MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 47737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013887	GTTT	2	8	186551	186558	0 %	75 %	25 %	0 %	289191691
5002	NC_013887	ATT	2	6	186712	186717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191691
5003	NC_013887	TTC	2	6	186736	186741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191691
5004	NC_013887	AGT	2	6	186744	186749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191691
5005	NC_013887	AGG	2	6	186753	186758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191691
5006	NC_013887	AAACA	2	10	186795	186804	80 %	0 %	0 %	20 %	289191691
5007	NC_013887	TATT	2	8	186814	186821	25 %	75 %	0 %	0 %	289191691
5008	NC_013887	TAA	2	6	186899	186904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013887	GTT	2	6	186963	186968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191692
5010	NC_013887	GAA	2	6	187014	187019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191692
5011	NC_013887	GGA	2	6	187035	187040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191692
5012	NC_013887	GGC	2	6	187122	187127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289191692
5013	NC_013887	GGGA	2	8	187182	187189	25 %	0 %	75 %	0 %	289191692
5014	NC_013887	AGGAGA	2	12	187201	187212	50 %	0 %	50 %	0 %	289191692
5015	NC_013887	ATG	2	6	187246	187251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191692
5016	NC_013887	TTG	2	6	187261	187266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191692
5017	NC_013887	GA	3	6	187327	187332	50 %	0 %	50 %	0 %	289191692
5018	NC_013887	GGA	2	6	187353	187358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191692
5019	NC_013887	AG	3	6	187394	187399	50 %	0 %	50 %	0 %	289191692
5020	NC_013887	A	6	6	187452	187457	100 %	0 %	0 %	0 %	289191692
5021	NC_013887	GTT	2	6	187464	187469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191692
5022	NC_013887	GA	3	6	187480	187485	50 %	0 %	50 %	0 %	289191692
5023	NC_013887	TTAT	2	8	187523	187530	25 %	75 %	0 %	0 %	289191692
5024	NC_013887	TGGA	2	8	187570	187577	25 %	25 %	50 %	0 %	289191692
5025	NC_013887	TA	3	6	187621	187626	50 %	50 %	0 %	0 %	289191692
5026	NC_013887	TAA	2	6	187639	187644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191692
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5028	NC_013887	TGA	2	6	187697	187702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191692
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5030	NC_013887	TTG	2	6	187714	187719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191692
5031	NC_013887	AAAT	2	8	187743	187750	75 %	25 %	0 %	0 %	289191692
5032	NC_013887	T	6	6	187793	187798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013887	ATT	2	6	187826	187831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191693
5034	NC_013887	ATC	2	6	187886	187891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191693
5035	NC_013887	GAAT	2	8	187956	187963	50 %	25 %	25 %	0 %	289191693
5036	NC_013887	ATT	2	6	188003	188008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191693
5037	NC_013887	AT	3	6	188072	188077	50 %	50 %	0 %	0 %	289191693
5038	NC_013887	AGT	2	6	188122	188127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191693
5039	NC_013887	AGT	2	6	188152	188157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191693
5040	NC_013887	CAA	2	6	188271	188276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191693
5041	NC_013887	A	7	7	188323	188329	100 %	0 %	0 %	0 %	289191693
5042	NC_013887	AAG	2	6	188547	188552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191693
5043	NC_013887	TAT	2	6	188573	188578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191693
5044	NC_013887	AAT	2	6	188596	188601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191693
5045	NC_013887	GAT	2	6	188641	188646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191693
5046	NC_013887	TA	3	6	188722	188727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013887	TTG	2	6	188777	188782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013887	TA	3	6	188901	188906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013887	GAT	2	6	188936	188941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013887	TGA	2	6	188947	188952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_013887	CGA	2	6	189032	189037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_013887	ATGTCC	2	12	189062	189073	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_013887	TGA	2	6	189131	189136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013887	AT	3	6	189161	189166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013887	AAAG	2	8	189313	189320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013887	CCG	2	6	189467	189472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289191694
5057	NC_013887	ATC	2	6	189487	189492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191694
5058	NC_013887	GCT	2	6	189648	189653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191694
5059	NC_013887	CCTT	2	8	189791	189798	0 %	50 %	0 %	50 %	289191694
5060	NC_013887	TTG	2	6	189947	189952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191694
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5073	NC_013887	TCT	3	9	190947	190955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_013887	TTTATC	2	12	191049	191060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5075	NC_013887	ATT	2	6	191061	191066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_013887	ATG	2	6	191088	191093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_013887	ATTG	2	8	191101	191108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013887	AT	3	6	191118	191123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_013887	TAA	2	6	191166	191171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_013887	TTTA	2	8	191298	191305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_013887	ACATT	2	10	191348	191357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5084	NC_013887	ATG	2	6	191411	191416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_013887	ATTG	2	8	191557	191564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_013887	GTTT	2	8	191594	191601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013887	GGA	2	6	191650	191655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013887	TAC	2	6	191675	191680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_013887	ATA	2	6	191811	191816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013887	GAA	2	6	191850	191855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013887	TA	3	6	191941	191946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013887	TTC	2	6	191963	191968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_013887	AGAA	2	8	191971	191978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_013887	ATG	2	6	192018	192023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_013887	TAT	2	6	192026	192031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_013887	TTA	2	6	192090	192095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013887	TAA	2	6	192103	192108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013887	T	7	7	192125	192131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_013887	TA	3	6	192143	192148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_013887	ATT	2	6	192189	192194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013887	TATAAT	2	12	192203	192214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_013887	AT	4	8	192218	192225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_013887	A	6	6	192517	192522	100 %	0 %	0 %	0 %	289191695
5111	NC_013887	ATTC	2	8	192534	192541	25 %	50 %	0 %	25 %	289191695
5112	NC_013887	GAA	2	6	192601	192606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191695
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5114	NC_013887	GATATT	2	12	192631	192642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289191695
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5116	NC_013887	A	6	6	192690	192695	100 %	0 %	0 %	0 %	289191695
5117	NC_013887	GAA	2	6	192699	192704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191695
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5119	NC_013887	CAA	4	12	192739	192750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191696
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5122	NC_013887	GAT	2	6	192836	192841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191696
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5124	NC_013887	CTGGAA	2	12	193078	193089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289191696
5125	NC_013887	ATAA	2	8	193137	193144	75 %	25 %	0 %	0 %	289191696
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5253	NC_013887	CAACCT	2	12	198362	198373	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	289191700
5254	NC_013887	TTGA	2	8	198390	198397	25 %	50 %	25 %	0 %	289191700
5255	NC_013887	TCA	2	6	198598	198603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191700
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5257	NC_013887	AGC	2	6	198849	198854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191700
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5260	NC_013887	CATG	2	8	198998	199005	25 %	25 %	25 %	25 %	289191700
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5271	NC_013887	ACC	2	6	199329	199334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5272	NC_013887	AAT	2	6	199371	199376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_013887	CTT	2	6	199425	199430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191701
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5280	NC_013887	CTCTAA	2	12	199809	199820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191701
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5338	NC_013887	CCTT	2	8	201854	201861	0 %	50 %	0 %	50 %	289191702
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5372	NC_013887	GGA	2	6	203242	203247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191704
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