	289191531
102	NC_013887	TCCA	2	8	30663	30670	25 %	25 %	0 %	50 %	289191531
103	NC_013887	TACA	2	8	30672	30679	50 %	25 %	0 %	25 %	289191531
104	NC_013887	TTTA	2	8	31022	31029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013887	GAAA	2	8	31147	31154	75 %	0 %	25 %	0 %	289191532
106	NC_013887	AGTT	2	8	31636	31643	25 %	50 %	25 %	0 %	289191533
107	NC_013887	TGGA	2	8	32070	32077	25 %	25 %	50 %	0 %	289191535
108	NC_013887	TTTA	2	8	32187	32194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013887	ATTC	2	8	32391	32398	25 %	50 %	0 %	25 %	289191536
110	NC_013887	AGGA	2	8	32598	32605	50 %	0 %	50 %	0 %	289191536
111	NC_013887	TCCA	2	8	32894	32901	25 %	25 %	0 %	50 %	289191536
112	NC_013887	ATGA	2	8	32958	32965	50 %	25 %	25 %	0 %	289191536
113	NC_013887	ATTG	2	8	33308	33315	25 %	50 %	25 %	0 %	289191537
114	NC_013887	GGTA	2	8	33875	33882	25 %	25 %	50 %	0 %	289191537
115	NC_013887	GATT	2	8	34043	34050	25 %	50 %	25 %	0 %	289191537
116	NC_013887	ATGC	2	8	34552	34559	25 %	25 %	25 %	25 %	289191538
117	NC_013887	ATTA	2	8	34733	34740	50 %	50 %	0 %	0 %	289191538
118	NC_013887	CCTC	2	8	34984	34991	0 %	25 %	0 %	75 %	289191538
119	NC_013887	TTTG	2	8	35282	35289	0 %	75 %	25 %	0 %	289191538
120	NC_013887	TTAA	2	8	35913	35920	50 %	50 %	0 %	0 %	289191538
121	NC_013887	TATT	2	8	36701	36708	25 %	75 %	0 %	0 %	289191539
122	NC_013887	ATCT	2	8	37030	37037	25 %	50 %	0 %	25 %	289191540
123	NC_013887	CATT	2	8	39371	39378	25 %	50 %	0 %	25 %	289191543
124	NC_013887	TTAT	2	8	39644	39651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013887	AAAG	2	8	39785	39792	75 %	0 %	25 %	0 %	289191544
126	NC_013887	GACA	2	8	40096	40103	50 %	0 %	25 %	25 %	289191544
127	NC_013887	ATTG	2	8	40576	40583	25 %	50 %	25 %	0 %	289191544
128	NC_013887	AAGA	2	8	40693	40700	75 %	0 %	25 %	0 %	289191544
129	NC_013887	CTAT	2	8	40794	40801	25 %	50 %	0 %	25 %	289191544
130	NC_013887	TACC	2	8	41511	41518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013887	AAAG	2	8	41759	41766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013887	AAAG	2	8	42053	42060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013887	ATTG	2	8	42197	42204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013887	ATAA	2	8	42320	42327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013887	AAAC	2	8	42368	42375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013887	AGAA	2	8	43061	43068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013887	GCAT	2	8	43534	43541	25 %	25 %	25 %	25 %	289191545
138	NC_013887	TTTG	2	8	44091	44098	0 %	75 %	25 %	0 %	289191546
139	NC_013887	TTAT	2	8	44313	44320	25 %	75 %	0 %	0 %	289191546
140	NC_013887	CTAT	2	8	44601	44608	25 %	50 %	0 %	25 %	289191547
141	NC_013887	TTAT	2	8	45024	45031	25 %	75 %	0 %	0 %	289191548
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