MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 26881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013887	AGA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191497
2	NC_013887	GCT	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191497
3	NC_013887	TCT	2	6	410	415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191497
4	NC_013887	TTG	2	6	448	453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191497
5	NC_013887	TGC	2	6	510	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191497
6	NC_013887	GCA	2	6	577	582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191497
7	NC_013887	TTG	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191497
8	NC_013887	CCT	2	6	723	728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013887	GAA	3	9	850	858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191498
10	NC_013887	AGA	2	6	885	890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191498
11	NC_013887	AAG	2	6	932	937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191498
12	NC_013887	ATT	2	6	958	963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191498
13	NC_013887	TTA	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191498
14	NC_013887	AGA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191498
15	NC_013887	TAA	2	6	1100	1105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191498
16	NC_013887	GGA	2	6	1129	1134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191498
17	NC_013887	GAA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191498
18	NC_013887	CTG	2	6	1289	1294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191498
19	NC_013887	ATA	2	6	1313	1318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191498
20	NC_013887	AAG	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191499
21	NC_013887	AGA	2	6	1654	1659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191499
22	NC_013887	GTT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191499
23	NC_013887	TGT	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191499
24	NC_013887	TAA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191499
25	NC_013887	GTT	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191499
26	NC_013887	AGG	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191499
27	NC_013887	ATA	2	6	2063	2068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191499
28	NC_013887	AAT	2	6	2119	2124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191499
29	NC_013887	TTG	2	6	2160	2165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191499
30	NC_013887	AAT	2	6	2170	2175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191499
31	NC_013887	CAG	2	6	2226	2231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191499
32	NC_013887	GGA	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191499
33	NC_013887	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191499
34	NC_013887	AAG	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191499
35	NC_013887	CAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191499
36	NC_013887	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191499
37	NC_013887	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191499
38	NC_013887	AGA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191499
39	NC_013887	GTT	2	6	2624	2629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191500
40	NC_013887	ATG	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191500
41	NC_013887	AAT	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191500
42	NC_013887	TAA	2	6	2874	2879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191500
43	NC_013887	ATA	2	6	2905	2910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191500
44	NC_013887	AAC	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013887	GTT	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191501
46	NC_013887	GAA	2	6	3038	3043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191501
47	NC_013887	GAT	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191501
48	NC_013887	GAA	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191501
49	NC_013887	AGT	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191501
50	NC_013887	TGA	2	6	3361	3366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191501
51	NC_013887	TTG	2	6	3420	3425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191501
52	NC_013887	AGG	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191501
53	NC_013887	GAA	2	6	3452	3457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191501
54	NC_013887	AGT	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191501
55	NC_013887	ATG	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191501
56	NC_013887	ACC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191501
57	NC_013887	TTC	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191501
58	NC_013887	AGG	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191501
59	NC_013887	CAG	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191501
60	NC_013887	GAA	2	6	3758	3763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191501
61	NC_013887	CAG	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191501
62	NC_013887	GAG	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191501
63	NC_013887	CAC	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191501
64	NC_013887	AGG	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191501
65	NC_013887	AAG	3	9	4207	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191501
66	NC_013887	TGA	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191501
67	NC_013887	GTG	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289191501
68	NC_013887	TTG	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191501
69	NC_013887	TGA	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191501
70	NC_013887	CCA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191501
71	NC_013887	TGA	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013887	CAG	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191502
73	NC_013887	TCA	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191502
74	NC_013887	TTG	2	6	4816	4821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191502
75	NC_013887	AGC	2	6	4835	4840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191502
76	NC_013887	TTG	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191502
77	NC_013887	GAA	2	6	4987	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191502
78	NC_013887	GGA	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191502
79	NC_013887	CAA	2	6	5164	5169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191502
80	NC_013887	AGC	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191502
81	NC_013887	AGA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191502
82	NC_013887	CTT	2	6	5342	5347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191502
83	NC_013887	AGT	2	6	5387	5392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191502
84	NC_013887	ACT	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191502
85	NC_013887	CAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191502
86	NC_013887	GAA	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191502
87	NC_013887	CCA	2	6	5784	5789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191502
88	NC_013887	AGA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191502
89	NC_013887	GTT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191502
90	NC_013887	TGC	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191502
91	NC_013887	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191502
92	NC_013887	GTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191502
93	NC_013887	AGA	3	9	6080	6088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191502
94	NC_013887	ATT	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191503
95	NC_013887	TTG	2	6	6497	6502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191503
96	NC_013887	GTT	3	9	6538	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191503
97	NC_013887	TGG	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289191503
98	NC_013887	AGA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191503
99	NC_013887	ATT	2	6	6692	6697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191503
100	NC_013887	AAT	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191503
101	NC_013887	TCT	3	9	7048	7056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191504
102	NC_013887	ATA	2	6	7148	7153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013887	AAT	2	6	7341	7346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191505
104	NC_013887	TCA	3	9	7366	7374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191505
105	NC_013887	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191506
106	NC_013887	TCA	2	6	7741	7746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191506
107	NC_013887	AAT	2	6	7776	7781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191506
108	NC_013887	TGT	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191506
109	NC_013887	CAA	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191506
110	NC_013887	TCA	2	6	7934	7939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191506
111	NC_013887	TAA	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191506
112	NC_013887	ATT	2	6	8242	8247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191506
113	NC_013887	TGG	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289191506
114	NC_013887	TGC	2	6	8409	8414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191506
115	NC_013887	CCA	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191506
116	NC_013887	TCC	2	6	8521	8526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191506
117	NC_013887	CAT	2	6	8540	8545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191506
118	NC_013887	GCT	2	6	8557	8562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191506
119	NC_013887	TCC	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191506
120	NC_013887	TCT	2	6	8809	8814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191506
121	NC_013887	ATT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191506
122	NC_013887	ACT	2	6	8986	8991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191506
123	NC_013887	TGG	2	6	9031	9036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289191506
124	NC_013887	CAG	2	6	9038	9043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191506
125	NC_013887	TGG	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289191506
126	NC_013887	TTA	2	6	9091	9096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191506
127	NC_013887	AAC	2	6	9120	9125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191506
128	NC_013887	TAT	2	6	9280	9285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013887	ACT	2	6	9290	9295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013887	TTA	2	6	9325	9330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013887	AAC	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013887	CTT	2	6	9566	9571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191507
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262	NC_013887	GAA	2	6	18545	18550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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