MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 3721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	AT	3	6	139	144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013665	AC	3	6	146	151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013665	CG	3	6	3496	3501	0 %	0 %	50 %	50 %	282162675
4	NC_013665	AT	3	6	4654	4659	50 %	50 %	0 %	0 %	282162676
5	NC_013665	AC	3	6	5125	5130	50 %	0 %	0 %	50 %	282162676
6	NC_013665	TG	3	6	5286	5291	0 %	50 %	50 %	0 %	282162676
7	NC_013665	AT	3	6	7233	7238	50 %	50 %	0 %	0 %	282162677
8	NC_013665	GC	3	6	7934	7939	0 %	0 %	50 %	50 %	282162678
9	NC_013665	GC	3	6	9122	9127	0 %	0 %	50 %	50 %	282162681
10	NC_013665	AT	4	8	11281	11288	50 %	50 %	0 %	0 %	282162686
11	NC_013665	CA	3	6	11531	11536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013665	CG	3	6	11633	11638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013665	GA	3	6	11994	11999	50 %	0 %	50 %	0 %	282162687
14	NC_013665	CT	3	6	12564	12569	0 %	50 %	0 %	50 %	282162687
15	NC_013665	GC	3	6	12792	12797	0 %	0 %	50 %	50 %	282162688
16	NC_013665	TA	3	6	13316	13321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013665	GC	3	6	14658	14663	0 %	0 %	50 %	50 %	282162690
18	NC_013665	GC	3	6	14872	14877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013665	AG	3	6	15673	15678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013665	AT	3	6	15949	15954	50 %	50 %	0 %	0 %	282162693
21	NC_013665	CG	3	6	16162	16167	0 %	0 %	50 %	50 %	282162693
22	NC_013665	TA	3	6	16354	16359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013665	TA	3	6	16366	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013665	CT	3	6	17087	17092	0 %	50 %	0 %	50 %	282162694
25	NC_013665	GC	3	6	17634	17639	0 %	0 %	50 %	50 %	282162695
26	NC_013665	AT	3	6	18890	18895	50 %	50 %	0 %	0 %	282162696
27	NC_013665	GC	3	6	22054	22059	0 %	0 %	50 %	50 %	282162699
28	NC_013665	TA	3	6	23929	23934	50 %	50 %	0 %	0 %	282162703
29	NC_013665	AT	4	8	24722	24729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013665	TA	3	6	26183	26188	50 %	50 %	0 %	0 %	282162704
31	NC_013665	GC	3	6	26707	26712	0 %	0 %	50 %	50 %	282162704
32	NC_013665	AG	3	6	27212	27217	50 %	0 %	50 %	0 %	282162705
33	NC_013665	GA	3	6	27891	27896	50 %	0 %	50 %	0 %	282162707
34	NC_013665	AT	3	6	28914	28919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013665	CA	3	6	29056	29061	50 %	0 %	0 %	50 %	282162709
36	NC_013665	CT	3	6	32320	32325	0 %	50 %	0 %	50 %	282162711
37	NC_013665	TA	4	8	36184	36191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013665	TG	3	6	37102	37107	0 %	50 %	50 %	0 %	282162717
39	NC_013665	TA	4	8	37158	37165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013665	GT	3	6	39066	39071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013665	AT	3	6	39239	39244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013665	AT	3	6	39618	39623	50 %	50 %	0 %	0 %	282162721
43	NC_013665	AT	3	6	39714	39719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013665	CG	3	6	41830	41835	0 %	0 %	50 %	50 %	282162722
45	NC_013665	AT	3	6	42373	42378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013665	CG	3	6	43312	43317	0 %	0 %	50 %	50 %	282162723
47	NC_013665	CT	3	6	44967	44972	0 %	50 %	0 %	50 %	282162724
48	NC_013665	AT	3	6	45074	45079	50 %	50 %	0 %	0 %	282162724
49	NC_013665	AT	3	6	45269	45274	50 %	50 %	0 %	0 %	282162724
50	NC_013665	TC	3	6	45636	45641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013665	CG	3	6	46861	46866	0 %	0 %	50 %	50 %	282162726
52	NC_013665	AC	3	6	46905	46910	50 %	0 %	0 %	50 %	282162726
53	NC_013665	GC	4	8	47216	47223	0 %	0 %	50 %	50 %	282162726
54	NC_013665	AT	3	6	47647	47652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013665	TA	3	6	47660	47665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013665	GA	3	6	50330	50335	50 %	0 %	50 %	0 %	282162728
57	NC_013665	CT	3	6	50428	50433	0 %	50 %	0 %	50 %	282162728
58	NC_013665	CT	3	6	50826	50831	0 %	50 %	0 %	50 %	282162728
59	NC_013665	CT	3	6	51662	51667	0 %	50 %	0 %	50 %	282162729
60	NC_013665	TA	3	6	52039	52044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013665	GC	3	6	53545	53550	0 %	0 %	50 %	50 %	282162730
62	NC_013665	GC	3	6	54307	54312	0 %	0 %	50 %	50 %	282162732
63	NC_013665	GC	3	6	54753	54758	0 %	0 %	50 %	50 %	282162733
64	NC_013665	TC	3	6	55686	55691	0 %	50 %	0 %	50 %	282162734
65	NC_013665	TC	3	6	56347	56352	0 %	50 %	0 %	50 %	282162734
66	NC_013665	AT	3	6	57599	57604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013665	AG	3	6	57647	57652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013665	AT	3	6	59859	59864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013665	TA	3	6	63204	63209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013665	TG	3	6	63861	63866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013665	CT	4	8	64725	64732	0 %	50 %	0 %	50 %	282162742
72	NC_013665	AT	3	6	65213	65218	50 %	50 %	0 %	0 %	282162742
73	NC_013665	CT	3	6	65825	65830	0 %	50 %	0 %	50 %	282162743
74	NC_013665	GC	3	6	66226	66231	0 %	0 %	50 %	50 %	282162744
75	NC_013665	CG	3	6	66384	66389	0 %	0 %	50 %	50 %	282162744
76	NC_013665	GT	3	6	66425	66430	0 %	50 %	50 %	0 %	282162744
77	NC_013665	TC	3	6	66744	66749	0 %	50 %	0 %	50 %	282162745
78	NC_013665	GC	3	6	67206	67211	0 %	0 %	50 %	50 %	282162745
79	NC_013665	GA	3	6	67325	67330	50 %	0 %	50 %	0 %	282162745
80	NC_013665	TC	3	6	69119	69124	0 %	50 %	0 %	50 %	282162748
81	NC_013665	TA	3	6	69688	69693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013665	GC	3	6	69965	69970	0 %	0 %	50 %	50 %	282162749
83	NC_013665	AT	3	6	71530	71535	50 %	50 %	0 %	0 %	282162750
84	NC_013665	GC	3	6	71656	71661	0 %	0 %	50 %	50 %	282162750
85	NC_013665	GT	3	6	71723	71728	0 %	50 %	50 %	0 %	282162750
86	NC_013665	GA	3	6	71989	71994	50 %	0 %	50 %	0 %	282162750
87	NC_013665	CG	3	6	73748	73753	0 %	0 %	50 %	50 %	282162752
88	NC_013665	GA	3	6	74077	74082	50 %	0 %	50 %	0 %	282162752
89	NC_013665	GC	3	6	75094	75099	0 %	0 %	50 %	50 %	282162753
90	NC_013665	TA	3	6	76823	76828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013665	CT	3	6	77481	77486	0 %	50 %	0 %	50 %	282162756
92	NC_013665	TA	4	8	78328	78335	50 %	50 %	0 %	0 %	282162757
93	NC_013665	TA	3	6	78380	78385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013665	AT	3	6	79583	79588	50 %	50 %	0 %	0 %	282162758
95	NC_013665	TA	3	6	80117	80122	50 %	50 %	0 %	0 %	282162759
96	NC_013665	AT	3	6	82723	82728	50 %	50 %	0 %	0 %	282162762
97	NC_013665	AT	3	6	82856	82861	50 %	50 %	0 %	0 %	282162762
98	NC_013665	AG	3	6	84607	84612	50 %	0 %	50 %	0 %	282162763
99	NC_013665	GC	3	6	85069	85074	0 %	0 %	50 %	50 %	282162764
100	NC_013665	GC	3	6	85273	85278	0 %	0 %	50 %	50 %	282162765
101	NC_013665	CT	3	6	87626	87631	0 %	50 %	0 %	50 %	282162768
102	NC_013665	CT	3	6	88110	88115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013665	TC	3	6	88689	88694	0 %	50 %	0 %	50 %	282162769
104	NC_013665	CT	3	6	90220	90225	0 %	50 %	0 %	50 %	282162771
105	NC_013665	TC	3	6	91926	91931	0 %	50 %	0 %	50 %	282162773
106	NC_013665	AT	4	8	92636	92643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013665	CG	3	6	93660	93665	0 %	0 %	50 %	50 %	282162774
108	NC_013665	TA	3	6	94997	95002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013665	AT	3	6	95015	95020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013665	GC	3	6	95241	95246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013665	TA	3	6	95445	95450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013665	AT	3	6	96895	96900	50 %	50 %	0 %	0 %	282162778
113	NC_013665	TA	3	6	97870	97875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013665	TA	4	8	97878	97885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013665	TA	3	6	97889	97894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013665	AT	3	6	97985	97990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013665	TA	3	6	99510	99515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013665	GC	3	6	100404	100409	0 %	0 %	50 %	50 %	282162780
119	NC_013665	AT	3	6	101543	101548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013665	GA	3	6	102960	102965	50 %	0 %	50 %	0 %	282162783
121	NC_013665	AT	3	6	103882	103887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013665	GA	3	6	104667	104672	50 %	0 %	50 %	0 %	282162786
123	NC_013665	CT	3	6	104897	104902	0 %	50 %	0 %	50 %	282162786
124	NC_013665	CT	3	6	105281	105286	0 %	50 %	0 %	50 %	282162786
125	NC_013665	AT	4	8	105310	105317	50 %	50 %	0 %	0 %	282162786
126	NC_013665	GC	3	6	105475	105480	0 %	0 %	50 %	50 %	282162786
127	NC_013665	TC	3	6	105626	105631	0 %	50 %	0 %	50 %	282162786
128	NC_013665	GC	3	6	105674	105679	0 %	0 %	50 %	50 %	282162786
129	NC_013665	TA	3	6	106123	106128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013665	TA	4	8	106256	106263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013665	CA	3	6	107917	107922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013665	TG	3	6	108569	108574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013665	AT	3	6	109226	109231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013665	CG	3	6	109521	109526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013665	GC	3	6	110116	110121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013665	AC	3	6	111729	111734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013665	TG	3	6	111841	111846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013665	CA	3	6	111976	111981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013665	GC	3	6	113306	113311	0 %	0 %	50 %	50 %	282162788
140	NC_013665	CT	3	6	115656	115661	0 %	50 %	0 %	50 %	282162789
141	NC_013665	CT	3	6	118473	118478	0 %	50 %	0 %	50 %	282162792
142	NC_013665	TA	3	6	120518	120523	50 %	50 %	0 %	0 %	282162797
143	NC_013665	CT	3	6	120596	120601	0 %	50 %	0 %	50 %	282162797
144	NC_013665	GT	3	6	120741	120746	0 %	50 %	50 %	0 %	282162797
145	NC_013665	AT	3	6	120820	120825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013665	GA	3	6	120875	120880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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